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为了借助分子标记手段对草菇菌株进行鉴别，利用7个RAPD、ISSR，对62个草菇菌株基因组DNA进行PCR扩增，对草菇菌株的遗传差异进行分析。结果表明，7个引物共扩增出46条清晰的DNA片段，其大小介于250-2000bp，其中多态性片段43条，平均多态性位点百分率为93.5%。DNA指纹图谱分析结果表明，所有的供试菌株间的DNA指纹均存在差异性，各菌株间的遗传相似系数在0.63~0.97之间。聚类分析结果表明，62个草菇菌株在遗传相似系数为0.80处可以分成25个群组 草菇V0062、V0079和V0004与其它菌株之间的遗传距离最远。菌株V0084和V0085相似系数为0，需要借助其它方法进行进一步的鉴定。 相似文献
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《分子植物育种》2016,(1)
本研究以苹果砧木SH38为材料,利用正交试验设计对影响SRAP-PCR反应的4因素(Taq DNA聚合酶、模板DNA,d NTPs,引物)4水平进行优化,并构建苹果砧木SH38的SRAP-PCR的最佳反应体系。结果显示:15μL的总反应体系中,d NTPs浓度为0.3 mmol/L,Taq DNA聚合酶用量为0.75 U,上、下游引物为50 ng,DNA模板用量为60 ng。运用该反应体系并结合BSA法,从128对引物组合中筛选出4对引物,该4对引物扩增出的特异性片段与苹果砧木的耐盐基因存在连锁。研究结果可为苹果砧木利用SRAP分子标记进行耐盐性的分子标记辅助育种提供基础。 相似文献
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杂交水稻种子纯度分子鉴定技术研究 总被引：3，自引：0，他引：3
为了鉴定杂交水稻种子的纯度,用49条ISSR引物对供试的5组三系杂交水稻F1和父母本进行扩增,结果28条引物能扩增出DNA带,随机选取其中3条引物用于指纹分析,3条ISSR引物共扩增出32条DNA带,其中多态性条带为27条,并将这些多态性条带进行聚类分析。 相似文献
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以辣椒细胞质雄性不育系21A及其保持系21B的线粒体DNA为材料进行SRAP分析,结果表明,从128对引物扩增获得了1 440条100～1 000 bp的条带,多态性位点仅有9个,占0.63%,其中7条多态性条带位于21A中;对多态性条带回收、克隆和测序分析后发现,9个克隆在GenBank中找到了相似的功能,绝大部分与能量代谢有关;利用21A中的多态性序列特点设计SCAR引物,对21A和21B的基因组DNA进行扩增验证,3对引物在21A中扩增出目的条带,表明已成功地将SRAP标记转化为SCAR标记,是新发现的与辣椒细胞质雄性不育基因相关的片段。 相似文献
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SCoT-PCR是一种单引物扩增分子标记。为了将SCoT分子标记应用于海南油茶的分子鉴定和遗传多样性评价中,本研究采用单因素试验和正交试验结合方法,分析模板DNA、dNTPs、Taq DNA聚合酶及引物4种因素对海南油茶SCoT-PCR扩增结果的影响,构建海南油茶SCoT-PCR体系,并筛选多态性引物。单因素试验结果表明：DNA浓度对海南油茶扩增效率影响不大,高浓度dNTPs利于扩增产物,而Taq酶和引物扩增高效率偏于中浓度。正交试验结果表明：各因素对海南油茶SCoT-PCR扩增影响大小依次为引物>Taq DNA聚合酶>dNTPs>模板DNA;总体系为20μL时,最佳反应体系中模板DNA用量为30 ng,dNTPs浓度为0.30 mmol/L,引物浓度为0.60μmol/L,Taq DNA聚合酶用量为1.00 U。利用构建的SCoT-pcr体系对80条SCoT单引物进行筛选,最终筛选出16条SCoT条带清晰的多态性引物,多态性比率平均值达到76.25%。本试验结果可为海南油茶的遗传多样性分析和种质资源鉴定等研究提供参考数据。 相似文献
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ISSR分子标记及其在植物研究中的应用 总被引：2，自引：0，他引：2
ISSR(inter simple sequence repeat)分子标记是一种以微卫星序列为引物,进行多位点PCR扩增的技术.ISSR技术简易、快捷,同时兼备AFLP(扩增酶切片段多态性)、SSR(简单序列重复)和RAPD(DNA随机扩增多态性)等分子标记方法的优点.引物设计无需预知基因组序列,只要是目标区域的长度在可扩增范围内,就能扩增出微卫星重复序列间的DNA片段.ISSR标记以其高多态性,已被广泛应用于种质收集、品种鉴定、遗传多样性、系截系、遗传作图、基因定位、标记辅助选择、预测基因组SSR基序的丰度以及SSR引物开发等研究.本文对ISSR技术及其在植物研究中的应用进行全面的概述. 相似文献
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SSR-PCR产物的重测序是SSR标记技术开发和应用的必要步骤。本研究以6个桉树DNA样品为对照组,1个基因组DNA混合池为试验组进行基因组DNA混合池在SSR引物筛选中的可靠性性分析。通过SSR-PCR产物的重测序分析,6个桉树单一DNA样品与基因组DNA混合池的扩增序列比对结果分析显示,两种模板扩增结果差异不显著,即基因组DNA混合池可以替代多个单一DNA样品进行SSR引物的高效筛选。利用20对SSR引物在6种桉树DNA样品中的扩增序列进行多态性分析发现,同一位点不同桉树种间的扩增序列存在长度多态性和核苷酸多态性,从而证实了SSR序列的多态性和复杂性,为SSR标记技术在桉树遗传育种研究中的应用提供了理论依据。 相似文献
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基于AFLP和SSR分子标记的苹果属植物亲缘关系研究 总被引：1，自引：1，他引：0
