11个延边地区栽培梨品种的S基因型鉴定     

《果树学报》2011,(4):575-579

鉴定梨品种的S基因型可为合理配置授粉树、杂交亲本选配提供理论依据。为鉴定11个延边地区栽培梨品种的S基因型,利用梨的自交不亲和基因（S-RNase）特异引物FTQQYQ和anti-IIWPNV,对11个梨品种的基因组DNA进行S基因特异扩增,并对扩增片段进行回收、克隆、测序,使用生物信息学软件对各序列进行分析和同源性搜...  相似文献   

8个中国梨品种S基因型的分子鉴定     

梁文杰  谭晓风  张琳  曾艳玲  姜傲芳  曹玉芬  李秀根 《果树学报》2007,24(6):757-760

为鉴定8个中国梨品种的S基因型,使用梨自交不亲和基因(S-RNase)特异引物"FTQQYQ"和"anti-ⅡWP-NV",对8个梨品种的基因组DNA进行特异扩增,并对扩增片段进行回收、克隆、测序。使用生物信息学软件对各序列分析和经同源性搜索分析后,确定了各品种的S基因型。结果分别是:兰州花长把为S19S22,青面为S1S18,黄面为S1S12,早蜜为S19S29,大面黄为S1S19,无子黄为S28S16,大青皮为S34S19及金锤子为S16S19。  相似文献   

秋子梨品种‘龙香’S基因型的鉴定及梨S_(42)-RNase新基因的序列分析     

梁文杰  谭晓风  王立新  夏丽芝  曹玉芬  张琳 《北方园艺》2009,(12)

利用特异引物对秋子梨品种‘龙香'的基因组DNA进行PCR扩增.通过对扩增片段的回收、克隆和测序,获得2条大小分别为469 bp和653 bp的DNA序列,将其推导氨基酸序列与GenBank中已登录的梨S基因的序列进行比对.结果表明:469 bp序列与已登录梨的S16-RNase基因完全一致,确定‘龙香'的1个等位基因为梨S16基因;653 bp序列与梨S基因的相似性在75%～90%之间,且在高变区存在6个以上氨基酸的差异,近一步分析确定为1条新的梨S基因,命名为S42-RNase基因,该基因在GenBank的登录号为:EF088497.确定秋子梨品种‘龙香'的S基因型为S16S42.  相似文献   

6个梨品种S基因型鉴定及新基因S_(45)-RNase序列分析     

《果树学报》2010,(5)

梨是典型的配子体自交不亲和果树,生产上需要配置授粉树才能获得理想的产量。鉴定梨品种的S基因型能够为合理配置授粉树提供理论依据。为鉴定S基因型,设计特异性引物对6个中国原产梨品种的基因组DNA进行扩增,片段回收、克隆、测序。使用生物信息学软件对各序列进行分析,确定6个梨品种S基因型分别为:宝珠S22S42,半斤酥S5S21,张掖长把S19S22,贵德长把S19S22,满顶雪S4S15,水冬瓜S15S45。其中S45为新分离鉴定的梨S-RNase基因,GenBank登录号为:EF643634。S45和梨S26的相似性最高,但高变区有5个氨基酸差异。  相似文献   

京白梨等品种S 基因型鉴定及新基因S₂₈ 和S₃₀ 的核苷酸序列分析   总被引：8，自引：3，他引：8  

张妤艳  吴俊  衡伟  张绍铃 《园艺学报》2006,33(3):496-500

 根据梨S基因高度保守区C1和C3区, 设计1对引物P1和P2, 对梨品种的基因组DNA进行S基因特异扩增、克隆、测序, 并在GenBank中BLAST比较, 确定S 基因特异性片段, 对京白梨等6个供试自交不亲和品种的S基因型比对结果为: 白梨中的‘库尔勒香梨’为S₂₁ S₂₈ , ‘苹果梨’为S₁₇S₁₉ ; 砂梨中的‘台湾蜜梨’为S₁₁ S₂₂ ; 西洋梨中的‘葫芦梨’为S_a S_b; 秋子梨中的‘京白’为S₁₆ S₃₀ , ‘早梨18’为S₄ S₂₈。其中S₂₈和S₃₀为首次登录的新S 基因, 在GenBank的登录号分别为AY562394 (库尔勒香梨) 和AY876945 (京白) 。  相似文献   

