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利用PCR技术扩增青海湖3个不同地区（黑马河，布哈河，沙柳河）的青海湖裸鲤（Cormnocypris przewalskii（Kessler））线粒体D-loop基因片段，测定该基因片段1 005bp序列。通过线粒体基因组D-loop区序列比较分析，对比3个不同地区的83尾青海湖裸鲤的遗传结构进行研究，共检测出多态性位点65个，其中有1个插入位点（b3，nt-569），2个缺失位点（s6和b37，nt-169、nt-170），多态性位点数62。3个群体内的多态性位点分别为黑马河51个、布哈河38个、沙柳河39个，平均核苷酸位点差异数分别为9.377、7.782和7.510。结果表明，不同地区的遗传距离分别为黑马河群体与布哈河群体间的平均遗传距离最小（0.01093），布哈河群体与沙柳河群体次之（0.01423），黑马河群体与沙柳河群体的遗传平均距离最大（0.01909）。3个群体间的遗传平均距离都在0.01以上，而且3个群体间总的遗传分化指数为0.01926，基因流为12.73。UPGMA法构建的分子系统树中，沙柳河群体聚成一支，黑马河和布哈河群体混杂在一起，聚成一支。从序列差异的分析中得出，沙柳河群体与黑马河和布哈河群体的亲缘关系较远；黑马河和布哈河群体亲缘关系较近。以上数据还表明，青海湖裸鲤3个繁殖群体间具有较弱的遗传分化，洄游到同一河流里进行交配繁殖的群体内基因交流作用比较大，而洄游到不同河流进行繁殖的群体间的基因交流相对较小。 相似文献
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对65尾祁连山裸鲤(Gymnocypris chilianensis)和40尾青海湖裸鲤(G.przewalskii)mt DNA cyt b基因(Cytochrome b,cyt b 1140 bp)和D-loop区(747 bp)基因片段进行了扩增和测定,探讨了上述基因片断的序列特征和两种裸鲤的遗传分化关系。结果显示,2个基因片段的G含量普遍较低,在编码基因cyt b各密码子的第三位上表现得尤为突出。线粒体DNA cyt b和D-loop基因片段均存在明显的遗传分化,核苷酸替代速率cyt bDloop。基于核苷酸最佳替换模型计算2种间的遗传距离,cyt b为0.08,D-loop为0.03。基于cyt b基因序列分析结果表明,两物种发生遗传分化的时间在距今约220万年的更新世初期,与青藏高原隆升时期相吻合。 相似文献
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青海湖裸鲤是唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的鲤科鱼类。苯丙氨酸-X-酪氨酸-天冬氨酸(FXYD)家族是一类小分子单跨膜蛋白，具有调节离子通道作用，在多种生物的盐度胁迫和盐度适应中发挥重要作用。笔者基于青海湖裸鲤全基因组数据，利用生物信息学方法，鉴定到16个青海湖裸鲤FXYD(gpFXYD)基因，通过多重序列比对和系统进化分析，16个gpFXYD基因成员分属于5个亚型。共线性分析表明，青海湖裸鲤FXYD基因家族中12个成员起源于全基因组复制，且与斑马鱼FXYD基因存在共线性，推测全基因组复制导致了青海湖裸鲤FXYD基因的加倍。分子进化分析显示，gpFXYD1b/1c和gpFXYD5c/5d基因的进化选择压力(Ka/Ks)>1,表明其在进化过程中受到了正选择，可能发生了适应性进化。不同亚家族在青海湖裸鲤多种组织表达中，gpFXYD1s基因在青海湖裸鲤的心脏和脑组织特异性表达，而gpFXYD7s基因在青海湖裸鲤的脑组织中特异表达，分析gpFXYD基因不同亚型可能在不同组织中发挥功能。组织表达中，gpFXYD5s、gpFXYD6s、gpFXYD11s基因在青海湖裸鲤肾脏和鳃组织中出现显著... 相似文献
