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甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferase, GPAT)是三酰甘油(triacylglycerol, TAG)生物合成的限速酶,催化TAG生物合成的起始步骤,为多种脂质合成提供了底物,会直接参与到植物的生长发育和抗逆过程。蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)作为豆科模式植物具有基因组小、生长周期短、遗传转化效率高等特点。为了解GPAT基因在苜蓿抗逆尤其是在耐盐中的作用,本研究选择蒺藜苜蓿基因组为研究对象,采用Blastp和Hmm结构域搜索方法,共鉴定出24个mtGPAT基因。根据系统进化、基因结构和结构域差异将其分成3个亚家族。同时染色体定位分析发现,24个mtGPAT基因不均匀分布在7条苜蓿染色体上,每条染色体上分布有2～5个基因。基因表达谱分析表明:蒺藜苜蓿GPAT基因具有器官特异性,并且会参与盐胁迫反应。这些结果可为进一步深入研究蒺藜苜蓿GPAT家族基因的功能提供理论基础。 相似文献
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蒺藜苜蓿全基因组中U-box基因家族的筛选与特征分析 总被引：1，自引：0，他引：1
植物基因组中广泛存在U-box基因,其编码蛋白大部分作为泛素系统中决定底物特异性识别的E3泛素连接酶,广泛地调控植物生长生殖发育以及响应逆境胁迫等过程。本文利用蒺藜苜蓿基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定蒺藜苜蓿U-box家族基因;采用MEGA6软件进行系统进化树分析;通过GSDS在线工具和Mapinspect软件进行基因结构及染色体定位分析;利用已有的蒺藜苜蓿芯片数据进行组织表达和胁迫响应表达分析。结果表明,蒺藜苜蓿基因组中含有41个U-box基因,不均匀地分布于蒺藜苜蓿的8条染色体上。根据结构域组成和系统进化分析将这些U-box蛋白分成6类。基因表达模式分析发现,该家族成员的表达具有一定的组织特异性,并能响应盐、干旱和氮素胁迫。这些研究结果为蒺藜苜蓿U-box基因家族的功能分析奠定了基础。 相似文献
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MADS-box基因家族是植物体内的重要转录因子,它们广泛地调控着植物生长、发育和生殖等过程。本研究以蒺藜苜蓿基因组数据为材料,采用结构域搜索方法,鉴定了138个MADS-box基因。通过序列比对系统进化分析,将它们分成两大类:Ⅰ型(92个)和Ⅱ型(46个)。同时,通过染色体定位分析发现,134个MADS-box基因定位在染色体上,还有4个MADS-box基因定位在尚未完成最终拼接的超长片段上。蒺藜苜蓿的MADS-box基因家族成员之间存在大量的基因重复,特别是Ⅰ型MADS-box基因,通过基因复制,MADS-box基因家族在染色体上形成多个密集的MADS-box基因簇。对蒺藜苜蓿的RNA-seq表达谱数据分析,发现MADS-box基因在心皮组织、花器官等组织中表达量较高,这表明蒺藜苜蓿的MADS-box基因家族广泛地参与苜蓿组织分化、发育以及生殖等过程的调控,这将为进一步揭示MADS-box类转录因子在蒺藜苜蓿中作用机制提供了重要的参考。 相似文献
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甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase, GPAT)是甘油生物合成的限速酶，参与多种脂类的生物合成途径，在植物生长发育和抗逆过程中具有重要作用。为了解GPAT基因在紫花苜蓿(Medicago sativa)应对非生物胁迫过程中的作用，本研究利用生物信息学方法共鉴定出73个紫花苜蓿MsGPATs基因。研究表明，MsGPAT基因在染色体上不均匀分布，大多数基因存在大片段复制现象。系统进化树分析将其分为3个亚组。基因结构和蛋白质保守基序分析表明MsGPAT基因家族成员多数含有2～3个外显子或11～12个外显子，至少含有1个保守基序。顺式作用元件分析表明不同MsGPATs基因含有不同的光、生长素和胁迫应答元件。基因表达谱分析显示，分别有10,5,18个MsGPATs基因积极响应高盐、高碱和混合盐碱胁迫，可作为紫花苜蓿耐盐碱研究的候选基因。 相似文献
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胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA)是一类在种子胚胎发育后期特异表达并受发育阶段及脱水信号调节的脱水保护蛋白,在响应植物干旱、低温、高盐等逆境胁迫中具有重要功能。本研究利用生物信息学手段,在全基因组水平对蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)LEA基因家族进行分析,并对其进化、基因结构、进化压力、染色体定位及基因表达模式进行了系统分析。本研究共筛选出23个蒺藜苜蓿LEA家族基因,可分为8个亚家族。基因定位结果表明,23个蒺藜苜蓿LEA基因分布于除6号染色体外的其他7条染色体上,但分布不均匀;家族成员外显子数目都不超过两个,结构简单。不同组织表达谱分析结果显示,LEA家族基因具有不同的组织表达模式,并受干旱逆境胁迫调控。本研究结果可为蒺藜苜蓿LEA基因家族的功能分析奠定基础。 相似文献
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苜蓿全基因组WRKY转录因子基因的分析 总被引：4，自引：3，他引：1
蒺藜苜蓿的基因组较小,遗传转化相对容易,是国际上广泛用于研究豆科植物的模式植物,其全基因组测序已经完成。WRKY转录因子是近年来在植物中发现的N-端含有WRKYGQK高度保守氨基酸序列的新型转录调控因子, 调节启动子中含W-box元件的调节基因和(/或)功能基因的表达, 从而参与植物的各种防卫反应。本研究以苜蓿基因组序列(Mt2.0)为材料,利用生物信息学方法分析苜蓿全基因组WRKY转录因子基因的数目、种类、系统发生学、保守基序,结果表明,苜蓿中共有28个WRKY基因,其中5个基因含有2个WRKY结构域,共含有33个WRKY结构域,根据其结构域特点可以分为3个大类,同时与水稻WRKY基因进行了比较研究,发现基因数目远少于拟南芥和水稻,同时研究证实苜蓿与水稻WRKY基因的起源和进化关系存在较大差异,显示出苜蓿WRKY进化有其独特的特点,此外分析苜蓿WRKY基因的保守motif共有46个,筛选得到WRKY结构域的5个保守motif。该研究对苜蓿WRKY基因功能的研究及进化具有重要的意义。 相似文献
