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应用AFLP技术检测水稻遗传多样性的研究 总被引：5，自引：0，他引：5
利用扩增片断长度多态性（Amplified fragment lenth polymorphism简作AFLP)分子标记技术研究了23个水稻品种的遗传多样性从49对AFLP引物中筛选出4对多态性高，分辨能力强的引物。4个AFLP引物组合分别扩增出43、37、49、33条多态性带，平均每个引物组合扩出40．5条多态性带，4个引物组合共扩增出246条带。利用AFLP数据进行聚类分析，将23个品种聚为10个类群，结果表明，AFLP在水稻类群划分的应用是可行的。 相似文献
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7个柱花草品种的AFLP和SSR遗传多样性分析 总被引：2，自引：1，他引：1
旨在阐明不同柱花草品种的遗传差异。利用AFLP、SSR两种分子标记技术对7个柱花草品种进行遗传多样性分析。12对AFLP引物组合共扩出966个条带,其中多态性条带有850条,平均每对引物的多态性条带为70.8条,多态性比率为87.99%。10对SSR引物共扩出26个条带,其中多态性条带有23个,多态性比率为88.46%;10对引物的观察杂合度(Ho)的范围是0~0.7143,平均为0.1857,Shannon’s遗传多样性指数(I)平均值为0.6545,平均多态性含量(PIC)为0.727。根据非加权成对平均数法(UPGMA)进行聚类分析,获得品种聚类树形图,AFLP与SSR分析的聚类图相似性显著,7个品种明显分成两类。‘矮柱花草’与‘西卡柱花草’的遗传关系最为疏远,‘奥克雷柱花草’与‘爱德华柱花草’、‘格拉姆柱花草’与‘热研5号柱花草’关系最为密切。 相似文献
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不同类型黄瓜亲缘关系的AFLP分析 总被引：6，自引：2，他引：4
用AFLP分子标记对4种不同类型黄瓜种质资源进行了多态性分析.利用NTSYS软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图.从50对AFLP引物中筛选出24对多态性高、扩增稳定、重复性好的引物.结果表明:24对引物组合共产生1 367条扩增带,平均每对引物组合产生56.96条;共产生多态性位点297个,多态性比率为21.7%.28份材料两两间的遗传相似系数在0.841 3～O.994 9之间.聚类分析结果显示,28份材料被聚成7小组,各组内生态类型基本一致.其中,华北有刺类型黄瓜在DNA水平上的同源性极高,遗传变异度较小,多样性水平较低,不如其他3个类型黄瓜多样性丰富.试验结果表明AFLP标记位点多,重复性好,可以揭示不同类型黄瓜种质之间的遗传基础. 相似文献
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西瓜种质资源的遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析 总被引：2，自引：1，他引：2
利用AFLP指纹图谱分析技术对57个西瓜材料进行了基因组DNA多态性分析.结果表明,18对AFLP引物共产生709条DNA带,平均每个引物组合扩增出39.4条带,其中440条为多态性带,占总带数的61.4%;根据DNA谱带计算品种间遗传相似系数,其变化范围在0.24～0.99之间,平均相似系数为0.70,说明西瓜品种间遗传基础狭窄.用NTSYS软件进行聚类分析,57个西瓜品种被划分为2个类群.其中类群1包括1个野生西瓜,类群2均为栽培种.在类群2中引进的资源聚在一起,杂交种和双亲或其一聚在一起.此外,本研究表明,AFLP指纹分析技术具有很高的分辨率,能够揭示西瓜品种间的差异,是鉴定西瓜品种的有力工具. 相似文献
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SSR和AFLP分析玉米遗传多样性的研究 总被引：26，自引：3，他引：26
利用SSR，AFLP两种分子标记方法研究了23个玉米种质材料的遗传多样性，并对这两种分子标记系统进行了比较。利用筛选出的40对SSR引物，检测到了202个等位基因。用12对AFLP引物组，检测到了444条有多态性的带。SSR和AFLP分子标记均有很高的多态性，SSR位点的平均多态性信息量（PIC）值达0．60，而AFLP多态性带比例是72％。两种分子标记结果将玉米种质划分为5组，与系谱分析基本一致，两种分子标记划分的结果也相近。研究认为SSR，AFLP两种分子标记系统均适合于玉米种质的遗传多样性研究。 相似文献
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利用AFLP指纹图谱分析技术对57个西瓜材料进行了基因组DNA多态性分析。结果表明,18对AFLP引物共产生709条DNA带,平均每个引物组合扩增出39.4条带,其中440条为多态性带,占总带数的61.4%;根据DNA谱带计算品种间遗传相似系数,其变化范围在0.24-0.99之间,平均相似系数为0.70,说明西瓜品种间遗传基础狭窄。用NTSYS软件进行聚类分析,57个西瓜品种被划分为2个类群。其中类群1包括1个野生西瓜,类群2均为栽培种。在类群2中引进的资源聚在一起,杂交种和双亲或其一聚在一起。此外,本研究表明,AFLP指纹分析技术具有很高的分辨率,能够揭示西瓜品种间的差异,是鉴定西瓜品种的有力工具。 相似文献
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利用SSR标记分析野生小豆及其近缘野生植物的遗传多样性 总被引：1，自引：0，他引：1
利用28对SSR引物对96份野生小豆资源、小豆近缘野生植物及栽培小豆品种进行遗传多样性分析,共检测到255个等位变异,平均每对SSR引物9.10个,多态信息含量的变异范围从0.374到0.865,平均为0.722。野生小豆材料和近缘植物Vigna minima遗传变异丰富。来自不同地域的野生小豆材料具有大量特异等位变异,基于非加权成组配对算术平均法的聚类分析可将不同地理来源的野生小豆单独分群,且与主坐标分析的结果相一致。4份栽培小豆材料与日本野生小豆遗传距离较近,表明目前国内小豆育种中较多使用了含有日本血缘的小豆材料,以及国内野生小豆资源的搜集和利用工作落后于日本。本研究对国内野生小豆资源的搜集和保存具有指导意义,并可以为这些资源的评价、利用和优异基因的发掘提供参考。 相似文献