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为探究青海湖裸鲤在盐碱耐受过程中的基因表达变化，对青海湖河口水域以及入湖淡水河——泉吉河中的青海湖裸鲤的鳃、肾脏组织进行转录组测序，筛选青海湖裸鲤耐盐碱过程中发挥作用的免疫、代谢、渗透相关基因。结果显示，使用Trinity对所有样本质控数据(clean data)进行从头组装后共得到541 429个非冗余的序列(unigene),N50平均长度达612 bp。经差异表达分析发现，共有832个基因在2个区域中的青海湖裸鲤鳃、肾脏中共表达。经GO功能注释分析，注释到结合(binding)、细胞过程(cellular process)、代谢过程(metabolic process)、单一生物过程(single-organism process)的DEGs占比较多。KEGG通路分析结果表明，与免疫、代谢、渗透相关的通路得到了富集。根据差异表达基因的GO注释和KEGG信号通路富集分析，实验初步筛选到了青海湖裸鲤渗透相关基因，主要包括钠/钾转运ATP酶(sodium/potassium-transporting, ATPase)、钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶(calcium/calmodulin-d... 相似文献
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为探究青海湖特有珍稀鱼种青海湖裸鲤的盐度适应性机制,对青海湖裸鲤受盐度胁迫后的生长性能进行测定,qPCR检测渗透调节基因Na+/K+/2Cl-共转运蛋白1(NKCC1)基因、Na+/HCO3-共转运蛋白1(NBC1)基因、Na+/H+交换离子1(NHE1)基因和水通道蛋白1(AQP1)基因的表达。试验结果显示：不同盐度下青海湖裸鲤的各项生长指标存在显著差异(P<0.05);盐度的升高影响了青海湖裸鲤的生长发育,青海湖裸鲤的生长状况与盐度呈负相关关系。NKCC1、NBC1、NHE1、AQP1基因在不同盐度处理组青海湖裸鲤的鳃、肾脏和肝脏中均有表达,且表现出一定的组织特异性;NKCC1、NBC1、NHE1、AQP1基因参与了青海湖裸鲤机体内、外渗透压的调节,且因盐度、组织和胁迫时间的不同而表达水平也不同,反映出鳃和肾脏为主要的渗透压调节器官。本试验结果将为探讨青海湖裸鲤洄游后的生存状况及其盐度适应机制提供理论依... 相似文献
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青海湖裸鲤繁殖群体遗传多样性的RAPD分析 总被引：19，自引：0，他引：19
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对青海湖裸鲤的3个洄游繁殖群体-黑马河(HM)、布哈河(BH)及沙柳河(SL)群体各30个个体的DNA多态性进行了分析。用13个引物在三个群体中共检测出85个位点,其中多态性位点68个。青海湖裸鲤群体总的DNA多态位点百分率为80．0％。数据分析结果显示：青海湖裸鲤3个群体总的Nei基因多样性为0．3395,Shannon遗传多样性信息指数为0．4861,存在着较为丰富的遗传多样性。青海湖裸鲤3个群体间平均遗传距离为0．0788,基因分化系数Gst为0．1070,表明3个繁殖群体间产生了一定程度的遗传分化,通过UPGMA方法进行聚类分析显示,HM群体和BH群体优先聚类,表示它们之间的基因交流程度要高于它们分别与SL群体之间的交流。 相似文献
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青海湖是我国最大的内陆咸水湖,位于青藏高原东北部,海拔高,湖区生存鱼类主要为青海湖裸鲤。青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)别名湟鱼,属鲤科、裸鲤属,是青海湖地区主要的经济鱼类。由于青海湖裸鲤特殊的经济价值,造成过度捕捞和湖区生态恶化 相似文献
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青海湖裸鲤主要产卵河流相继断流大量产卵亲鱼被困 总被引：1，自引：0，他引：1
