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1.
基于基因重测序信息的大豆基因靶向CAPS标记开发 总被引：1，自引：0，他引：1
为了开发大豆基因靶向的功能分子标记,本研究采用生物信息学方法分析了大豆基因重测序数据,筛选出酶切位点突变的SNP位点,设计PCR引物163对,选用东北地区主栽品种绥农14的DNA为模板进行PCR扩增,其中139对引物获得大小为400~1 200 bp的特异片段。以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、PI209332、固新野生大豆、科丰1号和南农1138-2的DNA为模板,采用筛选的139对引物进行PCR扩增,对扩增产物进行酶切分析,发现73对引物的PCR产物具有酶切多态性,开发出CAPS标记73个。通过功能注释分析发现,这73个CAPS标记靶向的基因主要参与细胞内亚细胞定位过程、蛋白质的结合与催化以及代谢过程等,与大豆重要农艺性状的形成相关,可以用于大豆品种的鉴定和分子系统进化的研究。 相似文献
2.
来源于长穗偃麦草的基因Lr24对小麦叶锈病具有很高的抗性,本研究旨在开发用于Lr24基因分子标记辅助育种的新的分子标记。从定位于小麦3D染色体的22对SSR、EST-SSR引物中筛选出4对揭示TcLr24多态性的引物,用468株F2抗感群体对这4对引物进一步检测,得到1个与Lr24共分离的EST-SSR标记Xcwem17。对该标记进行测序,并设计了STS引物。用该STS引物及已知的Lr24SCAR引物对试验群体进行验证,两对引物在该F2群体中均表现共分离,且Xcwem17可在TcLr24单基因系和已知含Lr24的农家品种泰山1号中可扩增出180bp单一条带,感病对照及其余7个近等基因系无扩增。该EST-SSR标记可直接用于分子标记辅助选择。 相似文献
3.
小麦雌蕊和雄蕊突变体与川麦28之间特异性ISSR标记筛选 总被引：1，自引：0，他引：1
利用42条ISSR标记对小麦三雌蕊突变体(TP)和雄蕊同源转化为雌蕊突变体(HTS-1)与川麦28之间特异性的ISSR分子标记进行筛选,为利用ISSR标记定位Pis1基因和控制雄蕊同源转化成雌蕊的hts1和hts2基因奠定基础.结果表明:42条引物共扩增403个条带,有9条引物能在TP和CM 28之间扩增出差异条带,占所用引物的21.4％.有20条引物能在HTS-1和CM 28之间扩增出差异条带,占所用引物的47.6％.有21条引物能在TP与HTS-1之间扩增出差异条带,占所用引物的50％.每条引物最多能扩增出4条差异条带,大部分产生1～2条差异性条带.差异条带大小主要集中在250～750 bp之间.这也证明了ISSR标记是一种简单有效的分子标记,可作为SSR的一种重要补充标记用于遗传图谱的构建. 相似文献
4.
《分子植物育种》2021,(18)
‘大粒香’香味形成是由Badh2基因第7个外显子的8 bp缺失和3 bp突变引起。为了建立了‘大粒香’香味基因的快速准确的检测方法,本研究根据‘大粒香’和‘日本晴’Badh2基因序列的差异,设计了7条引物组合成11对功能标记检测引物,通过对引物组合扩增的产物进行电泳检测,筛选出最佳的引物组合。试验结果表明,开发设计的引物能够准确的检测出香味基因,PCR反应的最佳退火温度为60℃,其中BADH2-F1+BADH2-R+badh2-R2引物组合能准确区分非香基因纯合体、香味基因纯合体以及杂合体三种基因型。基于该功能引物引物组合BADH2-F1+BADH2-R+badh2-R2可以快速开展香味基因的MAS育种。本研究结果将有助于利用Badh2基因位点的分子标记培育香型优质水稻品种,为改良贵州省水稻品种的香味品质提供了技术支撑。 相似文献
5.
分子标记辅助玉米自交系京24抗南方锈病的改良 总被引：3，自引：0，他引：3
近年来,南方锈病对中国玉米生产的危害日益严重。本研究选用齐319为供体亲本,利用分子标记辅助前景选择和背景选择,结合回交转育技术,改良骨干系京24的南方锈病抗性。利用荧光毛细管电泳检测系统,从13对引物中最终筛选出与抗病基因遗传距离较近,扩增稳定、分别位于抗病基因上下游的两对引物Phi118和P2,用于目标性状的前景选择,230个BC1代单株室内分子标记检测结果和海南自然发病情况的比较,验证了前景选择标记的有效性。同时,从100对SSR引物中,筛选出在供受体间具有明显差异的42对引物用于回交群体的背景选择。单色荧光标记引物的多重电泳检测,可显著提高背景选择的效率。 相似文献
6.
