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基于线粒体序列特征的茶树菇及杨柳田头菇分离物快速鉴定 总被引：4，自引：2，他引：2
此试验拟探寻特异的DNA序列,快速鉴定茶树菇（Agrocybe aegerita）及其形态上易混淆种,给种质资源收集及利用提供有效工具。本研究以云南采集到的18个菌株为材料,其中5株为A. aegerita,13个为A. salicacola,并对线粒体小亚基V9区进行序列分析。结果发现A. aegerita比A. salicacola多1个约50碱基的插入片段,而其他序列组成一致。根据此特点,在插入区筛选到1个特异DraⅠ酶切位点。通过对18个菌株V9区PCR产物进行酶切,发现A. aegeritaV9片段能完全被切开,而A. salicacola V9片段则为完整。根据此酶切方法,可以高效鉴定A. aegerita及A. salicacola 2个近似种,为食用菌遗传及育种研究提供了重要的基础。 相似文献
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1株野生茶树菇的鉴定及其母种培养条件研究 总被引：1，自引：1，他引：0
为更好地开发利用茶树菇,同时丰富国内茶树菇种质资源,以采自贵州的1 株野生茶树菇NC1 菌株为材料,对其进行内转录间隔区ITS(internal transcribed spacer)鉴定和母种培养条件研究,包括对菌丝生长的最适碳源、氮源、C/N 比、最适温度、最适pH 等。结果表明：该菌株为柱状田头菇(Agrocybe aegerita),其菌丝生长的最适碳源为玉米淀粉,其次为葡萄糖或果糖,最适氮源为酵母粉,其次为蛋白胨,最适C/N 比为30/1~40/1,最适温度为29℃,最适pH 5.0~6.0。研究结果可为野生茶树菇NC1 菌株进一步驯化栽培和开发利用提供参考。 相似文献
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为了探明茶树菇有性生殖内在分子机制,包括交配极性转换产生的同核体出菇问题。以茶树菇YSG同核体子代为实验菌株,依据基因组注释信息,利用嵌套引物验证B交配位点,设计引物扩增同核体群体,获得的扩增谱与菌株交配型进行比对。结果表明：（1）同核体培养后出现3种类型,菌丝型、无盖型和菌柄型,后两种为畸形子实体,不进行有性生殖;（2）依据交配位点B设计的引物扩增谱显示,B交配位点完整遗传到子代菌株中,没有观察到重组事件发生;（3）交配型分析显示,该B交配位点决定菌株的交配型,没有新的交配极性出现。本研究推断供试菌株茶树菇YSG同核体只包含一个B交配位点,结果与已报道的3个亚位点不同。这些结果差异是否由于类群差异造成,还需要更多的出菇实验及交配位点鉴定予以确认。 相似文献
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在真核细胞中,线粒体是氧化磷酸化的发生部位。它广泛存在于生物体中,具有独立的遗传物质DNA,能够参与细胞质遗传。目前金针菇线粒体基因组已经被解析,但其在不同菌株中的多态性仍未见报道。本研究结合已经公布的金针菇菌株4019-20线粒体基因组,组装和注释了重测序的3株金针菇(6-3,6-21, L22)线粒体序列。基因组比较分析表明：金针菇线粒体基因组长度在87 646～88 508 bp,编码蛋白数量均为15个,编码tRNA数目为26个,编码rRNA大亚基和小亚基的基因各1个。除4019-20菌株含有9个内含子外,其余菌株均含有10个内含子。进一步对四株金针菇线粒体基因组结构共线性分析,结果表明,在4个菌株中含有4个差异片段,其中差异片段Ⅰ为cox1基因第4内含子(菌株4019-20缺失)。同时,我们还检测到金针菇线粒体基因组中有两个片段存在移位现象,在移位位点处存在～1.6 kb和～2.8 kb的多态性片段。本研究结果能为金针菇线粒体基因组结构和遗传特性研究提供一定数据基础。 相似文献
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《分子植物育种》2021,19(9):2785-2797
水稻抗白叶枯病基因Xa1是一个能对日本白叶枯病优势小种产生专化抗性的R基因,曾被广泛应用于水稻的抗性育种研究。为深入了解Xa1家族成员及其特征,本研究通过生物信息学对Xa1类成员进行系统鉴定,并分析其基本结构特征、染色体定位、序列变异以及系统进化关系等相关特性。结果显示,共鉴定到34个成员,它们都来自稻属植物,这些成员成簇分布在水稻4号染色体上。基本结构特征分析结果表明,Xa1家族成员的DNA、mRNA和CDS长度,以及内含子、外显子和氨基酸数量等偏差较大,但氨基酸残基组成差异不明显;多样性分析发现,氨基酸保守性低,密码子偏好性不强,核苷酸和氨基酸遗传变异较丰富,但大多的变异为无义突变;根据进化关系将家族成员分为五类,其中第五类成员包括LOC102719767共1个基因,它们位于系统树基部,为Xa1类基因进化的祖先类群。本研究初步分析了Xa1基因家族的特征,为后期从中发掘功能性抗白叶枯病基因提供理论支持。 相似文献
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主要杂交稻亲本和抗白叶枯病基因的抗性评价 总被引：3，自引：1，他引：2
