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1.
猪在农业和医学领域均具有重要应用价值,利用基因修饰技术能够快速提高猪的经济性状和培育
人类疾病动物模型。CRISPR/Cas9 基因编辑技术具有操作简单、高效和低成本的优势,在猪基因修饰领域具有重
要应用。但 CRISPR/Cas9 易引发基因组结构不稳、大范围染色体重排和基因脱靶等问题,因而具有潜在的生物
安全风险。近年基于 CRISPR/Cas9 开发的碱基编辑技术可以实现单个碱基定向转换,不会导致 DNA 双链断裂,
理论上不会引发插入 / 缺失（Indels）,对基因编辑更精准、更安全。随着碱基编辑工具的不断开发和改良,其
不仅能产生 C → T（A → G）突变,还能产生 C、A 两种碱基的同时突变以及 C → G 突变,增加了应用范围;改
良的碱基编辑工具在保持编辑效率的同时能够降低甚至消除旁侧突变、非 C → T（A → G）突变以及 Indels,使
得碱基编辑技术在猪遗传修饰上具有更加重要的潜在应用价值。综述了不同的碱基编辑系统原理、碱基编辑技
术在基因修饰猪模型构建和猪遗传改良中的应用,以及碱基编辑系统在猪成纤维细胞中的编辑效率和脱靶情况,
以期为开展猪碱基编辑应用实践提供参考。 相似文献
2.
为了解贵大白香猪的遗传多样性及其遗传背景,本文采用PCR测序技术测定了30个个体线粒体DNAD-loop全序列。检测到3种单倍型,包括4个多态位点,其中2次T/C转换、2次A/G转换,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为32.9%、24.8%、15.7%和26.6%,A＋T含量（57.7%）明显高于G＋C含量（42.3%）。D-loop区核苷酸多样性（Pi）为0.00155,平均核苷酸差异数（k）为1.949。与GenBank上收录的其它猪种线粒体DNAD-loop序列比对,未发现共享单倍型,证明贵大白香猪具有独立的母系遗传。 相似文献
3.
《河南农业大学学报》2015,(3)
对西藏16个牦牛类群共367头个体的mt DNA ATP8(Adenosine Triphosphate 8)基因进行克隆及序列分析。结果表明,西藏牦牛mt DNA ATP8基因全长201~203 bp,T、C、A和G 4种核苷酸的平均比例分别为29.3%、23.0%、41.8%和6.0%,A+T含量明显高于G+C,表现出一定的碱基偏倚性;在367头牦牛中,共检测到19个变异位点,其中单一信息位点15个,简约信息位点4个,存在转换和插入2种变异类型,碱基替换中存在转换73次,以A/G、T/C为主,占98.63%;在插入变异类型中以A碱基插入为主;367头牦牛共捡出20种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性指数分别为0.332和0.001 89,说明西藏牦牛具有较贫乏的遗传多样性;聚类分析显示,西藏牦牛可分为2类,其中桑日牦牛、类乌齐牦牛和桑日牦牛为1类,其余牦牛类群为另1类。20种单倍型可以分为2个聚类簇(I和Ⅱ),其中聚类簇I包含17种单倍型,占全部单倍型数的77.27%,包含了本次研究中的所有西藏牦牛类群;聚类簇Ⅱ中有3种单倍型,囊括了除错那、嘉黎、康布和帕里类群外的12个类群,显示西藏牦牛存在2个母系起源。 相似文献
4.
王帅 《湖南农业大学学报(自然科学版)》2013,40(6):92-96
针对倾向错误的PCR技术中不同目的、不同长度基因的诱变种类一直缺乏准确参考的问题,以酵母spt15基因为研究对象,在标准的PCR反应体系中加入不同Mn2+摩尔浓度（0.125,0.250 和0.500 mmol·L-1）进行倾向错误的PCR,扩增spt15不同长度（分别约为200, 500和700 bp）的DNA片段,研究其突变频率,突变碱基数目及突变类型,以分析不同种类的突变所需的最佳条件.研究结果表明：长片段DNA的PCR突变率对Mn2+摩尔浓度更敏感;模板的长度对DNA PCR突变碱基个数也有较为明显的影响,低Mn2+摩尔浓度有利于单突变;Mn2+驱动的突变有明显的倾向性,其中A→G和T→C的突变居多. 相似文献
5.
6.