《中国水产》2003,(8)
继今年6月13、14日青海湖地区布哈河、沙柳河发生不同程度地断流后，青海湖又一裸鲤重要产卵河流泉吉河也发生了断流，造成大量洄游产卵亲鱼搁浅被困。每年7月是青海湖裸鲤（又称湟鱼）产卵的最佳时期，而今年7月初又恰逢青海湖地区陆续降雨，泉吉河来水量增加、水位回升、流速加大，极其符合青海湖裸鲤产卵的生态条件，大量亲鱼溯河洄游产卵繁殖。但是，7月5日至6日泉吉河水量突然骤减、水位下降，河道出现大面积断流，造成大量产卵亲鱼被困。据不完全统计，仅在20多个洼坑被困的亲鱼就有近百吨。如不及时采取措施，青海湖裸鲤的再生能力和… 相似文献
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青海湖裸鲤[G.Pr z e w a ls k i iprzewalskii(Kessler)]俗称湟鱼(该鱼彩色照片见彩中插2),是青海省特有鱼类,仅分布于青海湖及其水系中。青海湖裸鲤与泰山赤鳞鱼、富春江鲥鱼、渤海的弓鱼和油鱼并称为我国五大名鱼。由于青海湖裸鲤在青海湖中生长缓慢,加上青海湖地区渐趋干旱,降水量大减,致使青海湖裸鲤产卵场受到严重破坏,加上过量的捕捞和对亲鱼的偷捕现象无法杜绝,青海湖裸鲤种群急剧衰减,使青海湖裸鲤已濒临绝迹。为了保存和发展这一名优水产品,我们在江苏省南通市龙洋水产有限公司开展了室内水泥池培育青海湖裸鲤苗种试验,现将有关… 相似文献
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以青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)为研究对象,采用半定量和定量PCR法研究HCO-3分泌相关基因SLC4(solute carrier family 4)和SLC26(solute carrier family 26)家族slc4a1、slc4a2、slc4a4和slc26a6基因组织分布情况,并对不同盐碱环境下肠道中SLC基因家族的表达情况进行定量分析,揭示青海湖裸鲤适应盐碱环境的肠道调节机制。结果表明,slc4a1、slc4a2、slc4a4和slc26a6基因在青海湖祼鲤鳃、肝脏、肾脏和肠道等多个组织中均有表达,且在肠道中的表达量较高,其中slc26a6在肠道中高表达,而在鳃中表达量极低,表现出组织特异性;在碱度组[盐度1.31±0.02,碳酸盐碱度(30.66±0.08)mmol·L-1]、盐度组[盐度15.02±0.02,碳酸盐碱度(2.12±0.05)mmol·L-1]和湖水组[盐度14.84±0.03,碳酸盐碱度(29.57±0.11)mmol·L-1]青海湖裸鲤肠slc4a1、slc4a2、slc4a4和slc26a6基因的表达量在胁迫4 d过程中均呈现出先升高后回落的现象,其中湖水组裸鲤肠SLC4、SLC26家族基因表达量上调最为明显,尤其是slc26a6基因表达量最高上升为对照组的4.9倍,同时,湖水组裸鲤直肠排泄HCO-3浓度也最高,说明盐碱环境下青海湖裸鲤通过肠道Cl–/HCO-3交换子(slc4a1、slc4a2、slc26a6)、Na+–HCO-3联合转运子(slc4a4)分泌和排泄机体内积累的碱,这一调节途径有助于青海湖裸鲤补偿因水环境中盐碱度升高而造成的渗透及酸碱失衡。 相似文献
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基于线粒体D-loop区与COI基因序列比较分析养殖与野生银鲳群体遗传多样性 总被引：5，自引：1，他引：4
