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1.
紫茎泽兰在湖北地区的入侵风险评估 总被引：1，自引：1，他引：0
紫茎泽兰是我国危害最严重的入侵物种之一,据已有路线分析有入侵华中地区的风险。在武汉同质种植园中建立了不同年份（2009年和2012年）从西昌采回的紫茎泽兰种群,将2种群进行枝条扦插,比较了扦插苗的株高、茎宽、比叶面积、叶干物质含量、叶片C/N等生长参数和抗虫性,从中分析紫茎泽兰入侵种群在新引入地,随引入时间的表型变化响应。结果表明紫茎泽兰叶片C/N在两种群间差异不显著,但株高、茎宽、比叶面积、叶干物质含量和抗虫性,生长3年的种群均显著大于生长1年的种群,表现出明显的表型可塑性,其中比叶面积和叶干物质含量在两种群均为负相关关系。在新入侵地（缺乏专食性昆虫）,随引入时间的延长,植株的适应能力增强,获取资源的能力提高,对广食性昆虫的抗性增强。由于防御广谱天敌的物质含量低,合成成本低,植物把资源主要用于自身的生长。因此我们应在入侵早期对紫茎泽兰进行防治,这样才能更有效的控制其传播。 相似文献
2.
为了对巴西木薯种质资源进行遗传多样性、亲缘关系和群体遗传结构分析,本研究利用了7946个SNPs和1997个InDels分子标记,通过ADMIXTURE软件进行群体结构分析、GCTA软件进行主成分分析。结果显示,巴西木薯被划分为9个亚群。这与利用PHYLIP进行的聚类分析结果大概一致,其中亚群1、亚群2、亚群4、亚群6和亚群8能较好地分别聚在一起,而其他亚群中的样品大致能聚在一起,且样品间有一定的交叉。巴西木薯种质资源遗传多样性指数(0.274)高于中国、尼日利亚等,其中巴西木薯亚群5具有相对较高的遗传多样性水平(0.29)。巴西木薯各亚群的群体遗传分化程度较低(群体分化指数在0.03~0.15之间),但高于中国木薯种质资源的群体分化指数。各木薯材料间的遗传距离变幅为0.084~0.297,平均遗传距离为0.228。本研究结果可为后续关联分析发掘优良等位基因及引种提供依据。 相似文献
3.
《分子植物育种》2017,(6)
利用中间锦鸡儿干旱转录组数据自主开发、筛选具有多态性的SSR标记;在此基础上,选取了内蒙古地区10个居群的中间锦鸡儿种质资源为试验材料,对其遗传多样性展开了系统研究。研究如下:中间锦鸡儿干旱转录组共搜索到404个SSR标记,分布于349条Unigenes序列上,出现频率为14.78%。其中二核苷酸重复是主要的类型,占总SSRs的64.90%;其次是三核苷酸重复,占总SSRs的33.70%;二核苷酸重复基元中以AG/CT和GA/TC为优势重复基元,占总SSRs的29.45%,三核苷酸重复基元以AAG/CTT为主,占总SSRs的5.69%。成功设计了76对引物并筛选出条带清晰、多态性好、重复性好的7对引物进行遗传多样性分析。共检测到29个等位基因(Na),有效等位基因数为1.101~2.007,Nei’s多样性指数为0.254;Shannon多样性指数(I)为0.193~0.709,平均每位点I值为0.482;种群间遗传距离(GD)的范围是0.002 7~0.068 8,遗传一致度(GI)的范围是0.933 5~0.997 3,采用Nei's遗传关系用UPGMA进行聚类,10个居群分为2个亚群,包头市百灵庙镇和乌兰察布市凉城县聚为一个亚群,其余种群聚为另一个亚群。中间锦鸡儿种群间平均近交系数(Fis)大于0且基因流为3.726,遗传距离与地理距离相关系数R~2=0.023。分析表明供试材料的遗传多样性较低,可能是中间锦鸡儿居群受到自然和人为干预较多,遗传交流大所导致的。 相似文献
4.