用高感甘薯茎线虫病的甘薯品种徐薯18和高抗茎线虫病的徐78-1杂交,得到其F1分离群体。根据连续3年的抗病鉴定结果,从中挑选出8个高抗和8个高感茎线虫病的株系,构建抗病池和感病池。分别以抗感池基因组DNA为模板,用225对SRAP引物组合进行PCR扩增,其中77对引物组合在抗、感池间表现出多态性。通过一组小群体的进一步筛选,有4对引物组合被认为与甘薯茎线虫病抗性基因相关。这4对引物组合分别对2个亲本、抗感池和F1分离群体中的65个抗病株系和79个感病株系基因组DNA进行SRAP分析,有2对引物组合（a5b12和a9b11）各获得1个与甘薯茎线虫病抗性基因紧密连锁的分子标记SP1和SP2,它们与抗甘薯茎线虫病基因的遗传距离分别为4．86cM和4．17cM。获得的分子标记对克隆抗病基因和利用分子标记辅助选择提高育种效率具有重要的意义。 相似文献
7.
甜菜雄性核不育基因的SRAP标记 总被引：6，自引：0，他引：6
采用SRAP技术对甜菜核雄性不育基因进行分子标记的研究,为甜菜育种提供了一条新的途径。以遗传背景相似的可育株和不育株甜菜为材料,用64对SRAP引物组,进行了SRAP分子标记研究。在64对引物组中有2对引物组(即M2E7和M8E8)可分别得到1个育性基因相关的SRAP分子标记,即M2E7-480和M8E8-130,出现频率分别为73%和76%。表明该SRAP标记技术可用于甜菜辅助育种及遗传多样性分析,从而为甜菜雄性不育相关基因的表达提供科学依据。 相似文献
8.
9.
正交设计优化黄瓜ISSR体系 总被引：28，自引：0，他引：28
黄瓜是一种重要的蔬菜作物,品种资源较为丰富,利用分子标记进行黄瓜资源鉴定和分类、构建分子遗传图谱和基因定位方面已取得一定进展,目前应用的分子标记主要包括RAPD、AFLP和SSR,尚未见有关于ISSR标记在黄瓜上的研究报道。ISSR主要是由单一引物且以重复序列为主要引物序列的PCR标记,其反应条件受模板DNA、TaqDNA聚合酶、Mg2 、dNTPs和引物等因素的影响。正交试验设计能明确各因素间的互作效应,建立最优化的反应体系。本研究利用这一方法,从Taq酶、dNTPs、引物、Mg2 4种因素各3个水平来优化黄瓜ISSR反应体系。通过实验,在25μl反应体系中初步确定各反应成分为:1×PCRbuffer,1.5mmol/LMg2 ,25ng黄瓜模板DNA,ddH2O,1UTaq酶,200μmol/LdNTPs,0.75μmol/L引物。这一体系的建立为今后利用ISSR技术进行黄瓜种质资源分类、遗传图谱构建和基因定位奠定了技术基础。 相似文献
10.
黄瓜抗枯萎病基因连锁分析和定位 总被引：4，自引：0，他引：4
《分子植物育种》2015,(9)
为筛选出与黄瓜抗枯萎病相关基因连锁的SSR分子标记,以对黄瓜抗枯萎病为单显性基因的母本WIS2757和感枯萎病父本津研2号及其F1、F2分离群体为试材,通过构建抗、感池对黄瓜枯萎病抗性进行SSR分析。结果表明:通过对278对SSR引物进行筛选,获得在双亲间存在多态性的引物102对,进一步通过抗、感池筛选,获得抗感池DNA间有差异的引物10对。经F2感病群体验证,共获得9个与黄瓜枯萎病抗性基因(Foc-4)连锁的SSR分子标记,并初步将Foc-4基因定位在2号染色体两标记SSR17631和SSR00684之间,距基因Foc-4的遗传距离分别为1.0 c M和0.9 c M,为进一步开发抗枯萎病分子标记及克隆黄瓜抗枯萎病基因奠定了基础。 相似文献
11.