研究比较AFLP与SSR 2种分子标记技术在苹果亲缘关系上的准确性。应用AFLP、SSR、AFLP与SSR结合这3种方法,对41份苹果属内种质资源类型进行亲缘关系分析。从64对AFLP引物中筛选出7对多态性较好的引物,7对引物平均多态率为86.72%。从40对SSR引物中筛选出7对多态性较好的引物,多态率均为100.00%。UPGMA聚类结果显示,3种方法分别将41份供试材料分为6大类群,大部分种质的分类结果与传统的分类方法一致。通过聚类分析也明确了部分新发现类型的分类地位归属,合理解释了新类型的起源,也通过分析比较了3种方法的准确性,认为AFLP的聚类结果更符合传统分类及田间形态,为苹果属植物种质资源的分类方法提供了分子生物学依据。 相似文献
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为了研究GA20氧化酶基因在苹果矮化砧木中的分子特征和表达特征,利用RT-PCR方法从苹果矮化砧木2号和36号c DNA中克隆了GA20氧化酶基因(GA20ox1),并对该基因及其编码氨基酸序列以及在不同时期砧木及嫁接品种中的表达分别进行了分析。结果表明,GA20ox1基因c DNA编码序列长1 179 bp,推导编码393个氨基酸(包括终止密码子),预测蛋白相对分子质量44.3 k Da,理论等电点5.89,编码的蛋白质包含GA20ox1基因家族所具有的特征保守结构域,系统进化分析表明该蛋白序列与苹果SH40的同源性达到96.9%。实时荧光定量PCR分析显示:36号砧木在6月份GA20ox1基因表达强度显著低于八棱海棠对照,而7-8月份的均显著高于对照,其上嫁接的品种7月份表达强度显著低于对照。在7-8月份2号砧木及嫁接品种GA20ox1基因的表达强度均显著低于对照。 相似文献
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山东主栽矮化中间砧苹果抗旱性主成分及隶属函数分析 总被引：3，自引：1，他引：2
使用抗旱性的砧木是解决目前苹果生产干旱问题的有效手段,但目前对于普遍使用的矮化中间砧并没有一个科学的抗旱性的评价。本研究利用主成分分析和隶属函数相结合的方法对山东普遍使用的矮化中间砧M26、SH40、MM106、M9和GM256（品种‘‘烟富3’’,基砧平邑甜茶）的抗旱性进行了综合评价。通过对干旱胁迫相关生理生化参数相对含水量(RWC)、脯氨酸(Pro)、丙二醛(MDA)、可溶性糖、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、叶绿素(Chl)含量进行主成分分析,利用隶属函数和权重计算求得综合评价值进行分析评价。结果表明：矮化中间砧M26、SH40、MM106、M9、GM256的综合评价值分别为：0.757、0.716、0.457、0.263、0.136,由此确定山东地区普遍使用的矮化中间砧抗旱性强弱顺序为：M26 >SH40 >MM106>M9 >GM256。 相似文献
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Identification of apple clonal rootstocks based on visual morphological characteristics is often difficult because of the genetic similarity of many rootstocks and the restriction of observable characteristics at the nursery stage. In this study, a total of 66 rootstock clones representing a sub‐sample of a collection of apple rootstocks from different countries maintained at NIFTS, Morioka, Japan, was screened with seven simple sequence repeat (SSR) markers to establish genetic identities, estimate genetic diversity, verify parentage and examine genetic relationships. All seven SSR loci produced one or two amplified fragments and made it possible to differentiate among the rootstocks, except between virus‐free subclones and their original parents as well as between ‘Aotea 40’ and ‘Aotea 106’. The parentage of all but one rootstock clone was confirmed. The placement of individual rootstock clones into subgroups in a phenogram generated from un‐weighted pair group average cluster analysis was generally based on parentage or genetic origin. Based upon the ability of the SSR data to differentiate these apple rootstocks and the high level of gene diversity, it is proposed that all commercial apple rootstocks be fingerprinted to provide a mechanism to verify the identity of individual clones. 相似文献
