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相似文献
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1.
分蘖洋葱叶片RNA提取方法的比较和分析   总被引:1,自引:1,他引:0  
黄钰  李旭双  陈典  王勇 《北方园艺》2011,(14):111-113
以新鲜的分蘖洋葱叶片为材料,比较了Trizol法、Trizol改进法、SDS法、SDS改进法以及柱式植物RNA提取法提取总RNA的效果。结果表明:Trizol法和Trizol改进法所提取的RNA得率很低,且不能有效除去叶片中的多糖成分;SDS改进法能够有效的去除分蘖洋葱叶片中的多糖,提取的RNA中28S RNA亮度约为18S RNA的2倍,OD260/OD280值介于1.7~2.2之间,但RNA的得率偏低,约为56.32μg/g;柱式植物RNA提取法提取的RNA 28S、18S、5S条带清晰,完整性好,RNA的得率最高,为123.58μg/g,完全适合于分蘖洋葱进一步的分子生物学研究。  相似文献   

2.
《中国瓜菜》2016,(1):8-10
针对辣椒根中富含多糖多酚的特点,比较了Trizol法、改良Trizol法和改良CTAB法3种方法对辣椒根总RNA提取的效果。结果表明,Trizol法、改良Trizol法能提取到辣椒根总RNA,但效果不理想;改良CTAB法提取到的辣椒根总RNA,28 S rRNA的亮度是18 S rRNA的2倍,OD260/OD280和OD260/OD230值分别为1.88和1.80,RNA质量浓度为254.0 mg·L-1;用提取到的RNA进行RT-PCR后可扩增出acting基因特异片段。因此改良CTAB法提取辣椒根总RNA的效果好、质量高、完整性好,能够满足后续试验要求。  相似文献   

3.
以中国李品种‘槜李’的果肉组织为试材,比较了Trizol法、RNA提取试剂盒和改良的CTAB法提取RNA的效果,筛选出适合李果实果肉组织总RNA的提取方法。结果表明:Trizol法和RNA提取试剂盒均不能得到完整的RNA;改良的CTAB法能有效去除多糖,28S条带的荧光亮度是18S条带的1.5~2.0倍,D260/D280值都在1.8~2.1,样品的平均得率为770.96~1 029.04ng/μL,RT-PCR结果扩增出了特异性条带,说明改良CTAB法从李果实果肉组织中提取的RNA质量高、完整性好、产率高,完全可以用于后续的分子生物学试验。  相似文献   

4.
简便高质量的食用菌总RNA提取方法   总被引:3,自引:0,他引:3  
STE法是针对食用菌多糖含量高而设计的一种提取食用菌总RNA的有效方法。本研究以灵芝、香菇和白腐真菌TR16菌株的菌丝体为材料,采用STE法提取其总RNA,同时以Trizol法作对照。结果表明:采用STE法提取的三种菌丝的总RNAA260/A280比值在1.80~2.10范围内,A260/A230略大于2.00;而Trizol法提取的总RNAA260/A280比值小于1.80,A260/A230小于1.90,明显比STE法效果差;总RNA电泳检测表明:STE法的3条带(28S rRNA、18SrRNA和5SrRNA)清晰,无拖尾,无杂带,效果比Trizol法好;将STE法提取的总RNA进行反转录后合成双链cDNA,进行预扩增,电泳显示呈弥散状;再进行选择性扩增,有相同或相异的条带。进一步表明STE法提取的总RNA质量较高,可以满足后续分子生物学研究的要求。  相似文献   

5.
番木瓜叶片总RNA提取方法比较研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
陈萍  姜成东  卢业凌 《北方园艺》2010,(18):133-135
采用了CTAB法和GHCL法及SDS法3种方法分别对番木瓜的叶片进行RNA的提取。该试验采用SDS法、GHCL法提取番木瓜总RNA,并对提取的RNA进行质量比较。结果表明:GHCL法(方法2)提取的RNA产率高,无明显降解,OD260/OD280比值较好,是有效提取总RNA的方法。  相似文献   

6.
适于SSR分析的树莓基因组DNA的快速提取   总被引:1,自引:0,他引:1  
通过改良CTAB法对不同品种的树莓幼嫩叶片进行DNA提取,并对得到的DNA进行了电泳检测、含量测定和SSR分析.结果表明:该方法所提DNA的纯度和产率都较高,OD260/OD280比值均介于1.7~1.9之间,OD260/OD230比值介于2.0~2.5之间,无降解现象,RNA去除干净,产率均在50~130μg/mL之间.经SSR-PCR分析条带清晰,多态性好,说明此方法提取的树莓基因组DNA完全适于SSR分析.  相似文献   