对贵州麻羊13个个体线粒体DNA细胞色素b基因全序列进行直接测序比对。结果表明,山羊线粒体细胞色素b基因全长为1140bp,T、C、A和G碱基的平均含量分别为26．8％、28．2％、31．9％和13．1％,碱基组成的百分比中显示出G的相对缺乏,A＋T含量（58．7％）比G＋C（41．3％）含量高;总共发现6个变异位点,分别为174、576、594、721、852、1068;观察到3种单倍型;构建了16个山羊个体的N-J树,显示贵州黔北麻羊存在2个母系起源。 相似文献
7.
基于线粒体DNA D-loop 序列的五华三黄鸡遗传多样性及其品种起源研究 总被引：1，自引：0，他引：1
通过PCR产物直接测序法对五华三黄鸡保种群120个个体进行线粒体DNA(mt DNA)D-loop序列测定,研究该品种的遗传多样性和系统进化。结果显示,五华三黄鸡保留着较高水平的遗传多样性。mt DNA D-loop的C+G含量(42.5%)低于T+A含量(57.5%),核苷酸多样性和核苷酸差异均数分别为0.01298±0.00051和6.750。共检测到33个突变位点,均为转换突变,包括23个TC转换和10个AG转换,占分析位点的6.35%。定义了32种单倍型,其中独享型单倍型19个,单倍型多样性为0.913±0.012,遗传距离为0.013±0.003。单倍型类群主要分布在进化枝A、B、C和E,其中B为优势单倍型类群。系统进化分析和进化枝地理分布特征表明,五华三黄鸡有4个母系来源,可能受北方家鸡南迁的影响。 相似文献
8.
对大鲵(Andrias davidianus)2个驯化种群的核DNA进行PCR扩增,获得大鲵核DNA上编码核糖体5.8S rRNA和28S rRNA基因的部分序列和完整的ITS2序列(606 bp)。运用DNA分析软件对大鲵2个驯养种群(重庆水产研究所长寿湖珍稀鱼类繁育中心及广汉珍稀鱼类养殖公司)进行了遗传多样性分析。结果显示,该序列平均T、C、A、G含量分别为15.6%、36.5%、12.5%和35.4%,其中G、C的含量C+G(平均为71.9%)显著高于A、T含量A+T(平均为28.1%)。所测序列中有271个碱基发生颠换,112个碱基发生转换,转换与颠换比值(Si/Sv)为0.41,颠换大于转换。10个体均为单倍型,单倍型多样度(H)均为1.000 0±0.126 0,平均核苷酸差异系数(K)为5.932 1±0.861 4,核苷酸多样性(Pi)为0.631 9±0.013 9。种群遗传分化度(Fst)为0.030 5,中性检验及聚类分析表明2个群体没有分化成单一的群体,2个驯养种群遗传多样性好。 相似文献
9.
采用PCR扩增结合DNA克隆测序技术,分析了斑翅草螽Conocephalus maculates 9个地理种群mtDNA控制区序列的变异及遗传多样性.切除侧翼RNA基因序列后,最终获得的斑翅草螽mtDNA控制区比对后全长为676 bp,平均碱基组成T(37.8％),C(11.7％),A(41.3％)和G(9.1％).共检测到98个可变位点,占总位点数的14.5％,其中,9处碱基插入/缺失,74处转换(40个T/C,34个A/G),50处颠换(18个A/T,11个T/G,15个A/C,6个C/G).共定义46个单倍型,其中,4个为种群间共享单倍型(H02、H05、H08和H10),其余42个为各种群独有单倍型,包括6个种群内共享单倍型(H09、H11、H15、H18、H26和H38).单倍型总数占实验个体总数的69.7％,除四川峨眉山外,其余种群单倍型百分比均＞50％.通过两两地理种群间的FST值差异显著性检验,将这些群体分为4组,分别为SC+CQ,GX+FLB+HN+YN,XZ和HB.以长瓣草螽C.gladiatus、峨眉草螽C.emeiensis、悦鸣草螽C.melaenus、竹草螽C.bambusanus为外群,构建的斑翅草螽mtDNA控制区单倍型NJ法系统树形成3个自举支持度较高的分支,其中,分支A由28种单倍体组成,包括本研究中除四川峨眉山(SC)和重庆万州(CQ)以外的7个种群;分支B由12种单倍体组成,包含除菲律宾拉乌尼翁(FLB)和江西南昌(JX)以外的7个种群;分支C由6种单倍型组成,全部来自西藏林芝(XZ)的单倍型.聚类结果表明,斑翅草螽不同地理种群间的遗传分化并不明显,即使是两两群体间FST值差异显著的群体,也未能形成完全独立的分支. 相似文献
10.
