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相似文献
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1.
利用数量性状基因位点(QTLs)进行分子作图的主要难度是:(1)建立一个从农艺性状上可接受的作图群体,通过这个群体来测定不含非正常分离的微小连锁效应。(2)建立有效的分子标记系,用以测定众多的多态标记基因。本研究的目标是利用基因重组近交系(RI)有效地创建连锁图:(1)创建具有多种农艺性状和纤维性状的陆地棉RI系作图群体;(2)使有效的分子标记系最优化,从而可以快速记录大数量的多态标记基因;(3)在两个RI系的亲本中区分大量的多态标记基因,最终创建分子标记基因和 QTLs的连锁图。试验从F。的9…  相似文献   

2.
小麦7D染色体数量性状基因定位和效应估计的研究   总被引:10,自引:0,他引:10  
李维明 Worl.  AJ 《作物学报》1996,22(6):641-646
综合应用方差分析法、区间定位法和联合定位法将控制抽穗期、有效穗数、小穗数、50粒重和单穗产量等5个性状的6个数量性状基因座(QTL)定位在小麦7D染色体上。其中控制粒重的QTL有2个。这些QTL集中分布在着丝粒附近和染色体长臂的末端两个区域。效应估计结果表明多数QTL的效应是微效的,控制同一个性状(粒重)的两个QTL的效应几乎相等。比较3种QTL定位法的分析结果,方差分析简单有效,且当染色体上只有  相似文献   

3.
水稻许多重要农艺性状都是数量性状,水稻遗传改良的大部分工作就是改良这些数量性状。1980年以后,随着分子标记的出现,水稻高密度遗传连锁图谱的大量绘制,各种作图群体的迅猛构建,功能强大的各种统计学软件的快速开发,全基因组序列测序的完成,特别是多个QTL精细定位和先后克隆,使得我们对数量性状的认识得到了长足的进步,QTL的研究正在走进新时代。  相似文献   

4.
甜瓜基因组学研究进展   总被引:7,自引:0,他引:7  
甜瓜是一种世界性的园艺作物.随着现代生物技术的迅速发展,甜瓜基因组学研究越来越深入,国际葫芦科基因组计划也已经筹备完成即将启动.目前已构建有14张甜瓜遗传图谱,多个重要性状的分子标记及数量性状位点已找到并定位在图中,并开始在葫芦科作物之间进行比较基因组图谱方面的研究.已克隆出枯萎病抗性基因Fom-2,其它农艺性状基因的克隆工作也在陆续开展.本文在甜瓜遗传连锁图谱的构建、重要性状分子标记及OTL定位、比较基因组学及基因克隆等方面分别对其研究进展进行了探讨,以期为我国的甜瓜基因组学研究提供有益的参考.  相似文献   

5.
普通小麦遗传图谱研究现状与展望   总被引:2,自引:0,他引:2  
高密度的小麦遗传连锁图的构建,对分析小麦遗传变异、标记目标性状、数量性状定位和分子辅助选择遗传改良有重要意义.本文对小麦遗传图谱的构建及箕研究概况进行了综述.  相似文献   

6.
数量性状的遗传剖析和分子剖析   总被引:21,自引:3,他引:18  
生物的大多数重要性状都是数量性状, 遗传基础复杂, 遗传研究非常困难。 近20年来, 由于分子生物技术飞速发展, 特别是分子标记技术和大片段DNA克隆和分析技术的出现, 使遗传学开始向阐明人类和一些模式动植物整个基因组的宏伟目标进军, 也使得数量性状 的遗 传剖析(即系统地对各个数量性状基因或QTL的遗传定位和效应分  相似文献   

7.
棉花遗传连锁图谱及其应用研究进展   总被引:1,自引:1,他引:0  
张轲  张正圣 《棉花学报》2008,20(6):460-469
 基于DNA标记的遗传连锁图谱, 是研究植物基因组结构、功能以及进化的重要工具。随着分子标记技术的发明和应用,RFLP,RAPD,AFLP,SSR等多种DNA标记技术被用于棉花遗传连锁图谱的构建以及棉花重要农艺性状基因的定位。本文通过对现有异源四倍体棉种的遗传图谱的分析,发现异源四倍体棉花种间遗传图谱已相对饱和,但所构建陆地棉种内遗传连锁图的基因组覆盖率低;同时QTL定位研究较多,MAS、图位克隆和物理图谱构建工作已经展开。今后棉花遗传图谱的研究任务,一方面是增加现有种间图谱的标记密度,另一方面是构建覆盖陆地棉全基因组的遗传图谱。  相似文献   

8.
高粱重要抗性性状的基因定位研究综述   总被引:3,自引:0,他引:3  
随着完整的覆盖全基因组高密度遗传图谱的构建完成,高粱重要抗性性状包括高粱抗旱性QTL、抗病性QTL和抗虫性QTL,根据相应的分子标记定位于相应的遗传连锁图上,对于高粱抗性机制的生理研究、性状基因的图位克隆、分子标记辅助选择、有利基因的定向转移及基因聚合奠定了基础。  相似文献   

