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1.
以1年种植(新植园)和3年连作百香果园根际土壤作为研究对象,采用Illumina MiSeq高通量测序技术分析根际土壤中的微生物群落结构组成和多样性变化,以期为克服百香果连作障碍提供指导。结果表明,相比新植园,3年连作园根际土壤细菌群落多样性显著降低,细菌群落丰富度,真菌群落丰富度、多样性增加。根际土壤微生物群落组成发生了较大变化,在门分类水平上,3年连作园根际土壤中变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度分别增加了5.86个百分点和2.21个百分点;放线菌门(Actinobacteria)减少了3.40个百分点,子囊菌门(Ascomycota)减少了28.41个百分点,而毛霉门(Mucoromycota)增加了14.73个百分点。在属分类水平上,3年连作园根际土壤中γ-变形菌纲中未分类属unclassified;ammaproteobacteria、黄单胞杆菌科未分类属unclassified;anthomonadaceae相对丰度显著增加,酸杆菌门中Gp2相对丰度显著降低;子囊菌属(Archaeorhizomyces)、孢子丝菌属(Sporothrix)、粪壳菌属(Sordaria)相对丰度减少,小被孢霉(Mortierella)、镰刀菌属(Fusarium)两个病原菌属相对丰度增加。说明连作改变了百香果根际土壤微生物群落结构,细菌多样性降低,真菌多样性升高,病原菌相对丰度增加,土壤由细菌型向真菌型转化。 相似文献
2.
植物根际土壤微生物群落能够加速根际营养元素的循环,调节土壤肥力。分析桃树根际土壤微生态结构,可以为桃树种植土壤改良提供依据。利用高通量测序技术对临沂市李官、汤头、沂水3个地区桃园根际土壤微生物多样性和群落组成进行分析。经筛选和去除嵌合体后,得到了425 267条优质序列,这些序列的长度主要集中在400～450bp。在3个地区的样品中共鉴定出4 175个操作性分类单元（OTU）。物种分类结果显示,细菌包括25个门、54个纲、145个目、272个科、497个属和577个物种。在临沂不同地区的桃树根际土壤样品中,细菌群落组成和结构存在一定差异,细菌丰富度和多样性的顺序为汤头>沂水>李官。细菌群落中,线菌门和变形菌门的丰度之和达到50.37%～66.07%,属于绝对优势菌门。根据COG功能分类统计,土壤细菌的功能基因主要集中在新陈代谢、遗传信息和细胞信号传导等方面。总体而言,桃根际土壤的细菌多样性和群落组成在不同地区之间存在差异。 相似文献
3.
《北方园艺》2020,(14)
以灰枣和骏枣根际土壤为试材,采用Illumina Miseq测序技术分析了不同地区不同品种红枣黑斑病病株及健株根际土壤真菌群落组成和多样性;对土壤理化性质与根际土壤真菌丰富度前20位优势菌属之间的相关性进行分析。通过探究南疆地区发生红枣黑斑病根际土壤真菌群落的多样性,以期揭示新疆红枣发病与其根际土壤真菌群落之间的相关性,为生物防治提供思路和方法。结果表明:阿克苏和喀什地区灰枣和骏枣的根际土壤真菌测序中共获得6 221 336个有效标签,17 239个OTUs共鉴定出21个门42个纲299个属,其中80%为子囊菌门和担子菌门。阿克苏地区灰枣根际土样和骏枣根际土样中的菌属分别聚类在一起,喀什地区灰枣根际土样和骏枣根际土样中的菌属分别聚类在一起。RDA分析表明,发病灰枣土样中有效磷和pH对土壤微生物群落结构的影响最大,发病骏枣土样中有机碳、速效钾和pH对土壤微生物群落结构的影响最大。红枣黑斑病根际土样中真菌群落组成丰富,同一地区不同红枣品种根际土真菌群落结构存在显著差异;发病红枣根际土壤真菌群落多样性与土壤环境因子之间存在一定相关性。 相似文献
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以种植白及2年的砂质壤土和砂质粘土为试材,采用高通量测序技术和生物信息学分析方法,研究根际真菌群落结构特征,测定土壤理化因子,分析土壤理化因子与真菌群落的相关性,以期为白及根际土壤微生物改良及优质高产栽培提供参考依据。结果表明：共得到43 651条真菌基因优化序列,2种根际土壤真菌存在差异,砂质壤土和砂质粘土特有真菌OTU数分别占总数的33.50%、33.60%;α多样性分析表明,砂质壤土中真菌属丰富度高于砂质粘土;群落结构分析表明,除未分类的真菌属之外,镰刀菌属(Fusarium)和被孢霉属(Mortierella)在2种白及根际土壤中均为优势真菌属,砂质壤土中显著富集附球霉属(Epicoccum)、土赤壳属(Ilyonectria)、Knufia,而砂质粘土中显著富集外瓶柄霉属(Exophiala)、原隐球菌属(Saitozyma);土壤有效磷对白及根际土壤真菌群落的α多样性有显著影响,有机质、pH、有效磷、有效镁、有效钙对土壤真菌群落具有显著影响。种植白及的砂质壤土和砂质粘土真菌群落结构存在差异,土壤理化因子对根际真菌具有一定影响,其中有效磷最为显著。 相似文献
6.
