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1.
应用ISSR分子标记绘制红麻种质资源DNA指纹图谱 总被引：12，自引：0，他引：12
以6份红麻种质资源为材料, 对UBC807~UBC80等80个ISSR引物进行筛选, 筛选出多态性好的ISSR引物20个。利用这20个ISSR引物扩增来自国内外84份红麻种质资源, 共获得230条谱带, 平均每个引物扩增出11.5条谱带, 其中多态性谱带185条, 多态性条带比率为80.43%, 表明供试的红麻种质资源遗传多样性较丰富。以供试84份红麻种质资源的ISSR扩增谱带为基础, 建立了供试材料扩增条带指纹数据库的Excel文件。根据指纹图谱唯一性原则, 采用自行开发的DNA指纹数据分析软件, 再从20个多态性好的ISSR引物中遴选出UBC 813、UBC 825、UBC 836、UBC 888和UBC 889引物, 绘制出82个红麻种质资源的DNA指纹图谱, 为红麻种质资源分子身份证的构建奠定了基础。 相似文献
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为了有效地鉴别白芥和芥菜型油菜品种,为白芥种质资源研究和育种工作提供理论依据,本研究利用ISSR分子标记对12份白芥材料和8份芥菜型油菜(辣芥4份,红芥4份)进行了品种鉴定及亲缘关系分析。结果表明:6条ISSR引物成功扩增出39条DNA片段,其中34条具有多态性,引物的多态性位点百分率在66.7%～100.0%间,平均87.7%。通过UPGMA聚类分析和遗传一致度分析发现,所有白芥材料归为一大类,红芥和辣芥材料归为一大类(遗传一致度0.875 0)。白芥表现为同一来源地的材料归为一组,安徽白芥和青海‘白芥1号’的亲缘关系较近(遗传一致度0.750 0),而四川白芥与安徽白芥和青海‘白芥1号’的遗传一致度相对较低,分别为0.641 0和0.589 7。基于6条ISSR引物获得供试材料的指纹图谱,利用引物UBC836、UBC847、UBC821和UBC855可以区分白芥和芥菜型油菜红芥和辣芥。辣芥有1个特异出现条带(UBC850-375)和1个特异缺失条带(UBC821-1000),可用于区分辣芥与红芥。利用引物UBC836、UBC850、UBC855、UBC821,共获得可以区分不同产区白芥的6个特异标记和3个特异缺失标记。利用ISSR标记构建的DNA指纹图谱简单、直观,可有效应用于白芥和芥菜型油菜品种的鉴定。 相似文献
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适合于甜菜品种鉴定的ISSR核心引物的筛选 总被引：2，自引：2，他引：0
探寻适合甜菜品种鉴定的ISSR引物,用以构建甜菜品种的指纹图谱。利用一个品种对全部100条ISSR引物进行退火梯度实验,然后利用16个进口甜菜品种在每个引物的最佳退火温度下对全部引物进行扩增,筛选适合甜菜品种纯度鉴定的ISSR引物。结果从100条ISSR引物中筛选出多态性高、扩增条带清晰、重复性好的引物16条,这16条ISSR引物总共扩增100条多态性条带,引物的PIC值均大于0.6,从理论上讲,这些核心引物完全可以实现对现有甜菜品种的鉴定。 相似文献
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40个龙眼品种(品系)DNA指纹图谱构建及遗传关系分析 总被引：2，自引：1，他引：1
有效鉴别龙眼新品种（品系）,为龙眼种质资源研究和新品种保护提供理论基础。利用ISSR分子标记分析‘冬宝9 号’、‘高宝’等4 个龙眼新品种（品系）与36 个龙眼品种的遗传关系,并建立其DNA指纹图谱。从80 个ISSR 引物中筛选出11 个多态性好、扩增清晰的引物。结果显示,11 个引物共获得146个位点,有125 个多态性位点,多态性百分率为85.7%。40 个龙眼品种（品系）的遗传相似系数在0.58~0.88 之间。UPGMA聚类结果表明,40 个龙眼品种（品系）在遗传相似系数为0.64 的水平处划分为3 组。引物UBC810/UBC818 组合可将40 个龙眼品种（品系）全部区分开,并依此建立了数字化的DNA指纹图谱,为龙眼新品种的鉴别、分类、示范及推广等方面提供依据。 相似文献
5.
