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1.
蛋鸭骨桥蛋白基因OPN的多态性与蛋品质性状的相关性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
骨桥蛋白(osteopontin,OPN)是一种分泌型磷酸化蛋白,其可能在蛋壳形成过程中发挥作用。为了分析蛋鸭OPN基因单核甘酸多态性(SNPs)及其与蛋品性状的相关性,本研究以山麻鸭和绍兴鸭(Anas platyrhyncha domestica)各100个个体为研究材料,采用直接测序法进行OPN基因外显子7 SNPs的筛选。结果显示,山麻鸭中共发现8个突变位点,绍兴鸭有9个突变位点。在山麻鸭群体中,G544C、A671G,G672C、T761C和T873C 5处SNPs对部分蛋品性状有极显著或显著作用。而绍兴鸭群体中,A671G、G672C和T761C 3处SNPs对部分蛋品性状有极显著或显著作用。其中,山麻鸭A671G及G672C位点有3种基因型,对蛋壳厚度,BB型个体均值极显著高于其他基因型,对哈氏单位,AA型个体均值显著高于其他基因型。T761C位点有3种基因型,BB基因型对300日龄蛋壳厚度极显著优于AB/AB基因型。T873C位点,BB基因型在300日龄蛋壳厚度和蛋壳强度及500日龄蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋壳重均高于其他基因型。因此推断,位点T761C的B等位基因和T873C的B等位基因为改善蛋品性状的有利基因。绍兴鸭A671G和G672C位点在500日龄蛋形指数方面,AB基因型均值极显著高于AA和BB基因型。在T761C位点,BB型和AB型的300日龄蛋壳强度和蛋壳厚度均值显著高于AA基因型,在500日龄蛋形指数、蛋重、蛋壳重和蛋内容物重4个性状上,AB基因型均值略高于AA基因型,极显著高于BB基因型。结果表明,OPN基因可作为蛋品性状分子标记,为蛋鸭的标记辅助选择育种提供基础资料。 相似文献
2.
Toll-样受体(toll like receptors,TLRs)可以通过识别病原微生物启动天然免疫并激活适应性免疫.以中国荷斯坦奶牛和新疆褐牛为研究对象,对TLR4基因外显子3进行了序列分析,并对发现的多态性位点进行PCR-RFLP分析,共发现TLR4 E3+1656、TLR4 E3+2021和TLR4 E3+2414三个多态位点.对TLR4E3+1656和TLR4 E3+2021位点x2检验表明:2个品种的突变均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).运用最小二乘法分析表明,TLR4E3+1656位点的各基因型个体间的体细胞评分(SCS)差异不显著(P>0.05);而TLR4 E3+2021位点中AA与AB基因型SCS水平差异显著(P<0.05),AA与BB基因型SCS水平差异极显著(P<0.01),但AB与BB基因型SCS水平差异不显著(P>0.05).研究结果提示,TLR4E3+2021位点的AA基因型可能与抗乳房炎的抗性有关,A等位基因是乳房炎抗性的有利基因.采用RT-PCR技术检测了不同基因型的新疆褐牛个体中TLRs信号通路下游的部分基因mRNA的表达水平,结果显示,NF-κB1、NF-κB2和IL-1β基因mRNA表达水平与TLR4 E3+2021位点AB和BB两种基因型差异显著(P<0.05),TLR4、IL-10和IL-8基因mRNA表达水平与TLR4 E3+2021位点AB和BB两种基因型差异不显著(P>0.05). 相似文献
3.
