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[目的]信号转导及转录激活因子（STAT5A）基因主要参与哺乳动物乳腺组织中细胞因子的信号转导,对泌乳活动具有重要的调控作用。[方法]根据牛的STAT5A基因序列设计引物,本文采用直接测序和PCR—RFLP技术首次研究了槟榔江水牛STAT5A基因多态性。[结果]共检测到38个SNP位点,其中4个SNP位于外显子,34个SNP位于内含子,4个外显子SNP没有导致氨基酸的变化,属于同义突变。内含子15中的一个C／T变异产生了一个MspI酶切位点,因此我们建立了PCR—RFLP检测标记。本研究计算了24个SNP位点在槟榔江水牛群体中的等位基因频率及基因型频率,结果显示21个处于Hardy-Weinberg平衡状态,3个偏离Hardy-Weinberg平衡状态。[结论]本研究结果表明,槟榔江水牛STAT5A基因存在高度多态性,可能与槟榔江水牛的遗传背景有关。SNP的发现及PCR—RFLP标记的建立为进一步研究STA5A基因变异与槟榔江水牛经济性状的关系提供了重要基础资料。 相似文献
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《黑龙江畜牧兽医》2016,(11)
为了研究卵泡抑素(FST)基因在槟榔江水牛和德宏水牛中的特征,试验采集43头槟榔江水牛和48头德宏水牛的血样,利用牛基因组报道的牛FST基因序列设计引物,采用PCR扩增和序列测定等分析技术,研究了这两种水牛的FST基因多态性、基因频率和基因型频率,构建了单倍型和单倍型亲缘关系聚类图,分析了杂合度、遗传分化系数等群体遗传特征。结果表明:FST基因在槟榔江水牛及德宏水牛中均有高度的多态性,在FST基因上共检测到4个单核苷酸多态性(SNPs)位点,从水牛单倍型间的遗传距离和单倍型聚类图的结构来看,槟榔江水牛与沼泽型德宏水牛亲缘关系较远。从FST核基因上为槟榔江水牛属于河流型水牛起源提供了分子遗传学依据。 相似文献
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[目的]为了解水牛繁殖性能的分子基础及建立检测分子标记,本研究分析卵泡抑素(FST)基因在槟榔江、德宏水牛中的多态性,并与繁殖性能进行关联分析。[方法]研究采用PCR扩增及DNA测序方法,检测水牛FST基因多态性,并分析该基因变异位点与繁殖性能的关系。[结果]在槟榔江、德宏水牛的FST基因序列共检测到7个SNP位点,未发现插入/缺失变异。经χ2检验,除德宏水牛中SNP6偏离Hardy-Weinberg遗传平衡状态,其他SNP位点均处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态。FST基因与槟榔、德宏水牛产犊和产犊率性状相关不显著,而当两个群体合并后,FST基因有两个变异位点与产犊率呈极显著相关。[结论]FST基因在槟榔江、德宏水牛中存在较高基因变异性,FST基因与水牛繁殖性状的关系还需进一步研究。 相似文献
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利用微卫星DNA标记分析槟榔江水牛群体遗传特征 总被引：2，自引：0，他引：2
槟榔江水牛是近年在我国云南西部发现的第一个本土河流型水牛.为了揭示其群体遗传多样性、群体遗传组成、其与河流型和沼泽型水牛的遗传关系及沼泽型水牛对该水牛的基因渗入等重要遗传背景信息,本研究采用30个微卫星DNA标记对141份槟榔江水牛样品和对照群体24份河流型水牛(摩拉水牛)样品、41份沼泽型水牛(滇东南水牛)样品进行了检测分析.结果,在槟榔江水牛群体中共检测到253个等位基因,其中,54个为3个群体所共享的等位基因,58个为只在槟榔江水牛与摩拉水牛间共享的等位基因,73个为只在槟榔江水牛与滇东南水牛间共享的等位基因,其余68个等位基因为该群体所独有.槟榔江水牛平均等位基因数、平均表观杂合度、平均期望杂合度和多态信息含量等参数均显著高于对照组群体,分别为8.433 3、0.640 5、0.600 9和0.594 7.该水牛群体近交系数FIS值为0.061 9.槟榔江水牛与摩拉水牛间的DA遗传距离为最小(0.114 4),在NJ树上聚为一支;而滇东南水牛与槟榔江水牛和摩拉水牛间的遗传距离较大(分别为0.382 9和0.555 3),其在NJ树上单独聚为一支.群体遗传结构分析显示,槟榔江水牛遗传组分为河流型与沼泽型2种类型水牛混合的模式(当K=2时),整个群体中有相当数量的个体存在沼泽型水牛的遗传渗入(群体中沼泽型水牛遗传组分为0.067 2).结果揭示,槟榔江水牛遗传资源独特,群体遗传多样性丰富,但该群体杂合子缺乏,且存在一定沼泽型水牛的基因渗入. 相似文献
