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1.
为寻找与乳房炎相关的分子标记,以期为荷斯坦牛的抗病育种提供理论基础,利用PCR SSCP技术和直接测序技术对宁夏农垦303头中国荷斯坦牛的TLR6基因进行了遗传多态性分析,利用一般线性模型分析TLR6基因c.640G>A突变位点与中国荷斯坦牛体细胞评分（SCS）以及各个因素之间的相关性。结果表明,中国荷斯坦牛TLR6基因c.640G>A突变位点与SCS值和胎次之间存在极显著和显著相关性,GA和AA基因型个体的SCS值极显著低于GG基因型个体（P<001）。因此,在中国荷斯坦牛育种中,可尝试将c.640G>A突变位点的GA基因型作为低SCC/SCS牛的优良基因型加以应用。 相似文献
2.
以702只中国美利奴羊(新疆军垦型)为试验材料,采用PCR-RFLP技术分析KAP1.3基因的多态性,并分析这些多态性位点与羊毛性状的相关性。结果显示:KAP1.3基因编码区存在2个单核苷酸多态性位点(c.240G>A和c.312G>A),均存在3种基因型,经最小二乘拟合线性模型分析,c.240G>A位点的3种基因型(GG、AG和AA)个体间平均毛纤维直径、卷曲度、毛长、污毛量、密度、净毛率和细度离散系数差异不显著(P>0.05);c.312G>A位点的3种基因型(GG、AG和AA)个体间的毛纤维直径、卷曲度、毛长、污毛量、密度、净毛率等性状差异不显著(P>0.05),但GG基因型与AA基因型间毛平均细度离散系数显著小于AG基因型(P<0.05)。因此KAP1.3基因可作为绵羊毛细度离散系数的候选基因之一,其生物学功能有待于进一步研究。 相似文献
3.
【目的】探索tva受体基因起始密码子突变(tva c.3G>A)对鸡感染A亚群禽白血病病毒(Avian leukemia virus subgroup A, ALV-A)的影响。【方法】利用Sanger测序和RT-PCR验证我国黄羽肉鸡存在tva c.3G>A突变。利用流式细胞术检测tva c.3G>A突变对鸡体外感染RCASBP(A)-GFP荧光报告病毒的影响。通过ALV-A体内攻毒试验,探究tva c.3G>A突变对鸡体内感染ALV-A的影响。利用直接测序方法对我国黄羽肉鸡品系tva c.3G>A突变位点进行基因分型。【结果】Sanger测序和RT-PCR结果鉴定我国黄羽肉鸡品系tva基因编码区第3位碱基由G突变为A,该突变引起tva基因起始密码子序列由ATG突变为ATA。流式细胞术检测结果显示野生型tva c.3G/G鸡胚成纤维细胞(Chicken embryo fibroblast, CEF)对RCASBP(A)-GFP易感,纯合突变型tva c.3A/A CEF抗RCASBP(A)-GFP感染,表明tva c.3G>A突变导致鸡体外抗RCA... 相似文献
4.
【目的】研究牛Toll样受体蛋白2基因(TLR2)的多态性及其与中国荷斯坦奶牛乳房炎的关系。【方法】以中国荷斯坦奶牛、鲁西黄牛和渤海黑牛为研究对象,利用DNA测序、PCR-RFLP和创造酶切位点RFLP(CRS-RFLP)技术对TLR2基因多态性及其与中国荷斯坦奶牛乳房炎的关系进行研究。【结果】经DNA测序,在牛TLR2基因的3′非翻译区发现1个新的SNP,即mRNA序列的3 008位发生了T/C突变。TLR2基因编码区(c.651G>A,c.827A>G)和3′非翻译区(c.3008T>C)有3个突变位点,分别是PstI,Hin1Ⅱ和HhaI限制性内切酶的酶切多态位点。3个多态位点在各品种牛之间的基因型频率和等位基因频率差异较大;经χ2适合性检验,除鲁西黄牛的HhaI酶切位点处于非Hardy-Weinberg平衡状态外,3种牛在其他位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。只有Hin1Ⅱ酶切多态位点与牛乳中的体细胞评分(SCS)存在相关性,含有B等位基因的个体SCS显著低于含有A等位基因的个体(P<0.05)。中国荷斯坦奶牛在3个酶切位点形成了H1-H8共8种单倍型,产生了H1H1、H1H2、H1H3、H1H4、H1H7和H1H8等6种单倍型组合,其中H1H1的频率最高(55.89%),H1H4的SCS最低(3.17),且不同单倍型组合与SCS存在相关性。【结论】TLR2基因可用作奶牛抗乳房炎性状的辅助选择标记。 相似文献
5.