利用PCR-SSCP技术检测垂体腺苷酸环化酶激活多肽基因（PACAP）在257头秦川牛（Bos tarurs）群体中的多态性,并构建最小二乘分析模型,分析基因型与部分生长性状的相关性。结果表明,在该基因3909bp处发生G/A突变,基因型检测结果共发现3种基因型,AA、AB和BB,A和B等位基因的频率分别为0.5992和0.4008。卡方检测结果显示该位点在所检测秦川牛群体中处于Hardy-Weinbery平衡状态。方差分析结果显示：体斜长,AA、AB和BB基因型个体之间差异均达到极显著（P〈0.01）;体高,AA和AB基因型个体极显著高于BB基因型个体（P〈0.01）,AA基因型个体显著高于AB基因型个体（P〈0.05）;体重,AA和AB基因型个体极显著高于BB基因型个体（P〈0.01）;胸围,AA基因型极显著高于BB基因型个体（P〈0.01）,AA基因型个体显著高于AB基因型个体（P〈0.05）,AB基因型个体显著高于BB基因型个体（P〈0.05）;胸宽,AB基因型个体显著高于BB基因型个体（P〈0.05）;而其它性状差异均不显著。该位点可能是影响秦川牛体斜长、体高、体重、胸围和胸宽的主效QTN或与之紧密连锁,可作为秦川牛选育的侯选分子标记。 相似文献
4.
为寻找与山羊(Capra hircus)产羔数密切相关的分子标记,加快山羊育种进程,研究转化生长因子β1基因(TGF-β1)遗传多态性与山羊产羔数的相关性,根据牛的TGF-β1基因序列设计3对引物,采用PCR-SSCP.和DNA测序技术检测山羊TGF-β1基因外显子2和内含子3的多态性,同时用最小二乘法研究了其多态性与产羔数的关系。结果表明,在波尔山羊和陕南白山羊中,仅第二外显子148bp位点碱基发生A→G的突变,导致苏氨酸(Thr)变为丙氨酸(Ala);多态位点均以A为优势等位基因,基因频率分别为0.530和0.648。在波尔山羊的1～3胎产羔数中,AB型个体的产羔数显著高于BB和AA型个体(P<0.05);在第四胎产羔数和平均产羔数中,AB型个体的产羔数显著高于AA(P<0.05),显著高于BB(P<0.05);BB型个体的平均产羔数显著高于AA型(P<0.05)。在陕南白山羊中,AB型个体的2～4胎产羔数和平均产羔数显著高于AA和BB型个体(P<0.05);在第一胎中,AB型个体显著高于AA型个体(P<0.05)。研究结果表明TGF-β1基因多态位点与产羔数显著相关,可以用于山羊分子遗传育种的候选基因。 相似文献
5.
肌肉生长抑制素基因(MSTN)外显子1的多态性及其与边鸡生长性状的关联分析 总被引：5，自引：0，他引：5
为了对边鸡生长性状的标记辅助选择提供基础资料,本研究采用PCR-SSCP技术检测边鸡(Gallusgallus)及3个对照鸡(G.gallus)群体(京海黄鸡、尤溪麻鸡和Arbor Acre鸡)肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因外显子1的单核苷酸多态性,并与边鸡的生长性状进行相关性分析。结果表明,在边鸡、京海黄鸡和尤溪麻鸡中都检测到6种基因型(AA、AB、BB、BC、AC和CC),而在Arbor Acre鸡中只检测到4种基因型(AB、BC、AC和CC)。总共检测到3个多态位点(G2100A、G2109A和C2244G)。在6～8和12周龄时,BB基因型个体的体重显著高于AA基因型个体(P<0.05)。在14周龄时,BB基因型个体的体重显著高于AA和AC基因型个体(P<0.05)。在16～18周龄时,BB基因型个体的体重显著高于其余5种基因型个体(P<0.05)。研究结果提示,MSTN基因可能是影响边鸡生长性状的一个主效基因或是与之存在紧密遗传连锁的一个标记。 相似文献
6.
