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1.
大豆蛋白质含量相关QTL间的上位效应和QE互作效应 总被引：10，自引：1，他引：10
利用Charleston×东农594重组自交系构建的SSR遗传图谱及混合线性模型方法对2002—2006连续5年的大豆蛋白质含量进行QTL定位,并作加性效应,加性×加性上位互作效应及环境互作效应分析。共检测到10个控制蛋白质含量的QTL,分别位于第B2、C2、D1a、E和N连锁群,其中1个表现为遗传正效应,9个表现为遗传负效应,另检测到15对影响蛋白质含量的加性×加性上位互作效应的QTL,解释该性状总变异的13.75%。环境互作检测中,发现9个QTL与环境存在互作,贡献率达到4.47%。 相似文献
2.
以丰产性好、抗旱力强的栽培大豆晋豆23为母本,山西农家品种半野生大豆灰布支黑豆为父本杂交衍生的447个RIL作为供试群体。将亲本及447个家系分别于2011、2012和2013年采用随机试验种植,按照标准测量叶长、叶宽和叶柄长3个性状,并于2012年8月1日和8月8日和2013年8月2日和8月9日各测量1次叶绿素含量。采用QTLNETwork 2.0混合线性模型分析方法和主基因+多基因混合遗传分离分析法,对大豆叶片性状和叶绿素含量进行遗传分析和QTL间的上位性和环境互作效应研究。结果表明,叶长受2对加性-加性×加性上位性混合主基因控制,叶宽受3对等效主基因控制,叶柄长受4对加性-加性×加性上位性主基因控制,叶绿素含量受4对加性主基因控制;检测到10个与叶长、叶宽、叶柄长和叶绿素含量相关的QTL,分别位于A1、A2、C2、H_1、L和O染色体。其中2个叶长QTL分别位于C2和L染色体,是2对加性×加性上位互作效应及环境互作效应QTL;3个叶宽加性与环境互作QTL分别位于A2、C2和O染色体;2个叶柄长QTL分别位于L和O染色体;3个叶绿素含量QTL分别位于A1、C2和H_1染色体。叶片性状和叶绿素含量的遗传机制较复杂,加性效应、加性×加性上位互作效应及环境互作效应是大豆叶片性状和叶绿素含量的重要遗传基础。建议大豆分子标记辅助育种中,一方面要考虑起主要作用的QTL,另一方面要注重上位性QTL的影响,这对于性状的遗传和稳定表达具有积极的意义。 相似文献
3.
水稻抽穗期上位效应和QE互作效应的分析 总被引：4，自引：0，他引：4
抽穗期是水稻的重要农艺性状,深入了解其遗传效应对水稻育种实践具有重要现实意义。本研究利用基于明恢86×佳辐占、广陆矮×佳辐占两个重组自交系构建的SSR遗传图谱,应用混合线性模型方法对2003年晚季和2005年早季获得的两季水稻抽穗期数据进行QTL定位,并作加性效应、加性×加性上位互作效应及环境互作效应分析。两个群体共检测到10个控制抽穗期的QTL,分别位于1、2、3、6、7和10号染色体上,仅qHD10(广佳重组自交系中为qHD10-1)在两个群体中同时检测到,另检测到11对具有上位效应的互作位点,其中有5个是加性效应显著的QTL。环境互作检测中,发现明佳重组自交系的qHD10和广佳重组自交系的qHD7与环境存在显著互作,贡献率分别为0.34%和2.32%。本研究表明:两群体的抽穗期性状的遗传受环境因素影响较小,特别是明佳组合,较适合作为分子辅助育种的研究材料。 相似文献
4.
大豆产量及主要农艺性状QTL的上位性互作和环境互作分析 总被引：2，自引：0，他引：2
梁慧珍 余永亮 杨红旗 张海洋 董薇 李彩云 杜华巩鹏涛 刘学义 方宣钧 河南省农业科学院芝麻研究中心 河南郑州 东北油田盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室/东北林业大学盐碱地生物资源环境研究中心 黑龙江哈尔滨 山西省农业科学院经济作物研究所 山西汾阳 海南省热带农业资源开发利用研究所 海南三亚 《作物学报》2014,40(1):37-44
以栽培大豆晋豆23为母本,半野生大豆灰布支黑豆ZDD2315为父本杂交衍生的F2:15和F2:16的447个RIL家系为遗传群体,绘制SSR遗传图谱,采用混合线性模型方法,对2年大豆小区产量及主要农艺性状进行加性QTL、加性×加性上位互作及环境互作分析。结果检测到9个与小区产量、茎粗、有效分枝、主茎节数、株高、结荚高度相关的QTL,分别位于J_2、I、M连锁群上,其中小区产量、茎粗、株高、有效分枝和主茎节数QTL的加性效应为正值,说明增加这些性状的等位基因来源于母本晋豆23。同时,检测到7对影响小区产量、茎粗、株高和结荚高度的加性×加性上位互作效应及环境互作效应的QTL,共发现14个与环境存在互作的QTL。上位效应和QE互作效应对大豆小区产量及主要农艺性状的遗传影响较大。大豆分子标记辅助育种中,既要考虑起主要作用的QTL,又要注重上位性QTL,才有利于性状的稳定表达和遗传。 相似文献
5.
