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谷子核心种质表型遗传多样性分析及综合评价 总被引：17，自引：0，他引：17
通过遗传种质的多样性评估可以指导深入研究资源和育种中优异互补亲本的选择进而提高优异基因的交流累加和新品种培育的效率。本研究选用了来自世界各地的份谷子核心种质通过个表型性状的综合鉴定评估遗传多样性和筛选优异种质资源结果表明我国谷子资源的表型遗传多样性丰富单穗粒重、穗长、穗粗、株高、茎节数和生育期均表现了丰富的变异谷子育成品种遗传多样性相比农家品种下降明显育种的遗传增益主要体现在株高和穗长的适度减低,以及茎粗、茎节数、穗粗、单穗粒重、单穗重及生育期的适度增加系统聚类分析将谷子资源分成类第类以来源为东北欧国家的品种为主第类以北美和非洲的品种为主第类以东亚、南亚的品种为主我国种质可划分为春播型、春夏兼播型和南方型类型采用主成分分析法和逐步回归分析法综合评判表明叶鞘色、刚毛长度、粒色、米色、株高、穗长、茎粗和单穗粒重个性状可作为谷子表型鉴定的主要指标。 相似文献
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为探究粳稻种质资源遗传多样性,提高粳稻育种组合选配的针对性和育种效率,通过变异系数、遗传多样性指数、聚类分析、相关分析、主成分分析、二维排序分析和逐步回归分析方法对不同生态区80份粳稻种质资源的8个表型性状的多样性水平进行了分析。结果表明：8个表型性状的变异系数为11.06%~36.97%,其中,千粒重的变异系数最小,每穗总粒数的变异系数最大;8个表型性状的遗传多样性指数为1.54~2.06,其中,单株有效穗数的遗传多样性指数最高,结实率的遗传多样性指数最低;在欧式距离9.0处,可将80份参试材料分为4类,各类表型性状差异明显;根据主成分分析和综合评价结果,80份粳稻种质资源中贵州的毕大香6号综合性状排名第1位,同时筛选到每穗实粒数、千粒重、株高、穗长和单株有效穗数性状可作为粳稻种质资源综合评价的关键指标;利用主成分二维排序分析筛选到矮秆、大穗、分蘖能力强及结实率高的4类优异种质资源,结合二维排序结果,大方晚糯是在二维排序重叠种质,可作为育种中间材料。同时基于主成分构建了粳稻种质资源的综合评价方程。 相似文献
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中国甘薯主要亲本遗传多样性的ISSR分析 总被引：20，自引：0，他引：20
用ISSR标记分析了中国62份甘薯主要亲本的遗传多样性, 明确了其遗传差异。结果表明, 17个ISSR引物共检测出490条多态性谱带, 平均每条引物检测出28.8条多态性谱带, 说明ISSR标记是评价甘薯遗传多样性的有效途径之一。62份中国甘薯主要亲本遗传距离为0.158~0.924, 平均为0.574, 通过UPGMA法, 可以聚为2大类, 一类为国内自育亲本, 一类为外引亲本, 说明中国甘薯主要亲本遗传多样性较丰富, 其中自育亲本与外引亲本之间遗传距离较远; 亚洲亲本遗传多样性高于非洲和美洲亲本, 并且与其他亲本间遗传距离较远; 亚洲品种中, 中国大陆亲本遗传距离最小, 为0.419, 与来自中国台湾的亲本差异较小, 但与外引亚洲亲本遗传距离较远。因此, 中国在未来甘薯育种中, 可以国内自育亲本与外引亲本以及外引亚洲亲本与外引其他亲本配制组合, 拓宽中国甘薯品种的遗传背景。 相似文献
4.