《分子植物育种》2016,(7)
解析地方晒烟种质资源的遗传背景,为晒烟种质的高效利用提供依据。本研究筛选多态性丰富的14对SRAP引物组合,对贵州省内广泛地理来源的136份地方性晒烟资源进行遗传多样性分析,根据Model-base和NJ聚类进行遗传结构分析。结果表明:参试材料具有较高的遗传多样性,共扩增出250个稳定的多态性位点,多态性位点比率为97.6%,有效等位基因数(Ne)为1.22,Nei's基因多样性指数(H)为0.15,Shannon's信息指数(I)为0.26,材料间平均遗传距离为0.778,多数材料间亲缘关系较远。Model-base遗传结构分析和NJ聚类结果一致,将总材料划分为三大亚群,亚群Ⅰ包含46份资源,亚群Ⅱ包含47份资源,亚群Ⅲ包含43份资源,划分结果与材料的地理来源关系不大,三个亚群多样性依次为:亚群Ⅱ亚群Ⅰ亚群Ⅲ。 相似文献
5.
《分子植物育种》2020,(18)
为了从分子水平分析山西省高粱地方品种的遗传多样性和遗传结构,本研究从140对SSR引物中筛选到22对条带清晰且多态性稳定的引物,对来自于山西省11个地区66个县市的158份高粱材料进行了遗传多样性分析,结果共检测到147个等位基因的位点变异,平均等位基因数为6.68。每个SSR位点的多态性信息含量(PIC)平均为0.635,变异范围为0.168～0.870,表明山西高粱的地方品种具有较丰富的多态性。针对11个不同地理居群的遗传多样性分析表明,不同的地理居群间遗传分化水平差异较大,地理居群间存在不同程度的基因交流。无论从等位基因数、有效等位基因数还是Shannon's信息指数上,都可以看出忻州居群的遗传多样性最高,而阳泉居群的最低。针对不同地理居群间遗传距离的分析结果表明,忻州居群和晋中居群的遗传距离最小,两个群体的亲缘关系较近,基因交流比较频繁。而阳泉居群和其他居群间的遗传距离都较大,显示阳泉居群与其他居群之间的基因交流阻隔,进一步显示了阳泉居群的独特性。基于模型的遗传结构分析和基于遗传距离的N-J聚类分析都将种质材料划分为2个类群,不同地区高粱资源居群间的遗传关系远近与其地理信息并没有明显的相关性。本研究旨在为高粱种质资源的收集、鉴定与创新提供理论依据。 相似文献
6.
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青海湖裸鲤线粒体DNA D-loop区的遗传多样性及其遗传分化研究 总被引：2，自引：1，他引：1
为了科学有效地保护青海湖裸鲤的种质资源,对青海湖裸鲤的遗传多样性及种群结构进行研究是尤为重要。本研究采用PCR技术对青海湖裸鲤的4个种群（青海湖、可鲁克湖、甘子河、草搭连）155个个体的mtDNA D-loop区部分序列进行扩增,得到了754 bp的核苷酸序列。采用MEGA 5.05和DnaSP 5.10.1软件对序列进行分析,结果显示：155个个体中共检测出34个单倍型,单倍型多样性（Hd）为0.906±0.013,核苷酸多样性（Pi）为0.00556±0.00034。其中可鲁克湖种群的单倍型多样性0.422±0.093和核苷酸多样性0.00272±0.00066均低于其他3个种群,且该种群内的平均遗传距离（0.00276）低于群体间的遗传距离0.00522~0.00709。通过群体分化指数（Fst）和基因流（Nm）分析显示,可鲁克湖种群与其他3个种群之间有着明显的遗传分化（Fst〉0.26327,Nm〈0.69959）,且与甘子河种群分化程度最显著（Fst=0.45854,P〈0.01;Nm=0.29521）。但是系统发育树并未显示出明显的单系群,可能是水系间地理隔离格局的形成时间较晚。研究结果表明：青海湖裸鲤具有较高的遗传多样性,种群间出现了一定程度的遗传分化,特别是可鲁克湖种群已经高度分化,但其遗传多样性水平很低,应优先对其进行保护。 相似文献
8.
