101份糯玉米自交系的遗传多样性   总被引：1，自引：0，他引：1  

马鹏  王国琴  谷静丛 《贵州农业科学》2014,(12)

为筛选出形态学表现好、遗传距离较远的糯玉米自交系类群,利用 SSR分子标记技术对表型不同的101份糯玉米自交系进行 SSR 分子标记遗传多样性分析。结果表明,30对 SSR 引物筛选出23对多态性好、带型稳定的引物,分布在玉米所有染色体上;共检测出128个条带,108个等位基因,平均每个引物检测出4．7个等位基因;23对引物多态性信息量为0．59～0．94,平均为0．85;SSR 聚类结果将101份糯玉米自交系分为10大类群。  相似文献   

图们江下游地区野生大豆遗传多样性分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

朴向民  刘宪虎  许明子  李美善  孙晓环 《延边大学农学学报》2009,31(1):36-41

利用9对多样性较高的SSR引物分析来自图们江下游地区的36份野生大豆材料的遗传多样性．结果表明，36份材料中，共检测到111个等位基因，每对引物检测出5（8att141）～16个（Satt157），平均每个位点12．3个，平均多态性信息含量（PIC）为0．821，说明图们江下游沿岸的野生大豆具有比较丰富的遗传多样性．聚类分析结果表明，SSR分子标记的结果与品种的地理来源及特性有一定的联系．  相似文献   

利用SSR标记对不同类型抗虫棉品种的遗传多样性分析     

朱四元  陈金湘  刘爱玉  李瑞莲  严跃文  唐海明 《湖南农业大学学报(自然科学版)》2006,32(5):469-472

以97014,BR—S-10和sGK321等14份不同类型的抗虫棉花品种（系沩试验材料,利用SSR分子标记技术,对这些棉花品种（系）的遗传多样性进行了研究．结果表明,从126对SSR引物筛选出的22对引物均能在14份抗虫棉品种（系）中产生明显的扩增差异带,共检测出97个等位基因位点,其中多态性位点69个,多态性比率达71．1％．引物等位位点数在2～7个,平均每对引物为4．4个．利用Jaccard遗传相似系数计算了14份抗虫棉品种（系）的SSR数据的距离矩阵,按UPGMA方法进行聚类,发现14个品种（系）间的遗传距离在0．035～1．056．聚类分析表明,14份棉花品种（系）可分为2大类4亚类,其中,第1大类是以转基因的抗虫棉为主,第Ⅱ大类包括3个品种（系）,分别是中棉所的ISA4ne,BR—S-10和湖南农业大学的97014,这3个品种都为无蜜腺的形态抗虫棉品种,故较早的聚为一类．本研究表明,用SSR分子标记技术分析棉花不同品种间的遗传多样性是町靠的,揭示了抗虫棉花品种种质资源的多样性,大多数品种的遗传基础比较狭窄．  相似文献   

小麦抗麦红吸浆虫品种的遗传多样性分析     

史忠良  仇松英  张松令  谢福来  高炜  张婷  逯腊虎  武计平 《农学学报》2011,1(1):10-16

为了更深入地揭示小麦抗麦红吸浆虫品种（系）的遗传多样性,在田间虫圃对1562份小麦品种（系）损失率鉴定结果的基础上,取47份年度间鉴定抗性结果较为一致的材料,按损失率大小,由小到大排列起来,利用19对多态性SSR标记检测了参试材料的遗传多态性。结果表明,19对SSR标记在47份不同抗性品种中检测到104个等位基因,能够将所有品种区分开来,每对引物可以检测到3-8个等位基因,平均5．47个。47个小麦品种间的遗传距离从0．40～0．95不等,平均为0．71。高抗品种间遗传距离平均为0．66（0．40-0．95）;中抗品种间的遗传距离平均为0．69（0．46～0．90）;感虫品种间的遗传距离平均为0．69（0．53-0．95）;高感品种间的遗传距离平均为0．68（0．41～0．90）。SSR标记聚类分析在遗传距离为0．74处将供试材料分为6大类群。抗虫品种晋麦65号单独聚为一类,同其余品种具有较远的亲缘关系,可作为新的抗源用于抗虫育种,并在吸浆虫发生地块推广种植。  相似文献   