为探究红色红菇Russula rosea生境中的微生物群落及物种多样性，采用高通量测序技术或平板分离的方法对其子实体及菌根根际土壤进行分析。高通量方法分析结果，红色红菇生境中真菌种类覆盖5门，15纲，54目，75科，157属，其中绝对优势属红菇属Russula和金孢菌属Chrysosporium的占比分别为80%、2.3%,2个优势真菌R.rosea与Chrysosporiu spp.呈负相关关系；细菌种类覆盖3门，6纲，11目，20科，104属，其中绝对优势属杜檊氏属Duganella和假单胞菌属Pseudomonas分别占32%、20%，且Duganella sp与Pseudomonas sp属于正相关的功能群。此外，从R.rosea子实体上分离到3株真菌，从其根际土壤鉴定到4株真菌和2株细菌。研究为红菇的人工分离培养，微生态制剂的开发等提供理论依据。 相似文献
7.
《果树学报》2020,(9)
【目的】从根际微生物群落代谢与组成方面探讨不同落叶果树根际差异性。【方法】利用Biolog ECO板方法与Illumina Miseq sequencing技术,以未种植果树区域土壤为对照,研究苹果、梨及葡萄等8种落叶果树根际微生物群落的代谢与组成。【结果】8种果树根际微生物的代谢活性与功能多样性指数(除Pielou均匀度指数E外)均显著高于对照。比较8种果树根际微生物群落的碳源利用特征情况发现,杏树根际微生物群落对酚酸类物质(PC,phenolic compounds)的利用比率显著下降,对碳水化合物(CH, carbohydrate)的利用比率显著上升,而对照土壤微生物群落对氨基酸类(AA,amino acids)碳源利用比率最高。细菌与真菌群落纲水平相对丰度表明,8种果树根际细菌与真菌群落相对丰度存在明显差异,其中苹果与核桃γ-变形菌纲相对丰度较其他果树显著上升;而与细菌群落相比,8种果树根际真菌群落在纲水平上差异更为明显。基于纲水平优势菌与微生物群落代谢之间的相关性分析表明,微生物群落代谢与Betaproteobacteria、Alphaproteobacteria及Sphingobacteriia呈显著正相关,而与Gemmatimonadetes、Sordariomycetes、Glomeromycetes及Chytridiomycetes均呈显著负相关。另外,RDA分析表明,微生物功能多样性(除E外)与细菌α多样性呈正相关,而与真菌α多样性呈负相关。【结论】8种果树微生物群落碳代谢存在显著差异。8种果树根际细菌与真菌群落均存在显著差异,而真菌群落较细菌差异更为显著。根际微生物群落代谢与细菌群落呈正相关,而与真菌群落呈负相关。 相似文献
8.