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[目的]槟榔江水牛为我国目前为止发现的唯一本土河流型水牛,具有产奶性能高、肉用性能好的特点,为了进一步阐明槟榔江水牛的生长发育规律,本文收集云南腾冲县巴福乐槟榔江水牛2004~2011年生长发育数据资料,研究性别、月份和年度等固定效应对体重的影响。[方法]应用SAS分析性别、月份、年度等非遗传因素对槟榔江水牛体重的影响,并且用MTDFREML软件分析了固定效应值。[结果]本研究结果表明,槟榔江水牛性别对初生重具有显著影响,公犊平均初生重(35.04kg)显著高于母犊(32.63kg);月份对母牛初生重没有显著影响,公牛的效应值比母牛的较大。[结论]月份对槟榔江水牛的体重有显著的影响,可能与饲料的季节性供给有关。 相似文献
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本研究对槟榔江水牛3-酮酸辅酶A转移酶1（3-oxoacid CoA-transferase 1,OXCT1）基因的完整CDS区进行了PCR扩增,并对其功能生物信息学和多组织差异表达进行了分析。以普通牛OXCT1基因序列（GenBank登录号：XM_006076397）为参考序列,采用Primer Premier 5.0软件设计引物序列,以提取的槟榔江水牛基因组DNA为模板,PCR扩增获得槟榔江水牛OXCT1基因mRNA序列,扩增产物经测序后利用ORF Finder软件进行开放阅读框识别,获得水牛OXCT1基因CDS区全序列,并对其进行生物信息学分析。结果显示,槟榔江水牛OXCT1基因CDS序列全长1 563 bp,编码520个氨基酸,蛋白分子式为C2509H4041N687O746S23,分子质量为56.50 ku,理论等电点（pI）为8.69,不稳定系数为27.49,平均疏水性（GRAVY）为-0.097,该蛋白属弱亲水性蛋白。OXCT1蛋白无信号肽和跨膜结构,属于线粒体膜蛋白;包含pcaJ_scoB_fam和AtoD 2个保守结构域,且具有5个功能活性位点。槟榔江水牛与普通牛、藏羚羊等5个物种的OXCT1氨基酸序列同源性≥ 97%。对槟榔江水牛13个组织进行表达谱分析表明,在泌乳期,OXCT1基因在乳腺中表达量最高,在肾脏、垂体、脂肪、大脑、皮肤和肌肉中不表达;在非泌乳期,OXCT1基因在除脂肪以外的其他12个组织中都有表达。OXCT1基因在槟榔江水牛泌乳期乳腺组织中表达量最高,推测其可能参与了水牛的乳脂合成调控事件。本研究结果可为深入了解乳脂合成代谢及其调控机制提供依据。 相似文献
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探讨德宏奶水牛（摩拉水牛×德宏水牛）DGAT1基因多态性与产奶性状的关系,以期为德宏奶水牛产奶性状标记辅助选择侯选基因的选择提供理论依据。以81头泌乳的德宏奶水牛为研究对象,利用PCR—SSCP方法结合候选基因直接测序法检测DGAT1基因第8外显子及第8内含子区的多态性,并采用最小二乘法分析DGAT1基因多态位点对产奶量、乳脂率及乳蛋白率的影响。结果在德宏奶水牛群体中共检测到CTGG,CCGG和CCGT三种基因型,测序结果显示,在检测的群体中未发现K232A位点的突变,而在DGAT1基因第8内含子的第14位检测到C→T突变,第35位检测到G→T突变。多重比较表明,CCGT基因型对德宏奶水牛的乳脂率有显著影响（P〈0．05）。 相似文献
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本研究对槟榔江水牛3-酮酸辅酶A转移酶1(3-oxoacid CoA-transferase 1,OXCT1)基因的完整CDS区进行了PCR扩增,并对其功能生物信息学和多组织差异表达进行了分析。以普通牛OXCT1基因序列(GenBank登录号:XM_006076397)为参考序列,采用Primer Premier 5.0软件设计引物序列,以提取的槟榔江水牛基因组DNA为模板,PCR扩增获得槟榔江水牛OXCT1基因mRNA序列,扩增产物经测序后利用ORF Finder软件进行开放阅读框识别,获得水牛OXCT1基因CDS区全序列,并对其进行生物信息学分析。结果显示,槟榔江水牛OXCT1基因CDS序列全长1 563 bp,编码520个氨基酸,蛋白分子式为C_(2509)H_(4041)N_(687)O_(746)S_(23),分子质量为56.50 ku,理论等电点(pI)为8.69,不稳定系数为27.49,平均疏水性(GRAVY)为-0.097,该蛋白属弱亲水性蛋白。OXCT1蛋白无信号肽和跨膜结构,属于线粒体膜蛋白;包含pcaJ_scoB_fam和AtoD 2个保守结构域,且具有5个功能活性位点。槟榔江水牛与普通牛、藏羚羊等5个物种的OXCT1氨基酸序列同源性≥97%。对槟榔江水牛13个组织进行表达谱分析表明,在泌乳期,OXCT1基因在乳腺中表达量最高,在肾脏、垂体、脂肪、大脑、皮肤和肌肉中不表达;在非泌乳期,OXCT1基因在除脂肪以外的其他12个组织中都有表达。OXCT1基因在槟榔江水牛泌乳期乳腺组织中表达量最高,推测其可能参与了水牛的乳脂合成调控事件。本研究结果可为深入了解乳脂合成代谢及其调控机制提供依据。 相似文献