9.
随着棉花基因组学研究的不断深入和遗传图谱的不断饱和,为一些控制棉花重要性状基因的定位提供了便利.将各类分子标记定位于相应的遗传连锁图或染色体上,为研究棉花诸多性状基因的图位克隆、抗性机制的遗传揭示、分子标记辅助选择、有利基因的定向转移及基因聚合育种等奠定了坚实的基础.综述了近年来棉花重要质量性状基因和数量性状基因(QTLs)定位研究的最新进展,并对研究中存在的主要问题进行分析和展望.  相似文献   

10.
为了将已有的大白菜分子遗传图谱和已发表的A基因组参考图谱对应起来,本研究利用国际上发表的大白菜和甘蓝型油菜A基因组特异SSR标记作为锚定标记,重新构建了白菜×芜菁分子遗传图谱。利用双亲和F1对326个SSR标记进行了筛选,共获得86个多态性分子标记。在此基础上整合了已有的400个标记,最终构建了一张由10个连锁群组成,包含了347个标记的分子连锁图谱,图谱总长度为1008.7cM,标记间的平均图距为2.91cM。此图谱上包含了已在A基因组参考图谱上定位的56个SSR标记,分布于10个连锁群上,从而将各个连锁群与参考图谱的连锁群对应起来。每个连锁群上的标记数在25~58个之间,连锁群长度在60.6~177.0cM范围内,平均图距在1.33~4.92cM之间。该图谱为白菜重要性状的遗传定位奠定了良好基础。  相似文献   

11.
基于单粒观察值的胚乳性状QTL图的构建方法   总被引:6,自引:2,他引:4  
谷物胚乳性状是决定谷物品质的一类重要性状。由于胚乳是由雌性的两个极核和雄性的一个精核受精发育而形成的三倍体组织,因此胚乳性状的遗传基础要比通常的二倍体农艺性状复杂得多。本文根据三倍体胚乳性状的数量遗传模型,提出利用分布于染色体上的所有分子标记对胚乳性状数量基因座位(QTL)进行区间作图的极大似然估计方  相似文献   

12.
大豆的许多重要农艺性状和经济性状是受多基因控制的数量性状。针对大豆产量性状、种子品质性状和重要病害的抗性等,综述了近年来大豆数量性状基因座位(quantitative trait locus, QTL)定位研究的进展,并讨论了目前大豆QTL定位研究存在的问题及解决途径。  相似文献   

13.
基于株平均值的胚乳性状QTL作图的极大似然方法   总被引:6,自引:2,他引:4  
徐辰武  王伟  胡治球  孙长森 《作物学报》2005,31(10):1271-1276
根据三倍体胚乳性状的数量遗传模型,发展出一种新的专用于胚乳性状数量基因座位(QTL)区间作图的统计方法。该方法以分离群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒种子胚乳性状的平均值为数据模式,采用基于平均值混合分布理论的极大似然方法进行QTL分析。QTL效应估计通过EM算法实现。由于该方法利用标记基因型内QTL基因型的混合分布特性,因此,它比同样基于株平均值的最小平方QTL分析方法以及迭代重新加权最小平方QTL分析方法具有更高的统计功效和精确度。方法的可行性和有效性通过计算机模拟数据分析得到了进一步验证。  相似文献   

14.
The construction of genetic maps is an expensive and time-consuming process. The breeder is therefore interested in using maps developed from other mapping populations but this is only possible if the genetic structure is similar for the chromosomal regions of interest. In this paper, maps of three populations of sugar beet (Beta vulgaris L.) with common polymorphic marker loci are compared. Maps were constructed with MAPMAKER 3.0 and JOINMAP 2.0. Both mapping programs gave, in general, the same order for common markers. However, the number of common markers was too low to construct a combined map for all chromosomes. For one population, in contrast to the other two, the map constructed with MAPMAKER 3.0 was much longer than that constructed with JOINMAP 2.0. For two of these populations yield traits were also available from different environments. For quantitative trait loci (QTL) analysis of the yield data, the packages MAPMAKER/QTL 1.1 and PLABQTL were used. No QTL common for the two populations could be detected. The program and the version used strongly influenced the estimated positions of QTLs. There was also a strong interaction with environments.  相似文献   