以黑土、沙土和沙壤土为研究对象，采用农化分析技术测定土壤化学因子，利用16S rRNA和ITS技术开展根际土壤细菌和真菌基因组测序研究，以期探讨龙胆不同栽培土壤微生物群落结构及多样性特征。结果表明：3种土壤的养分除了TP以外均存在明显差异(P<0.05),其中，黑土养分含量最高，沙壤土次之。黑土中酸杆菌门、绿弯菌门和担子菌门占优势，在沙壤土中，放线菌门、疣微菌门和被孢霉门占优势，而变形菌门、芽单胞菌门和子囊菌门在沙土中占优势。Shannon和Chao1指数表明黑土微生物群落多样性和丰富度略高于沙壤土，但二者显著高于沙土(P<0.05)。PLS-PM分析表明，土壤有机碳(SOC)与土壤细菌群落结构呈极显著正相关(P<0.01),而土壤速效养分(NH+4-N、NO-3-N,AP和AK)与细菌多样性具有极显著负相关关系(P<0.01)。可以看出，SOC和速效养分影响了根际细菌群落结构和多样性，黑土和沙壤土比较适合栽培龙胆。 相似文献
9.
《中国南方果树》2021,(4)
前期研究表明,木霉P3.9菌株Trichoderma atroviride对土传真菌引起的枇杷根腐病有较好盆栽防治效果,为了明确木霉P3.9菌株对枇杷根际细菌多样性及群落组成的影响,采用其菌株孢子悬浮液1×10~6 cfu/mL灌根后,不同时间采集枇杷根际土壤,通过Illumina平台高通量测序,比较木霉P3.9菌株处理和对照(清水)对枇杷根际细菌群落组成及多样性差异的影响。结果表明,枇杷根际土壤细菌优势菌群为变形杆菌门Proteobacteria、放线菌纲Actinobacteria、丙酸杆菌目Propionibacteriales、类诺卡氏菌科Nocardioidaceae、气微菌属Aeromicrobium。木霉P3.9菌株处理没有改变枇杷根际细菌物种多样性及优势菌群种类,而改变了非优势菌群的丰度。木霉P3.9菌株处理30 d之内,不改变枇杷根际细菌多样性,30～40 d多样性略有下降,50～90 d枇杷根际细菌多样性又恢复正常水平。说明枇杷根际添加木霉P3.9菌株对其根际细菌多样性无不良影响,反而可以改善非优势菌群的丰度,对连作枇杷根际土壤肥力有提升作用。 相似文献
10.
分析猕猴桃根腐病感病植株和未感病植株根际土壤真菌群落差异,可为研究猕猴桃根腐病发生机制及其调控技术提供依据。在浙江省天台县街头镇的“红阳”猕猴桃种植基地,以树龄9年的猕猴桃根腐病感病植株和未感病植株根际土壤真菌为研究对象,对菌群ITS序列进行高通量测序注释后,对比分析了真菌群落结构与多样性指数的差异,并测定分析了根际土壤脲酶、蔗糖酶和酸性磷酸酶的活性。结果表明,猕猴桃根腐病的发生极显著地降低了根际土壤脲酶、蔗糖酶和磷酸酶的活性(p<0.01)。感病植株根际土壤真菌群落丰富度指数(Chao1)显著低于未感病植株根际土壤(p<0.05)。在门分类水平上,感病植株根际土壤真菌中相对丰度降低的有担子菌门、未分类真菌和接合菌门,其差异均为极显著(p<0.01);相对丰度升高的为子囊菌门,其差异达极显著水平(p<0.01)。在属分类水平上,感病植株根际土壤真菌相对丰度增加的有赤霉菌属、丛赤壳属、镰刀菌属、假裸囊菌属和肉座菌属,其差异均达极显著水平(p<0.01);相对丰度降低的有未分类伞菌纲、枝鼻菌属、粗糙孔菌属、线虫草属、支顶孢属、粪盘菌属、木霉属和被孢霉属,其差异... 相似文献
11.