【目的】探究PAX3基因多态性与大别山牛生长性状的相关性。【方法】采集292头安徽大别山成年（24～48月龄）母牛的耳组织,并测定其体尺数据,提取DNA后,通过PCR和测序技术鉴定出大别山牛群体中PAX3基因的多态性,利用POPGENE、Haploview和SHEsis软件,分别对多态位点进行遗传多样性、哈代 温伯格平衡和单倍型分析,利用SPSS 23.0软件分析其与生长性状的相关性。【结果】在大别山牛PAX3基因第4内含子中检测到3个SNPs位点（g.4718G>C、g.4744T>C和g.4757C>A）,第6内含子中检测到1个SNPs位点（g.78920C>T）,4个SNPs位点均存在3种基因型。遗传多样性分析发现,g.4718G>C位点属于低度多态（PIC≤0.25）,g.4744T>C、g.4757C>A和g.78920C>T位点均属于中度多态（0.25A外,其余3个位点均处于哈代-温伯格平衡状态（P>0.05）。单倍型分析发现,4个SNPs位点间无强连锁相关（r2<0.33）,形成13种单倍型,其中频率大于0.03的单倍型有6个。相关性分析发现,g.4718G>C位点与大别山牛的十字部高显著相关(P<0.05);g.4744T>C位点与十字部高、腹围和腰角宽极显著相关(P<0.01);g.4757C>A位点与腰角宽显著相关(P<0.05);g.78920C>T位点与腹围极显著相关(P<0.01),与管围显著相关(P<0.05)。【结论】PAX3基因第4内含子的g.4718G>C、g.4744T>C 和g.4757C>A位点以及第6内含子的g.78920C>T位点多态性与大别山牛群体部分生长性状具有显著或极显著的相关性,可以作为大别山牛遗传选育的候选分子标记。 相似文献
6.
I-FABP基因侧翼区多态性与鸡生长和胴体组成性状的相关研究 总被引：1，自引：0，他引：1
本研究以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系第9世代肉仔鸡为试验材料,利用PCR-RFLP法对鸡肠型脂肪酸结合蛋白基因进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,分析该基因多态性与鸡生长和胴体组成性状的关系。统计分析结果表明,该基因c.*822G>A突变位点不同基因型对肉仔鸡5周龄、7周龄体重和屠体重有显著影响(P<0.05),对出生重、1周龄和3周龄体重有一定的影响(P<0.2)。AA基因型个体的5周龄、7周龄体重和屠体重显著高于AG和GG基因型个体(P<0.05)。本研究首次推测I-FABP基因可能是影响鸡体重的主效基因或与影响该性状的主效基因紧密连锁。 相似文献
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【目的】研究苏钟猪TLR4的多态性及其编码区第1 027 bp处突变对TLR4蛋白功能的影响。【方法】采用PCR-SSCP的方法检测TLR4在苏钟猪中的多态性并利用real-time PCR方法检测不同基因型（CC型和AC型）的猪肺泡巨噬细胞经脂多糖（lipopolysaccharide,LPS）诱导后,TLR4及促炎症因子TNF-α、IL-1β表达量的变化情况,探讨该处突变对TLR4识别LPS的影响。【结果】①共检测到3个突变：G962A、C1027A、G960A,其中前两个为有义突变,且C1027A突变可引起编码氨基酸性质的改变;②LPS能快速诱导猪肺泡巨噬细胞中TLR4及促炎症因子TNF-α和IL-1β表达水平上调且TLR4编码区C1027A不同基因型（CC型和AC型）的猪肺泡巨噬细胞（pulmonary alveolar macrophages,PAMs）对LPS的敏感性及反应强度存在显著性差异。【结论】苏钟猪TLR4编码区的序列相对保守、多态含量较低,群体遗传变异程度较小。TLR4编码区C1027A突变能影响TLR4识别LPS的能力,等位基因C为苏钟猪抗革兰阴性菌感染的优势基因。 相似文献
8.