为了揭示长白山区中华蜜蜂种型的分子特点,选取其线粒体DNA（mtDNA）非编码区至COⅡ基因段的序列为研究对象,设计并合成了一种理想的用于扩增中华蜜蜂mtDNA非编码区至COⅡ基因段的引物对E2’/H2’,结果可以获得418bp有效的核酸序列;该序列上A＋T含量占84.45%,而G＋C的含量只有15.55%,序列里长白山区中华蜜蜂与意大利蜜蜂在核苷酸水平上的种间序列相似性为81.71%,并且序列具有丰富的限制性核酸内切酶的酶切位点,其中,52位上的MseⅠ的酶切位点属于长白山区中华蜜蜂的特异酶切位点,53位处出现一个SNP位点,属于由碱基C转换为碱基T的转换型突变,这也进一步证明了蜜蜂mtDNA非编码区是进化速度较快的区域。长白山区中华蜜蜂mtDNA非编码区至COII基因段序列结果已经获得美国国家生物信息（NCBI）网站GenBank的登录号,登录号为FJ494922。 相似文献
11.
李春来 《农业图书情报学刊》2007,19(12):136-137
合格编辑的智能培养是编辑队伍建设中的一个重要课题。编辑智能是编辑人员综合运用各种基础知识、专业技术和整体文化素质去处理审编工作的智慧和才能。合格的编辑必须具备这种智能,才能胜任主编所交付的编辑工作。 相似文献
12.
13.
The molecular structure of a DNA-triostin A complex 总被引：31，自引：0，他引：31
A H Wang G Ughetto G J Quigley T Hakoshima G A van der Marel J H van Boom A Rich 《Science (New York, N.Y.)》1984,225(4667):1115-1121
The molecular structure of triostin A, a cyclic octadepsipeptide antibiotic, has been solved complexed to a DNA double helical fragment with the sequence CGTACG (C, cytosine; G, guanine; T, thymine; A, adenine). The two planar quinoxaline rings of triostin A bis intercalate on the minor groove of the DNA double helix surrounding the CG base pairs at either end. The alanine residues form hydrogen bonds to the guanines. Base stacking in the DNA is perturbed, and the major binding interaction involves a large number of van der Waals contacts between the peptides and the nucleic acid. The adenine residues in the center are in the syn conformation and are paired to thymine through Hoogsteen base pairing. 相似文献
14.
Persistence of the entire Epstein-Barr virus genome integrated into human lymphocyte DNA 总被引：46，自引：0，他引：46
The entire Epstein-Barr virus genome is integrated into Burkitt tumor cell DNA at the terminal direct repeat sequence of the virus. There is no homology between the GC-rich (G, guanine; C, cytosine) terminal repeat and the AT-rich (A, adenine; T, thymine) cell sequences with which it has recombined. More than 15 kilobases of cell DNA have been deleted and 236 base pairs are duplicated at one virus-cell junction site. 相似文献
15.
[目的]为全面认识miRNA的结构属性和miRNA基因识别策略的设计提供帮助。[方法]利用miRNA数据库,借助于相关的生物信息学软件和数据统计软件,对昆虫纲与线虫纲部分物种(黑腹果蝇、暗果蝇、西方蜜蜂、冈比亚疟蚊、秀丽线杆线虫、线虫种)的已知miRNA序列的碱基组成进行统计分析。[结果]6种生物的miRNA序列中,腺嘌呤(A)含量较为稳定,在碱基组成上AU含量高于GC含量。比较同一物种pre-miRNA与mat-miRNA间相同碱基含量发现,除黑腹果蝇pre-miRNA与mat-miRNA在胞嘧啶(C)的含量上存在显著差异外,其余均未见显著差异。[结论]推测miRNA碱基组成上AU含量高可能与其调控基因表达功能和物种的进化关系有关。 相似文献
16.