高密度脂蛋白结合蛋白(high density lipoprotein binding protein,HBP)在动物的脂肪代谢中发挥重要的作用。脂类是鱼类的重要能源物质,尤其是那些对糖类利用率很低的肉食性鱼类。HBP基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)可能会影响脂肪代谢,而对大口黑鲈的生长性状产生影响,研究其SNP与生长性状的相关性可为其分子标记辅助选择提供候选标记。本研究根据大口黑鲈(Micropterus salmoides)EST-SNP库中HBP基因的序列(GenBank accession No.KF652241),用直接测序法在HBP基因3'非编码区获得了3个SNPs位点:H1(G+2782T),H2(T+2817C)和H3(G+2857A);随机选择同批繁殖、同塘养殖的165尾大口黑鲈样本,对3个SNPs位点用SnaPshot方法进行检测和分型,分型结果用软件Popgene32进行遗传结构分析;运用软件spss17.0的一般线性模型(general linear model,GLM)对获得的不同基因型与生长性状进行关联分析。结果表明,3个位点均处于哈温平衡,其中H1和H2位点组成了两种单倍型(A和B),观测到3种基因型(AA、AB和BB);H1、H2和H3共组成6种双倍型(D1、D2、D3、D4、D5和D6)。不同基因型与生长性状的相关性分析显示,基因型BB在体质量和全长形态指标显著高于基因型AB(P0.05),双倍型D6在体质量和全长形态指标显著高于双倍型D4(P0.05)。本研究在大口黑鲈HBP基因3'非编码区获得了与生长性状相关的SNPs标记,可应用于大口黑鲈分子标记辅助选择育种。 相似文献
7.
西安地区荷斯坦奶牛群5个基因位点遗传多态性与泌乳性状的相关分析 总被引：6，自引：0，他引：6
首次以IGFBP-3基因作为中国荷斯坦牛泌乳性状的候选基因，对中国荷斯坦奶牛群5个基因位点中4个多态基因位点与泌乳性状进行了相关分析。κ-cn、β-lg、β-lg 5′侧翼区和IGFBP-3多态基因位点基因型与泌乳性状的最小二乘分析和多重比较表明，κ-cn基因位点基因型对所有的性状影响不显著；IGFBP-3 BB型的305 d泌乳量显著高出AA、AB型1054.17 kg和838.15 kg (P <0.05)， AB型的乳蛋白率显著高于BB型(P< 0.05)；β-lg AA型对乳脂率与乳蛋白率的比值有正效应，AB型对乳蛋白率具有负效应；β-lg 5′侧翼区AA型的305 d泌乳量显著高于AB型(P <0.05)，AA型的乳脂率显著高于BB型(P < 0.05)， BB型的乳蛋白率显著高于AB型(P <0.05)。 相似文献
8.
采用PCR-RFLP、CRS-PCR和DNA测序技术,对435头荷斯坦牛的酪蛋白基因的外显子4和5上2个单核苷酸多态性(SNP)位点进行了研究.结果发现,在435头牛群中,共有8种基因型组合.单个SNP位点关联分析表明:T10996A突变位点3种基因型间TA基因型个体乳脂率极显著高于AA基因型个体(P<0.01),TA基因型个体乳蛋白率显著高于AA基因型个体(P<0.05).T12980C突变位点的3种基因型间TC基因型个体乳脂率极显著高于TT基因型个体(P<0.01),TC和CC基因型个体乳蛋白率显著高于TT基因型个体(P<0.05).T10996A/T12980C两种基因型组合分析中,在乳脂率上,TTCC基因型组合个体最高,TATC基因型组合个体位居第三位;在乳蛋白率上,TATC基因型组合个体显著高于AATT基因型组合个体(P<0.05).酪蛋白基因不同基因型和基因型组合与荷斯坦牛乳脂率和乳蛋白率存在相关性,但与产奶量和脂蛋白比不相关. 相似文献
9.