以掖478×丹340的500个F2单株为作图群体,利用混合线性模型的复合区间作图法对397个F2∶3家系在5个生态环境下进行穗长的QTL定位分析。共检测到16个穗长QTL,单个QTL所解释的表型变异在0.15%~6.24%,累计贡献率为47.8%。在16个QTL中有10个与环境发生互作,占62.5%,贡献率在0.48%~3.78%之间。上位性互作检测到4对QTL,未检测到上位性QTL与环境互作。表明穗长受微效多基因的控制,易与环境发生互作,上位性互作在其遗传中起一定作用。 相似文献
6.
水稻粒形性状的上位性和QE互作效应分析 总被引：4，自引：0，他引：4
本研究利用基于明恢86×佳辐占水稻重组自交系(recombinant inbred line,RIL)构建的SSR遗传图谱,总标记数为131.联合两季的稻米粒长(GL)、粒宽(GW)、长宽比(L/W)表型数据,应用混合线性模型方法进行QTL定位,并作加性效应、上位效应以及加性QTL、上位性QTL与环境(QTL-by-environment,QE)的互作效应分析.检测到粒长、粒宽和长宽比的加性效应QTLs分别为6个、4个和4个,贡献率分别为23.67%、21.41%和25.78%;检测到8对粒长的上位性QTLs,5对粒宽的上位性QTLs,2对长宽比的上位性QTLs,贡献率分别为16.75%、22.36%和7.55%;环境互作检测中,发现共有9个加性QTLs和7对上位性QTLs与环境发生了互作.结果表明,上位效应在粒形性状的遗传与加性效应一样起了重要作用,环境互作效应对粒形性状有一定的影响. 相似文献
7.
以掖478×丹340的500个F2单株为作图群体,利用混合线性模型的复合区间作图法对397个F2： 3家系在5个生态环境下进行穗长的QTL定位分析.共检测到16个穗长QTL,单个QTL所解释的表型变异在0.15%～6.24%,累计贡献率为47.8%.在16个QTL中有10个与环境发生互作,占62.5%,贡献率在0.48%～3.78%之间.上位性互作检测到4对QTL,未检测到上位性QTL与环境互作.表明穗长受微效多基因的控制,易与环境发生互作,上位性互作在其遗传中起一定作用. 相似文献
8.
烤烟几种化学成分的QTL初步分析 总被引：9，自引：3，他引：6
以含137个株系的烤烟DH群体(G-28×NC2326)及其亲本为材料, 在以前作图数据的基础上, 新增23个标记。将这些标记数据合并起来构建了包括11个ISSR标记和158个RAPD标记、由27个连锁群组成的烤烟分子标记遗传连锁图, 覆盖长度2 094.6 cM, 相邻标记间的平均图距为15.95 cM。利用4个环境下的试验数据进行了总糖、烟碱、氧化钾3种烟叶化学成分的QTL初步分析, 共检测到7个加性效应QTL和9对加加上位性效应QTL, 其中3个加性QTL和3对上位性QTL存在QTL与环境互作效应(QE)。表明在烤烟总糖、烟碱、氧化钾的遗传控制中除加性效应外, 上位性效应也具有重要作用。对于烟碱、氧化钾检测到加性QTL与环境互作效应, 对于总糖、氧化钾检测到上位性QTL与环境互作效应, 利用这些与环境具有互作效应的QTL进行标记辅助选择时宜考虑特定的环境条件。 相似文献
9.
