SDS-CTAB法提取烟草病圃土壤微生物总DNA   总被引：2，自引：1，他引：1  

蔡刘体  胡重怡  罗正友 《江西农业学报》2011,23(2):119-121

采用SDS-CTAB法提取了烟草病圃土壤中微生物的总DNA,经过纯化后获得的DNA大小约为21 kb,OD260/OD280高于1.70;用细菌和真菌保守序列引物进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳能检测到预期大小的扩增条带。  相似文献   

桉树人工林根际土壤DNA提取的优化     

胡凯  愈霞  王微 《湖北农业科学》2016,(12):3207-3211

通过优化土壤微生物总DNA的提取方法,获得高纯度、高得率和完整性好的总DNA,为桉树种植地土壤微生物群落多样性的分析奠定基础。综合比较已报道的土壤微生物DNA提取方法的优缺点,设计了7种从巨桉(Eucalyptus grandis Hill ex Maiden)人工林根际土壤中直接提取微生物DNA的方法,并通过PCR扩增、DGGE电泳及荧光定量PCR分析比较了不同方法所提取DNA的质量以及对后期分子生物学研究的适用性。结果表明,使用PVPP和硫酸铝铵联用吸附腐殖酸杂质后,采用PEG 8 000沉淀能够有效地提取桉树根际土壤DNA。该方法提取的DNA纯度最高,OD260 nm/OD230 nm达到2.45,OD260 nm/OD280 nm达到1.78,DNA得率为5.56μg/g土壤,适用于PCR扩增和荧光定量分析,并且通过DGGE电泳分离出最丰富的条带,是一种高效的提取土壤微生物DNA方法。  相似文献   

革兰氏阳性与阴性细菌基因组DNA提取方法的优化     

云飞  梁林  鲍彦彬  石雅丽  孙亚超  李永丽  兰辉 《安徽农业科学》2021,49(10):98-100

在分析现有提取微生物基因组DNA的原理和方法基础上,对SDS-NaCl法进行了改良,以商品化微生物基因组提取试剂盒提取的基因组结果为对照,利用改良的SDS-NaCl法,分别提取大肠杆菌(Escherichia coli)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的基因组DNA.结果表明,改良的SDS-NaCl法提取的大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌基因组DNA的OD260/OD280分别为1.88、1.89、1.81,浓度分别为61.67、64.32、53.22μg/mL;而商品化试剂盒提取大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌基因组DNA OD260/OD280分别为1.85、1.87、1.83,浓度分别为64.07、58.43、52.34μg/mL.结果证明改良SDS-NaCl法提取的革兰氏阳性和阴性细菌的基因组DNA可用于后续试验如全基因组测序和PCR等,同时可快速获得大量的高质量微生物基因组.  相似文献   

罗非鱼幼鱼肠道微生物基因组DNA的提取   总被引：1，自引：0，他引：1  

汪立平  马相杰  赵勇 《湖南农业科学》2009,(10):147-150

以提取幼鱼肠道微生物总DNA的浓度、OD260/280、及对ERIC—PCR和PCR—DGGE指纹图谱的影响作为判断依据,比较了3种不同幼鱼肠道微生物总DNA的提取方法。结果表明方法2提取的总DNA的浓度明显高于方法1和方法3;3种方法获得总DNA的纯度相似,OD260/280在1．8～1．9间;对ERIC—PCR和PCR—DGGE指纹图谱分析表明,3种方法中方法2提取的DNA最能反映出幼鱼肠道微生物的多样性。  相似文献   

腰果叶片DNA的提取     

黄伟坚  黄海杰  张中润  王金辉  吴家和  梁李宏 《广东农业科学》2010,37(2):175-176,191

以CTAB法为基础,设计了一种快速分离和纯化腰果叶片总DNA的方法。研究结果表明,该改良方法简便、快速、经济、有效。分光光度法测定与电泳检测分析表明,采用该方法提取腰果叶片总DNA的纯度和完整性良好,OD260/OD230平均值为1.91、OD260/OD280平均值为1.86,可以进行PCR扩增、Southern杂交等分子生物学研究。  相似文献   

TENP-PBS预处理在提取土壤DNA中的应用     

宋培勇  马莉莉 《安徽农业科学》2010,38(24):12978-12980

以一种土壤DNA直接提取法为基础,比较了TENP-PBS预处理在土壤DNA提取中的应用效果。OD260/OD230和OD260/OD280以及PCR扩增结果表明,在提取DNA之前用TENP-PBS对土壤进行预处理可以有效去除腐殖酸污染,提高DNA纯度。  相似文献   

不同方法提取土壤、活性污泥中总DNA的比较研究     

魏斐  杨丽荣  吴坤  薛保国 《河南农业科学》2012,41(5):74-77,95

试验目的在于研究土壤和活性污泥的最适DNA提取方法。采用9种不同的提取方法,对所提取DNA的浓度、纯度、提取率、片段大小、16SrDNA PCR结果进行了比较,结果表明,在土壤中,液氮研磨法提取DNA最优:DNA质量浓度为800mg/L,OD260/OD280为1.7。提取率为320μg/g;在活性污泥中,液氮浸泡法提取DNA最优:DNA质量浓度为1 485mg/L,OD260/OD280为1.59,提取率为594μg/g。  相似文献   

基于AFLP分析的蚕豆DNA提取方法     

刘玉皎  杨菁  崔志松 《江苏农业科学》2008,(1):54-56

蚕豆是高蛋白含酚类物质较多的作物,为了提取适于蚕豆AFLP分析的高质量DNA,采用改良CTAB法,以β-巯基乙醇和PVP抗氧化剂浓度为因素进行了试验。结果表明,用改良的CTAB法提取的蚕豆DNA质量较好,纯度高,OD260/OD280平均值为1.915,变幅在1.81~2.08之间,绝大多数集中在1.9左右。β-巯基乙醇和PVP对蚕豆DNA纯化具有替代作用,其中在CTAB提取液中加入1%β-巯基乙醇和0.5%的PVP或直接加入1%PVP后,提取的DNA纯度较高,OD260/OD280平均值分别为1.868、1.865,而且电泳谱带最清晰,最适于AFLP技术的要求。  相似文献   

一种适宜于文库构建的土壤微生物总DNA提取方法     

高岳 《安徽农业科学》2014,(34):12041-12042

采用改良的方法提取2种土壤微生物总DNA,并采用透析法对提取的DNA进行纯化,与MO BIO公司PowerSoil DNA isolation Kit试剂盒法进行比较,结果表明,改良的土壤微生物总DNA提取方法提取到的DNA明显高于试剂盒提取的DNA,且A260/A280及A260/A230与试剂盒提取的相差不大,片段也较大,是一种经济方便的土壤微生物总DNA提取方法,比较适合用于构建高质量的宏基因组文库.  相似文献   

神秘果基因组DNA提取方法比较研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈萍  杨通顺  王欢 《广东农业科学》2008,(3):26-28

在CTAB法及SDS法的基础上设计了6种提取方法,比较了不同方法对神秘果幼嫩叶片DNA的提取效果。结果表明:改进的SDS法,通过提高提取缓冲液中重要成分的含量,与二次纯化的方法相结合,提取的DNA无明显降解、杂质少,OD260/OD280值为1.62,接近标准值,是有效提取神秘果基因组DNA的方法。  相似文献