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为了筛选出优异的扁蓿豆育种新材料,本研究采用AFLP和SSR分子标记技术对来自于中国7个省市自治区的15份扁蓿豆种质资源进行遗传多样性的比较分析,结果表明:18对SSR引物扩增出109个多态位点,8个AFLP引物组合扩增出640条带,其中472条多态带.AFLP标记的平均Nei′s遗传多样性指数、Shannon多样性指数和遗传分化系数均高于SSR标记.15份扁蓿豆种质的遗传距离和遗传相似系数与地理类群很接近.AFLP和SSR数据的聚类分析显示:15份扁蓿豆种质分为4大类,但是聚类结果与地理类群不完全相符,主成分结果与聚类结果相似,Mantel 检测表明:AFLP和SSR数据有较高的显著相关性,AFLP和SSR标记能够有效地对扁蓿豆进行遗传多样性分析,其结果为扁蓿豆育种和资源保护具有指导意义. 相似文献
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Knowledge of the genetic relationships among landraces is useful to gene bank managers because it permits a better organization of the crop's gene pool management, more efficient sampling of the available germplasm resources and better access to useful genetic variation for breeders. Genetic diversity of 19 landraces of the cultivated mung bean, Vigna radiate, and three weedy and wild relatives including Vigna mungo, Vigna luteola and Vigna radiate var. sublobata, was investigated at the DNA level with the random amplified polymorphic DNA (RAPD) procedure. Sixty random decamer primers were employed in amplification reactions; 28 of these were informative and yielded 246 bands, of which 229 were polymorphic with a mean of 8.2 bands per primer. A genetic distance matrix based on Nei and Li coefficient was converted to a dendrogram and a two-dimensional plot using multidimensional scaling (MDS). The accessions studied were separated into three main clusters, which included V. radiate landraces, V. mungo and V. luteola, respectively. The variation of this cluster supports the view that the genetic distance of V. mungo and V. luteola varies considerably from the accession VO2955 (V. radiata). The multidimensional scaling plot confirmed that V. mungo, V. luteola and most of the accessions of V. radiata formed distinct clusters with no overlap, and two mung bean accessions (PI177493 and VO4134–1 from Turkey and India, respectively) were genetically distant from other V. radiata landraces. V. radiata and V. mungo are positioned in separate botanical species and V. radiata var. sublobata is classified within other V. radiata landraces. Based on the limited range of accessions tested, the approach holds promise for the classification of mung bean germplasm, identification of mung bean landraces and applications of molecular markers to mung bean breeding. 相似文献
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Anochar Kaewwongwal Alisa Kongjaimun Prakit Somta Sompong Chankaew Tarikar Yimram Peerasak Srinives 《Breeding Science》2015,65(2):127-137