7.
以刺山柑为试材,研究比较了改良SDS提取法、RNApure Plant Plus Reagent法、RNAplant Plus Reagent法和RNAprep Pure Plant Kit法提取总RNA的效果,以期寻找一种适于野生刺山柑叶片高质量总RNA最佳提取方法。结果表明:4种方法提取的总RNA均可见28S和18S2条电泳谱带,RNAprep Pure Plant Kit法获得的RNA图谱条带清晰、明亮、稳定,28S rRNA亮度约是18SrRNA的2倍,OD260/OD280为2.00,产率为175.3μg/g,除RNAprep Pure Plant Kit法能够从叶片中提取到完整性好、纯度高及产率高的总RNA外,其它3种方法提取的总RNA均存在降解及DNA和蛋白等污染,经cDNA-SRAP分析检测,此方法获得的RNA反转录后能扩增出清晰稳定的多态性条带,能够满足后续试验的要求。进一步采用RNAprep Pure Plant Kit法从刺山柑幼苗整株、根、茎及叶中能够获得高质量的总RNA,因此,RNAprep Pure Plant Kit法适合刺山柑总RNA的提取。  相似文献   

8.
以甜瓜品种河套蜜瓜果肉为试验材料,比较了异硫氰酸胍法、CTAB法和SDS法3种RNA提取方法,结合KAc沉淀多糖和低浓度乙醇沉淀多糖2种去糖方法。结果表明:异硫氰酸胍法结合KAc沉淀多糖的去糖效果最佳,提取的RNA中28S亮度约为18S的2倍,且OD260/OD280值在1.8以上,RNA产率为64.48μg/g。经RT-PCR获得了乙烯受体基因etr1长达2.3 kb的cDNA特异性条带,说明异硫氰酸胍结合KAc沉淀多糖法从甜瓜果肉中提取的RNA质量好、产率较高、完整性好,适合于甜瓜进一步的分子生物学研究。  相似文献   

9.
葡萄叶片中提取总RNA的三种方法比较   总被引:5,自引:0,他引:5  
采用试剂盒法、热酚法和LiCl沉淀法3种方法提取葡萄叶片总RNA,通过琼脂糖凝胶电泳和Agilent 2100计检测总RNA的完整性和提取纯度.对红地球葡萄叶片总RNA提取方法做比较,以得到完整的、高质量的葡萄RNA.结果表明:LiCl沉淀法提取的RNA收率高,完整性好,OD260/OD280均在1.80~2.00,纯度高,28S、18S条带清晰完整.可以满足后续分子生物学的研究.  相似文献   

10.
为给巨大口蘑cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)等后续试验提供高质量的RNA,以巨大口蘑子实体为试验材料,筛选最适的巨大口蘑总RNA提取方法。采用Trizol法、CTAB-LiCL法和试剂盒法提取巨大口蘑总RNA,并对所提取的总RNA浓度、A260/A280、A260/A230以及凝胶电泳效果等指标进行比较分析。结果表明,3种方法都可以提取巨大口蘑子实体总RNA,CTAB-LiCl法提取总RNA的A260/A280为1.92,A260/A230为2.25,质量浓度为235μg/g,说明其完整且纯净;而Trizol法和试剂盒法提取总RNA的A260/A230均小于2.0,说明提取RNA中存在蛋白质、酚类等杂质,且RNA纯度低,其质量浓度分别为147μg/g、89μg/g。CTAB-LiCl法提取的巨大口蘑总RNA浓度高,纯度也较理想,凝胶电泳效果好,是进行后续相关研究的较佳选择。  相似文献   

11.
以改良CTAB法、改良SDS法、试剂盒法提取青藏高原蕨麻总DNA;用紫外分光光度法测定提取的青藏高原蕨麻的总DNA浓度和质量;用琼脂糖凝胶电泳法、分光光度法测定提取的青藏高原蕨麻的总DNA质量,以期筛选出青藏高原蕨麻总DNA提取的最佳方法。结果表明:用改良SDS法提取的蛋白质含量最高,OD260/OD2801.61左右,用改良CTAB法提取的DNA的OD260/OD2801.76左右;用试剂盒法提取的DNA的OD260/OD2801.70左右;用改良CTAB法提取DNA的浓度在100μg/mL。  相似文献   

12.
葡萄总RNA提取方法的研究   总被引:63,自引:3,他引:63  
针对葡萄组织中多酚、多糖类物质含量较高的特点,比较了改进SDS/酚法、异硫氰酸胍法和市售总RNA提取试剂盒等不同的提取方法,3种改进方法均能从葡萄幼嫩叶片中提取到总RNA。其中改进的SDS/酚法能有效抑制酚类物质和多糖对总RNA提取的影响,能够从成熟的叶片和完熟果实的果皮中获得质量高、完整性好的总RNA,28SrRNA亮度约为18SrRNA的2倍,A260/A280介于1.8~2.0之间,A260/A230大于2.0,且总RNA产率高,其中幼叶总RNA产率为261.20μg/g,成熟叶产率为191.40μg/g,完熟果皮产率为31.50μg/g,完全适于进行DDRT-PCR、Northernbolt和cDNA文库构建等研究。且该方法具有快速、简单、有效的特点。  相似文献   