分析贵州栽培川续断的表型多样性及类群表型特征,为川续断育种合理选配亲本及优异种质资源保存提供参考,本研究对58份川续断种质资源的25个农艺性状、浸出物和川续断皂苷Ⅵ进行测量,对其种质及表型特征进行相关性分析、多样性分析和聚类分析。结果表明,栽培川续断具有丰富的表型多样性,多样性指数在1.091 6～2.068 6之间,其中川续断皂苷Ⅵ含量、地下生物量、主根粗等22个性状多样性指数大于1.9;变异系数在6.03%～57.58%之间,其中浸出物含量、株高、主茎节数变异系数较小;基于各种质表型差异,可将58份种质聚类划分为3个类群,第Ⅱ类群为优质选育目标的最优亲本材料,第Ⅲ类群为高产育种目标的亲本材料。由此可见,贵州栽培川续断种质资源的表型性状变异较大,多样性较丰富;根条数、主根粗、地下生物量、川续断皂苷Ⅵ含量等7个指标是构成种质差异的主要因素;第Ⅱ类群和第Ⅲ类群为贵州川续断育种及种质筛选提供了良好的亲本材料。 相似文献
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大麦农艺性状和子粒支链淀粉的多元分析与评价 总被引：5，自引：2，他引：3
为了解高支链淀粉大麦种质资源的表型特性,以16份高支链淀粉含量的大麦种质资源为材料,通过主成分分析和聚类分析研究了9个主要农艺性状的遗传多样性。结果表明,9个农艺性状中芒长的变异系数最大,为43.26%,单穗粒数次之,子粒粒宽的变异系数最小,为4.76%。主成分分析结果表明,前3个主成分累计贡献率为78.844%,可依次归类为子粒大小控制因子、穗粒数控制因子和株型控制因子。相关性分析结果显示,支链淀粉含量与株高呈极显著负相关。采用类平均法聚类将参试的16份大麦种质资源分为4个大类,第一、二类属于矮秆低产型;第三类的千粒重和芒均最长,可以作为以千粒重为选拔对象的亲本;第四类属于高秆型。为了改良糯大麦种质甘垦5号和C2-1的农艺性状可从第四类材料中选择优异亲本。结合主成分分析和聚类分析,能较好地对参试种质资源主要农艺性状做出综合评价,为高支链淀粉大麦遗传育种提供优良的种质资源,为合理选配亲本提供参考。 相似文献
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宁夏和新疆水稻种质资源表型遗传多样性分析及综合评价 总被引：2，自引：1，他引：1
为了拓宽宁夏水稻种质资源的遗传基础,本研究对193份宁夏及新疆水稻种质资源的表型性状进行了遗传多样性分析与综合评价,结果表明：大部分水稻种质资源呈现出茎节包、叶片不早衰、剑叶角度小、抗倒性强、穗立形状弯曲、落粒性难;14个数量性状的遗传变异均达到了极显著水平,其中单株产量的变异系数最大,为23.8%;遗传多样性指数变幅为1.86~2.08,平均2.02;通过聚类分析将193份水稻种质资源划分为8个类群,大部分种质资源分布在第Ⅰ类群,占比65.3%,第Ⅱ类群占比9.3%,第Ⅲ类群占比20.7%,第Ⅳ-Ⅷ类群共包含9份种质资源,总占比4.7%。通过主成分分析,将14个数量性状指标转换为7个主成分,累积贡献率为90.67%;利用隶属函数与权重对193份水稻种质进行综合评价,获得了可综合评价种质资源农艺性状的D值,排名前5的种质资源均来自宁夏,表现出较好的综合性状,其中以宁218表现最为突出,新疆种质资源新引区2015-13的D值最低,综合性状表现最差;利用逐步回归分析,获得了株高、穗长、每穗实粒数、结实率、一次枝梗数、粒长宽比、单株产量、单穗粒重、千粒重9个关键表型性状指标。本研究剖析了宁夏及新疆水稻种质资源的亲缘关系,探索了水稻农艺性状的综合评价方法,可为拓宽宁夏水稻种质资源的遗传基础提供理论参考。 相似文献
7.
为了系统分析云南籽粒苋种质资源的表型遗传多样性。采用遗传多样性指数、主成分分析、相关分析和聚类分析对104份云南籽粒苋种质资源的30个表型性状进行研究。结果表明,遗传多样性指数最高的质量性状和数量性状分别是主花序形状(1.68)和主花序长度(2.07)。前10个主成分累计贡献率达到73.944%,单株鲜体重与第3、第6、第9主成分极显著正相关,单株粒重与第9主成分极显著正相关。聚类分析将104份种质划分为5类,第Ⅰ类群可为间套种亲本材料,第Ⅱ和Ⅲ类群可为大粒亲本材料,第Ⅳ类群可为优质饲用亲本材料,第Ⅴ类群可为观赏类亲本材料。云南籽粒苋种质资源表型性状具有丰富的遗传多样性,有较大的开发利用潜力。 相似文献
8.