运用线粒体D-loop区与COI基因片段序列比较分析了养殖与野生银鲳群体的遗传多样性。研究结果显示,线粒体D-loop区片段中,A、T、C与G4种核苷酸的平均含量分别为40.00%、30.55%、16.75%和12.70%,A+T的含量为70.55%,明显高于G+C的含量。COI基因片段中,A、T、C和G的平均含量分别为25.85%、33.90%、21.30%和18.85%,A+T的含量(59.75%)同样高于G+C的含量。基于D-loop序列分析所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为19、15、0.895、0.007和2.505。基于COI基因所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为33、17、0.713、0.004和2.239。基于线粒体D-loop区与COI基因片段序列的研究结果均显示,养殖银鲳群体的遗传多样性低于野生群体的遗传多样性。养殖群体基于线粒体D-loop区与COI基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.562与0.571,野生群体基于线粒体D-loop区与COI基因片段分析得出的单倍型多样性分别... 相似文献
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为了解体重对青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)排氨率和排氨量的影响,在21℃左右的水温下,结合对青海湖裸鲤耗氧率和呼吸频率的测定,采用酚盐分光光度法测定并研究了不同体重下青海湖裸鲤的排氨量、排氨率。结果表明:不同体重的青海湖裸鲤在基础呼吸代谢过程中其排氨量方面有极显著的差异(P<0.01)。青海湖裸鲤的排氨量随着体重的增加而增加,呈幂指数关系。不同体重的青海湖裸鲤的排氨率等也有显著差异(P<0.01),随着体重的增加排氨率相对降低。 相似文献
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采用PCR技术对乌克兰鳞鲤、德国镜鲤、框鳞镜鲤、红镜鲤和州河鲤共97尾个体的线粒体DNA D-loop及邻近区段进行了扩增,经测序后获得碱基顺序排列清晰的DNA片段,长度分别为1342、1343、1344 bp。共得到8种单倍型(GenBank序列号为MG786481~MG786483,MG786485~MG786487,KC292935,KC292936)。使用Mega 6.0软件计算出5个群体的组内及组间遗传距离,并构建邻接系统树。线粒体DNA D-loop及邻近区段、单独D-loop区段的碱基序列分析结果表明,单倍型Ⅰ至Ⅳ为欧洲血统,碱基差异位点数较多,变异程度较高;单倍型Ⅴ至Ⅷ为亚洲血统,碱基差异位点数较少,变异程度较低。在线粒体DNA D-loop及邻近区段内,德国镜鲤组内平均遗传距离为0.00462,核苷酸多样性指数为0.00458,平均核苷酸差异性为6.150,遗传多样性最大;州河鲤组内的平均遗传距离为0.00065,核苷酸多样性指数为0.00065,平均核苷酸差异性为0.870,遗传多样性最低。 相似文献
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青海湖裸鲤与鲤、鲫、草鱼的随机扩增多态DNA分析 总被引：3，自引：0，他引：3
本文利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对4 种鲤科鱼类,即裂腹鱼亚科的青海湖裸鲤、鲤亚科的鲤和鲫鱼、雅罗鱼亚科的草鱼基因组DN A进行了分析,目的是探讨青海湖裸鲤的系统分类位置.遗传距离指数计算结果显示,鲤亚科2个鱼种间的相似性显著高于青海湖裸鲤和草鱼间的相似性,而裂腹鱼亚科的青海湖裸鲤与另两个鲤亚科三种鱼类之间的差异(0.8769、0.7145、0.6930)明显高于雅罗鱼亚科草鱼与鲤亚科鲤、鲫鱼之间的差异(0.4718、0.5218).在此基础上讨论了RAPD技术适用性的一些问题. 相似文献
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青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii),又名青海湟鱼,属鲤科(Gyprinidae),裂腹鱼亚科(Schizothoracinae),裸鲤属(Gymnocypris),是青海湖水域长期地理隔离所演化而来的冷水性咸水特有鱼种,也是青海湖地区重要的经济鱼类,属国家二类保护鱼类.…… 相似文献