四照花观赏价值极高,其栽培品种繁多且难以区分。为了快速有效地鉴定四照花栽培品种,本研究利用ISSR标记,建立了44个四照花主要栽培品种及其亲本的指纹图谱,并分析了其亲缘关系,为四照花的推广应用提供依据。利用优化的ISSR-PCR体系,从100条ISSR引物中筛选出7条,对44个四照花样本的基因组DNA进行PCR扩增。通过2条引物UBC834和UBC847的扩增,建立了品种特异性指纹码,可将44个样本中的42个加以区分。7条ISSR引物共获得91条扩增带,其中多态性条带90条,多态性比例为98.9%,平均每个引物扩增出13个位点;在遗传距离为0.60处,可以将44个样本分为3类:第1类包括大花四照花原种、所有大花四照花栽培品种和以大花四照花为母本的杂交品种37号(C.‘Rutban’)和38号(C.‘Celestial Shadow’);第2类为所有日本四照花和中国四照花及其两者的栽培品种、以日本四照花为亲本的杂交品种36(C./Ruth Ellen/‘Rutlan’)、39(C.‘Rutcan’Constellation)、40(C.‘KN4-43’Starlight),和未知品种41号;第3类,未知样本42号单独聚为一类,但在遗传距离为0.62处与第1类聚到一起,推测其可能是源于大花四照花的品种。本研究基于ISSR标记构建的指纹图谱可有效用于四照花栽培品种鉴定,并揭示其亲缘关系。 相似文献
6.
利用ISSR分子标记对25个猕猴桃品种和种质资源材料进行遗传多样性分析,并构建其ISSR指纹图谱,旨在阐明其亲缘关系,为遗传、育种和利用提供理论依据。结果显示,从100条引物中筛选出10条引物,在25个供试材料中共扩增出172条带,每条引物平均扩增条带数为17.2条,多态性条带169条,每条引物平均扩增多态性条带数为16.9条,多态性比例为98.26%;遗传相似系数值在0.51~0.87之间;在相似系数水平为0.604时,可将所有供试材料聚为三类。本研究构建的指纹图谱可用于猕猴桃种质的分类与鉴定,为种质资源的鉴定、分类、利用和杂交育种亲本的选配等方面提供理论依据。 相似文献
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利用SRAP、ISSR、SSR标记绘制黄麻基因源分子指纹图谱 总被引：3，自引：0，他引：3
以国内外引进保存的231份黄麻种质资源为材料,分别采用SRAP、ISSR、SSR分子标记和编程DNA指纹图谱分析软件,绘制黄麻遗传资源基因组DNA指纹图谱。结果表明,通过筛选出的35对SRAP引物对231份黄麻品种进行标记分析,获得96份黄麻品种DNA指纹图谱;11个ISSR多态性引物对96份材料进行DNA标记分析,获得45份黄麻品种DNA指纹图谱;49对SSR多态性引物对48份黄麻品种进行DNA标记分析,获得13份黄麻品种DNA指纹图谱,累计完成了154份黄麻品种基因组DNA分子指纹图谱绘制。每一个被识别的品种都具有其独特的分子"身份证"。其他77份地方品种因与部分品种遗传相似性过高,未能被识别,表明黄麻地方品种存在较为严重的同种异名现象。 相似文献
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《分子植物育种》2021,(10)
为了快速区分万寿菊属品种(系),鉴定品种(系)的特异性和真实性,构建分子指纹图谱便显得尤为重要。本研究利用SSR标记对32个万寿菊属品种(系)进行遗传多样性分析及指纹图谱构建。结果表明,48对SSR引物组合中筛选出8对多态性较好的引物,利用这8对引物在32个万寿菊属品种(系)中共扩增出23条谱带,其中多态性谱带19条,多态性百分率为82.60%。万寿菊属品种(系)间遗传相似系数为0.46～0.95,UPGMA聚类分析表明,在相似系数0.46处可被分为2大类群。株高相近的万寿菊属品种(系)被优先聚为一类。利用8对SSR引物构建了32个万寿菊属品种(系)的DNA指纹图谱,为万寿菊属品种(系)的特异性和真实性鉴定提供了理论依据。 相似文献
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国产糖甜菜品种SSR指纹图谱的构建 总被引：7，自引：7，他引：0
为了构建14份国产甜菜品种的指纹图谱,利用6个差异较大的甜菜品系对50对SSR引物进行筛选,共选出7对多态性高、带型清晰、重复性好的SSR引物。利用这7对SSR引物对国产14份糖甜菜品种进行扩增,共获得40条谱带,其中多态性位点28个,多态性比率达75%;每对引物产生的等位基因数为5-8个,平均6.6个。利用其中三对引物S6,S13和BVGTT6构建了14份国产甜菜品种的DNA指纹图谱,结果表明,每个甜菜品种有唯一的数字指纹区别于其它品种,说明SSR标记适用于甜菜品种纯度和真实性的鉴定,同时甜菜品种指纹图谱库的构建也为将来可能出现的甜菜品种纠纷打下坚实的技术基础。 相似文献
10.