为提高西辽河地区高粱种质资源利用效率,以199份高粱种质资源为材料,运用主成分分析、聚类分析等方法对其16个农艺性状进行综合分析。结果表明,西辽河地区高粱种质资源农艺性状的变异范围在6.51%～53.75%之间,遗传多样性指数变幅介于0.678～2.046之间,株高(53.75%)和穗形(50.06%)的变异系数最大,茎粗(2.027)、穗柄长(2.020)、千粒重(2.046)3个数量性状的遗传多样性指数最大。通过主成分分析将16个农艺性状简化为9个主成分,累计遗传贡献率为86.702%。构建高粱种质资源评价方程,作为评价高粱种质农艺性状的综合指标。通过聚类分析将199份高粱种质划分为四大类群,分别对应早熟矮秆高粱、中早熟紧凑型高粱、中熟抗倒伏高秆高粱以及综合农艺性状优良的育种亲本,可在高粱新品种选育时根据育种需求有目的地选取育种亲本。 相似文献
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硒是人体必需的微量元素,富硒水稻是人类主要的富硒食物,但目前选育的富硒水稻品种极少。本研究筛选出61份富硒籼稻品种,综合应用遗传多样性、主成分分析等方法对其表型性状进行综合评价。结果表明,富硒水稻品种表型性状具有丰富的多样性,质量性状中稻瘟病抗性指数的遗传多样性指数最大,数量性状中有效穗数遗传多样性指数最高。相关分析表明,产量与株高、穗长、每穗总粒数和千粒重显著正相关,与有效穗数显著负相关;水稻籽粒硒含量与直链淀粉含量呈显著负相关。聚类分析可将材料分为4大类群,类群1植株矮、穗短、产量低;类群2含硒高、千粒重大;类群3穗长长、穗粒数高、产量高;类群4胶稠度低、千粒重大。主成分分析表明,13个数量性状提取出5个主成分,分别体现产量和农艺性状综合指标、品质指标、籽粒硒含量指标、穗部特征指标、整精米率指标。整合评价表明,高F值的富硒水稻品种具有产量高等特征。富硒水稻种质资源的遗传多样性丰富,采用多元统计分析方法综合评价富硒水稻种质资源是可行的,本研究结果可为富硒水稻种质资源的保护和利用提供科学依据。 相似文献
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黄淮麦区部分小麦种质资源农艺性状的聚类分析 总被引：8，自引：0，他引：8
小麦遗传资源是小麦育种的重要基础,对小麦遗传多样性的研究不仅有助于种质资源的搜集、管理和利用,也有利于进行核心种质的研究。为了解黄淮麦区种质资源在农艺性状上的遗传多样性,对130份品种（系）的24个农艺性状进行了鉴定。结果表明：24个农艺性状具有较大的变异潜力,在12个数量性状中,变异系数最大的是穗下空节,为48.267,其次是叶夹角,为45.355;变异系数最小的是株高,为8.934。该群体间的欧氏距离变化在2.281～14.242之间,平均值为6.599。聚类分析在欧氏距离为9.200处把供试材料分为10组,各组具有一定的特点,有利于育种亲本选择。 相似文献
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Haizheng Xiong Jun Qin Ainong Shi Beiquan Mou Dianxing Wu Jian Sun Xiaoli Shu Zhixue Wang Weiguo Lu Jianbing Ma Yuejin Weng Wei Yang 《Euphytica》2018,214(1):4
The evolution of species is complex and subtle which always associates with the genetic variation and environment adaption during active/passive spread or migration. In crops, this process is usually driven and influenced by human activities such as domestication, cultivation and immigration. One method to discover this process is to analyze the genetic diversity of those crops in different regions. This research first assessed the similarity and differentiation between genetic diversity of genotype and phenotype in 768 world-wild cowpea germplasm which were collected by USDA and US breeding programs. Totally 1048 genotyping by sequencing (GBS) derived single nucleotide polymorphisms (SNPs) and 17 agronomic traits were used to analyze the genetic diversity, distance, cluster and phylogeny. The group differentiation was analyzed based on both the genotype distances from 1048 SNP markers and the phenotypic (Mahalanobis) distance D2 from 11 traits. A consistent result of diversity in genotype (polymorphism information content, PIC) and phenotype (Shannon and Simpson index) indicated that the East Africa and South Asia sub-continents were the original and secondary regions of cowpea domestication. Both dendrograms built by genetic distance present relationship among different regions, and the Mantel coefficient showed medium correlation level (r = 0.58) between genotype and phenotype. The information of both genotypic and phenotypic differentiations may help us to understand evolution and migration of cowpea more comprehensively and also will inform breeders how to use cowpea germplasm in breeding programs. 相似文献
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山西芝麻种质资源遗传多样性分析 总被引：3，自引：0，他引：3
为了解山西芝麻种质资源遗传多样性,本研究对189份山西芝麻种质资源的10个质量性状和8个数量性状进行遗传多样性分析和聚类分析。结果表明：189份山西芝麻种质资源的表型性状存在较大的遗传差异,质量性状以主茎茸毛量的遗传多样性指数最高,为1.15,以蒴果棱数的变异系数最高,为63.88%;数量性状以节间长度的遗传多样性指数最高,为2.09,以单株产量的变异系数最高,为47.66%;通过聚类分析,将189份山西芝麻种质资源分为4个类群,类群Ⅰ可作为选育八棱、高秆品种的亲本材料,类群Ⅱ为矮秆、短节间特异材料,类群Ⅲ为高产选育目标材料,综合性状较好,可直接作为优异亲本加以利用,类群Ⅳ包含一批单花、高产特异材料。 相似文献