测定不同水稻品种对白叶枯病的抗谱,有助于抗病品种的直接利用和通过分子标记辅助选择或基因工程培育抗病品种.本研究利用10个来源于菲律宾的白叶枯菌株对我国目前大面积栽培的16个杂交稻骨干亲本品种、4个明确携有抗白叶枯病基凶的材料和高感白叶枯病材料IR24进行了抗性评价,结果表明:16个杂交稻亲本中对10个菌株全感的品种有7个,抗1个菌株的品种有6个,抗2个菌株的品种2个和抗3个菌株的品种1个.所有16个杂交稻亲本都不能达到蜀恢52721(Xa21)、明恢6323(Xa23)、IRBB3(Xa3)的抗病水平,说明它们不携有这3个广谱抗白叶枯病基因.从抗病的广谱性与强度评价,4个抗病基因的抗病效果强弱依次为Xa23、Xa21、Xa3、Xa4;10个白叶枯菌株的致病力强弱顺序为:P6＞P7＞P2＞P8＞P3＞P1＞P10＞P4＞P5＞P9;筛选出适合抗性基因Xa3、Xa4的鉴别菌株P1,Xa21、Xa23的鉴别菌株P6. 相似文献
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利用真菌核糖体核苷酸序列信息及RNA二级结构特征对针层孔菌属(Phellinus)复合种进行分类学研究。通过分析国内外已报道的一些针层孔菌属及其近缘属真菌核糖体DNA内转录间隔区(Internal transcribed spacer, ITS)序列、线粒体核糖体小亚基DNA(Mitochondrial small subunit ribosomal DNA, mt SSU rDNA)序列,分别构建系统进化树,并基于最小自由能原理分析RNA二级结构,结果显示松针层孔菌(Phellinus pini)不同菌株的序列差异极小,其可能并非复合种,而火木针层孔菌(Phellinus igniarius)可能包含更多的种,且这些种序列变异较大,其分类地位较复杂。 相似文献
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为提高抗白叶枯病新品种选育效率,减少育种的盲目性,本实验以87份杂交水稻品种为研究对象进行水稻白叶枯病鉴定,同时在基于SSR分子标记技术上进行遗传多样性分析。通过白叶枯病表型聚类和SSR分子标记聚类相结合方式进行分析,选择在抗白叶枯病方面具有优势的亲本。研究结果表明：在以优良不育系望S、粤禾丝苗、Y58S和优良恢复系R301、N111S为亲本的杂交水稻的白叶枯病的等级较低。在遗传多样性分析方面,筛选出36对具有多态性位点的SSR引物,分子量范围为90～200 bp;共扩增出118个等位基因,87份杂交稻品种在不同位点等位基因数目平均为3.3个,范围为2～6个,平均Nei’s基因多样性指数为0.452,变幅为0.096 (SSR03)～0.764 (SSR19)。亲本不育系望S、粤禾丝苗、Y58S和恢复系R301、N111S在选育抗白叶枯新品种时具有一定育种价值,可以为育种家选育抗白叶枯病新品种提供参考。 相似文献
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《Medicinal Plant》2014,(1)
[Objective]To provide molecular theoretical basis for the breeding research of Bletilla Rchb. f. by conducting the analysis of the genetic diversity of its germplasm resources and carrying out an analysis of the kinship of theses 17 samples and their tracks of evolution.[Methods]The genetic distance will be calculated by analyzing these 17 samples through the application of SRAP marker technology and using NTSYSpcV2. 10e Version to analyze data and the UPGMA cluster analysis will also be conducted. [Results]18 primer combinations with good polymorphism from 72 primer combinations are selected. 417 polymorphism bands are generated by expansion. It is showed in the UPGMA cluster analysis that these 17 samples can be divided into three parts. The range of their genetic distance is from 0. 288 1 to 1. 095 6 and the average range is 0. 610 9.[Conclusions] It is proved from this experiment that it is feasible to adopt SRAP technology to carry out research of the diversity of traditional Chinese medicines resources and the analysis of Bletilla Rchb. f provides molecular theoretical basis for its breeding research. 相似文献