利用10对SSR引物对南宁地区5个金花茶种群进行遗传多样性分析,探讨金花茶边缘种群及变种小果金花茶的遗传多样性,为金花茶的合理保护提供科学依据。结果显示:小果金花茶平均等位基因数(A)、有效等位基因数(Ae)、期望杂合度(He)和观测杂合度(Ho)分别为4.40、2.433、0.533和0.429,表明小果金花茶具有较低水平的遗传多样性。STRUCTURE聚类分析显示,5个金花茶种群按照两变种分为2个组。AMOVA结果和遗传分化系数(FST)均表明两变种间存在很大的遗传分化。位于平果县坡造乡的金花茶边缘种群具有最低水平的遗传多样性(PPB=50%, A=1.70, Ho=0.100),与主分布区种群间存在很大的遗传分化。基于以上结果表明,小果金花茶和平果县坡造乡边缘种群应当作为独立保护单元保护起来。 相似文献
9.
日本沼虾不同地理种群的遗传多样性研究 总被引：6，自引：1，他引：5
本文采用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对6个地理种群（微山湖、洪泽湖、太湖、龙感湖、洪湖、珠江）的日本沼虾各30个个体进行了遗传多样性分析。在筛选出的18个引物中共检测到201个位点,大小在100～2000bp之间。多态位点141个,多态位点比例70.15％;各种群的多态位点数为30～99不等,多态位点比例为21.13%～55.93%。日本沼虾中国不同地理种群的平均遗传杂合度为0.2446,各种群内平均遗传杂合度为0.1132～0.2071。Shannon信息指数（I）为0.1695～0.2950。日本沼虾6个地理种群的两两地理种群间遗传分化指数Gst值在0.2116～0.4442之间,种群间总的遗传分化指数Gst0值为0.4858,Nm值在0.6257～1.8628之间,表明日本沼虾种群间已经发生显著或重要分化。同时发现OPX－830bp、OPI－360bp为珠江种群区别于其他种群的特征标记。聚类分析结果表明,洪湖种群与龙感湖种群,洪泽湖种群与微山湖种群分别先聚在一起,再与太湖种群聚类,最后与珠江种群聚合在一起。 相似文献
10.
为了明确不同地理位置杂草稻群体的遗传多样性现状、遗传分化水平以及杂草稻群体之间的基因流。本研究利用24对SSR引物对来自黑龙江、吉林、辽宁、江苏和广东共17个杂草稻群体的469份杂草稻样本进行的遗传多样性及遗传分化分析。结果表明杂草稻群体的总体遗传多样性较为丰富(I=0.36, He=0.23),不同杂草稻群体间的遗传多样性指数差异较大,He在0.07～0.35之间。AMOVA分析结果表明,杂草稻群体70%的变异来源于群体间,30%的变异来源于群体内。聚类分析显示,相邻地区的种群间相似性较高,江苏省杂草稻的不同种群间存在较高遗传分化;遗传分化与基因流结果表明,17个杂草稻种群间总的Nm值为0.117,总Fst值为0.694。地理位置较近的种群间Nm普遍较高,Fst较低;而地理位置较远的种群间Nm普遍较低,Fst较高。总之,本实验中的杂草稻群体总体的遗传多样性水平较高,群体之间的遗传多样性指数差异较大;杂草稻群体间的遗传分化显著大于群体内的分化,符合遗传距离的空间隔离模型;杂草稻群体间和地区间有一定水平的基因流,本研究对理解杂草稻在农田生态系统中的适应性进化及制定杂草稻控制策略具有重要意义。 相似文献
11.
