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半滑舌鳎有效群体大小估计 总被引：1，自引：0，他引：1
为了解半滑舌鳎当前的群体遗传结构,探究半滑舌鳎有效群体大小(Ne)发展趋势及现状,实验通过性别特异性分子标记随机鉴定了800尾半滑舌鳎的遗传性别,选取297个遗传雌性半滑舌鳎样本进行简化基因组测序(2b-RAD),获得了64 416个可用SNP标记,利用这些标记进行全基因组范围的连锁不平衡分析得到各染色体上连锁不平衡分布;根据标记间不同物理间距进行半滑舌鳎有效群体大小的估计,初步了解各历史世代下有效群体规模;通过选择0.1、0.2、0.5、1.0、2.0、5.0、10.0 Mb等7个不同染色体片段大小反映出半滑舌鳎群体遗传结构经过自然与人工共同选择的历史发展趋势。结果显示,半滑舌鳎有效群体大小随其连锁不平衡程度衰减而呈连续下降趋势,至2世代前其有效群体大小仅为29尾左右。 相似文献
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不同循环投喂模式对半滑舌鳎的生长、体成分组成、代谢和能量收支的影响 总被引：2，自引：2，他引：0
研究了不同循环投喂模式对半滑舌鳎的生长、体成分组成、代谢和能量收支的影响。其中包括5个处理:C(对照组,实验过程中持续投喂);S2F4组(饥饿2 d,投喂4 d);S4F8组(饥饿4 d,投喂8 d);S8F16组(饥饿8 d,投喂16 d);S12F24组(饥饿12 d,投喂24 d),实验时间72 d。结果表明,对照组的特定生长率(SGRw和SGRe)显著高于循环投喂各组(P<0.05)。对照组和S2F4组半滑舌鳎幼鱼的末体重没有显著差异(P>0.05),并且均显著高于其它各组(P<0.05)。对照组半滑舌鳎幼鱼的消化率显著低于其它各组(P<0.05),而能量消化率与S12F24组没有显著差异(P>0.05),但显著低于其它3个处理组(P<0.05)。S4F8组半滑舌鳎幼鱼饲料转化率显著低于S12F24组(P<0.05),对照组饲料转化率低于S2F4组和S12F24组但没有显著差异(P>0.05)。对照组半滑舌鳎幼鱼的摄食率显著低于其它各组(P<0.05)。体成分组成中,蛋白含量随饥饿、投喂周期的延长而下降,S2F4组和对照组半滑舌鳎的蛋白含量没有显著差异(P>0.05)。S2F4组的耗氧率和排氨率均较低。对照组的摄食能显著高于其它各组(P<0.05),S2F4组的呼吸能占摄食能的比例显著高于对照组(P<0.05)。研究表明,半滑舌鳎幼鱼在循环投喂模式下,具有较强的补偿生长能力,S2F4组具有完全补偿生长能力;在较长的周期性饥饿条件下,半滑舌鳎幼鱼体内的蛋白质含量会受到显著影响。 相似文献
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半滑舌鳎是我国九大海水养殖鱼类之一,入选国家海水鱼产业技术体系。因其肉质细腻、味道鲜美,极受消费者欢迎,市场价值很高。在半滑舌鳎养殖业蓬勃发展过程中,种质退化、抗病力下降和疾病频发等问题相继出现,制约了养殖产业的发展。为改善半滑舌鳎种质资源现状,我们针对生长和抗病性状开展了连续四代家系选育,并从第三代选育开始,利用基因组选择育种技术估算半滑舌鳎抗哈维氏弧菌的基因组估计育种值,提高抗病性状的选育效率,于2018年分别筛选出一批生长速度快、抗病力强的家系。随后,利用这些抗病速生家系进行大规模苗种繁育,并在山东、河北和天津等地进行了连续两年的生产性对比试验。2021年,半滑舌鳎速生抗病新品种通过了全国水产原种和良种审定委员会的审定,命名为“鳎优1号”。与未经选育的半滑舌鳎相比,“鳎优1号”新品种抗哈维氏弧菌感染能力提高30.9%,18月龄鱼的体重平均提高17.7%,养殖成活率平均提高15.7%。此外,“鳎优1号”苗种的生理雌鱼比例高达40%左右。半滑舌鳎新品种“鳎优1号”的成功培育为水产养殖种业增添了良种,推动了半滑舌鳎分子育种技术的发展,为基因组选择育种技术在水产良种培育中的应用奠定了基础。 相似文献
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以团头鲂细胞因子信号传导抑制蛋白1（SOCS1）基因socs1a和socs1b为编辑对象,在线分析并筛选出合适的靶点合成向导 RNA (guide RNA, gRNA),然后对1~2细胞期的团头鲂胚胎进行gRNA和Cas9蛋白的混合注射。通过荧光定量PCR技术在转录水平检测socs1a和socs1b的表达,并通过测序平台在DNA水平鉴定基因序列的突变,成功建立了多种socs1的突变品系。与同期野生型(WT)相比,socs1a突变杂合体（SOCS1a+/-）和socs1b 突变杂合体（SOCS1b+/-）团头鲂生长性能增强、体质量显著增加,同时炎症因子基因中肿瘤坏死因子α基因(TNF-α)和白细胞介素6基因(IL-6)表达量显著增加,而白细胞介素1β基因(IL-1β)表达无明显变化。注射嗜水气单胞菌后,与野生型不同的是,IL-6和TNF-α在SOCS1a+/-和SOCS1b+/-团头鲂肝脏中的表达均有持续显著上升。本实验通过CRISPR/Cas9系统成功敲除了团头鲂socs1a和socs1b,为进一步探讨socs1的作用提供了一定的研究基础,同时为CRISPR/Cas9基因编辑技术在养殖鱼类中的合理应用提供了依据和借鉴。 相似文献