多种环境下大豆单株粒重QTL的定位与互作分析 总被引：1，自引：0，他引：1
定位大豆单株粒重QTL、分析QTL间的上位效应及QTL与环境互作效应, 有利于大豆单株粒重遗传机理的深入研究。利用147个F2:14~F2:18 RIL群体, 5年2点多环境下以CIM和MIM方法同时定位大豆单株粒重QTL, 检测到17个控制单株粒重的QTL, 分别位于D1a、B1、B2、C2、F、G和A1连锁群上, 贡献率为6.0%~47.9%;用2种方法同时检测到3个QTL, 即qSWPP-DIa-3、qSWPP-F-1和qSWPP-D1a-5, 贡献率为6.3%~38.3%;2年以上同时检测到4个QTL, 即qSWPP-DIa-1、qSWPP-DIa-2、qSWPP-B1-1和qSWPP-G-1, 贡献率为8.1%~47.9%;利用QTLMapper分析QE互作效应和QTL间上位效应, 7种环境下的数据联合分析得到1个QE互作QTL和4对上位效应QTL, 贡献率和加性效应都较小。在分子标记辅助育种中应该同时考虑主效QTL及各微效QTL之间的互作。 相似文献
10.
稻米淀粉黏滞性QTL定位及其G×E互作分析 总被引：4，自引：0，他引：4
用珍汕97B/密阳46构建RIL群体及其遗传图谱,经海南和杭州两地遗传试验,以精米粉RVA谱5个参数特征值PKV、HPV、CPV、BDV和SBV作为研究稻米淀粉黏滞性的指标,运用检测QTL主效应、上位性效应和G×E互作效应的遗传分析方法,进行QTL联合分析。结果表明, (1)在检测到涉及5个性状的9个主效应QTL中,除PKV位于第5染色体qPKV5外,其余8个QTL均位于第6染色体上;(2)5个性状均检测到位于第6染色体RM197-RZ516区间的主效应QTL,很可能它们为同一基因,该基因还与Wx基因处于相同区域;(3)检测到与PKV、HPV、CPV、BDV等4个性状有关的QTL主效基因均表现有G×E互作,且方向一致,在海南试验中有增效作用;(4)还检测到涉及5个性状的10对上位性互作效应,但均未发现有显著的上位性×环境互作效应。 相似文献
11.
Increasing seed oil content is an important breeding goal for Brassica napus L. (B. napus). The identification of quantitative trait loci (QTL) for seed oil content and related traits is important for efficient
selection of B. napus cultivars with high seed oil content. To get better knowledge on these traits, a molecular marker linkage map for B. napus was constructed with a recombinant inbred lines (RIL) population. The length of the map was 1,589 cM with 451 markers distributed
over 25 linkage groups. QTL for seed oil content, seed hull content and seed coat color in three environments were detected
by composite interval mapping (CIM) tests. Eleven QTL accounted for 5.19–13.57% of the variation for seed oil content. Twelve
QTL associated with seed hull content were identified with contribution ranging from 5.80 to 22.71% and four QTL for seed
coat color accounted for 5.23–15.99% of the variation. It is very interesting to found that co-localization between QTL for
the three traits were found on N8. These results indicated the possibility to combine favorable alleles at different QTL to
increase seed oil content, as well as to combine information about the relationship between seed oil content and other traits. 相似文献
12.
A SNP genetic linkage map based on the ‘Hamilton’ by ‘Spencer’ recombinant inbred line population identified QTL for seed isoflavone contents in soybean 
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下载免费PDF全文 Masum Akond Shiming Liu Stella K. Kantartzi Khalid Meksem Nacer Bellaloui David A. Lightfoot Jiazheng Yuan Dechun Wang James Anderson My Abdelmajid Kassem 《Plant Breeding》2015,134(5):580-588
Soybean is one of the most important crops worldwide for its protein and oil as well as the health beneficial phytoestrogens or isoflavone. This study reports a relatively dense single nucleotide polymorphism (SNP)‐based genetic map based on ‘Hamilton’ by ‘Spencer’ recombinant inbred line population and quantitative trait loci (QTL) for seed isoflavone contents. The genetic map is composed of 1502 SNP markers and covers about 1423.72 cM of the soybean genome. Two QTL for seed isoflavone contents have been identified in this population. One major QTL that controlled both daidzein (qDZ1) and total isoflavone contents (qTI1) was found on LG C2 (Chr 6). And a second QTL for glycitein content (qGT1) was identified on the LG G (Chr 18). These two QTL in addition to others identified in soybean could be used in soybean breeding to optimize isoflavone content. This newly assembled soybean linkage map is a useful tool to identify and map QTL for important agronomic traits and enhance the identification of the genes involved in these traits. 相似文献
13.