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随着肥料的大量施入,果园土壤酸化现象日趋严重,而酸性土壤中的铝能破坏根尖结构,抑制根系伸长生长,对树体生长造成不良影响。笔者以1年生平邑甜茶（Malus hupehensis Rehd.）、八棱海棠（M.micromalus Makino）、东北山荆子（M.baccata Borkh.）、富平楸子[M.prunifolia（Willd.）Borkh.]和新疆野苹果[M.sievesii（Ledeb.）Roemer]为材料,研究其在不添加和添加少量速效磷条件下对AlPO4的吸收和利用特性。结果表明：AlPO4胁迫下,5种砧木根、茎、叶各器官生物量及整株生物量从高到低分别为平邑甜茶〉八棱海棠〉新疆野苹果〉富平楸子〉东北山荆子;平邑甜茶AlPO4吸收效率最高,为8.85 mg/株,其次是八棱海棠（6.93 mg/株）,东北山荆子磷吸收效率最低,仅为2.22 mg/株。少量速效磷诱导后,5种砧木的生物量和磷吸收效率均显著增加,但不同砧木增加量差异显著,其中增幅最大的是东北山荆子,其总生物量和磷吸收效率分别增加2.17倍和2.27倍,其次为富平楸子（1.55倍和1.74倍）,平邑甜茶增幅最小,其生物量增加了0.44倍,磷吸收效率增加0.38倍,但砧木的磷利用效率无显著差异。因此,平邑甜茶对AlPO4的适应能力最佳,八棱海棠次之,东北山荆子最差。与添加少量速效磷处理相比,铝胁迫明显降低了各砧木根际环境的pH,平邑甜茶降低幅度最大（1.52）,其次为八棱海棠（0.59）,东北山荆子降幅最小,其pH仅降低0.22。 相似文献
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C. Bisognin E. Seemüller S. Citterio R. Velasco M. S. Grando W. Jarausch 《Plant Breeding》2009,128(5):507-513
To obtain apple rootstocks resistant to apple proliferation and suitable to modern fruit growing, 24 cross-combinations were performed over a 5-year period using Malus sieboldii and its hybrids as donors of the resistance trait and standard apple rootstock Malus × domestica genotypes as donors of agronomic value. Breeding with these genotypes was achieved despite different degrees of apomixis and polyploidy. Sets of five to six locus-specific microsatellite markers were identified for characterizing each progeny. Supported by flow cytometry these markers were applied to infer mode of reproduction, genomic constitution and ploidy level. Microsatellites allele composition identical to the maternal parent was revealed in 1668 of 3032 seedlings indicating seed formation through apomixis. Complete genetic recombination was found in 398 seedlings. The remaining hybrids displayed a higher ploidy than that of the parental plants which was consistent with the fertilization of unreduced egg cells. Thus, for each cross-combination, microsatellite loci were identified which enabled a reliable prediction of the ploidy level. They can now be applied in routine screening to distinguish sexual from apomictic progeny. 相似文献
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SH系列苹果矮化砧木育种研究 总被引：5，自引：0，他引：5
SH系列苹果矮化砧木系国光×河南海囊种间杂交育出的苹果无性系自根砧,对照为M_9,M_7,MM_(106)无性系自根砧和山定子实生砧,嫁接品种为羽红(3号 红星)、金冠、富士等.1987年杂交,1982年秋定植于鉴定圃.经过5年的生物学特性、物候期及园艺学性状观察,以及矿质营养,净光合效率,气孔阻力,蒸腾强度,ABA含量等分析测定,4100个砧木杂交单系中选出SH系列苹果矮化砧木.本文报道的是SH系列中SH_3、SH_4、SH_5、SH_9、SH_(12)、SH_(14)、SH_(15)、SH_(20)、SH_(21)、SH_(29)等10个突出的优系砧木.它们的共同性状表现为早花早果,树体矮化、半矮化,抗逆性强(抗旱、抗倒伏、抗抽条),早期丰产稳产,果实着色浓红艳丽,含可溶性固形物高,风味浓,品质好,果实硬度大耐贮藏,容易繁殖,综合性状超过对照M_9、M_7、M_(106)和山定子的苹果矮化砧木新系列. 相似文献