梨配子体型自交不亲和性及其分子机理   总被引：19，自引：1，他引：19  

徐义流  张绍铃 《果树学报》2003,20(1):59-63

综述了梨(Pyrus)配子体型自交不亲和性机理研究的一些进展,主要包括梨自交不亲和性的表现,雌蕊自交不亲和基因(S基因)的表达特性与克隆,S基因蛋白产物(S糖蛋白)的分离、特性鉴定,S糖蛋白的晶体结构与功能,梨S基因型的确定等方面的研究成果,并提出了梨自交不亲和性研究中尚待阐明的问题。  相似文献   

梨S基因芯片的试制及分子杂交条件的优化   总被引：5，自引：0，他引：5  

江南  谭晓风  陈洪  王秀利  张琳  曾艳玲 《园艺学报》2008,35(4):475-486

 为研究寡核苷酸芯片在确定梨品种S基因型中的应用价值,根据梨自交不亲和基因的结构特点设计了部分S基因的检测探针,并制成寡核苷酸芯片;采用引物Cy3荧光标记法标记检测样品的PCR产物并进行杂交,以检测不同样品的S基因型。结果表明：通过对不同杂交温度、杂交时间等的探索获得了较好的反应条件并用制备的芯片检测了已知S基因型的梨样品,检测结果与各品种的已知基因型相符。证明寡核苷酸芯片检测梨品种的S基因型是一种切实可行的检测方法,若对芯片进一步完善,则今后在梨的自交不亲和性状的机理研究及梨自交不亲和性状的利用等方面将有着广阔的应用前景。  相似文献   

甜樱桃S基因型PCR鉴定技术研究     

张晓明  王鸿霞  姜立杰  王国英  周宇  闫国华  张开春 《果树学报》2007,24(4):466-471

绝大部分甜樱桃品种自交不亲和,因此自交不亲和基因型的鉴定对于生产具有重要的意义。以甜樱桃主栽品种为试材,建立基于PCR技术的甜樱桃品种S基因型鉴定技术。试验根据已发表的樱桃S基因序列设计了2对引物组合BFP73/74,BFP93/94,结合S1、S5基因的特异扩增引物,利用扩增片段长度的不同,就可以对樱桃品种的S基因型进行鉴定。通过对已知S基因型品种基因组的扩增,最终建立了基于PCR技术的甜樱桃品种S基因型鉴定技术。  相似文献   

‘金坠梨’自交亲和性突变机制的初步研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

吴华清  张绍铃  吴巨友  王迎涛  吴俊 《园艺学报》2007,34(2):295-300

 自交不亲和性品种鸭梨的芽变品种‘金坠梨’自花授粉能结实, 但其自交亲和性突变机制至今不祥。本研究结果表明, 鸭梨自花授粉结实率仅2% , 自花花粉管在花柱中上部已经停止生长, 而金坠梨自花授粉结实率高达76% , 自花的花粉管能正常生长至花柱基部; 鸭梨花柱能够接受金坠梨花粉并受精结实, 而金坠梨花柱却与鸭梨花粉杂交不亲和; 进一步鉴定出了鸭梨和金坠梨基于S-RNase基因的S基因型, 发现两者S基因型相同, 均为S₂₁S₃₄ ; 通过克隆两品种S-RNase基因cDNA全长序列并进行比较分析发现, 该两品种的1对雌蕊S-RNase基因在核苷酸序列上完全相同, 且S-RNase基因均正常表达, 表达量没有明显差异, 从分子水平上证实了金坠梨在花柱方面和鸭梨并无差异, 可能是花粉S 基因发生突变, 导致了自交不亲和性功能的丧失, 表现出自花授粉能够结实。  相似文献   