11.
利用SRAP引物组合构建甜菜品种的指纹图谱 总被引：1，自引：1，他引：0
为了构建甜菜品种的指纹图谱,通过对183对SRAP引物组合的筛选,筛选出多态性好、条带清晰易于识别的SRAP引物组合两对(EM4-ME8和EM7-ME10)。利用筛选出的两对引物组合构建17份已经登记品种的指纹图谱,结果表明,引物组合EM7-ME10可以鉴别15个品种,扩增产生15种不同的带型；引物组合EM4-ME8可以鉴别14个品种,扩增产生14种不同的带型；这两对引物组合结合到一起就可以鉴别全部的17个品种。利用SRAP引物组合构建甜菜品种指纹图谱的成功为快速鉴定甜菜品种的真实性提供了一个新的解决办法,也为保护农民和育种家的权益提供了一个新的思路。 相似文献
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利用SSR标记鉴定柚和杂柑品种 总被引：4，自引：0，他引：4
采用SSR技术,从105对柑桔SSR引物中,筛选出10对在柑桔大类品种间多态性位点丰富、带型清晰、重复性好的SSR引物.利用其中5对SSR引物对5个柚和7个杂柑品种DNA进行PCR分析,共扩增出35条谱带,其中27条谱带呈现多态性,引物多态性带纹比例均在60%以上.扩增片断的大小集中在100 bp～500 bp之间.分别针对柚和杂柑品种筛选出两个高效的引物组合(SSR17、SSR15、SSR16、SSR12与SSR17、SSR18、SSR16),利用这两组引物成功构建出了我国主推的5个柚和7个杂柑品种的特征指纹图谱.并应用指纹图谱自动识别软件Gel 2.0对各品种指纹图谱进行识别,建立了相应品种的指纹模式图谱库. 相似文献
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水稻光温敏核不育系的ISSR和SSR遗传分析比较 总被引：25，自引：0，他引：25
本研究应用ISSR和SSR技术建立了24个水稻光温敏核不育系的DNA指纹图谱，利用13个ISSR引物和20对SSR引物，分别获得174个多态性片段和62个多态性片段，平均每个ISSR引物检测到13．38个多态性片段，远远高于SSR引物的检测率。根据遗传距离进行的聚类分析表明，利用这两种标记所得的聚类结果十分相似，24个材料被聚为粳型，偏籼型和籼型三个类群，在籼型不育系类群内，又可明显的分成三个亚类群，其中7个安农S-1衍生的不育系聚为一类，与农垦58S衍生的不育系有明显的遗传差异。根据两种标记计算的遗传距离及其遗传关系，所得的结果仍有一些差异，但总体趋势是一致。研究结果表明，ISSR和SSR标记适用于构建DNA指纹图谱，进行分类鉴定和遗传分析。 相似文献
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《分子植物育种》2021,(10)
食用羽衣甘蓝新品种‘沪羽甘1号’是利用羽衣甘蓝胞质雄性不育系与高代自交系通过常规育种技术选育而成的F1代杂交种,2019年通过上海市农作物品种审定委员会认定。为进一步推广和保护该品种,以‘沃特斯’品种为对照,比较研究了‘沪羽甘1号’的特征特性,并利用ISSR分子标记技术构建了‘沪羽甘1号’亲本的DNA指纹图谱。与对照‘沃特斯’相比,‘沪羽甘1号’具有较高的营养价值,且具有早熟、抗黑腐病的特点。‘沪羽甘1号’蛋白质、VC、纤维素、水分和可溶性固形物的含量分别为20.7%、95.1 (100 mg/kg)、10.8%、76.1%和8.8%。从80个ISSR引物中筛选出8条核心引物在‘沪羽甘1号’父本‘HL2250-8’和母本‘CMS-015-319’中分别扩增出10和13条多态性条带,分别选择其中的5和7条谱带构建‘HL2250-8’和‘CMS-015-319’的DNA指纹图谱。该研究结果为‘沪羽甘1号’推广和品种保护提供了科学依据。 相似文献