不同树龄南丰蜜橘根际土壤微生物群落多样性分析 总被引：3，自引：0，他引：3
采用磷脂脂肪酸（PLFA）生物标记法,分析了树龄（嫁接后）1年、8年、15年和20年的南丰蜜橘根际土壤微生物多样性。结果表明,不同树龄南丰蜜橘根际土壤PLFA标记含量存在差异,呈现出不同的变化趋势,细菌、硫酸盐还原菌、嗜热解氢杆菌、放线菌等一些参与土壤物质循环的微生物类群的数量在下降,真菌、伯克霍尔德菌等一些适应于贫瘠土壤、代谢能力低的类群数量增加。8年树龄的南丰蜜橘根际土壤PLFA总量最大,细菌、放线菌PLFA含量高于其它土壤样品;20年树龄的南丰蜜橘根际土壤PLFA总量最小,其真菌PLFA含量高于其它土壤样品,表明土壤微生物量与土壤的肥沃程度相关,真菌比细菌更能适应养分贫瘠的条件。采用多样性指数分析,显示8年树龄的南丰蜜橘根际土壤微生物多样性指数最高,20年树龄的最低,表明随着南丰蜜橘树龄增长,微生物群落多样性与均匀程度皆出现了一定程度的下降。土壤酶活性分析结果表明,与8年树龄相比,20年树龄的南丰蜜橘根际土壤脲酶、酸性磷酸单酯酶与过氧化物酶活性较低,蔗糖酶活性较高。通过相关性分析发现,不同树龄南丰蜜橘土壤细菌、放线菌、真菌、原生动物各总PLFA与酶活性、土壤肥力因子之间存在相关性。由此可见,随着南丰蜜橘种植年限的增加,南丰蜜橘根际土壤的微生物群落多样性降低,根际土壤质量和一些关键酶活性出现较大幅度下降。 相似文献
12.
通过田间微区试验,采用高通量测序技术,探究不同土壤消毒结合微生物菌剂方法对连作茄子黄萎病防控和根际土壤真菌群落结构影响。结果表明:土壤消毒结合枯草芽孢杆菌处理(BB)显著降低了根际真菌Ace、Chao和Shannon指数,分别比连作茄子处理(CK)降低了23.29%、19.78%和42.71%,黄萎病病原菌数量与病情指数分别比CK处理降低97.2%和51.6%。茄子根际土壤真菌多样性和黄萎病病原菌数量呈显著正相关性。根际土壤主要优势菌门为子囊菌门(Ascomycota),相对百分比在各处理中均大于50%。BB处理显著增加了接合菌门(Zygomycota)的相对丰度,比CK处理增加了73.3%,但子囊菌门和担子菌门(Basidiomycota)的相对丰度分别降低33.6%和61.1%;与对照处理(CK)和化学农药消毒(CF)相比,BB处理和土壤消毒处理(BF)毛壳菌(unclassified_f_Chaetomiaceae)和被孢酶属(Mortierella)等有益菌相对丰度增加,镰刀菌属(Fusarium)和马杜拉分枝菌属(Madurella)等病土传病原菌的相对丰度降低。土壤消毒并配施枯草芽孢杆菌改变土壤真菌群落结构使茄子黄萎病得到有效防控。 相似文献
13.
《北方园艺》2020,(10)
以多年连作的西葫芦试验田为平台,设置油菜根际土壤(RRS)、油菜非根际土壤(NRS)及油菜生物熏蒸(BFS)3个处理,采用土壤理化分析、高通量测序技术研究生物熏蒸前后土壤环境因子及真菌群落结构的变化。结果表明:在连作西葫芦试验田种植油菜后,油菜根际及破碎后生物熏蒸能够改善土壤养分,改变土壤真菌群落结构组成,抑制或杀害土壤中部分有害病原菌,在一定程度上有助于防治连作引起的土传病害。3个处理在门分类水平上,共检测到5个菌门,且NRS处理存在分类地位不确定真菌门,子囊菌门为绝对优势菌门;3个处理的真菌群落丰富度和多样性指数大小排序为NRSBFSRRS,且仅在RRS和NRS处理间存在显著差异;与NRS相比,RRS及BFS能抑制或杀灭土壤中部分有害真菌属;NRS处理的显著性差异物种高于其它2个处理;聚类分析表明NRS与BFS处理土壤真菌群落结构相似;与NRS相比,RRS及BFS处理显著提高了土壤碱解氮、速效钾、有机质含量,降低了土壤pH;CCA分析表明,土壤碱解氮、速效磷及有机质含量是影响真菌群落最为重要的环境因子。 相似文献
14.