脂蛋白脂酶(LPL)是机体脂质和脂蛋白代谢的关键酶,在脂质代谢、转运和能量代谢方面发挥着重要作用,影响着动物的生长发育。为探讨湘西黄牛LPL基因的分子遗传特征和寻找与生长性状相关的分子标记,采用PCR产物测序的方法检测了湘西黄牛LPL基因的SNP位点,并进行了LPL基因exon 5的g.365458G>A位点进行了群体遗传多态与生长性状的关联分析。SNP检测结果表明,LPL基因在Intron 4上新发现了3个SNP(g.365186A>C、g.365248C>T和g.365249C>T),在exon5的182 bp处检测到了1个SNP(g.365458G>A)。g.365458G>A位点的多态性检测结果表明,g.365458G>A位点存在AA、AG和GG 3种基因型,呈中度多态,且达到了Hardy-Weinberg平衡状态。多态性与生产性状的相关性分析结果表明,湘西黄牛AA基因型个体的体高和胸围显著大于GG基因型个体(P<0.05),AA基因型个体的体长和体重极显著大于GG基因型个体(P<0.01)。A等位基因对湘西黄牛的体高、体长、胸围和体重都为正效应,而G等位基因都为负效应。推测LPL基因exon5的g.365458G>A位点有可能作为湘西黄牛生长性状的分子遗传标记位点。 相似文献
9.
本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性（SNPs）与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊（n=544）、济宁青山羊（n=133）和辽宁绒山羊（n=91）3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与繁殖性状表型（产羔数、初生窝重、断奶窝重）进行关联分析。群体遗传学结果表明,EGR4 g.11029053G> T和g.11029600T> A位点在云上黑山羊中为中度多态（0.25 A位点在3种山羊群体中为低度多态（PIC <0.25）;KDM4C g.37764228T> A位点在济宁青山羊中为中度多态（0.25 A和g.37768026C> G位点在3种山羊群体中为低度多态（PIC <0.25）;KDM6A g.271775... 相似文献
10.