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为了研究担子菌单核菌株单一性，通过形态与分子鉴定比对，以期为食用菌的杂交育种及遗传研究提供参考。用单孢稀释法涂布孢子，挑选单孢菌株进行锁状结构观察，判定的“单核菌株”用A和B交配位点进行扩增分析。结果表明：（1）随机挑选的11个单孢菌株中，10个菌株缺少该结构，被判定为单核体，而剩下的1个菌株具有明显的锁状结构，被判定为异核体；（2）依据交配位点A和B设计的引物扩增结果表明3个“单核体”为非单一性菌株，有两种A交配位点，但只有一种B交配位点。根据锁状结构认定的部分“单核体”可能会混有相同A或B交配型的异源菌株，建议单核体的分离采用单孢分离法，并且要结合分子鉴定。 相似文献
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【目的】旨在深入挖掘大丽轮枝菌致病相关基因。【方法】运用转录组测序技术比较分析了强致病力大丽轮枝菌Vd991在侵染陆地棉品种Coker 312早期阶段的基因表达情况。【结果】对Vd991侵染前后的转录组数据进行差异表达分析,共筛选到979个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中376个上调,603个下调。通过基因注释和功能分类发现,这些DEGs涉及细胞增殖与生长、产孢、碳水化合物结合、蛋白激酶活性调节、裂解酶活性、水解酶活性等功能。对上调DEGs进行基因本体(Gene ontology,GO)功能富集分析,发现共有277个GO词条达到显著富集水平(P0.05),涉及生长速率正向调控、核苷酸合成、解旋酶活性等功能;京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析表明,上调DEGs参与53个代谢通路,包括嘧啶代谢、嘌呤代谢等。【结论】在早期侵染过程中,大丽轮枝菌细胞增殖相关基因表现活跃。上述分析为进一步揭示大丽轮枝菌的致病机理提供了有价值的参考。 相似文献
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[Objective] The aim of this study was to explore the quantitative trait locus (QTL) related to the boll weight. [Method] A single seed descended population of 137 recombinant inbred lines (RILs) was developed from the cross of upland cotton (Gossypium hirsutum L.) CCRI 36 and G2005, an introgression inbred line introgressed from G. barbadense. Using restriction-site associated DNA sequencing (RAD-seq), a genetic linkage map composed of 6 434 makers, including 6 295 single nucleotide polymorphisms (SNP) and 139 simple sequence repeat (SSR) markers, was developed from the RILs population. [Result] This map spanned 4 071.98 cM with an average distance of 0.63 cM between adjacent markers. QTL mapping was performed by using boll weight data of five environments through WinQTLCart 2.5 software. Thirty-two QTL, with 4.46%-15.84% explained phenotypic variation related boll weight, were detected and found distributing on 15 chromosomes. qBW-A4-1, qBW-A4-2, qBW-A5-2, qBW-D9-1, and qBW-D9-2 were detected in two environments, which explained 5.07%-15.84% of the phenotypic variation. [Conclusion] Major QTLs detected in this study will provide an important reference for analysis of the genetic mechanism of boll weight. 相似文献
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离子注入线辣椒F2代表型观察及变异分析 总被引：1，自引：0，他引：1