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Genetic diversity constitutes the raw material for plant improvement, and provides protection against genetic vulnerability to biotic and abiotic stresses. Diversity of parental lines of indica hybrid rice in China is not well‐characterized. The major objective of this study was to quantify genetic diversity of Chinese parental lines of hybrid rice via coefficient of parentage (COP). All 100 parental lines of hybrid rice widely used in hybrid breeding and commercial production during 1976–2003 were studied by COP analysis. The mean COP for the 100 parental lines was low (0.056), indicating a potentially high degree of diversity in Chinese hybrid rice breeding. Forty‐nine percent of all pairs of parental lines were completely unrelated by pedigree data. The low mean COP for the parental lines was attributed to a continual incorporation of exotic germplasm (wild rice, japonica and javanica etc.) into the genetic base over time, to the introduction of foreign germplasm from the Philippines (International Rice Research Institute), Korea, the United States, Thailand, and Guyana as breeding stock. The mean COP from 1976 to 1990 was twice as much as that from 1990 to 2003. Cluster analysis was an effective method to discriminate diversity, ten clusters were identified, and maintainer lines, restorer lines and other parental lines with special genetic background were clearly grouped. In addition, restorer lines were further divided into 11 sub‐clusters, which basically was in agreement with hybrid rice breeding. Among ten provinces, Hunan, Sichuan and Fujian were outstanding for breeding 54 of 100 parental lines in hybrid rice production, and the genetic diversity of parental lines in Fujian, Sichuan,Guangxi, Hunan and Jiangsu were all narrower than that in Hubei, Guangdong, Zhejiang and Jiangxi. The result of coefficient of parentage analysis for 100 parental lines may promote the management of parental diversity and hybrid rice breeding in China. 相似文献
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引进马铃薯种质资源在干旱半干旱区的表型性状遗传多样性分析及综合评价 总被引：3，自引：0，他引：3
马铃薯种质资源缺乏,适宜干旱半干旱条件下生长的品种更为紧缺,引进马铃薯种质是丰富种质资源的有效途径。本文采用Shannon-Wiener’s多样性指数及综合得分(F值)对119份从秘鲁国际马铃薯中心引进的马铃薯材料的表型性状(出苗率、株高、茎粗、叶面积、生育期、单株结薯数、单株产量、商品率、干物质含量和块茎长宽比)进行遗传多样性分析及综合评价。结果表明,参试材料的10个表型性状中生育期遗传多样性最为丰富;茎粗、叶面积、生育期、单株结薯数、单株产量、商品率、干物质含量、块茎长宽比对马铃薯种质资源表型性状综合值具有显著影响,这些指标可用于旱作条件下对马铃薯种质资源的综合评价;综合得分F值与所测经济性状(单株产量、商品率、干物质)具显著相关性,可作为马铃薯种质资源的主要评价指标;引进材料中CIP393228.67和CIP 385561.124在干旱区,CIP304350.95、CIP392797.22、CIP388615.22在半干旱区分别表现出较好的丰产稳产特性。这些材料综合评价较好,可有效补充中国马铃薯种质资源。 相似文献
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Geographical patterns of variation for morphological and agronomic characteristics in the chickpea germplasm collection 总被引：5，自引：0，他引：5
Hari D. Upadhyaya 《Euphytica》2003,132(3):343-352
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Octaviano Igor Yelome Kris Audenaert Sofie Landschoot Alexandre Dansi Wouter Vanhove Drissa Silue Patrick Van Damme Geert Haesaert 《Euphytica》2018,214(11):215
To fully exploit the diversity in African rice germplasm and to broaden the gene pool reliable information on the population genetic diversity and phenotypic characteristics is a prerequisite. In this paper, the population structure and genetic diversity of 42 cultivated African rice (Oryza spp.) accessions originating from West Africa (Benin, Mali and Nigeria, Liberia etc.) were investigated using 20 simple sequence repeats (SSR) and 77 amplified fragment length polymorphisms (AFLP). Additionally, field trials were set up to gain insight into phenotypic characteristics that differentiate the genetic populations among rice accessions. The analysis revealed considerably high polymorphisms for SSR markers (PIC mean?=?0.78) in the germplasm studied. A significant association was found between AFLP markers and geographic origin of rice accessions (R?=?0.72). Germplasm structure showed that Oryza sativa accessions were not totally isolated from Oryza glaberrima accessions. The results allowed identification of five O. glaberrima accessions which grouped together with O. sativa accessions, sharing common alleles of 18 loci out of the 20 SSR markers analyzed. Population structure analysis revealed existence of a gene flow between O. sativa and O. glaberrima rice accessions which can be used to combine several interesting traits in breeding programs. Further studies are needed to clarify the contributions of this gene flow to valuable traits such as abiotic and biotic stresses including disease resistance. 相似文献