In this study, 520 cultivated and 14 wild accessions of black gram (Vigna mungo (L.) Hepper) were assessed for diversity using 22 SSR markers. Totally, 199 alleles were detected with a mean of 9.05 alleles per locus. Wild black gram showed higher gene diversity than cultivated black gram. Gene diversity of cultivated accessions among regions was comparable, while allelic richness of South Asia was higher than that of other regions. 78.67% of the wild gene diversity presented in cultivated accessions, indicating that the domestication bottleneck effect in black gram is relatively low. Genetic distance analysis revealed that cultivated black gram was more closely related to wild black gram from South Asia than that from Southeast Asia. STRUCTURE, principal coordinate and neighbor-joining analyses consistently revealed that 534 black gram accessions were grouped into three major subpopulations. The analyses also revealed that cultivated black gram from South Asia was genetically distinct from that from West Asia. Comparison by SSR analysis with other closely related Vigna species, including mungbean, azuki bean, and rice bean, revealed that level of gene diversity of black gram is comparable to that of mungbean and rice bean but lower than that of azuki bean. 相似文献
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马铃薯品种遗传多样性的AFLP分析 总被引：5，自引：0，他引：5
利用AFLP分子标记技术对19份克新系列马铃薯品种进行了遗传多样性分析,用30对引物组合进行了初筛,选出7对有多态性的引物组合进行了详细研究。每对AFLP引物组合扩增出54~90条带,共获得495条带,其中多态性条带为302条。AFLP分析表明19个材料的遗传距离介于0.2091~0.7679之间,平均值为0.4811。聚类分析将19份材料划分为4类,其中第2类包括14个品种,占总数73.86%,表明多数品种亲缘关系较近,但有少数品种亲缘关系较远,说明克新系列马铃薯的遗传基础有所拓宽。研究表明：AFLP指纹分析技术具有很高的分辨率,适于进行马铃薯遗传多样性研究 相似文献
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利用SSR分析四倍体棉种多态性 总被引：7，自引：2，他引：5
利用SSR标记对60份四倍体棉种材料进行遗传多样性分析,其中包括42份陆地棉野生种系。结果显示, 从1 050对SSR引物筛选出的95对SSR引物均能在60份材料间扩增出稳定明显的多态性条带,共检测出660个片段,其中多态性片段584个,占88.5%。每个位点的等位基因为2~12个,平均每对引物6.1个。UPGMA聚类分析显示, 42份材料的相似性系数(GS)在0.306~1.000之间,平均成对相似系数为0.493。95对引物的多态信息含量(PIC)的变幅为0.278~0.905,基因多样性(H¢)的变幅为0.451~2.451, 有效等位基因数(Ne)在1.385~10.490之间变动。SSR标记在陆地棉野生种系及四倍体棉种间均可反映丰富的遗传多样性信息,其中陆地棉与陆地棉野生种系中阔叶棉的亲缘关系最近,海岛棉和达尔文棉的亲缘关系非常相近,黄褐棉和毛棉相对较近,陆地棉与其他4个棉种的亲缘关系最远。 相似文献
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木豆种质资源AFLP标记遗传多样性分析 总被引：6，自引：0，他引：6
利用AFLP分子标记技术,以木豆野生种(Cajanus scarabaeiodes)为对照,对来自印度、中国、非洲和美洲的139份栽培木豆(Cajanus cajan)种质遗传多样性进行研究。17对引物共扩增出502条清晰可辨的带,其中多态性带494条。遗传相似性系数UPGMA聚类图,揭示木豆种内存在足够的遗传多样性,可用于种质资源的准确鉴别与分类。借助遗传距离的ME进化树又将参试种质分成8个组群。分析结果表明,印度地方资源遗传多样性广泛,育成品种遗传基础广阔;非洲、美洲资源遗传多样性较丰富,且与印度资源的亲缘关系较密切。中国地方资源遗传多样性独特,且与印度、非洲、美洲栽培木豆资源亲缘关系不明显。研究结果基本支持印度木豆起源和多样性中心、非洲次生多样性中心的观点,并提出中国次生起源中心和遗传多样性中心假说。研究还发现,木豆核质互作雄性不育系(A)和保持系(B)间存在独特的AFLP谱带差异,可能有助于分子标记辅助的木豆杂种优势利用和杂交种培育。 相似文献
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六倍体小黑麦种质资源遗传多样性分析 总被引：3，自引：1，他引：2
利用RAPD标记对10份六倍体小黑麦、1份普通小麦和1份黑麦种质资源遗传多样性进行了分析,19个RAPD引物中,有10个引物(52.63%)可扩增出清晰且具多态性的条带。10个引物共产生385条DNA片段,其中384条具有多态性,多态性比率为99.74%,不同引物扩增带数变幅为8~71条,平均为38.5条,扩增产物的片段大小为298~3 054 bp,材料间的遗传距离变化范围在0.724~0.833之间。对12份供试材料的遗传关系进行聚类分析,在平均GD值0.77水平上可将12份供试材料分为3类。研究结果为将六倍体小黑麦的优良基因导入到普通小麦中提供了理论依据。 相似文献