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本文系统介绍了鱼类性别特异分子标记筛选的研究历程、分子标记辅助性控育种的研究进展及展望。首先，作者回顾了我国鱼类性别特异分子标记的研究历程，包括探索期(2001—2006年)，突破期(2007—2012年)和快速发展期(2013—2023)，其中在突破期重点描述了半滑舌鳎、黄颡鱼等性别特异分子标记的发现，为我国鱼类性别决定机制研究和性控育种提供了重要技术手段。其次介绍了分子标记辅助性控育种的研究进展，采用性别特异分子标记辅助培育出半滑舌鳎“鳎优1号”，黄颡鱼“全雄1号”、“全雄2号”等新品种，极大的推动了我国鱼类性别控制育种研究工作。最后，文章对我国鱼类性别特异分子标记筛选和分子标记辅助性控育种的未来发展方向进行了展望，提出今后应从持续开发养殖鱼类性别特异分子标记、强化鱼类性别特异分子标记筛选方法创新、优化鱼类性别特异标记的应用方法等方面加强鱼类分子标记辅助性控育种的研究。 相似文献
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免疫球蛋白是鱼类适应性免疫中主要的效应因子之一, 研究鱼类免疫球蛋白对鱼类疾病的免疫防控尤为重要。本研究利用 PCR 与 RACE 技术克隆获得青鲫(Carassius auratus indigentiaus)分泌型免疫球蛋白 Z (secretory immunoglobulin Z, sIgZ)重链基因 cDNA 全长序列 (基因序列登录号: MZ274344.1), 青鲫 sIgZ 重链基因 cDNA 序列全长 2083 bp, 其开放阅读框长 1668 bp, 编码一条由 556 个氨基酸组成的肽链, 相对分子质量为 61.59 kD, 理论等电点为 7.03。青鲫 sIgZ 重链基因结构由 1 个可变区(VH), 4 个恒定区(CH1-CH4)以及 1 个分泌型的尾部(secretory tail, Sec tail)构成。在 GenBank 中进行同源序列检索, 青鲫 sIgZ 氨基酸序列与其他鱼类 IgZ 的相似性依次为团头鲂 (Megalobrama amblycephala) (63.17%)、草鱼(Ctenopharyngodon idella) (60.82%)、鲤(Cyprinus carpio carpio) (52.98%)、虹鳟(Oncorhynchus mykiss)(37.06%)和金头鲷(Sparus aurata)(35.01%)。利用 MEGA 5.1 软件进行多重序列比对分析, 采用邻接法构建遗传系统进化树, 发现青鲫 sIgZ 基因与同属鲤科(Cyprinidae)鱼类的 IgZ 聚为一支, 青鲫 sIgZ 与团头鲂的 sIgZ 亲源关系最近。通过 qPCR 检测青鲫不同组织中 sIgZ 基因的表达, 发现青鲫头肾中 sIgZ 基因的表达量最高, 中肾、脾和肝脏次之。利用嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)对青鲫进行浸泡感染, sIgZ 在头肾、脾脏、中肾、肝、肠、鳃和皮肤中的表达水平在感染的 28 d 内先升高后降低, sIgZ 的相对表达量在黏膜免疫组织(肠和皮肤)中达到峰值的时间要早于系统免疫组织(头肾和脾脏), 肠和皮肤中 sIgZ 在峰值时的相对表达量显著高于头肾中 sIgZ 在峰值时的相对表达量, 实验结果显示, 青鲫 sIgZ 在肠和皮肤黏膜免疫组织中可能发挥重要的免疫功能。 相似文献
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红鲫属于鲤科、鲤亚科、鲫属,染色体数目为2n=100,核型为22m+34sm+22st+22t;鲤属于鲤科、鲤亚科、鲤属,染色体数目为2n=100,核型为22m+34sm+22st+22t。已有研究表明,红鲫(♀)×鲤(♂)杂交第一代(F1)和第二代(F2)为二倍体,F2能产生染色体数不减数的配子,在第三代(F3)中形成四倍体鱼。通对F1和F3进行胚胎染色体制片,在染色体水平上探讨红鲫和鲤远缘杂交的多倍体发生途径及F2产生不减数配子的潜能。结果表明,F1混合胚胎都为二倍性胚胎,没有发现单倍性和多倍性胚胎,但F3混合胚胎中则有染色体数为100,150,200甚至300的染色体分裂相,推测F2生殖细胞发生了一次或多次染色体数加倍,产生了二倍性和更高倍性的配子,它们结合形成了不同倍性的F3胚胎。实验证明双亲基因组大小及核型相似的鲫鲤远缘杂交第一代不发生多倍化,但获得的二倍体杂交后代能产生不减数配子,在F3中产生多倍体鱼。 相似文献
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大亚湾海域鱼类分类多样性研究 总被引：10，自引：2，他引：8
根据20世纪80年代起大亚湾海域鱼类调查研究的历史资料,采用Nelson分类系统对鱼类物种组成进行了系统整理,从不同分类阶元分析了大亚湾海域鱼类的多样性。分类阶元包含指数(TINCLi),分类多样性指数(Δ+和∧+),目级和科级水平丰富度(R)以及目级和科级水平相似性系数(C)为本研究的主要研究指数,其中分类阶元包含指数TINCLi为本文首次提出。结果显示,大亚湾海域共记录鱼类22目94科206属,以鲈形目种类居绝对优势。采用分类阶元包含指数分析,大亚湾海域鱼类组成目、科、属所分别拥有的(科、属、种),(属、种)和(种)的平均数目分别为(4.27、9.36、14.55),(2.19、3.40)和(1.55),高于东海陆架,而低于东沙群岛海域,并且与纬度梯度成反比,证明低纬度海域的鱼类分类多样性低,种类组成主要集中分布于较少数的分类类群。使用PRIMER 5.2软件计算了平均分类差异指数Δ+和分类差异变异指数∧+,数值分别为62.2和110.0,其中Δ+低于东海陆架区(65.7),高于东沙群岛海域(55.2),说明大亚湾海域鱼类的亲缘关系比东海陆架区海域鱼类近,比东沙群岛海域鱼类的远,并且分布较不均匀。3个海区的相似性系数比较结果显示,在目级水平上,大亚湾海域鱼类组成同东沙群岛接近,而科级水平上同东海陆架区更为接近。本研究在种以上的分类阶元审视大亚湾海域鱼类组成,以期增加对大亚湾鱼类多样性的认识,为该区域鱼类资源的开发、利用和保护提供参考依据。 相似文献