番茄遗传资源的聚类分析研究 总被引：2，自引：0，他引：2
通过测定番茄品质特性的遗传多样性和分子标记的多态性,对番茄品种资源进行了聚类分析。结果表明,品质特性聚类分析和分子标记聚类分析最后都形成了四大类群,而且都把果实硬度大、软化速度慢、果型长圆、含水量低、可溶性固形物含量高的加工番茄聚合在了一起,说明一些分子标记可能和控制番茄加工品质特性的基因有比较紧密的连锁关系。分子标记更能灵敏地区分不同品种间的遗传差异。不同类群间品质性状的差异明显大于群内不同品种间的差异,说明聚类分析是鉴别品种资源遗传差异程度、筛选核心资源的有效手段。 相似文献
12.
Summary Tomato is a crop plant with a relatively small DNA content per haploid genome and a well developed genetics. Plant regeneration from explants and protoplasts is feasable which led to the development of efficient transformation procedures.In view of the current data, the isolation of useful mutants at the cellular level probably will be of limited value in the genetic improvement of tomato. Protoplast fusion may lead to novel combinations of organelle and nuclear DNA (cybrids), whereas this technique also provides a means of introducing genetic information from alien species into tomato. Important developments have come from molecular approaches. Following the construction of an RFLP map, these RFLP markers can be used in tomato to tag quantitative traits bred in from related species. Both RFLP's and transposons are in the process of being used to clone desired genes for which no gene products are known. Cloned genes can be introduced and potentially improve specific properties of tomato especially those controlled by single genes. Recent results suggest that, in principle, phenotypic mutants can be created for cloned and characterized genes and will prove their value in further improving the cultivated tomato. 相似文献
13.
基于SLAF-seq技术开发长穗偃麦草染色体特异分子标记 总被引：10，自引：0，他引：10
长穗偃麦草1E及7E染色体上带有重要的抗赤霉病基因, 开发大量相关染色体特异分子标记有助于准确定位抗性基因及获得可用于辅助育种紧密连锁的标记。基于SLAF-seq技术, 获得了368个长穗偃麦草1E染色体特异片段, 随机选取80个特异片段设计引物, 开发了20个长穗偃麦草1E染色体特异分子标记、2个长穗偃麦草基因组特异分子标记及26个其他特异分子标记, 效率达60%。用这些特异标记能稳定检测出不同小麦–长穗偃麦草衍生材料中的1E染色体或片段。通过标记与优良性状的共分离特性, 获得与相关基因紧密连锁的标记, 将为小麦抗性育种中的分子标记辅助选择提供依据。 相似文献
14.
本研究采用多重PCR方法对与抗番茄黄化曲叶病毒病（tomato yellow leafcurl virus,TYLCV）的Ty-2和Ty-3基因紧密连锁的共显性SCAR标记进行扩增筛选,不同基因型（Ty-2/Ty-2,Ty-2/ty-2,ty-2/ty-2,ty-3/ty-3）的材料扩增出不同长度的特异片段,建立了一种快速检测抗TYLCV基因的技术。利用该技术对22份番茄材料进行检测,同时利用普通PCR对上述材料进行检测,两者结果完全吻合。最后用田间自然发病的方法在大田对这些材料抗性进行验证,符合率达86.4%。 相似文献
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黄瓜的分子标记和连锁图谱研究进展 总被引：4，自引：0，他引：4
黄瓜分子标记和遗传连锁图谱的研究工作相对番茄、小麦等作物比较落后，至今开展的分子标记研究多围绕黄瓜遗传关系分析进行，现有的几张遗传连锁图谱基本是由美国Staub研究小组完成，已被定位在图谱上的同工酶、RAPD、RFLP、SSR、AFLP等标记总数达到300多个，各标记间平均距离达到2.1cM，被整合在一起的遗传基因不足10个(F、B、de、ll、dm)。 相似文献
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Majid R. Foolad Matthew T. Sullenberger Erik W. Ohlson Beth K. Gugino 《Plant Breeding》2014,133(3):401-411
Late blight (LB), caused by the oomycete Phytophthora infestans, is one of the most devastating diseases of the cultivated tomato (Solanum lycopersicum) worldwide. Most commercial cultivars of tomato are susceptible to LB. Previously, three major LB resistance genes (Ph‐1, Ph‐2, Ph‐3) were identified and incorporated into a few commercial cultivars of tomato. Reduced effectiveness and potential breakdown of the resistance genes has necessitated identification, characterization and utilization of new sources of resistance. We evaluated the response of 67 accessions of the wild tomato species, S. pimpinellifolium to LB, under multiple field and greenhouse (GH) conditions and compared them with six control genotypes. Sixteen accessions were identified with strong LB resistance in both field and GH experiments. However, 12 accessions exhibited resistance similar to a control line which was homozygous for Ph‐2 + Ph‐3. Genotyping accessions with molecular markers for Ph‐2 and Ph‐3 were not conclusive, indicating that resistance in these accessions could be due to these or other resistance genes. Strong correlations were observed between field and GH disease response and between foliar and stem infection. 相似文献
18.