【研究目的】观察离子注入线辣椒种子在F1代诱变产生的生物学效应在F2代的遗传特征。【方法】选取经离子注入后发生生物学诱变的5组F1代线辣椒种子继续在田间播种实验,观察F2代主要表型变化,并通过过氧化物同工酶的测定对离子注入引起生物化学变化进行分析。【结果】种子双面分别注入9×1011 P2+/cm2和1×1012 Cu2+/cm2组（No.21）单株产量在F2代继续保持明显优势,而其他4组F1代的一些生物学优良性状未能在F2代中继续遗传显现。【结论】F1代No.21处理组种子诱变的优良生物学性状在F2代继续得到了遗传,具有进一步选育的价值。 相似文献
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人工栽培石斛的ISSR标记分析 总被引：5，自引：4，他引：5
为了给石斛品种的人工选育和杂交育种提供参考,利用ISSR分子标记技术对9种药用栽培石斛的遗传多样性进行了研究。从备选的引物中筛选出14条多态性引物,共检测到179个多态性位点,多态性比率为94.71%。Jaccard相似性指数显示：15个铁皮石斛样本的相似度介于0.264~0.536之间,6个齿瓣石斛样本的相似度介于0.351~0.561之间,不同种间的相似度介于0.115~0.371之间。虽然种内与种间的相似度值存在一些交叉情况,但UPGMA聚类分析表明,不同种的石斛之间并不存在明显的杂交情况。ISSR标记检测结果显示,源于不同栽培地区栽培的的石斛属植物的遗传多样性非常丰富。 相似文献
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Qiao Wenqing Yan Gentu Shi Jianbin Wang Ning Zhang Yalin Xu Qinghua Zhou Hong Huang Qun 《棉花学报》2019,31(4):282-296
[Objective] This article aims to provide a theoretical basis for molecular marker-assisted breeding by quantitative trait loci (QTLs) mapping and gene function annotation of fiber quality. [Method] F2 populations were constructed using the two cotton cultivars (lines), CCRI 49 and 396289, as parents. Based on high-density genetic maps, the F2:3 families with three environments were included in the F2 population. The QTL mapping of seven fiber quality traits including fineness and maturity, etc., was performed using the Clusters of orthologous groups (COG), Gene ontology (GO), and Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) databases to annotate QTLs for gene function. [Result] A total of 157 QTLs related to fiber quality were obtained and distributed on 20 chromosomes. QTLs with more traits on A03, A04, D02, A11 and D07 chromosomes clustered and may be the key chromosomes controlling fiber quality traits. A total of 13 stable QTLs were obtained, of which qFL-A03-1 and qFin-A11-4 were repeated in three environments, and nine other QTLs were repeated in two environments. And 4 763 candidate genes were annotated, with 2 416, 4 188, and 2 512 genes being annotated in COG, GO, and KEGG, respectively. Among them, 429 genes were annotated in stable QTLs. Some of these genes may be closely related to fiber quality. [Conclusion] The high-density genetic map obtained by high-throughput sequencing can help to obtain more QTLs, which is beneficial to the screening of candidate genes related to fiber quality and the improvement of fiber traits, and improves the breeding efficiency. 相似文献