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鱼类基因组研究十年回顾与展望 总被引：2，自引：1，他引：1
本文回顾了我国鱼类基因组研究从无到有、从小到大的十年发展历程。分别介绍了我国在鱼类BAC文库构建、高密度遗传连锁图谱构建与QTL定位、全基因组测序和精细图谱绘制、基因组选择育种和基因组编辑等方面取得的重要进展和成果。结合国际上鱼类基因组研究进展,通过分析、比较指出,从2008—2013年,我国鱼类基因组研究在国际上处于全面跟跑状态,从2014—2018年,我国水产科学家奋起直追,加快鱼类基因组研究步伐,在短短5年内,在国际顶级刊物Nature Genetics、Nature上相继发表了半滑舌鳎、鲤、草鱼、牙鲆和海马等养殖鱼类的基因组精细图谱,使我国鱼类基因组研究在国际上从全面跟跑进入跟跑、并跑、领跑并存状态,特别是在个别方向和少数种类上实现了领跑。同时,指出了我国现阶段鱼类基因组研究与应用方面存在的不足和问题,并展望了我国鱼类基因组研究今后的发展方向和前景。 相似文献
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多巴色素异构酶（dopachrome tautomerase，Dct）是酪氨酸酶家族的重要成员之一，在黑色素合成过程中具有重要作用。为了解多巴色素异构酶基因（）的“粉花”体色类型为研究对象，在对该基因进行克隆和表达分析的基础上，应用CRISPR/Cas9基因编辑技术研究了该基因对瓯江彩鲤黑斑体色的影响。结果发现，瓯江彩鲤存在2个Dct1与在“粉花”体色瓯江彩鲤的黑斑皮肤中的表达量显著高于白色皮肤，而Dct1和基因突变对瓯江彩鲤黑斑体色存在重要影响，与在鲤的黑斑体色形成中发挥着更大的作用。 相似文献
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水产种业是水产养殖业发展的基础,是渔业战略性、基础性核心产业,也是保障未来养殖业绿色、健康发展的核心竞争力。随着水产业全球化、市场化的发展,我国种业正面临着前所未有的机遇与挑战。特别是随着生物技术的快速发展,水产育种也由传统的选择育种和杂交育种,发展至细胞工程育种、分子标记辅助育种、全基因组选择育种、分子设计育种和基因组编辑等精准设计育种。水产动物重要经济性状的基础研究及其遗传改良技术的创建驱动着我国水产种业的蓬勃发展,截止2022年,通过全国水产原种和良种审定委员会审定并由农业农村部公告的水产新品种就有266个,其中鲤新品种数量最多,为31个,表明鲤育种工作卓有成效。本文重点回顾了我国鲤的种质和基因组资源现状,鲤的主要品种及其育种方法;简要介绍了鲤生长、抗病、体色、饲料转化率等经济性状关联的遗传研究进展,并由此提出了新时代背景下鲤种业的发展方向和措施建议,以期为我国鱼类育种提供借鉴。 相似文献
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我国鱼类近缘杂交研究及其在水产养殖上的应用 总被引：7，自引：2，他引：5
基因型不同的动物体间相互交配的过程称为杂交(hybridization)。杂交是被广泛采用的育种手段。杂交的主要目的在于获得杂种优势,并通过杂交选育新品种或新品系。根据杂交亲本的亲缘关系,杂交可分为远缘杂交(remote hybridization,distant hybridization)和近缘杂交(closehybrid 相似文献
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半滑舌鳎雌性特异扩增片段长度多态性标记的筛选与应用 总被引：3，自引：2，他引：1
半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevisGünther)为东北亚特有的名贵冷温性比目鱼类,为我国养殖业的新宠。半滑舌鳎雌鱼生长速度是雄性的2~3倍,若能实现单雌化养殖将大大提高养殖业的经济效益。本研究利用扩增片段长度多态性(AFLP)技术,应用64个引物组合,检测了半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevisGünther)雌雄基因组DNA的多态性,筛选与半滑舌鳎性别相关的AFLP分子标记。实验经过3轮筛选和验证,4个引物组合扩增出7个雌性个体出现频率为100%的DNA片段,我们认为这7个标记是半滑舌鳎雌性特异的AFLP标记,分别命名为CseF382、CseF575、CseF783、CseF464、CseF136、CseF618和CseF305。同时,将标记CseF382成功转化为SCAR标记,测定了该标记的DNA序列,建立了半滑舌鳎遗传性别鉴定的PCR技术,为半滑舌鳎性别决定机制的研究和性别控制奠定了重要基础。 相似文献
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Ana Milstein 《Aquaculture International》1995,3(4):292-314