为探究关岭牛TBC1D7(TBC1 domain family,member 7)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism sites,SNPs)对其生长性状的影响。以贵州关岭牛为试验对象,构建DNA混合池,采用PCR扩增后直接测序法对关岭牛TBC1D7基因进行SNPs检测,并对其进行生物信息学分析。结果显示:关岭牛TBC1D7基因蛋白质编码区(CDS)全长882 bp,编码氨基酸293个,形成了一种不稳定的可溶性蛋白。该蛋白中不存在跨膜区域且不存在信号肽,为非分泌蛋白。蛋白中存在6个潜在的N-糖基化位点,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;在关岭牛TBC1D7基因CDS区共发现了4个同义突变位点,分别为c.402T>C、c.414A>G、c.609C>T和c.648T>C。4个突变位点均导致关岭牛TBC1D7基因mRNA二级结构、自由能和基因频率发生变化。本实验筛查到关岭牛TBC1D7基因4个SNPs位点,表明关岭牛TBC1D7基因多态性丰富,为进一步研究TBC1D7基因变异和关岭牛生长发育性状的相关性提供理论基础。 相似文献
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Toll-like receptor (TLR) 4 plays an important role in the innate immune system and has been involved in resistance/ susceptibility to a number of diseases as revealed by studies in human and other domestic animals.Wild boar survives in natural environment without artificial interference and may be different from domestic pig in innate immune system.Here,the complete coding sequence of TLR4 and TLR4A was cloned in wild boar,and two other alternative splicing variants,TLR4B and TLR4C,were obtained.Compared to the counterpart from domestic pig (GenBank No.AJ628065),there were five SNPs,c.510T＞C,c.960A＞G,c.962A＞G,c.1605T＞G and c.1824A＞G,in the coding sequence of wild boar TLR4A gene.TLR4 gene was expressed in all the tissues from wild boar studied with the most abundance in spleen tissue,and mRNA level was significantly lower in spleen from wild boar than that from Min pig.The allele distribution was significantly different at polymorphic loci c.962G＞A and c.1027C＞A (p＜0.01) between wild boar and Min pig.The results would contribute to understand the innate immune system in wild boar. 相似文献
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【目的】探讨五指山小型猪近交系主动脉内皮细胞体外分离培养和鉴定的方法,研究LPS对内皮细胞TLR2表达的影响及TLR2介导内皮细胞炎症因子的表达情况。【方法】以3—4月龄的五指山小型猪近交系为试验材料,取其胸腹主动脉,采用0.1%I型胶原酶消化分离主动脉内皮细胞。利用细胞吸收DiI-Ac-LDL试验和流式细胞仪检测CD31的特异表达两种方法进行内皮细胞的鉴定。1 μg•mL-1LPS刺激内皮细胞0、6、8和12 h,实时荧光定量PCR检测TLR2和TLR4的表达量;1 μg•mL-1LPS刺激内皮细胞12 h后,10 μg•mL-1LTA孵育0、6和12 h,实时荧光定量PCR检测炎症因子IL-6、IL-8和黏附分子ICAM-1的表达量。【结果】分离得到的主动脉内皮细胞呈铺路石样整齐排列,且生长状态良好;细胞膜上表达CD31分子和Ac-LDL的受体,证实分离得到的细胞是血管内皮细胞。LPS刺激后细胞TLR2 mRNA水平的表达量明显升高（P＜0.05）,而TLR4 mRNA水平表达量无明显变化。添加LTA孵育后,细胞炎症因子IL-6、IL-8和黏附分子ICAM-1的mRNA水平表达量较对照明显升高（P＜0.05）。【结论】成功建立了五指山小型猪近交系主动脉内皮细胞体外培养模型,并检测到TLR2在LPS刺激内皮细胞后表达量升高,能够介导细胞炎症相关因子的表达。 相似文献
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The TLR Expression Pattern on Monocyte-Derived Macrophages for Lipopolysaccharid Stimulation of Calves 总被引：1，自引：0，他引：1
GUO Yi-jie ZHAO Guo-Qi HUO Yong-jiu Sachi Tana-ka Hisashi Aso Takahiro Yamaguchi 《中国农业科学(英文版)》2009,8(7):864-871
In this paper, toll-like receptor expression pattern in monocytes-derived macrophages by lipopolysaccharid （LPS） stimulation was examined. Jugular venous blood samples from 4 Japanese calves were obtained and the peripheral blood mononuclear cells （PBMC） were isolated. The PBMC were cultured for 7 d so as to collect monocytes-derived macrophages in Repcell. The PBMC were stimulated by LPS for 24 h and the mRNA expression pattern of TLR and cytokines in monocytes-derived macrophages （Mod-Mφ） was analyzed. Results showed that LPS stimulation of Mod-Mφ could increase the mRNA levels of the genes of TNF-α, IL-6, and IL-8. In addition, the mRNA levels of the genes of TNF-α and IL-6 in the group of LPS stimulation were most significantly （P 〈 0.01） higher than those in control group and the mRNA levels of TLR1, 3, 5, 8, and 10 were significantly （P 〈 0.05） decreased after LPS stimulation. There was no difference in the mRNA expressions of TLR2, 4, 6, and 7 between the groups of the control and LPS stimulation. Besides, expression of TLR9 was not found. It suggested that monocytes-derived macrophages could respond to LPS and they might take an important role in the innate immunity. The important function of the cells might contribute to better disease treatment. 相似文献