太湖稻区32个水稻品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析     

鈕玉伟  杨志刚  罗兵  孙海燕 《安徽农业科学》2014,42(36):12833-12835,12853

[目的]采用SSR标记构建太湖稻区16个常规粳稻品种和16个杂交水稻品种DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析.[方法]以筛选出的12对多态性高、稳定性好且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,构建太湖稻区32个主要栽植水稻品种DNA指纹图谱,以NTSYS-PCV2.10软件分析遗传多样性.[结果]12对SSR引物在32份材料中共扩增出了47个等位基因,平均每对引物4.7个,变幅2～6个;12对引物的多态性频率（FP）平均值为0.627,变幅0.266～0.833;以遗传相似系数0.74为阚值可将供试32个水稻品种分成4类.[结论]太湖稻区32个水稻品种遗传多样性相对狭窄.  相似文献   

贵州地方耐冷水稻品种的SSR遗传多样性分析   总被引：8，自引：0，他引：8  

余显权  蒋向辉  吴海滨  赵德刚  方宣钧 《西南农业学报》2005,18(1):1-4

用16对SSR引物对11个贵州地方耐冷水稻品种、2个典型的籼稻品种和2个典型的粳稻品种进行遗传多样性分析，在15份材料中共检测到95个等位基因，每一位点的等位基因变幅为4～12个，平均5．9个，其中有效等位基因70个，有效等位基因的百分数为75．8％，多态位点百分率为38％，贵州地方耐冷水稻品种间遗传距离为0．06～0．53。应用NJ法对基于16对SSR标记数据的品种进行聚类分析，结果表明：15份不同材料可分为粳稻组和籼稻组，粳稻组各品种间遗传距离为0．06～0．53，平均遗传距离为0．303，其中贵州地方耐冷水稻品种间的遗传距离为0．21～0．46，籼稻组各品种间遗传距离为0．297～0．377，平均遗传距离为0．329。11个贵州地方耐冷水稻品种除筒恢211外，其他都属粳稻组。用相同SSR标记数据和聚类方法分别对苗期、芽期、孕穗期和开花期耐冷的水稻品种进行聚类分析发现：同一时期耐冷品种在各自聚类图中的排列位置与全部材料聚类时有所不同，但其亲缘关系远近没有变化。结果表明SSR适合贵州地方耐冷水稻品种的遗传多样性研究和籼粳分类。  相似文献   

微卫星标记对籼稻品种遗传多样性分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

杨致荣  李润植  魏兴华 《山西农业科学》2008,36(8)

从水稻全基因组12条染色体上的439对SSR引物中选取30对,对国内外的12个籼稻品种进行遗传多样性研究。结果显示,试验选取的30对SSR引物中有29对具有多态性,多态性位点百分率为96.7%。这些多态性引物在12个材料中共扩增出137条多态性条带,平均每对SSR引物可检测到2～8个等位基因,平均4.7/位点。等位基因有效数(Ae)变幅为1～5.539,平均为3.47。多样性指数中,香浓多样性指数(I)为0～0.819,平均0.651;而Nei基因多样性指数变幅为0～1.907,平均1.3。Nei遗传距离及系统聚类和带型分析结果表明,利用SSR标记可将12份材料分为2个类群,国内和国外两个群体。说明SSR标记在区分水稻品种的生态型及遗传多样性研究方面具有重要作用,进一步证实了SSR标记是研究水稻种质资源分类、地理分布、生态类型的有效手段  相似文献   