To analyse the relationships among fish species performance and management procedures, a database was built up with data from 31 fish farms during the period 1976–1987 (1673 observations) and analysed through multivariate statistics (factor analysis). The data include nurseries, grow-out and operational ponds with mono- and polycultures of common carp, Cyprinus carpio, tilapia hybrid, Oreochromis niloticus × O. aureus, silver carp, Hypophthalmichthys molitrix, and mullet, Mugil cephalus. The main conclusions include the following. (1) The highest total yields and best tilapia performances were obtained in polyculture ponds where tilapia was the main species. (2) The best carp performances occurred in grow-out polyculture ponds where carp was the main species. Carp performance was improved in polycultures with mullet and silver carp, irrespective of whether tilapia were present or not. (3) Carp and tilapia yields increased as the nutritional inputs (feed pellets, sorghum pellets, manure), pond size and culture duration increased. The effect of the nutritional input was not linear, but logarithmic. (4) Growth rate of common carp was more affected by total density and stocking size than that of tilapia. Better carp and tilapia growth occurred in grow-out ponds when stocked at large sizes and cultured during short periods, mainly when both species were present. (5) Carp growth varied with the geographical region and size of fish pond, being better in smaller than in larger ponds due to reduced access to natural benthic food in deep ponds. 相似文献
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Defeng Zhang Xiaoli Ke Lihui Liu Maixin Lu Cunbin Shi Zhigang Liu 《Aquaculture International》2018,26(3):885-897
Several outbreaks of Streptococcus agalactiae infection of bighead carp (Aristichthys nobilis) were observed in China. The molecular epidemiology and pathogenicity of S. agalactiae in bighead carp and tilapia (Oreochromis sp.) is poorly understood. In the present study, we identified S. agalactiae strains isolated from diseased bighead carp using the API 20 Strep kit and 16S rDNA sequencing and determined whether these strains came from tilapia. Of the 46 identified S. agalactiae strains, 24 strains were successfully isolated from diseased bighead carps, 20 S. agalactiae strains were isolated from tilapia, and two S. agalactiae strains were isolated from tiger frog (Hoplobatrachus chinensis). The results of molecular typing, including multilocus sequence typing, molecular serotyping, surface protein gene detection, and virulence-related gene detection showed that the 44 