小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用57对小豆SSR标记和31对绿豆SSR标记,用5份日本材料作对照,对249份中国小豆种质进行遗传差异、群体结构和连锁不平衡(LD)分析。结果表明,共检测到630个等位变异,SSR位点等位变异数在2~17之间,遗传多样性指数范围为0.024~0.898,平均为0.574。15个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异,其中中国云南最高,河北、天津最低。聚类分析将254份材料划分为3个类群,在一定程度上和地理生态环境相关。LD分析显示和其他作物相比,小豆LD衰减距离较短,最大衰减距离为5.8 cM (R2>0.1),基因组LD平均衰减距离小于1 cM (R2>0.1,P<0.001)。 相似文献
12.
13.
In order to reveal levels and distribution of genetic variation within Oryza rufipogon Griff. of Yunnan, China, where one of the centers of genetic diversity for Asian cultivated rice O. sativa L. is located, allozyme variation encoded by 22 loci was electrophoretically analyzed in 149 individuals of all three existing
populations as well as five from other regions (Guangxi, Hainan and Jiangxi provinces) of China. As compared to the level
of genetic diversity (the mean A = 1.2, P = 24.1%, Ho = 0.045 and He = 0.079) for the populations from other regions, a rather
low genetic diversity (the mean A = 1.1, P = 7.6%, Ho = 0.007 and He = 0.011) was found in Yunnan, which may originate from
marginal nature of these populations, recent reduction of populations and consequent drift. The result suggests that the current
center of genetic diversity for O. rufipogon fail to agree with that for cultivated rice in China. The genetic differentiation for all the eight populations(FST = 0.254) was slightly lower than that for three populations from Yunnan (FST = 0.302), indicating a fairly high genetic differentiation in the region. Finally, a conservation plan for sampling/preserving
fewer populations but more individuals from each population for the species was given, and an appropriate strategy for conserving
the three surviving populations from Yunnan was proposed.
This revised version was published online in August 2006 with corrections to the Cover Date. 相似文献
14.
采用覆盖20条染色体的68对多态性引物在120个大豆品种（系）[包括67个中国大豆品种（系）和53个引自美国的品种（系）]进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果表明,120份大豆材料具有丰富的遗传多样性（Na=1.9852,Ne=1.4343,H=0.2776,I=0.4361）;中国大豆比美国引进大豆遗传多样性水平高;7个群体遗传多样性由高到低为,黄淮海地区组>引种资源组>热带亚热带地区组>长江流域地区组>北方春大豆组>西南山区组>鲜食大豆组;7个群体间总遗传多样度（Ht）为0.2807,群体内遗传多样度（Hs）为0.2361,群体间遗传分化系数（Gst）为0.1589,基因流（Nm）为2.6468,群体间存在中低度遗传分化,遗传变异主要存在于群体内部,群体间Nm较丰富;以群体和单个品种（系）为单位进行UPGMA聚类的结果基本一致,部分材料相互交错。大豆种质遗传多样性与地理来源具有一定相关性的同时,不同地区间存在丰富的基因交流;黄淮海地区、西南山区、热带亚热带地区和长江流域地区的大豆材料遗传距离较近;引进大豆、北方春大豆和鲜食大豆与其他群体遗传距离较远,可作为拓宽中国栽培大豆遗传背景的物质遗传基础。 相似文献
15.
用多态位点率和香农指数分析的 飞蝗地理种群遗传多样性 总被引：1，自引：0，他引：1
研究多态位点率和香农指数两种多样性参数所展示的飞蝗不同地理种群的遗传多样性。采用多态位点率和香农指数对飞蝗不同地理种群的RAPD数据进行了遗传多样性分析。飞蝗各种群平均多态位点率为59.17%-77.38%,平均香农指数为4.95-6.09。尽管两参数在不同引物之间存在极显著差异,但各种群的两参数之间的差异都不显著（p<0.05）。将香农指数分解为种群内和种群间两种水平的多样性,种群内多样性都比种群间的要大,平均所占比率分别为66.85%和23.15%,与用其他方法得到的结果类似。多态位点率和香农指数展示出中国飞蝗不同地理种群具较高的遗传多样性。两种多样性性参数分析RAPD数据来展示昆虫遗传多样性是可行的。 相似文献
16.