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[目的]本研究测定了摩拉水牛、尼里水牛和槟榔江水牛的射精量、精子密度、精子活力和畸形率。[方法]精液品质按照《牛冷冻精液》标准和《牛冷冻精液生产技术规程》进行测定。[结果]结果得出,摩拉水牛公牛的射精量为5.1±2.37ml（n=2688）、精子密度为7.8±3.68亿/ml、原精活力57.4±16.42%;冷冻精液解冻活力平均为36.0±2.13%（n=1680）、畸形率为20.62±11.04%（n=873）;尼里水牛公牛的射精量为5.3±1.99ml（n=1370）、精子密度为8.4±3.54亿/ml、原精活力62.7±12.51%;冷冻精液解冻活力平均36.5±2.43%（n=1102）、畸形率为15.2±5.71%（n=481）;槟榔江水牛公牛的射精量为5.6±2.26ml（n=271）、精子密度为8.6±5.13亿/ml、原精活力65.2±9.19%;冷冻精液解冻活力平均为37.2±2.48%（n=239）、畸形率为19.6±6.08%（n=110）。[结论]本研究获得了水牛精液品质的基础数据。 相似文献
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试验旨在研究延边黄牛ACTA1基因的遗传变异,分析其多态性对肉质性状的影响。采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法探讨ACTA1基因多态性及其与肉质性状的关联性。结果发现,延边黄牛ACTA1基因存在2个突变位点:A193G突变,导致氨基酸Arg → Gly的错义突变;A298G突变,导致氨基酸Lys →Arg的错义突变。χ2检验显示,A193G和A298G位点于检测群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。关联分析显示,延边黄牛ACTA1基因2个突变位点的不同基因型与肌肉中肉豆蔻酸、油酸含量、眼肌面积、大理石花纹等级呈显著相关（P<0.05）。初步认为ACTA1基因对延边黄牛肉质性状有显著影响,可作为延边黄牛新品种早期选择的候选基因。 相似文献
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This study was aimed to research the gentic variations of ACTA1 gene in Yanbian Yellow cattle, and analyze the influence of genetic polymorphisms on meat quality traits. PCR-RFLP and PCR-SSCP technique were used to analyze the association between the polymorphisms of ACTA1 gene and meat quality traits. The results showed that there were two SNPs, A193G which with replacement of Arg by Gly amino acid, A298G which with replacement of Lys by Arg amino acid. χ2 test showed A193G and A298G were in Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05). The association analysis indicated that the genotypes of different mutations in ACTA1 gene were found to be significantly related to myristic acid, oleic acid, loin muscle area, marbling score (P<0.05). ACTA1 gene had potential effects on meat quality traits of Yanbian Yellow cattle, and could be used for candidate gene in early selection of new varieties of Yanbian Yellow cattle. 相似文献