15.
As PCR techniques have developed over the last 15 years, a wealth of new DNA marker technologies have arisen which have enabled the generation of high‐density molecular maps for all the major Brassica crop species. Molecular markers have also been heavily used in analyses of genetic diversity in Brassica crops. The majority of the work utilizing molecular markers in Brassica oilseed breeding has to date been based on genetic mapping using various DNA marker systems in segregating populations generated for specific investigations of particular traits of interest. For numerous qualitative traits, traditional mapping approaches have led to the development of marker‐assisted selection strategies in oilseed Brassica breeding, and in some cases to map‐based cloning of the responsible genes. For quantitative traits, however, it has become apparent that traditional mapping of quantitative trait loci (QTL) is often not sufficient to develop effective markers for trait introgression or for identification of the genes responsible. In this case, allele‐trait association studies in non‐structured genetic populations represent an interesting new approach, provided the degree of gametic phase disequilibrium between the QTL and the marker loci is sufficient. Because Brassica species represent the closest crop plant relatives to the model plant Arabidopsis thaliana, significant progress will be achieved in the coming years through integration of candidate gene approaches in crop brassicas, using the detailed information now available for the Arabidopsis genome. Integration of information from the model plant with the increasing supply of data from physical mapping and sequencing of the diploid Brassica genomes will undoubtedly give great insight into the genetics underlying both simple and complex traits in oilseed rape. This review describes the current use of available genetic marker technologies in oilseed rape breeding and provides an outlook for use of new technologies, including single‐nucleotide polymorphism markers, candidate gene approaches and allele‐trait association studies.  相似文献   

16.
爆裂玉米3个膨爆特性的非条件和条件QTL分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
膨化倍数(PF)、膨化体积(PV)和爆花率(PR)是爆裂玉米的主要品质指标。本研究以普通玉米自交系丹232和爆裂玉米自交系N04杂交构建的259个F2:3家系为定位群体,采用完全随机区组设计在郑州夏播条件下测定了3个膨爆特性指标。利用覆盖玉米10条染色体的183对多态性分子标记构建连锁图,采用复合区间作图(CIM)方法对各性状进行非条件QTL定位分析,采用条件遗传统计软件对PF进行条件QTL分析。3个膨爆特性指标非条件QTL定位共检测出31个QTL,单个QTL的贡献率为3.09% ̄12.46%,累计贡献率为51.90%、77.37%和61.45%。在8个标记区间(占42.11%)同时检测到控制2 ̄3个性状的QTL。加性和部分显性在膨爆特性的遗传中起主要作用,同时存在显性和超显性基因效应。条件QTL定位结果表明,PV和PR以不同方式显著影响PF的QTL表达,PV比PR更重要。  相似文献   

17.
本研究以一个蝴蝶兰杂交组合Phal.462×Phal.20后代为材料,测定其后代群体中88个单株的叶长、叶宽和株幅,并基于已构建的AFLP分子连锁图谱,应用区间作图法对调控这3个性状的基因进行了QTL分析。统计分析结果表明,3个性状在群体中呈连续分布,具有数量性状的典型特征,叶长与株幅之间存在极显著正相关。QTL分析结果表明,在父本中共检测到QTL60个,分布于8个连锁群上,包括控制叶长性状的QTL20个,控制叶宽性状19个,控制株幅性状21个;各QTL的LOD值在3.05~14.78之间,可解释44.1%~89.4%的表型变异。在母本中共检测到QTL28个,分布于五个连锁群上,包括控制叶长性状10个,控制叶宽性状8个,控制株幅性状10个;各QTL的LOD值在3.1~9.24之间,可解释57.7%~76.3%的表型变异。这是蝴蝶兰上首个QTL分析研究,可为今后蝴蝶兰的基因克隆与分子标记辅助育种等提供基础。  相似文献   

18.
作物QTL分析的原理与方法   总被引:5,自引:0,他引:5  
作物的许多性状为数量性状,数量性状基因座(QTL)定位的理论依据是Morgan的连锁遗传规律;定位的群体有初级作图群体、次级作图群体和高级作图群体;分析的方法有零区间作图法、单区间作图法、复合区间作图法、混合线性模型;影响QTL定位精确性的因素有群体的大小、分析方法、QTL的分布及作用模式等。传统的作图群体和作图方法存在一些问题,因此有必要开发新的作图群体、研制新的作图方法,以缩短QTL分析与育种实际应用之间的距离。  相似文献   

19.
叶少平  张启军  李杰勤  赵兵  李平 《作物学报》2005,31(12):1620-1627
用水稻测序品种培矮64s和Nipponbare为亲本构建的含137个SSRs标记的连锁遗传图谱和(培矮64s/Nipponbare)F2群体的180个单株,对水稻的单株有效穗数、穗粒数、穗实粒数、结实率、穗着粒密度、千粒重等6个产量构成性状进行了QTL定位分析。共检测到6个性状的22个QTLs,分布在第1、2、4、5、6、9、10、11、12等9条染色体的14个区域,表型贡献率5.0%-19.3%;相关性较强的性状之间具有较多共同或紧密连锁的QTLs;集中分布的QTLs之间既有同向连锁.对不同水稻群体定位的同源QTL进行了比较,对QTL在染色体上的集中分布,以及用QTL定位结果和生物信息学方法相结合预测基因的英勇等进行了探讨。  相似文献   

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