土壤改良施肥对白菜根际微生物群落结构的影响 总被引：2，自引：0，他引：2
为了了解改良施肥方式对土壤微生物群落结构的影响,以白菜为试材,采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对常规施用化肥和改良施肥(化肥减量、增施有机肥、增施土壤调理剂)条件下白菜根际真菌和细菌群落结构进行了研究。结果表明:改良施肥后增加了白菜产量,缓解了土壤酸化的情况,土壤养分增加,改良施肥方式白菜根际真菌和细菌丰度和多样性大于常规施肥处理,2种施肥方式微生物群落组成和优势类群有较大差异。改良施肥后白菜根际微生物种类增多,优势类群发生了较大变化。 相似文献
15.
以羊肚菌栽培地内土壤为试材,采用Illumina HiSeq高通量测序技术分析土壤真菌群落结构的方法,研究了羊肚菌在进行栽培时翻地处理前后的土壤真菌群落结构的变化,以期为羊肚菌栽培时土壤真菌群落结构的变化提供参考依据。结果表明:4组土壤样品的真菌群落在门分类水平结构分析中共有优势菌门3种,分别为子囊菌门(Ascomycota)、鞭毛菌门(Mortierellomycota)、担子菌门(Basidiomycota);在属分类水平结构分析中仅有优势菌属2种,分别为Mortierella属和Tetracladium属。通过差异分析,发现翻地处理前后,不同土壤深度下真菌微生物群落组成发生较大变化。 相似文献
16.
为探究凤丹不同土层根际细菌群落组成及结构的垂直分布规律,采用高通量测序技术,分析了凤丹根际不同土层(0～20、20～40、40～60 cm)中细菌群落组成和多样性的变化。测序结果表明,所有土壤样品共获得3 588个OTUs,分属于20门,60纲、100目、110科、98属。0～20 cm深度土壤中的根际细菌丰富度显著高于20～40 cm和40～60 cm,不同土壤深度间根际细菌组成存在一定的差异,且随着土壤深度的增加根际细菌多样性逐渐减少。其中,3种土层间主要的差异细菌门为酸杆菌门、厚壁菌门、放线菌门,酸杆菌门在0～20 cm土层中占比18.7%,而在40～60 cm土层中酸杆菌门丰度达到34.5%;主要的差异细菌纲为酸杆菌纲、放线菌纲以及芽胞杆菌纲,酸杆菌纲在0～20 cm和20～40 cm土层中丰度分别达到18.7%和21.8%,而在40～60 cm土层中为34.5%,是前二者占比的1.58～1.84倍。放线细菌纲(Actinobacteria)在0～20 cm土层中仅占比6.5%,在20～40、40～60 cm土层中分别达到34.8%和20.7%。芽胞杆菌纲(Bacilli)在0... 相似文献
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西瓜连作对根际微生物群落的影响 总被引：1，自引：0，他引：1
为明确根际微生物群落演替变化与西瓜连作之间的关系,调查2014—2016年连续3 a(年)种植西瓜的产量和发病情况,并利用Illumina Miseq平台对连作西瓜根际土壤微生物群落进行扩增子测序分析。结果表明,连续3 a种植西瓜其产量显著降低而枯萎病发病率和病情指数显著提高。不同种植年限根际微生物群落多样性存在显著差异,西瓜的连年种植打破了其根际微生物群落原有的平衡,使得细菌群落多样性下降而真菌群落多样性上升。在门水平上,Proteobacteria、Acidobacteria和Ascomycota的相对丰度升高,而Firmicutes、Actinobacteria、Gemmatimonadetes和Chytridiomycota的相对丰度下降。在属水平上,Bacillus,Lysobacter与Pseudomonas等许多有益微生物相对丰度降低而病原菌所在的Fusarium相对丰度增加,最终表现为西瓜枯萎病爆发,产量降低。 相似文献