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槟榔江水牛在云南西部槟榔江上游的腾冲县饲养已有500年以上的历史。该水牛经过长期闭锁繁育和风土驯化，已适应当地亚热带气候环境，是我国发掘的首例本土河流型水牛类群。具有典型的河流型水牛体型外貌特征，但体型相对较小。遗传学分析表明：槟榔江水牛体细胞核型染色体数多为2n=50；其群体内遗传变异水平较高，遗传多样性丰富；该水牛与河流型水牛表现出较近的遗传关系，与沼泽型水牛遗传关系较远；确认在群体遗传组成和血统来源上，该水牛由差异十分明显的河流型和沼泽型两个世系所构成，但河流型水牛世系在该水牛群体中占主体，揭示该水牛存在一定的沼泽型水牛基因渗入。生产性能测定结果显示：该水牛一个泌乳期泌乳量为（2452．2±553．8）kg，比河流型摩拉和尼里一拉菲水牛高8．4％～15．0％，比沼泽型本地乳用水牛高124．4％～140．3％；且其乳质佳，乳蛋白率和乳脂率分别为4．60％和6．82％。该水牛在2008年经国家畜禽遗传资源委员会颁布为我国遗传资源的牛种之一，发展前景看好，将有望培育成中国首个河流型乳用水牛新品种。 相似文献
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The objective of this study was to detect insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R) polymorphisms, their allele, and genotype frequencies and to determine associations between these polymorphisms and growth traits in Egyptian water buffalo. Three loci of the IGF1R coding region were amplified by RT-PCR and, subsequently, subjected to sequence analysis, followed by single-strand conformation polymorphism to identify different allelic patterns. A total of 11 novel polymorphisms were detected; 6 SNPs among Egyptian water buffaloes and 5 polymorphisms compared with Indian buffalo (Y12700). Three of those polymorphisms; GAG Indel polymorphism, C261G, and G263C SNPs, were nonsynonymous mutations. The GAG Indel polymorphism led to deletion of E (glutamic) amino acid (aa) in the IGF1R of Egyptian water buffaloes compared with Indian buffalo. However, C261G SNP, which replaced A (alanine) by G (glycine) aa, and G263C SNP, which changed A (alanine) to P (proline) aa, were detected among Egyptian water buffaloes. Three different single-strand conformation polymorphism patterns were observed in exon 21: CC/CC, GG/GG, and CG/GC with frequencies of 0.291, 0.253, and 0.556, respectively. The heterozygous animals (CG/GC) had a higher ADG than homozygous animals (CC/CC and GG/GG) from birth to 6 mo of age. We conclude that the heterozygous haplotype, C261G/G263C, in exon 21 of the IGF1R gene is associated with the ADG during the early stages of life (from birth to 6 mo of age) and could be used as a genetic marker for selection of growth traits in Egyptian buffalo. 相似文献
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综合介绍了水牛由奶、肉、役兼用向奶畜专用转变的发展趋势以及槟榔江水牛品种的形成及其培育、体型外貌特征、遗传学特征、生产性能、存在的问题等,并对该水牛品种的有效开发和利用提出了建议。 相似文献