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为建立吊瓜品种的DNA指纹图谱,实现对吊瓜品种的高效鉴定,本研究以5份性状稳定的吊瓜品系为供试材料,开展多态性SSR分子标记引物筛选,并构建吊瓜品系的DNA指纹图谱。结果表明,从54对SSR引物中筛选出的4对核心引物,平均每对SSR核心引物扩增的多态性条带数为7.5条,多态性信息含量(PIC)平均为0.53,5份吊瓜材料间的相似系数为0.2～0.83。利用这4对引物分别构建5份供试吊瓜唯一的DNA指纹图谱,最终确定5份材料均为不同的品系。该研究表明SSR分子标记可于构建吊瓜品种的DNA指纹图谱,为开展吊瓜品种鉴定提供技术支持,同时也有助于对吊瓜新品种的申报和保护。 相似文献
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甘蓝品种的AFLP指纹鉴别图谱分析 总被引：1，自引：0，他引：1
本试验采用AFLP技术分析了来自全国9个栽培地区的44个甘蓝主栽品种,共筛选了40对E 3/M 3引物组合,多态性条带的数量从0条到15条不等。其中引物组合E-AAC/M-CTA是甘蓝品种中多态性最高的引物,有15条多态性条带,多态性条带的百分率为30%,但该引物不足以区分44个供试的甘蓝品种。同时筛选了11组E 2/M 3对引物组合,其中引物组合E-AG/M-CTC产生了13条清晰的多态性条带。以E-AAC/M-CTA和E-AG/M-CTC这两对引物组合的多态性条带构建了44份甘蓝品种材料的指纹图谱,此指纹图谱可以将供试的44份材料一一区分。 相似文献
18.
《种子》2018,(12)
利用ISSR技术对14个八仙花品种进行了亲缘关系的研究。从49个引物(引物选自加拿大哥伦比亚大学UBC公司公布的100条引物)中筛选了8个条带清晰、多态性高、重复性好的引物,对14个八仙花品种DNA进行扩增,共扩增出478条带(平均每个引物扩增59.75条DNA片段),多态性条带420条。用POPGENE分析数据得到14个品种的遗传距离为0.000 2～0.087 4,遗传相似性系数为0.916 3～1.000 0;利用NTSYSpc 2.1聚类分析,在遗传相似性系数约为0.38处将14个八仙花品种明显分为两大类,其中花园蕾丝、绿色夏天和圣代草莓被聚为第一类,其余11个品种被聚为第二类。 相似文献
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为创建砂仁及其主要混伪品益智仁的ISSR分子鉴别方法,以UBC818为引物,对影响ISSR-PCR反应体系的引物、dNTPs、DNA模板、Taq DNA聚合酶和Mg2+浓度进行5因素4水平正交优化试验,并在此基础上筛选阳春砂ISSR引物及砂仁正伪品的鉴别引物。结果表明,20μL阳春砂ISSR-PCR最佳反应体系包括引物0.5μmol/L、dNTPs 0.25 mmol/L、DNA模板40 ng、Taq DNA聚合酶1.2 U、Mg^2+2.0 mmol/L;从52条ISSR引物中筛选出10条阳春砂ISSR引物,从6条阳春砂和益智的共同引物中,筛选出扩增条带清晰、多态性强的砂仁正伪品的鉴别引物UBC808,利用UBC808对15份样品进行验证试验,结果表明鉴别体系稳定性好,可用于砂仁与益智仁的快速、准确鉴别。 相似文献
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《分子植物育种》2021,19(11):3646-3652
杜鹃花(Rhododendron spp.)是北温带植物区系的重要类群和世界著名的观赏花卉。本研究利用11个ISSR标记在32个杜鹃花品种内检测到44个多态性位点,品种内多样性丰富,平均Na为1.978,Ne为1.407,多样性指数h和I分别为0.263和0.414。聚类分析将32个品种分为2簇,第一簇含有18个红色、粉红色、紫色花系的品种,第二簇为14个白色和有条纹镶嵌的品种。筛选出10个品种特异性条带,引物844对‘吉见戈玉’和‘梅花茸’在350 bp处分别有一条明显的特异性带;引物846对‘外国红’在175 bp处有一条明显的特异性带;引物847对‘紫鹃’在750 bp处有一条明显的特异性带。本研究构建的DNA指纹图谱为杜鹃花品种鉴定提供了参考。 相似文献