设计5对引物P1～P5,采用PCR-SSCP技术检测210头荷斯坦母牛DNA依赖性蛋白激酶(DNA-dependent protein kinase,PRKDC)基因部分序列的多态性.结果发现P2扩增的外显子区域存在G34126A 1个突变位点,导致丝氨酸变为天冬酰胺;P3的扩增产物存在C77353T、T77384G、C77406T和77 408bp处C缺失4个突变位点.P2扩增产物经SSCP分析有AA、AB和BB 3种基因型,其频率分别为0.186、0.433和0.381;P3扩增片段经SSCP分析有CC、CD、DD、CE和DE 5种基因型,其频率分别为0.786、0.129、0.009、0.067和O.009.用最小二乘法分析PRKDC基因多态性与荷斯坦母牛体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关系,结果表明:对于P2扩增产物多态位点,AA基因型SCS最小二乘均值显著低于AB和BB基因型所对应的值(均为P＜0.05),AB和BB基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P＞0.05);对乳房炎抗性,AA是最有利基因型,BB是最不利基因型;对于P3扩增产物多态位点,CC、CD、DD、CE和DE基因型SCS最小二乘均值差异均不显著(P＞0.05).研究结果初步表明PRKDC基因G34126A多态位点的A等位基因是提高奶牛乳房炎抗性的一个潜在的DNA标记. 相似文献
10.
雌激素受体(estrogen receptor,ESR)是核受体超家族中的一种配体依赖的转录因子,大量研究显示,ESR基因与动物的繁殖活动密切相关.为了分析ESR基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)及其与蛋鸽(Columba livia)产蛋量的关系,本研究以泰平王鸽(C.livia)215个样本为研究对象,采用第一代测序法对ESR基因部分片段进行SNPs筛选.在所测的3个片段中共发现了10个突变位点,分别为ESRα基因的T129416C,ESRβ基因的T365C、A388G、C389A、A429G、G451A、G577A、T672C、A923C和T17167C,其中有3个突变位于外显子上,但只有位点G577A导致了氨基酸的改变,由氨基酸异亮氨酸(isoleucine,Ile)转变为缬氨酸(valine,Val).对10个位点进行了Hardy-Weinberg平衡状态检验,结果显示,所有位点均处于平衡状态.10个位点的连锁不平衡分析显示,位点S2与位点S4、S9为强连锁不平衡(D'≈1,r2＞0.8),位点S4、S9可以完全代表S2.多态位点与产蛋量关联分析显示,位点S8与产蛋量呈极显著相关,其中杂合子AB型的平均产蛋量极显著的高于纯合子AA型(P＜0.01);而纯合子BB型的平均产蛋量低于AB型,高于AA型,但差异不显著(P＞0.05).本研究表明,ESRβ基因中位点S8可作为蛋鸽产蛋量性状选育的候选分子标记位点,为蛋鸽的分子标记辅助育种提供资料. 相似文献
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Knudsen PB Mogensen JM Larsen TO Nielsen KF 《Journal of agricultural and food chemistry》2011,59(2):772-776
Concerns that raisins may be contaminated by fumonisins stem from the persistent occurrence of Aspergillus niger spores on raisins and the recent discovery of fumonisin production by A. niger on grapes, which leads to the widespread occurrence of fumonisin B(2) in wine. This study presents an LC-MS/MS survey of fumonisins in retail raisins. In 10 of 21 brands collected in Denmark, Germany, and The Netherlands, fumonisins B(2) and B(4) were detected at levels up to 13 and 1.3 μg/kg, respectively. Only fumonisin B(2) has been detected in wine, so the presence of fumonisin B(4) in raisins suggests that the fumonisins are produced mainly during the drying process concomitant with the decreasing water activity. Analysis of multiple packages from one manufacturer showed a 3-fold package-to-package variation, suggesting that a few raisins per package are contaminated. 相似文献
13.