新疆主栽杏品种自交不亲和SFB基因的检测   总被引：2，自引：0，他引：2  

刘月霞  冯建荣  王大江  樊新民  姜新 《园艺学报》2011,38(4):666-671

 为系统鉴定新疆主栽杏品种自交不亲和SFB基因型,以新疆25个主栽杏品种为试材,利用蔷薇科保守序列设计引物对叶片基因组DNA进行SFB基因特异PCR扩增,筛选出有效的扩增引物;对成功扩增的杏品种的特异条带克隆测序,在GenBank上进行BLASTN比对,确定各品种的SFB基因型。结果显示：引物组合Ⅱ-1、Ⅳ-2,1-Ⅰ、1-Ⅱ对新疆杏品种的扩增效果最好,成功地在18个品种上扩增出了5种大小不同的条带,14种不同的基因型,其中两  相似文献   

八月酥等14个梨品种自交不亲和基因(S基因)型的鉴定   总被引：3，自引：2，他引：3  

张妤艳  张绍铃  吴俊  张瑞萍  李秀根 《果树学报》2007,24(2):135-139

多数梨品种自花授粉不结实,生产上要合理配置授粉品种才能获得应有的产量。鉴定梨品种的S基因型,能为梨园合理配置授粉品种提供依据。以我国育成的梨品种为试材,利用特异引物PCR产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳分离及DNA序列分析,鉴定出了14个梨品种的自交不亲和基因型(S基因型),并通过统计部分品种的田间人工授粉的坐果率以及应用荧光显微镜观察异花授粉后花柱内的花粉管生长情况来验证鉴定出的梨品种S基因型的可靠性。这些品种的S基因型为:八月酥S3S16、绿云S3S29、谢花甜S29S34、香茌S1S21、脆绿S3S4、新雅S4S34、雅青S4S34、伊犁红句句S22S28、猪嘴酥S19S22、假直把子S5S19、青魁S1S3、德胜香S3S29、张掖长把S3S29、金坠梨S21S34。  相似文献   

梨抗黑星病基因的AFLP分子标记   总被引：1，自引：0，他引：1  

刘成  李俊才  许雪峰  李天忠  王忆  韩振海 《果树学报》2009,26(4)

为了解梨黑星病抗性遗传规律并为梨黑星病抗性育种早期选择提供理论依据,以新苹梨(梨黑星病抗性品种)×雪花梨(梨黑星病易感品种)的杂交后代为试材,进行了田间自然感病和棚内接种梨黑星病(Venturia nashicolaTanak et Yamamota)病菌后的抗性调查,并进行了AFLP分子标记的研究。结果表明,棚内接种梨黑星病菌后,杂交后代抗感分离规律符合双假测交的遗传规律;研究建立的AFLP分子标记体系可以用于梨黑星病的抗性基因标记,并初步找到了与梨黑星病抗性基因相关的分子标记。  相似文献   

果树自交不亲和性基因型及其鉴定方法   总被引：12，自引：3，他引：12  

张绍铃  曹生民  吴华清 《果树学报》2003,20(5):358-363

系统介绍了应用田间授粉试验、花柱离体培养、花柱S糖蛋白电泳及自交不亲和(S)基因特异性PCR分析等来鉴定果树品种S基因型的方法及其特点与应用前景;全面地列出了迄今国际上应用这些方法鉴定出的苹果、梨、甜樱桃、杏4个树种近300个品种的S基因型,探讨了品种来源与S基因型的联系,为果树合理配置授粉品种及在自交不亲和性机理研究中合理选择试材等提供了科学依据。  相似文献   

应用RAPD分析新疆主要梨品种的遗传关系   总被引：6，自引：2，他引：6  

马兵钢  牛建新  潘立忠  冯建荣  鲁晓燕 《果树学报》2004,21(6):521-525

利用RAPD分析了新疆18个梨品种间的亲缘关系。从160个随机十聚体引物中筛选出12条RAPD引物。18份材料共扩增133条带,平均每条引物扩增约11条带,其中14条带为所有材料的共有带,有119个多态性位点,占总带数的89.47%,Nei相似系数为0.5～0.923。用PHYLIP构建MP树,认为(1)对选用的形态学经典分类已较明确的新疆梨、白梨、砂梨、西洋梨、秋子梨,RAPD分析数据完全与其相符;(2)几个芽变品种间高度相似;(3)杂种新梨1号与砀山梨、杂种新梨6号与香梨、杂种早酥梨与苹果梨分别并类;(4)苹果梨独立于供试的5个种之外;(5)库尔勒香梨归属于新疆梨。  相似文献   