strains from bighead carp and tilapia were highly similar, whereas different from tiger frog GBS strains. Remarkably, the bighead carp strain Hn1404 showed high virulence in bighead carp and zebrafish. Moreover, this strain was pathogenic to Nile tilapia (Oreochromis niloticus). In addition, comparative genomic analysis showed that isolate Hn1404 had a close relationship with the bighead carp and tilapia S. agalactiae strains. All the analyses of the genetic characteristics of bighead carp and tilapia strains showed that tilapia S. agalactiae strains could be transmitted to other fish species such as bighead carp. 相似文献
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Matei Dimitrov 《Aquaculture (Amsterdam, Netherlands)》1984,38(3):241-253
Intensive polyculture of common carp and herbivorous fish (silver carp and grass carp) at high stocking densities and with intensive feeding with fodder and mineral and organic fertilization was carried out without mechanized aeration and automated feeding.Two stocking patterns were tested. The first, in Pond 1 (with an area of 2.5 ha), had the following stocking rates: one-year carp (C1), 8000 fish/ha; one-year silver carp (S1), 1500 fish/ha; and one-year grass carp (G1), 200 fish/ha. The yield was 6292 kg/ha of standard consumer fish (C1+ 743 g, S1+ 944 g, and G1+ 1000 g) at a relatively low food conversion ratio (2.24) and high survival of all fish. Within the total yield, the two-year carp contributed 76%, the silver carp 21%, and the grass carp 3%. The second stocking pattern, in Pond 2 (0.25 ha), had the following rates: C1, 8500 fish/ha; S1, 2000 fish/ha; and G1, 200 fish/ha, and produced a still higher total yield (6629 kg/ha) at a relatively low food conversion ratio (2.10). The two-year carp in Pond 2 contributed 88% of the total yield, and the herbivorous fish only 12% even though they accounted for 20% of the stock.Our results (Pond 2) are compared with other record yield experiments under similar conditions but including tilapia. At a total stocking rate of 10 700 fish/ha and without participation of tilapia, over a period of 186 days (as against 126 days in the other experiment), our experiments gave a total yield which was 347 kg/ha higher at a food coefficient 15% lower. The growth period was 60 days longer in our experiments but it included April and October when water temperature is much below the optimum and only 4% of the total amount of fodder was assimilated. 相似文献