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脱落酸(ABA)是一种内源性激素,在调节植物的生长发育、非生物胁迫和生物胁迫反应方面发挥着重要作用。Pyrabactin resistance 1-like(PYR/PYL)蛋白在ABA信号传导途径中起核心调控作用。然而,在蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)中并没有关于这个家族的细节。本研究根据拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的14个PYL基因,利用BLAST方法鉴定蒺藜苜蓿基因组中的PYL家族成员。结果表明,鉴定得到14个蒺藜苜蓿PYL基因家族成员,且所有成员均含有PYR-PYL-RCAR-like功能域。预测启动子中的顺式元件发现所有蒺藜苜蓿PYL基因家族成员均含有与胁迫以及激素相关的元件。基因本体论(GO)富集分析与KEGG通路分析显示其主要参与到脱落酸信号通路及对外界刺激的反应。基因表达模式分析显示,其在逆境胁迫下表现出特定的表达模式。本研究为进一步研究蒺藜苜蓿PYL基因奠定了基础。 相似文献
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豆科模式植物蒺藜苜蓿基因组研究进展 总被引：11，自引：0，他引：11
鉴于豆科植物的重要性和特殊性,近年来国际上发起将蒺藜苜蓿作为豆科基因组研究模式植物。由于具有基因组小、染色体数为2×8(2n=16)、生长期短、自花授粉、根瘤固氮、遗传转化效率高、与豆科主要作物亲缘关系较近等特点,蒺藜苜蓿已代替百脉根(Lotus japonicusL.)做为豆科模式植物。国际蒺藜苜蓿基因组研究计划于2001年启动,基因组全序列测定即将完成。目前已经构建了细胞遗传学图谱、物理图谱和遗传图谱,获得EST序列189714条。蒺藜苜蓿基因组长度470Mbp(1C=0.47pg,2C=1.15pg),基因密度7Kbp/基因,平均GC含量33.3%。细胞遗传学分析表明,蒺藜苜蓿染色体基因组分成常染色质和异染色质两个明显的区域,常染色质区富集基因,异染色质区富集大量重复序列。蒺藜苜蓿80%的基因组以异染色质的形式聚集在着丝粒附近。蒺藜苜蓿与苜蓿和豌豆有非常高的共线性关系,与大豆在宏线性水平和微线性水平也有较高的共线性关系,是豆科作物比较基因组研究的好材料,有待在我国开展相关的研究。 相似文献
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CPP （cysteine-rich polycomb-like protein）基因家族是一类小转录因子，广泛存在于除酵母与原核生物外的各种生物体中，在植物生长发育及响应胁迫过程中具有重要作用。截至目前，CPP基因家族已在多个物种中被鉴定和研究，但在豆科模式植物蒺藜苜蓿中还未见报道。本研究采用生物信息学的方法，在蒺藜苜蓿中共鉴定出9个CPP基因。通过与3个物种CPP基因的蛋白序列构建系统发育树，将CPP基因分为3类，MtCPP成员与大豆的亲缘关系更接近。保守结构域分析表明MtCPP转录因子都具有1~2个CXC保守结构域。染色体定位分析得出，9个CPP基因分布在6条染色体上，并鉴定出2对旁系同源基因，均来源于片段重复事件。通过基因芯片技术检测MtCPP基因的表达模式结果显示，MtCPP基因的表达具有一定的时空特异性。MtCPP基因启动子中含有大量与激素以及胁迫相关的顺式作用元件，并且MtCPP2、MtCPP5、MtCPP6和MtCPP7基因具有响应干旱的表达特征，MtCPP2和MtCPP8基因具有响应盐胁迫的功能。该研究可为后期深入解析MtCPP基因家族功能和筛选参与苜蓿抗逆的MtCPP基因奠定基础。 相似文献
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《饲料工业》2019,(18):54-58
应用电感耦合等离子-质谱技术(ICP-MS),建立饲料中钠、镁、铬、锰、铁、铜、锌、砷、硒、镉和铅等元素的测定方法。对饲料样品的前处理方法、仪器工作参数和11种元素标准曲线进行优化;并以加标回收、分析方法比对和重复测试说明方法的准确性和精密性。方法在0～1 000 ng/ml范围内线性良好,仪器检出限为0.557 7～5.072 ng/ml,具有良好的精密度,其回收率在88.1%～104.4%之间,相对标准偏差小于5.0%。同时与原子吸收和原子荧光方法进行比对,测定结果相近。所建立的方法简单、快速,可替代原子吸收和原子荧光方法测定饲料中的11种金属元素,为饲料的质量控制提供理想的元素分析方法。 相似文献
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In experiment 1, 6 pregnant mares received a concentrate that contained a trace mineral premix that provided 14.3 mg Cu, 40 mg Zn, 28 mg Fe, 28 mg Mn, 0.08 mg Co, 0.16 mg I, and 0.16 mg Se/kg concentrate (group A). Seven mares received the same concentrate plus 502 mg Zn and 127 mg Cu once daily (group B). No differences (P > .05) in foal growth data, or Cu, Zn, and Fe concentrations of mare milk, mare serum, or foal serum were observed. In experiment 2, 6 pregnant mares received the same concentrate as group A (group C), and 8 mares received the same concentrate fortified with 4× the trace mineral premix (group D). Group C mares had higher serum Zn concentration at 1 day (P < 0.01) and 56 days (P < 0.04). Group C mares had higher milk Fe concentration at 28 days (P < .01), and group D mares had higher milk Cu concentration at 56 days (P < .01). Group C foals had higher serum Cu concentration at 14 days (P < .03). The results from this study provide no evidence to indicate that supplementing late gestating and lactating mares with higher dietary trace mineral levels than those recommended currently by NRC has any influence on foal growth and development, or on the Cu, Zn, and Fe concentrations of the mare milk, mare serum, or foal serum. 相似文献
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Breed differences for weight (CW), height (CH), and condition score (CS) were estimated from records (n = 12,188) of 2- to 6-yr-old cows (n = 744) from Cycle IV of the U.S. Meat Animal Research Center's Germplasm Evaluation (GPE) Program. Cows were produced from mating Angus and Hereford dams to Angus, Hereford, Charolais, Shorthorn, Galloway, Longhorn, Nellore, Piedmontese, and Salers sires. Samples of Angus and Hereford sires were 1) reference sires born from 1962 through 1970 and 2) 1980s sires born in 1980 through 1987. The mixed model included cow age, season of measurement and their interactions, year of birth, pregnancy-lactation code (PL), and breedgroup as fixed effects for CW and CS. Analyses of weight adjusted for condition score included CS as a linear covariate. The model for CH excluded PL. Random effects were additive genetic and permanent environmental effects associated with the cow. Differences among breed groups were significant (P < 0.05) for all traits and were maintained through maturity with few interchanges in ranking. The order of F1 cows for weight was as follows: Charolais (506 to 635 kg for different ages), Shorthorn and Salers, reciprocal Hereford-Angus (HA) with 1980s sires, Nellore, HA with reference sires, Galloway, Piedmontese, and Longhorn (412 to 525 kg for different ages). Order for height was as follows: Nellore (136 to 140 cm), Charolais, Shorthorn, Salers, HA with 1980s sires, Piedmontese, Longhorn, Galloway and HA with reference sires (126 to 128 cm). Hereford and Angus cows with reference sires were generally lighter than those with 1980s sires. In general, breed differences for height followed those for weight except that F1 Nellore cows were tallest, which may in part be due to Bos taurus-Bos indicus heterosis for size. 相似文献
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液相色谱-串联质谱法测定动物尿液中11种β-受体激动剂残留量的不确定度评估 总被引：1，自引：1，他引：0
采用液相色谱-串联质谱法测定动物尿液中11种β-受体激动剂残留量,对标准溶液、体积、质谱峰面积、浓缩过程及回收率等测定不确定度因素进行了分析,通过评定各不确定度分量及标准不确定度,得出11种β-受体激动剂的扩展不确定度在0.7 ～ 1.1 ng/mL范围内.由各因素对合成不确定度的贡献比分析可知,影响较大的因素为试验回收率及标准溶液浓度. 相似文献
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