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SSR标记技术在马铃薯遗传育种研究中的应用 总被引：1，自引：0，他引：1
基于PCR基础上发展起来的SSR分子标记技术具有共显性遗传、多态性高、重复性好、稳定性好、操作简单等优点，本文简述了SSR分子标记技术的基本原理与特点，重点对马铃薯SSR引物的开发及其在马铃薯品种鉴定、遗传图谱构建与数量性状基因定位、分子标记辅助选择育种的研究现状进行了分析，并对其应用前景进行了展望。 相似文献
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EST-SSR标记及其在果树研究中的应用 总被引：3，自引：2，他引：1
近年来大量ESTs数据的出现已成为开发SSR标记的重要来源。EST-SSR作为一种新型的分子标记,不仅具备传统基因组SSR标记的特点,而且以其开发经济和通用性高等优势已在很多植物中得到开发和应用。简要介绍了EST-SSR标记的原理和特点,重点综述了其在果树的遗传多样性分析、遗传连锁图谱的构建、比较作图和分子系统发育等研究领域的应用现状,期望为今后该项技术在果树研究上的应用提供参考。 相似文献
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每个SSR序列的基本重复单元次数在不同基因型间的差异,从而形成其座位的多态性.SSR技术在果树育种中,主要应用在构建遗传图谱、DNA指纹图谱的建立种质资源的遗传多样性等.本文主要简述了SSR标志的原理和特点,并从亲缘关系和遗传多样性、遗传连锁图谱构建及基因定位、DNA指纹和品种鉴定、分子标记辅助育种等方面介绍了近年来SSR技术作为一种新的DNA分子标记技术在果树上的应用现状及前景. 相似文献
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SSR标记及其在葡萄上的应用 总被引：3，自引：0，他引：3
SSR(simple sequence repeat)作为第2代基于PCR的一种新型DNA分子遗传标记,数量丰富、多态性高、重复性好、分布于整个基因组、特异位点扩增、发生频率高、共显性遗传。对SSR引物开发,SSR标记在葡萄品种鉴别、系谱重建、遗传图谱构建、商业品种保护等方面的研究进展进行了综述,并指出了未来的研究方向。 相似文献
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分子标记技术是基于生物体基因组的遗传分析方法,在植物的亲缘关系分析、遗传多样性分析、遗传图谱构建、分子辅助育种、品种鉴定等研究中已有广泛应用。其中微卫星分子标记(Simple sequence repeats,SSRs)技术作为一种新世纪遗传学研究工具,以其信息量大,重复性好、可靠性高和多态性丰富等优点,在植物遗传育种研究中表现出很大的优势。本文简要介绍了简单重复序列(SSRs)标记的分布、功能、技术优缺点和产生多态性的机理,并对SSR标记在植物遗传多样性、遗传图谱构建、基因定位与克隆、分子标记辅助育种等研究中的应用情况进行了综述,为植物资源利用、开发和保护等研究领域的应用提供参考。 相似文献
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为筛选出一套大白菜（Brassica rapa L. ssp. pekinensis）简单重复序列（Simple sequence repeat,SSR）的核心引物,以54份大白菜骨干自交系为材料,从已发表的2 129对白菜SSR引物中,初步筛选出分布于白菜整个基因组、具有唯一扩增位点、扩增稳定性及重复性好的多态性SSR引物51对。进一步根据引物的多态性信息量（PIC）、等位基因数量、位点的物理位置和主成分分析（PCA）等分析结果,确定了一套包含28对SSR引物的核心引物组合。比较核心引物组合、51对多态性SSR引物和123个标记（72个SNP标记与51对多态性SSR引物）对54份大白菜骨干自交系的聚类分析结果,三者具有较高的一致性;该套引物可将262份大白菜高代自交系区分开,具有较好的鉴别能力。利用这套核心引物构建了242份大白菜品种的指纹图谱。该研究获得的28对SSR引物可以用于大白菜的遗传多样性分析和品种核酸指纹库构建等研究,可为大白菜新品种的特异性、一致性、稳定性检测体系的建立和新品种保护提供技术支持。 相似文献
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苹果酸度基因（Ma）SSR 标记及遗传分析 总被引：3，自引：0，他引：3
研究果实含酸量的遗传特性及其酸度基因的分子标记可以为果品品质育种提供辅助手段。以果实低酸的‘短枝富士’（Spur Fuji）和高酸的‘粉红女士’（Pink Lady）F1代群体（216株）为试材，利用SSR（simple sequence repeat）技术，结合集群分类分析法（bulked segregation analysis，BSA）进行了苹果酸度基因（Ma）分子标记研究。经过102对SSR引物的筛选，获得了与果实酸性状紧密连锁的分子标记CH03d12104和CH03d12118两个位点，连锁距离分别为3.24和2.31 cM。分析表明Ma1与Ma2对果实含酸量有控制作用，Ma对ma表现为完全显性。 相似文献
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以抗坏血酸（AsA）含量变异丰富的野生毛花猕猴桃（Actinidia eriantha Benth.）种群为试
验材料,对其叶片和果实中的AsA 含量与SSR 标记进行关联分析。结果表明：通过SSR 分子标记技术和
群体结构分析,可将70 份野生毛花猕猴桃种质材料分为4 个亚群;GLM 模型分析结果显示,在P < 0.01
水平上检测有7 个SSR 标记与叶片和果实AsA 含量紧密相关,各标记对叶片和果实AsA 含量变异的解释
率在0.082 5 ~ 0.175 5;MLM 模型分析结果显示,在P < 0.01 的水平上共检测到有6 个SSR 标记分别与
叶片和果实AsA 含量紧密相关,各个标记的解释率在0.073 6 ~ 0.154 6 之间。发现了与叶片及果实中的
AsA 含量关联的优异SSR 标记位点（UDK96-040、UDK96-053、UDK97-408、UDK97-414 和Ke227）。 相似文献
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Manosh Kumar Biswas Lijun Chai Mohamed Hamdy Amar Xianlong Zhang Xiu-xin Deng 《Scientia Horticulturae》2011