旨在分析不同地区野生驯化白芨居群间亲缘关系,为白芨资源保护和利用提供支撑。利用RAPD和ISSR标记技术从分子层面鉴别源于湖南、湖北、贵州、云南、江西等地的12个白芨资源遗传多样性差异,并通过UPGMA对该差异性进行了聚类分析。结果表明,在36条供试RAPD引物中有13条扩增带型清晰、多态性高,15条供试ISSR引物中有2条扩增带型清晰、多态性高,共获得40条多态性条带;通过UPGMA聚类分析表明,12份供试白芨种质资源间具有较高的遗传多样性,遗传距离最大可达0.975,供试材料总体上可分为两个支系,湖南、江西为一个支系,湖北、贵州和云南为一个支系。利用ISSR和RAPD标记可以从分子水平上揭示白芨的种质资源遗传多样性,同时,研究还发现ISSR标记能比RAPD标记扩增出更多的多态条带和获得更高的多态比率,且分析不受时间和地点限制,结果更稳定、可靠。本研究结果显示白芨居群间遗传差异性与地理距离呈现一定的相关性,对研究白芨物种的演化及遗传多样性提供了相关数据和理论支持。 相似文献
17.
For Brassica crop breeders, weedy crucifers are potential sources of disease resistance and other useful traits. However,
few species have been evaluated or are well represented in germplasm collections. In this study, we evaluated 24 Eurasian
crucifer species for disease reaction to North American isolates of the crop pathogens A. brassicicola and X. campestris pv.
campestris. The test array comprised 190 entries (genebank accessions and weed populations), including 108 B. nigra entries
from four geographic regions and 34 entries of Camelina sativa. Disease reaction was highly variable between species and within
some species. Reaction to A. brassicicola was variable between entries of C. sativa, a species reported as highly resistant
to Alternaria pathogens. In B. nigra, disease reaction was variable between geographic regions and between entries within
some regions. Most of the B. nigra entries rated as disease resistant were weed populations from North America, but disease
reaction was not related to the geographic distance between these populations. In summary, disease reaction to two crop pathogens
was variable in crucifer weed taxa, including species considered to contain little genetic variation. We identified entries
with promising levels of disease resistance and highlighted the potential value of weedy crucifer genetic resources.
This revised version was published online in July 2006 with corrections to the Cover Date. 相似文献
18.
紫茎泽兰对两种牧草发芽的化感克异作用 总被引：11，自引：2，他引：11
研究了紫茎泽兰地上部分、根系及根际土壤不同浓度提取液对白三叶和多花黑麦草发芽的影响。研究结果表明：紫茎泽兰对白三叶和黑麦草种子萌芽存在化感克异现象，并且随浓度的增加，影响越大；相同条件下，对白三叶的影响强于多花黑麦草；低浓度对白三叶败育的影响较大，但对多花黑麦草几乎没有影响；紫茎泽兰根际土壤对两种牧草种子萌芽无明显的化感克异作用。 相似文献
19.
小扁豆种质资源SSR标记遗传多样性及群体结构分析 总被引：3，自引：0，他引：3
从145对SSR引物中筛选到14对多态性引物,对选取国家种质库的440份小扁豆种质资源进行SSR标记遗传多样性分析,共检测出87个等位变异,平均每个SSR位点6.2143个;平均Shannon-Weaver指数(I)为1.1869。16个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异,国外群体的遗传多样性水平(0.9837)远高于国内群体(0.3485)。PCA、UPGMA法聚类分析和Structure群体结构分析结果相互间完全吻合。440份参试材料从遗传结构上可划分为8个组群,揭示国外群体遗传分化大,群体间的亲缘关系较远;国内群体与之相反。研究结果显示,山西、宁夏和甘肃省是我国小扁豆资源遗传多样性最丰富、遗传关系较复杂的地区,应对该区域小扁豆资源进一步搜集、保护和研究。同时,应继续加强小扁豆资源的国外引种与交流,做进一步系统研究和开发利用。 相似文献