Gang Chen Jianfeng Geng Mukhlesur Rahman Xueping Liu Jingxing Tu Tingdong Fu Gengyi Li Peter B. E. McVetty M. Tahir 《Euphytica》2010,175(2):161-174
A genetic map was constructed with 353 sequence-related amplified polymorphism and 34 simple sequence repeat markers in oilseed
rape (Brassica napus L.). The map consists of 19 linkage groups and covers 1,868 cM of the rapeseed genome. A recombinant doubled haploid (DH)
population consisting of 150 lines segregating for oil content and other agronomic traits was produced using standard microspore
culture techniques. The DH lines were phenotyped for days to flowering, oil content in the seed, and seed yield at three locations
for 3 years, generating nine environments. Data from each of the environments were analyzed separately to detect quantitative
trait loci (QTL) for these three phenotypic traits. For oil content, 27 QTL were identified on 14 linkage groups; individual
QTL for oil content explained 4.20–30.20% of the total phenotypic variance. For seed yield, 18 QTL on 11 linkage groups were
identified, and the phenotypic variance for seed yield, as explained by a single locus, ranged from 4.61 to 24.44%. Twenty-two
QTL were also detected for days to flowering, and individual loci explained 4.41–48.28% of the total phenotypic variance. 相似文献
14.
Yi-Dan Li Yong-Jun Wang Yi-Ping Tong Ji-Guo Gao Jin-Song Zhang Shou-Yi Chen 《Euphytica》2005,142(1-2):137-142
Phosphorus (P) deficiency is a major abiotic stress that limits plant growth and crop productivity throughout the world. In the present study, 184 recombinant inbred line (RIL) families developed from soybean varieties Kefeng No. 1 and Nanong 1138-2 were used to identify quantitative trait loci (QTL) associated with P deficiency tolerance. Seven traits of plant height (HT), weight of fresh shoot (FSW), weight of fresh root (FRW), weight of dry root (DRW), length of main root (RL), phosphorus content in leaf (LP), phosphorus content in root (RP), were used as parameters to assess the phosphorus deficiency tolerance. The QTL mapping for the seven traits was performed using the program WinQTLCart. Seven QTLs were detected and mapped on two linkage groups for three traits of weight of fresh shoot, phosphorus contents in leaf and in root. The QTLs that had LOD scores more than three were detected for all of the three traits above. Most of the QTLs explained more than 10% of the total variation. The two QTLs for phosphorus content in leaf explained more than 20% of the total variation, respectively. Five QTLs were mapped on linkage group F2, and two on linkage F1. It was suggested that the genes related to phosphorus deficiency tolerance located on linkage group F in soybean.Contributed equally to this work. 相似文献
15.
蛋白质和油分含量是大豆重要的育种目标,蛋白质和油分含量QTL定位和优异等位变异的发掘对大豆分子设计育种具有重要意义。本研究以(垦丰14×垦丰15)×(黑农48×垦丰19)衍生的后代株系为材料,构建含有204个株系的大豆四向重组自交系群体,利用区间作图法,应用前期构建的SSR遗传图谱,对2013、2014和2015年在哈尔滨和克山2地共8个环境下的蛋白质和油分含量进行QTL定位分析。结果表明,8个环境中检测到29个蛋白质含量QTL和39个油分含量QTL。在所定位的蛋白质含量QTL中,有5个能够在2个以上环境被定位到,这些蛋白质含量QTL分布在 A1、D2、J、N和O等6个连锁群上,对表型效应的贡献率为 7.65%~20.08%,其中qPC-A1-1、qPC-D2-1、qPC-J-1和qPC-O-2的贡献率在10%以上。在39个油分含量QTL中,有10个在多环境下被重复检测到,这些QTL分布在8个(A1、A2、B1、D1b、G、I、J、N)连锁群上,对表型效应的贡献率为7.30%~25.68%,其中qOC-A2-1、qOC-B1-1、qOC-G-1和qOC-J-1的贡献率在10%以上。 相似文献
16.