In this study we evaluate the informativeness and efficiency of Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), Sequence-Specific Amplified Polymorphism (S-SAP), Selectively Amplified Microsatellite Polymorphic Loci (SAMPL) and Simple Sequence Repeat (SSR) markers for genetic diversity, phylogenetic relationship among the Citrus species and mapping ability of the marker system. The SSR exhibited relatively higher level of polymorphism information content in terms of the expected heterozygosity, than that of the AFLPs, SSAPs and SAMPLs. For each marker system, average level of the discriminating potential was very close to the actual discriminating potential. Similarity matrices showed weak, yet significant correlations when Mantel's test was applied. The highest positive (0.72) correlation was found between the AFLP and SSAP markers. The SSR and SAMPL markers were poorly correlated. The dendrogram topology among the four marker systems had high similarity. Taken together, the SSAP and SAMPL were highly efficient in detecting genetic similarity in Citrus, while the SSR may be more useful for segregation studies and genome mapping in Citrus. The SSAP and SAMPL markers could be useful for Citrus genome mapping in combination with AFLP and SSR markers. To our knowledge, this was the first detail report of a comparison of performances among AFLP, SSR and retrotrasposon based molecular marker technique on a set of samples of Citrus. Our result provides guidance for future efficient use of these molecular methods in genetic analysis of Citrus sp. and its relatives. 相似文献
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砧用南瓜种质资源形态学性状与SSR标记分析 总被引：2，自引：0，他引：2
搜集了设施黄瓜嫁接栽培中常用的47 份砧用南瓜种质资源,利用63 个形态标记和40 对南瓜SSR 标记,对其进行遗传多样性及亲缘关系鉴定。结果表明,砧用南瓜的8 个质量性状（嫩瓜皮色、瓜形、主蔓色、瓜面斑纹、叶面白斑、叶形、嫩瓜斑纹和嫩瓜斑纹色）和23 个数量性状的多样性指数大于1.00;SSR 标记共检测到167 个等位变异,平均每个SSR 位点的等位基因数为4.18 个,变幅2 ~ 8 个,平均多样性指数为0.62,变化范围0.16 ~ 1.18。非加权算术平均法（UPGMA）聚类分析表明,砧用南瓜63 个形态学性状将47 份种质划分为4 个类群,大部分品种集中于一个类群中;40 对多态性SSR 标记将所有种质划分为3 个类群,大部分品种的分子标记与形态学标记的聚类结果相似。已搜集的47 份砧用南瓜种质资源遗传多样性并不丰富,亲缘关系较近;SSR 标记CMTm11 具有极高的多态性,可用于砧用南瓜种质分子标记辅助选择;嫩瓜皮色等8 个质量性状和大部分数量性状都可以作为形态标记辅助种质资源评价及新品种选育。 相似文献
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梨遗传连锁图谱的构建及部分果实性状QTL的定位 总被引：5，自引：1，他引：4
利用八月红梨和砀山酥梨杂交得到的F1代实生苗为作图群体,应用Joinmap3.0作图软件,构建了一张包含61个苹果EST-SSR标记、68个苹果SSR标记、49个梨SSR标记、1个RAPD标记和3个质量性状标记,共182个标记并分属于19个连锁群的梨遗传连锁图谱,图谱总长度为982cM,标记间平均图距5.4cM。控制果皮红色的基因RFS位于LG3连锁群上,与最近的分子标记MES93-264p的遗传距离分别为9cM。控制果锈存在的基因FR、控制萼片脱落性状的基因AS分别位于LG16连锁群和LG12连锁群上。采用区间作图法,检测到与果实可溶性固形物含量、单果质量、横径和纵径等性状连锁的QTL位点21个(LOD≥2.5),其中主效QTL位点6个(LOD≥3.5),与果实性状相关QTL位点多集中在LG7和LG11连锁群上。 相似文献
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以一年生辣椒（Capsicum annuum）B9431 为母本（P1）,中国野生灌木辣椒（C. frutescens）
H108 为父本（P2）进行种间杂交,得到包含180 个单株的F2 作图群体,利用SRAP、SSR、ISSR 标记和
形态标记构建辣椒遗传图谱。该图谱共包含14 个连锁群,涉及264 个SRAP 标记、32 个SSR 标记和2
个ISSR 标记,控制软肉落果性状的S 基因定位于LG8。图谱总长1 023.45 cM,标记间平均图距3.42 cM。
每个连锁群的标记数在2 ~ 44 个之间,连锁群的长度在13.84 ~ 129.93 cM 范围内,平均图距在2.38 ~ 12.90
cM 之间。以SSR 标记为锚定标记,将该图谱与Minamiyama 等构建的图谱进行了初步对应。 相似文献