13.
通过对比改良SDS-酚法、改良CTAB法和改良Trizol法3种RNA提取方法,提取"赤霞珠"(‘Cabernet Sauvignon’)葡萄芽、叶片和果皮RNA的质量及浓度,并进一步分离、纯化得到较高质量的RNA。结果表明:改良SDS-酚法与改良CTAB法适用于芽和叶片的提取,可以获得较好质量、高浓度的总RNA,其28S与18S亮度极高,5S清晰可见,完整性较好;改良Trizol操作环节较少,省时,质量好,条带锐利,可清晰看出28S与18S亮度比为2∶1,虽提取的样品浓度较低,但足以供下一步研究使用。  相似文献   

14.
徐美隆  章雨  倪细炉 《北方园艺》2011,(15):172-174
针对葡萄组织中多酚、多糖类物质含量较高的特点,对比研究了利用植物总DNA提取试剂盒和改良CTAB法提取葡萄总DNA.结果表明:改良的CTAB法能够从不同葡萄品种和不同生长时期的叶片中获得高质量、完整性好的总DNA,其OD260/OD260介于1.7~1.9之间,无降解现象,RNA去除干净,完全适于进行PCR和酶切等研究.  相似文献   

15.
【目的】为从枇杷果实中提取高质量的RNA,【方法】以枇杷果实为材料,对6种总RNA提取方法进行分析和比较。【结果】结果表明,在裂解前先用70%丙酮和80%乙醇分别对枇杷果皮和果肉进行预处理,再结合CTAB-LiCl法,得到的总RNA质量较好,OD260/OD280在1.8~2.2,OD260/OD230超过2.0,得率分别为幼果果皮56.78μg.g-1,幼果果肉40.62μg.g-1,成熟果果皮40.86μg.g-1,成熟果果肉9.24μg.g-1;并根据其他植物的八氢番茄红素合成酶基因(PSY)保守区设计引物,用以上方法提取的RNA为模板进行RT-PCR,得到453 bp的基因片段,其推导的氨基酸序列与其他植物的同源性高达95%,推测该片段为PSY基因。【结论】先用70%丙酮和80%乙醇分别对枇杷果皮和果肉进行预处理,再结合CTAB-LiCl法,得到的RNA质量好,可用于后续的分子生物学研究。  相似文献   

16.
以冬虫夏草新鲜子实体为材料,分别采用SDS抽提法、TRIzol法、CTAB-LiCl法和DEPC水法4种方法进行总RNA的提取试验,并对其进行了紫外及变性琼脂糖凝胶电泳检测。检测结果表明,4种提取方法中DEPC水法提取的总RNA质量最好,SDS抽提法次之,CTAB-LiCl法和TRIzol法效果最差。从RNA质量、操作难度、经济与否等方面综合分析,DEPC水法是较为理想的提取冬虫夏草新鲜子实体总RNA的方法。  相似文献   

17.
采用SDS抽提法、TRIzol法、CTAB-LiCl、DEPC水法对羊肚菌菌丝体进行了总RNA的提取,并对其进行了紫外及琼脂糖凝胶电泳检测。结果表明:4种提取方法中DEPC水法提取的总RNA质量最好,SDS抽提法次之,CTAB-LiCl法和TRIzol法效果最差。从RNA质量、操作简单、经济与否等方面综合分析,DEPC水法是羊肚菌菌丝体总RNA提取较为理想的方法。  相似文献   

18.
31份野生树莓资源的RAPD分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
用RAPD技术分析了31份野生树莓资源的亲缘关系,从100个A系列随机引物中选出了15个多态性高、分辨能力强的引物。将这15个引物应用于31份野生树莓材料,共扩增出182条谱带,其中170条为多态性标记(占93.41%),平均每个引物扩增多态性谱带12.13条,表明不同树莓资源基因型间存在着极为丰富的遗传多样性。基于RAPD的扩增结果建立UPGMA聚类分析树状图,31份野生树莓资源在遗传距离0.5100处被划分为4个类群。从分子水平研究了树莓属资源的亲缘关系,为树莓种质资源的保存和利用及其杂交亲本的选配提供了依据。  相似文献   

19.
银杏RNA的提取   总被引:19,自引:0,他引:19  
采用CTAB法提取银杏叶的RNA,结果表明:抽提的RNA经电泳检测,可见28SrRNA和18SrRNA两条主带;紫外吸收值测量,A260/A280接近2.0;反转录合成的cDNA经RAPD扩增,出现清晰的条带,这些说明提取的RNA纯度高,质量好。此方法简便易行,成本也较低,适合于富含多糖、多酚植物材料的RNA提取。  相似文献   

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