猪Tool-like Receptor 4(TLR4)的定位和组织表达 总被引：1，自引：0，他引：1
通过辐射杂交板的方法将猪的Tool-like Receptor 4(TLR4)定位在SSC1q2.9→q2.13,它与SW1957紧密连锁(15cR LOD score 15.16)。用RT-PCR表明TLR4mRNA在猪的睾丸、灰质、肌肉、白质、肾脏、心脏、小肠、胸腺、淋巴结、脾、肺和肝脏等各种组织中广泛表达,在肺中的表达量最高。TLR4mRNA在肺中的表达量可能与猪肺部疾病有关。 相似文献
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The effects of enhanced (NH4)2SO4 (NS) deposition on Norway spruce (Picea abies [L.] Karst) fine root biomass, vitality and chemistry were investigated using root-free in-growth cores reproducing native organic and mineral soil horizons. The cores were covered and watered every 2 weeks with native throughfall or throughfall supplemented with NS to increase deposition by 75 kg ha-1 a-1 NH4 +-N (86 kg ha-1 a-1 SO42--S). The in-growth cores were sampled after 19 months and assessed for root biomass, necromass, length, tip number, tip vitality and fine root chemistry. Root biomass and fine root aluminium (Al) concentration were negatively correlated, but NS deposition had no effect on root growth or root tip vitality. NS deposition caused increased fine root nitrogen (N) concentrations in the organic horizon and increased Calcium (Ca) concentrations in the mineral horizon. Fine root biomass was higher in the organic horizon, where fine root Al and potassium (K) concentrations were lower and Ca concentrations higher than in the mineral horizon. Results highlighted the importance of soil stratification on fine root growth and chemical composition. 相似文献
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K. H. Feger 《Water, air, and soil pollution》1992,61(3-4):295-307
Nitrogen cycling in two Norway spruce (Picea abies (L.) Karst.) ecosystems in the ARINUS experimental watershed areas Schluchsee and Villingen (Black Forest, SW Germany) and initial effects of a (NH4)2SO4 treatment are discussed. Although N reserves in the soils are similar and atmospheric N input is the same low to moderate level characteristic for many forested areas in SW Germany, N export by both seepage and streamwater differs considerably. At Villingen, deposited N is almost totally retained in the ecosystem, whereas at Schluchsee N export is the order of the input. This is explained by differences in forest management history. The Villingen site had been subject to excessive biomass export (e.g., litter raking) leading to unfavorable microbial transformations in the soil. In contrast, as a ‘relic’ of the former beech stand, the Schluchsee site is characterized by high biological activity in the soil with vigorous nitrification despite low pH values. Accordingly, the two ecosystems responded differently to the additional N input (150 kg NH4 + -N ha?1 as (NH4)2SO4). Nitrification starting immediately in the Schluchsee soils led to continued Al mobilization and leaching of basic cations and NO3 ?. The availability of Mg, already deficient before treatment, further decreased due to Mg leaching and marked N uptake by the stand. In contrast, most of the added N in Villingen was immobilized in the soil. Hence, uptake by the stand and leaching of NO3 ? and cations was correspondingly lower than at Schluchsee. The results emphasize the problems associated with the definition of generally applicable values for ‘critical loads’ of N deposition. 相似文献
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(R)-Terpinen-4-ol was mixed in an artificial diet at a concentration of 1 mg/g of diet, and the diet was fed to the last instar larvae of common cutworm (Spodoptera litura). Metabolites were recovered from frass and analyzed spectroscopically. (R)-Terpinen-4-ol was transformed mainly to (R)-p-menth-1-en-4,7-diol. Similarly, (S)-terpinen-4-ol was transformed mainly to (S)-p-menth-1-en-4,7-diol. The C-7 position (allylic methyl group) of (R)- and (S)-terpinen-4-ol was preferentially oxidized. 相似文献
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本文采用在硫酸铈(Ce~(4+))体系中,加入硫酸铜(Cu~(2+))的方法,改进铈(Ce~(4+))剂量体系的稳定性。实验测定Ce~(4+)/Cu~(2+)体系中,Ce~(4+)的摩尔吸光度5643±451.M~(-1).cm~(-1)。在150—4×10~4Gy范围内,用三种Ce~(4+)浓度,测定水深5厘米校准点的G(Ce~(3+))为2.20±0.04。研究表明,G(Ce~(3+))值随辐照温度的上升而线性下降,测得辐照温度修正系数为-(5.13±0.07)×10~(-3)/℃。在Ce~(4+)溶液体系中,加入0.1M Cu~(2+),使剂量体系趋于稳定。对非限束~(60)Coγ源,水中校准点吸收剂量不确定度±3.3%,重复性好于±2.5%。Ce~(4+)/Cu~(2+)适宜作为辐射加工中高剂量区的参考剂量计。 相似文献