Echinomycin binding sites on DNA 总被引：25，自引：0，他引：25
The preferred binding sites of echinomycin on DNA can be determined by a method called "footprinting." A 32P end-labeled restriction fragment from pBR322 DNA is protected by binding to echinomycin, and cleaved by a synthetic DNA cleaving reagent, methidiumpropyl--EDTA . Fe(II); the DNA cleavage products are then subjected to high-resolution gel analyses. This method reveals that echinomycin has a binding site size of four base pairs. The strong binding sites for echinomycin contain the central two-base-pair sequence 5'-CG-3'. From an analysis of 15 echinomycin sites on 210 base pairs of DNA, key recognition elements for echinomycin are contained in the sequences (5'-3') ACGT and TCGT (A, adenine; C, cytosine; G, guanine; T, thymine). 相似文献
17.
随着 CRISPR 基因编辑技术的出现,几乎在任何动植物细胞基因组的特定目标位点,DNA 大片段
的“无缝”插入或替换,均可在 CRISPR 核酸酶产生双链切口后,在供体 DNA 存在的情况下,诱导同源定向修
复来实现。目前,这种基于同源重组的 CRISPR 精准基因编辑在农作物基因功能分析和新技术育种中正发挥着
越来越重要的作用。围绕在植物细胞中高效实现同源重组介导的 CRISPR 精准编辑这一目标,简述 CRISPR 精
准编辑依赖的两种主要的基于同源重组的细胞修复机制,即合成依赖的链退火修复机制和非同源末端连接辅助
的单链退火修复机制;在此基础上,详述产生 DNA 双链切口并诱导同源重组定向修复的 CRISPR 核酸酶和供体
DNA/RNA,主要包括 Cas9/12 及其融合蛋白、sgRNA/crRNA 及其修饰物、供体 DNA/RNA 及其修饰物;进而总
结在植物遗传转化中为保障 DNA 双链切口和供体 DNA/RNA 发生的时空一致性以提高同源重组效率,而通常采
用的 CRISPR 组分及供体 DNA/RNA 细胞递送方式;最后从功能基因组学研究和农作物新技术育种等方面,展望
基于同源重组的 CRISPR 精准基因编辑技术的应用前景。 相似文献
18.
基因编辑(geneediting)是生命科学领域目前应用最广泛的技术之一,以其对生物内源基因改变的精确性极大地推动着生命科学的研究进程,而CRISPR技术则是目前适应范围最广、可靠性最高的一类基因编辑技术,与其他技术相比,该技术具有高效、简单等优点.CRISPR等基因编辑技术已在动植物遗传育种、生物医疗等领域广泛应用,... 相似文献
19.
Global Analysis of Cytosine Methylation and Proteome Under Cold Treatment in Brassica napus 
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下载免费PDF全文 WEI Fang ;HU Jie ;CUI Ming-zhu ;ZHANG Yan-hui ;LI Yun-ling ;TIAN Bao-ming 《农业科学学报》2014,13(10):2170-2176
Cytosine methylation/demethylation plays pivotal roles in regulating gene expression at a genome-wide level. However, limited reports are available to reveal correlating changes of cytosine methylation and proteomic expression in Brassica napus so far. Therefore, in the present study, global cytosine methylation and proteome were analysed in B. napus after cold treatment by methylation-sensitive amplified polymorphism （MSAP） and two-dimensional protein electrophoresis technology （2-DE）. The results showed that the lowered genome-wide DNA methylation status was revealed after cold treatment, and about 0.88% of discrepancy in DNA methylation was detected between the non-flowering and flowering plants after cold treatment. Moreover, the 52 significantly up-regulated proteins emerged in comparison with the 36 down-regulated proteins, as well as the 14 proteins exclusively detected in the flowering plants. Intriguingly the 8 specifically expressed proteins in the non-flowering plants disappeared in the flowering plants with cold treatment. Therefore, these present data proved that the correlating changes of cytosine methylation and proteomic expression were evidenced under cold treatment in B. napus. 相似文献
20.
CRISPR-Cas9基因编辑技术是继锌指核酸酶（ZFNs）和TALEN核酸酶（TALENs）之后、可高效定点编辑的第三代基因编辑技术,是目前基因功能研究和遗传疾病治疗等生命科学领域最前沿的基因编辑技术,在植物现代生物技术中占据着很重要的地位,特别是在作物遗传改良方面。作为作物遗传改良育种的有效技术手段,CRISPR-Cas9基因编辑技术为创制特种药材新种质资源特别是专用型品种资源带来了新契机,对于特种药材种质创新具有极其重要的作用。本文对CRISPR-Cas9基因编辑技术在特种药材中的研究与应用进行了综述,以期为特种药材的基因功能研究以及种质创新工作提供良好的研究基础与理论依据。 相似文献