Molecular markers have been used for identification and mapping of genes and QTLs for numerous agriculturally important traits
in tomato, including resistance/tolerance to biotic and abiotic stresses and fruit- and flower-related characteristics. However,
the extent to which markers have been utilized in tomato breeding programs has not been clearly determined. A review of the
literature indicated that the utility of most markers for use in tomato breeding programs have not been verified. Many markers
are not validated across tomato genotypes or are not polymorphic within tomato breeding populations. In this study, we examined
the utility of available markers for several major disease resistance traits in tomato by testing them in a number of breeding
lines and commercial cultivars with known resistance/susceptibility responses. While several markers were validated, others
needed PCR optimization for successful amplifications or were not informative in the genotypes used. Specifically, of the
37 markers examined 19 (~51%) were informative, including markers for resistance to Fusarium wilt, late blight, bacterial
wilt, tomato mosaic virus, tomato spotted wilt virus, and root knot nematodes. It appears that many of the available markers
may need to be further refined or examined for trait association and presence of polymorphism in breeding lines and populations.
However, with recent advances in tomato sequencing, it is becoming increasingly possible to develop more informative markers
to accelerate the use of MAS in tomato breeding. 相似文献
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本研究旨在筛选获得与番茄黄化卷叶病毒抗病基因Ty-1紧密连锁的分子标记,为番茄抗病育种提供技术支撑。根据与抗病基因Ty-1紧密连锁的RFLP标记序列设计特异引物,以抗病杂合体（Ty-1/ty-1）、抗病纯合体（Ty-1/Ty-1）和感病纯合体（ty-1/ty-1）材料提取的DNA为模板,进行PCR扩增,而后经不同的核酸内切酶酶切处理,筛选获得与Ty-1基因紧密连锁的CAPS标记。结果显示从4个标记中筛选获得了2个稳定可靠的CAPS标记,即TG97和Mi23。TG97标记在抗病杂合体产生398 bp、303 bp和95 bp 3个特异片段,抗病纯合体产生303 bp和95 bp 2个特异片段,感病纯合体产生398 bp一个特异片段。Mi23标记在抗病杂合体产生402 bp和354 bp 2个特异片段,抗病纯合体产生402 bp一个特异片段,感病纯合体产生354 bp一个特异片段。研究结果表明TG97和Mi23这2个CAPS标记均为共显性标记,可用于番茄抗病育种的辅助选择中。 相似文献
20.
番茄耐盐分子育种研究进展 总被引：8，自引：0，他引：8
土壤盐渍化是一个世界性问题,其中由于过量施用化肥,造成土壤尤其是蔬菜保护地次生盐渍化已是一个极其严重的现象,常障碍蔬菜作物的生长、发育,导致大幅度减产,产品品质下降。虽然作物耐盐新品种的选育,一直是国内外研究的重点,但对于番茄而言,普通栽培种一般表现对盐中度敏感。目前还尚未有很明确的生理生化指标,可供育种者直接进行番茄耐盐性的鉴定,番茄耐盐机理的明确,有助于相关指标的获得。研究业已表明,番茄耐盐受QTLs控制,遗传较为复杂,影响番茄耐盐的QTL在不同生长发育的阶段也不相同。因此育种难度较大。番茄在芽期和苗期对盐害最敏感,随着株龄的增加,耐盐性也增强,而影响番茄芽期和苗期的耐盐性为少数QTLs控制,且效应较大,因此开发芽期和苗期耐盐QTLs对于番茄耐盐育种意义较大。另外,耐盐QTLs还包括组成型和非组成型两种,控制番茄耐盐的组成型或非特异QTL对耐盐性贡献较大。部分野生资源材料及个别栽培种表现出一定程度的耐盐性,为番茄耐盐育种提供了可能。利用分子标记及生物工程技术深入挖掘这些材料,可加速番茄耐盐遗传改良。本文就番茄耐盐筛选方法、耐盐资源材料,耐盐QTL定位及利用分子标记辅助选育和基因工程等手段改良番茄耐盐新品种进行了综述。 相似文献