葡萄品种资源遗传关系的ISSR分析     

赖呈纯  范丽华  黄贤贵  甘煌灿  谢鸿根  余亚白 《福建农业大学学报(自然科学版)》2014,(1):20-28

利用ISSR分子标记技术对95份葡萄品种（系）资源进行遗传多样性和亲缘关系分析．结果表明,12条引物扩增出160个清晰可辨位点,其中多态性位点147个,多态性为91．88％;95份葡萄资源的平均有效等位基因数1．4326,平均Nei’s基因多样性指数0．2598,平均Shannon信息指数0．3979;品种间的遗传相似系数0．55000-0．99375,平均遗传相似系数0．72171;聚类分析结果表明,95份葡萄资源划分为3大类,分别为欧亚种、欧美杂种和东亚种群,这与葡萄传统分类结果一致．  相似文献   

普通野生稻遗传多样性分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

王兴春  杨致荣  魏兴华 《山西农业科学》2010,38(5):3-6

为了扩大水稻杂交育种中亲本的选择、改变目前遗传基础狭窄的状况,试验选用分布于水稻基因组的12条染色体上的30对SSR引物,对国内外的20份普通野生稻进行遗传多样性研究。结果显示,试验选取的30对SSR引物均具有多态性,多态性位点百分率为100%;这些多态性引物在20份材料中共扩增出220条多态性带,平均每对SSR引物可检测到3～11个等位基因,平均每个位点7.3条。Nei遗传距离及系统聚类和带型分析结果表明,在Nei遗传距离为1.3处可将20份材料分为3个类群,即2个国外群体和1个国内群体;同一生态型的稻种基本聚为一类,个别不同生态型的稻种由于品种间的基因交流,具有相对较近的亲缘关系。说明SSR是一种进行遗传多样性研究切实有效的方法;育种亲本的选择不能仅仅依据生态型。  相似文献   

贵州21份玉米优质种质资源的SSR标记分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

朱英  陶刚  黄永会  刘永翔  祝云芳  刘作易 《农业科学与技术》2013,(11):1578-1582

为建立优质玉米种质资源的指纹图谱,给贵州玉米优良杂交组合的选配提供分子水平上的依据和基础,利用微卫星分子标记（SSR）技术对21份贵州玉米优质种质资源进行了遗传多样性分析。结果显示,共筛选出多态性丰富的20对 SSR 引物,在供试材料中检测出97位基因变异,每对引物检测到等位基因2-11个,平均4.85个。 SSR引物的多态性信息量（PIC）介于0.19-0.78,平均为0.53。UPGMA聚类分析表明,供试材料间遗传距离变幅为0.22-0.63,平均为0.43。  相似文献   

利用SSR标记对高州野生稻遗传多样性的研究   总被引：4，自引：0，他引：4  

李晨  潘大建  毛兴学  涂从勇  周汉钦  范芝兰  李晓芳 《广东农业科学》2005,(6):5-8

利用24对SSR引物比较了来自我国广东高州、江西、福建、云南等地区及东南亚国家共计240份普通野生稻材料的遗传多样性。结果表明,24对引物中平均有17个位点表现出多态性,平均多态位点比率为69%;平均总等位基因数、平均每个位点的等位基因数、多态位点的平均等位基因数分别为51、2.04、2.43个,平均基因多样性为0.8447。指出高州野生稻5个居群间已经出现了较显著的分化,高州镇江镇朋山村普通野生稻的遗传多样性最高。  相似文献   

Development of a Highly Informative Microsatellite （SSR） Marker Framework for Rice （Oryza sativa L.） Genotyping     

JIANG Shu-kun  HUANG Cheng  ZHANG Xi-juan  WANG Jia-yu  CHEN Wen-fu  XU Zheng-jin 《中国农业科学(英文版)》2010,9(12):1697-1704