本地早橘的AFLP标记     

谭金娟  肖金平  陈力耕 《果树学报》2008,25(2):254-257

采用AFLP技术分析了来自浙江黄岩的4个本地早橘材料(3个无核材料,1个有核材料),共筛选了72对E+3/M+3引物组合,从中选用12对多态性较好的引物进行最终扩增;最终得到9条清晰稳定的标记片断,分别命名为SL1～SL9;克隆测序后将所得碱基序列提交Genbank核酸序列数据库进行BLAST比对分析,结果表明,特异片段SL1与一种植物生长素输出蛋白编码基因PIN9有78%的一致性;特异片段SL2与一种植物反转录转座子基因有87%的一致性;特异片段SL4与植物叶绿体基因有94%的一致性;与功能基因较高的同源性为我们理解柑橘无核形成的分子机制提供了有价值的信息。  相似文献   

苹果新品种自交不亲和基因型的分子生物学鉴定   总被引：1，自引：0，他引：1  

张雪梅  李保国  崔惠英  齐国辉 《园艺学报》2007,34(3):747-750

根据保守氨基酸序列FTQQYQ 和anti-¹/_M IWPNV 设计苹果自交不亲和基因引物P1 : 5′2 TT2TACGCAGCAATATCAG23′; P2 : 5′2 ACGTTCGGCCAAATA /CATT23′, 利用PCR - RFLP分析方法, 以河北省新引进的苹果品种美国8号、昂林、松本锦、华冠、南方脆幼叶为试验材料, 鉴定其自交不亲和基因型分别为S₉S₂₇、S₁S₉、S₉S ₉、S₂S₉、S₂S₉。  相似文献   

Cloning of the S25 cDNA from ‘McIntosh’ apple and an S25-allele identification method     

Kentaro Kitahara 《The Journal of Horticultural Science and Biotechnology》2013,88(6):724-728

Summary

An S₂₅-RNase gene in the pistil responsible for self-incompatibility within the apple (Malus × domestica Borkh.) was cloned from a McIntosh cultivar. We developed an S₂₅-allele-specific polymerase chain reaction and digestion (PCR-digestion) method using specific primers and the restriction enzyme BamHI. We investigated the S-allele genotypes of 18 ‘McIntosh’ progeny.  相似文献   

Nutritional,chemical and molecular characterisation of Moringa oleifera Lam. and Moringa peregrina (Forssk.) Fiori genotypes     

Anber Mahmoud Ahmed Hassanein 《The Journal of Horticultural Science and Biotechnology》2018,93(5):500-509

This work aimed to characterise Moringa oleifera (Mo) and Moringa peregrina (Mp), grown in Saudi Arabia, based on nutritional and molecular markers. Seven genotypes per species were evaluated using 1-year-old trees. The nutritional characterisation included chlorophyll, protein, macronutrients, micronutrients, and heavy metals. Simple sequence repeat (SSR) was applied using nine primers for genetic characterisation. Significant differences in nutritional content were found between the two species and among the genotypes of each species. Mp had more chlorophyll content, however Mo contained higher protein, Fe and Zn. Correlations among nutritional characteristics allowed representative classification of genotypes based on these pertinent indicators only. Cluster analysis separated the genotypes of each species in independent group, but three Mo genotypes and two Mp genotypes were distinguished for their variability in nutritional properties. Most Mo genotypes amplified the nine SSR primers, however 6/9 primers only produced bands in Mp genotypes. The number of amplified primers per Mp genotype varied from zero to six. A strong relationship was found between nutritional and molecular classifications of genotypes. The efficient classification based on four chemical characteristics could be beneficial for Moringa evaluation. The correlation between genetic and nutritional variability could serve in improving Moringa and identifying genetic criteria.  相似文献