以甘蓝型黄籽油菜GH06和甘蓝型黑籽油菜P174为亲本,通过单粒法连续自交8代构建重组自交系群体,应用SSR标记绘制31个连锁群(LGs)的遗传连锁图谱,图谱总长1437.1 cM,相邻标记间的平均距离为3.89 cM。对4个不同环境下RIL8群体中每个株系籽粒含油量、蛋白质、纤维素和半纤维素含量进行了近红外分析,性状相关性表明含油量与其他3个性状均表现负相关,蛋白质含量与纤维素和半纤维素分别表现负相关和正相关。结合构建的遗传图谱采用复合区间作图法分析4个性状QTL,共检测到26个QTL,分布在N2、N3、N8、N9、N11、N13、N16和N17连锁群上,其中8个含油量QTL可解释表型变异的4.96%~21.83%;6个蛋白含量QTL,可解释表型变异的3.12%~14.28%;4个纤维素含量QTL,可解释表型变异的4.60%~17.29%;8个半纤维素含量QTL,可解释表型变异率的6.66%~16.68%。在N8上,发现有含油量QTL与半纤维素含量QTL重叠的区段。在N9上,发现有纤维素含量QTL与半纤维素含量QTL重叠的区段,上述2个区段重叠QTL加性效应方向相反。本研究认为油菜种子含油量、蛋白质、纤维素和半纤维素属于典型的数量性状,受环境影响较大,与这些QTL紧密相关的分子标记可为下一步分子标记辅助育种提供一定技术支撑。 相似文献
17.
Linseed (Linum usitatissimum L.) is an important oilseed as well as stem fiber crop and rich source of omega-3 fatty acid. The present study aims to develop linkage map based on Indian genotypes and utilize it for mapping QTLs for important agronomic traits. Two diverse parental genotypes (KL-213 and RKY-14) of linseed showed wide range of variability for oil content and yield attributes. These parental genotypes also showed reasonable level of SSR polymorphism (~ 9.0%). The mapping population showed normal distribution of phenotypic traits. One hundred forty-six SSR markers were mapped on 15 linkage groups with marker density ranging from 3 to 18 markers per linkage group at average distance of 14.2 cM. A total of 11 QTLs were identified for six quantitative traits. Three QTLs for capsules/plant, 2 QTLs each for plant height, seeds/capsule and oil content and 1 QTL each for branches/plant and seed weight/plant were detected. Phenotypic variability explained by these QTLs varied from 1 to 15.23%. This study provides framework linkage map of linseed using Indian genotypes, which needs to be enriched further for future application in marker assisted breeding of linseed. 相似文献
18.
小麦穗部性状与单株产量密切相关。本研究以小麦骨干亲本燕大1817与优良品系北农6号衍生的269个重组自交系为材料,通过在北京和河北石家庄的2年田间试验数据,利用本实验室已构建的高密度SNP和SSR遗传连锁图谱进行穗长、穗粒数和穗粒重QTL定位。采用完备复合区间作图法共检测到29个穗部性状加性效应QTL,其中10个穗长QTL分布于1B、2D、3A、3B、4A、5A、5B、6A和7D染色体上,解释的表型变异率为2.96%~9.63%,QSl.cau-4A.2在所有5个环境中均能被检测到,解释的表型变异为5.89%~9.62%,另有7个QTL能在2个或2个以上环境中被检测到;8个穗粒数相关QTL分布于1A、3A、3D、4A和5B染色体上,解释的表型变异为4.06%~11.17%,为单个环境QTL。11个与穗粒重相关QTL分布于1A、1B、2A、2D、3A、4D、5A、5B和6B染色体上,解释的表型变异为2.79%~16.12%,其中QGws.cau-1B、QGws.cau-3A和QGws.cau-6B.2在2个或者2个以上环境中能被检测到。另外,鉴定出6个分布于1A、2D、3A、4A和5B染色体上的QTL富集区段。 相似文献
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Simple sequence repeat markers linked to a major QTL controlling pod shattering in soybean 总被引：3，自引：0，他引：3
H. Funatsuki M. Ishimoto H. Tsuji K. Kawaguchi M. Hajika K. Fujino 《Plant Breeding》2006,125(2):195-197
Shattering of soybean pods prior to harvest leads to a reduction in yield. In order to identify simple sequence repeat (SSR) markers linked to quantitative trait loci (QTLs) conditioning pod shattering, QTL analysis was conducted using an recombinant inbred line (RIL) population segregating for this trait. The degrees of pod‐shattering resistance were evaluated by heat treatment applied to pods harvested from plants in the field and in a growth chamber. Composite interval mapping identified one major QTL between SSR markers Sat_093 and Sat_366 on linkage group J for both environments. The position and the effect of this QTL were confirmed in an F2 population derived from a cross between the pod shattering‐susceptible parental cultivar and a pod shattering‐resistant RIL. The SSR markers linked to the major QTL will be useful for marker‐assisted selection in soybean‐breeding programmes. 相似文献