To select highly informative microsatellite markers （SSRs） and establish a useful genetic SSR framework for rice genotyping, 15 rice （Oryza sativa L.） cultivars including six indica varieties and nine japonica varieties were used to analyze the polymorphism information content （PIC） value of 489 SSR markers. A total of 1 296 alleles were detected by 405 polymorphic markers with an average of 3.2 per locus. The PIC value of each chromosome was ranged from 0.4039 （chromosome 2） to 0.5840 （chromosome 11）. Among the two rice subspecies, indica （0.3685-0.4952） gave a higher PIC value than japonica （0.1326-0.3164） and displayed a higher genetic diversity. Genetic diversity of indica was high on chromosome 12 （0.4952） and low on chromosome 8 （0.3685）, while that for japonica was high on chromosome 11 （0.3164） and low on chromosome 2 （0.1326）. A SSR framework including 141 highly informative markers for genotyping was selected from 199 SSR markers （PIC〉0.50）. Ninety-three SSR markers distributed on 12 chromosomes were found to be related to indica-japonica differentiation. Of these 93 pairs of SSR primers, 17 pairs were considered as core primers （all the japonica varieties have the same specific alleles, while the indica varieties have another specific alleles）, 48 pairs as the second classic primers （all the japonica or indica varieties have the same specific alleles, while the indica or japanica varieties have two or more other specific alleles ） and 28 pairs as the third classic primers （all the japonica and indica varieties have two or more alleles, but the specific alleles are different between japonica and indica）. Thirty-two SSR markers were selected to be highly informative and useful for genetic diversity analysis of japonica varieties. This work provides a lot of useful information of SSR markers for rice breeding programs, especially for genotyping, diversity analysis and genetic mapping.  相似文献   

陕西省水稻种质资源的遗传多样性分析和指纹图谱构建   总被引：1，自引：0，他引：1  

张羽  李新生  冯志峰  王胜宝  陈雪燕  莫丹 《西北农业学报》2011,20(12):59-65

对陕西省40份大田推广品种及其亲本和100份省水稻区域试验材料进行遗传多样性分析。结果表明,从陕西省40份大田推广品种及其亲本共检测到160个等位基因,平均每个标记检测到6个等位基因,每个SSR位点的遗传多态性信息含量为0.29～0.97,平均为0.64。聚类分析表明,40份大田推广品种及其亲本的遗传相似系数为0.55～0.97。100份陕西省水稻区域试验材料中,72个晚熟水稻材料的遗传相似系数为0.43～0.91,平均为0.67。28个中早熟水稻材料的遗传相似系数为0.56～0.87。  相似文献   

杂草稻、栽培稻及野生稻的遗传多样性比较   总被引：2，自引：0，他引：2  

王黎明  李战胜  高旭华  沈雪峰  方越  陈勇 《华中农业大学学报》2012,31(3):275-280

用30对SSR引物比较来自不同省区的12份杂草稻、34份栽培稻及36份普通野生稻的遗传多样性,共检测出121个等位变异,每个SSR位点的等位变异数在2～6之间,平均为4.033个。杂草稻、栽培稻和野生稻的遗传多样性指数分别为0.288 2、0.351 5和0.489 9,每个位点在杂草稻、栽培稻、野生稻中的等位基因数平均值分别为2.10、2.27、3.53,说明野生稻的遗传多样性最大。杂草稻与栽培稻之间的遗传距离(0.049 4)明显小于其与普通野生稻间的遗传距离(0.583 8),表明杂草稻与栽培稻亲缘关系较近,而与野生稻的亲缘关系较远,即杂草稻很可能起源于栽培稻的返祖退化。  相似文献   

板栗品种线粒体SSR遗传多样性分析     

张先启  郭献平  刘玉芬  张国庆  王珊珊  刘妍  秦岭  曹庆芹 《北京农学院学报》2012,27(2):17-20

本试验通过对来自水稻和马铃薯的16对具有多态性的线粒体SSR引物进行筛选,得到2对适用于板栗的具有多态性条带的线粒体SSR引物。利用这2对多态性引物对76个板栗品种进行遗传多样性分析。结果表明2个多态性SSR位点检测到4个等位基因,平均每个位点产生2.0个等位基因。应用NTSYS2.10软件中的UPG-MA方法,对数据进行聚类分析,获得板栗资源线粒体SSR聚类图。结果表明:在相似系数0.15处可以将板栗种质资源按亲缘关系分成3组。  相似文献   

黑稻资源遗传多样性的SSR分析     

崔海丽  夏春镗  赵则胜 《勤云标准版测试》2007,(1)