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MIAO Jin-feng ZHANG Yuan-shu HUANG Guo-qing MA Hai-tian ZOU Si-xiang ZHU Yu-min 《中国农业科学(英文版)》2009,8(8):1010-1018
The aim of this study was to evaluate, in rats, the changes in the T helper type 1（Th1）/Th2 radio in mammary glands after an intramammary infusion of lipopolysaccharide （LPS） and to characterize the moderating effects of the polysaccharide nucleic acid of Bacillus Calmette Guerin （BCG-PSN） on the mammary gland. In the control group, the levels of IL-2 and INF-7 mRNA expression increased, whereas IL-4 mRNA expression decreased after LPS challenge. As a consequence, the INF-γ/IL-4 mRNA ratio was significantly higher at 3, 6, and 9 h post-infusion （PI） compared to the control value （0 h; P〈0.01）. BCG-PSN increased mRNA expression of both INF-γ and IL-4 before infusion of LPS. LPS challenge significantly the reduced Th1/Th2 cytokine ratio due to Thl cytokine IFN-γ suppression and Th2 cytokine IL-4 upregulation compared with the control group. A significant reduction of N-acetyl-β-D-glucosaminidase （NAGase） was observed at 24 h PI in the BCG-PSN treatment group compared to the control group （P〈 0.05）. Thus, it was demonstrated that level of BCG-PSN might change the Th1/Th2 ratio mainly by enhancing the Th2 immune response. This is the first report of a Th1/Th2 change induced by coliform mastitis and characterization of the effect of BCG-PSN on mammary gland inflammation. This study makes a better understanding of the mechanisms of coliform mastitis and provides a putative novel strategy for the prevention and/or treatment of mastitis. 相似文献
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Peng G Guo Z Kiniwa Y Voo KS Peng W Fu T Wang DY Li Y Wang HY Wang RF 《Science (New York, N.Y.)》2005,309(5739):1380-1384
CD4+ regulatory T (Treg) cells have a profound ability to suppress host immune responses, yet little is understood about how these cells are regulated. We describe a mechanism linking Toll-like receptor (TLR) 8 signaling to the control of Treg cell function, in which synthetic and natural ligands for human TLR8 can reverse Treg cell function. This effect was independent of dendritic cells but required functional TLR8-MyD88-IRAK4 signaling in Treg cells. Adoptive transfer of TLR8 ligand-stimulated Treg cells into tumor-bearing mice enhanced anti-tumor immunity. These results suggest that TLR8 signaling could play a critical role in controlling immune responses to cancer and other diseases. 相似文献
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为鉴定牛BBOX1基因选择性多聚腺苷酸化的不同变异体及其3'UTR的多态性,采用3'RACE的方法检测出BBOX1基因3个不同3'UTR全长的APA变异体,短APA变异体3'UTR长度为229 bp,长APA变异体3'UTR长度分别为664 bp和678 bp。利用SSCP与测序相结合的方法,在BBOX1基因的3'UTR中检测到10个多态性,其中7个为SNP,分别为c.12TC、c.100AG、c.241TC、c.480TC、c.557TC、c.606TC和c.650TC;3个为插入或缺失突变,分别为c.28_29ins C、c.434_435del GT和c.512_513ins TGC。SNP c.650TC定位在Poly(A)加尾信号PAS3中,使加尾信号序列AAUAAA突变成AACAAA,导致3'UTR长度为678 bp的变异体出现。 相似文献