利用24对SSR引物比较了来自中国6个省市的29个黑稻品种的遗传多样性。结果表明,24对引物在上述品种中共检测到76个多态位点;多态位点的等位基因丰度、遗传多样性指数和平均香农指数分别为3.17、0.5287和0.9058,品种间遗传相似系数变异在0.0833-0.9583之间,说明黑稻中存在丰富的遗传多样性。利用品种间的遗传相似系数进行聚类分析,可将29份材料分为3个类群,其SSR分子标记分析表现出一定的地域相关性。  相似文献   

利用SSR标记划分微胚乳超高油玉米的杂种优势群   总被引：4，自引：0，他引：4  

戴罗杰  吴子恺  郝小琴  郑德波  吕凤连  余家安  高雷 《江西农业学报》2009,21(9):1-4

利用SSR分子标记研究了50份微胚乳超高油玉米自交系的遗传变异。从64对SSR引物中,选出扩增带型稳定的58对引物进行遗传多样性分析,共检测出207个多态性条带,涉及58个SSR位点,平均每个位点检测到的等位基因变异数为3.569个,变化范围2~7个;平均PIC值为0.560,变化范围从0.232到0.784。经遗传多样性和聚类分析把供试微胚乳超高油玉米自交系划分为4个类群(8个亚群)。聚类后的群内遗传相似系数大于群间遗传相似系数,这表明所选取的SSR引物可以有效地区分微胚乳超高油玉米自交系的遗传多样性,划分结果是客观合理的。  相似文献   

贵州地方水稻品种“禾”的SSR指纹图谱构建   总被引：5，自引：0，他引：5  

马琳  余显权  赵福胜 《西南农业学报》2010,23(1)

利用SSR标记对24份"禾"品种进行遗传多样性分析,初步建立了其DNA指纹图谱。从145对SSR引物中筛选出21对多态性引物组合,对所有供试材料进行分析,共检测出73个等位基因,平均为3.4762;平均PIC指数为0.4084,范围在0.1175(RM147)~0.6810(RM336)。应用6对引物(RM20A、RM161、RM253、RM280、RM336和RM495)的组合获得了每个品种的SSR特征带,可以将所有供试材料区分开来,从而建立24份"禾"品种的SSR指纹图谱。UPGMA聚类分析表明,在相似系数为0.652处,可将所有材料分为5类,聚类结果表明品种间的亲缘关系与地理来源关系不大。  相似文献   

太湖地区24 份杂交粳稻DNA指纹图谱的构建及遗传相似性分析     

徐港明  孙海燕  顾雯雯  王淑园  罗兵  杨志刚  沈宗根  端木银熙 《广东农业科学》2014,41(20):1-4

利用SSR标记对24份太湖地区杂交粳稻品种初步建立了DNA指纹图谱和进行遗传相似性分析.结果表明:24对引物在研究材料中共检测到105个多态性片段,平均每对引物的多态性片段为4.38个.筛选出5对核心引物(RM336、RM72、RM1195、RM19和RM267)建立了24份材料的DNA指纹图谱.24份材料之间的相似系数变化范围为0.69～0.99,相似系数比较大,表明供试材料的遗传基础多样性相对狭窄.在遗传相似系数0.71水平处可以将24份材料分为3个类群.  相似文献   

应用SSR和ISSR标记分析非AA型野生稻资源的遗传多样性     

张武汉  邓华凤  陈良碧  舒服  何强 《湖南农业科学》2008,(6)

利用SSR、ISSR标记分析了24份非AA型野生稻及4份AA型对照的遗传多样性。结果表明,11对SSR引物共检测到104个多态性片段,平均每个引物扩增多态性片段9.5个。非AA型野生稻的特异性片段74个,占总片段数的71.2%;8个ISSR引物共检测到166个多态性片段,平均每个引物扩增多态性片段20.8个。非AA型野生稻的特异性片段113个,占总片段数的68.7%。两种标记构建的亲缘关系树基本相似。非AA型野生稻遗传多样性丰富,且具有很多独特的性状,可以为水稻育种提供丰富的种质资源。  相似文献