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以“津优35号”黄瓜为试材,采用盆栽试验法,用150 mmol·L-1 NaCl模拟盐胁迫,通过添加体积比为300、600倍和900倍的腐殖酸进行处理,研究了腐殖酸对盐胁迫土壤养分和微生物群落结构的影响,以期探索腐殖酸对盐胁迫下温室黄瓜土壤微生态环境的作用效果。结果表明：腐殖酸显著提高了土壤中有机质、速效钾、速效磷和全氮含量,而降低了pH。在细菌群落结构方面,各处理间细菌α多样性差异不显著,T1和T2中放线菌门、绿弯菌门和浮霉菌门的相对丰度均高于CK,而拟杆菌门和酸杆菌门的相对丰度则相反,细菌在属水平上组成变化并不明显。在真菌群落结构方面,T1和T2中OTU数量和Shannon指数与CK差异均不显著,而Chao1指数均显著高于CK,腐殖酸还提高了子囊菌门的相对丰度,T1、T2和T3中子囊菌门相对丰度分别较CK高28.07%、26.48%和6.41%,降低了担子菌门和壶菌门的相对丰度,在已知菌属的变化中,毛壳菌属和枝顶孢属的相对丰度升高,根生壶菌属的相对丰度降低。RDA冗余分析表明速效钾是影响细菌群落结构的关键环境因子,而有机质、速效磷和pH则对真菌群落结构起到关键... 相似文献
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以3个厚皮甜瓜品种为试材,采用传统追施水溶性化肥(T1)和追施生物菌液(T2)2种施肥方法,研究高肥力土壤(速效养分超标)用生物菌液完全替代化肥对根际土壤生态和甜瓜生长、产量、品质的影响,以期为设施果蔬化肥减量提供参考依据。结果表明：270 L·hm-2生物菌液(T2)替代180 kg·hm-2化肥(T1),T2与T1相比,氮、钾投入量分别减少73.7%、97.8%,磷增加31.4%,根际土壤养分含量无显著差异。在微生物多样性上,细菌菌群T2>T1,但差异不显著,真菌菌群T1显著大于T2。在微生物组成上,T2有46种属水平的细菌菌群含量大于T1,后者有185个属水平的真菌菌群大于前者。2种施肥处理甜瓜产量和可溶性固形物含量均无显著差异。因此,在高肥力设施土壤可用生物菌液替代化肥实现氮、钾化肥减量增效。 相似文献
20.
以茄子作为砧木,番茄为接穗进行嫁接,并以番茄自根植株和茄子自根植株作为对照,基于传统及现代高通量测序技术分析根际土壤的生物学性状及细菌群落结构特征,旨在揭示嫁接植株抗性增强的机制。结果表明：番茄/茄子嫁接植株根际土壤中可培养细菌、放线菌数量,微生物生物量、酶活性和细菌丰富度、多样性指数均显著高于茄子和番茄自根植株;另一方面,norank_c_Acidobacteria、硝化螺菌属（Nitrospira）、芽孢杆菌属（Bacillus）、norank_f_Gemmatimonadaceae、norank_o_Gaiellales、norank_f_Xanthobacteraceae、norank_o_SC-I-84、norank_f_Anaerolineaceae、norank_f_Nitrosomonadaceae、鞘脂单胞菌属（Sphingomonas）细菌是嫁接植株与茄子、番茄自根植株根际土壤中的共有优势细菌属;g_unclassified_o_Ignavibacteriales 、 醋酸杆菌属（ g_Acetobacter ）、g_norank_f_Longimicrobiaceae 、g_unclassified_f_Verrucomicrobiaceae、g_norank_p_FBP、g_norank_p_Aminicenantes 属细菌是嫁接植株根际土壤的特有优势细菌属。与自根植株相比,番茄/茄子嫁接植株根际土壤存在更高可培养微生物数量,微生物生物量和相关酶活性,具有更高的土壤养分有效性,同时拥有不同占比的共有优势细菌门属,尤其拥有更为丰富的微生物可操作分类单元（operational taxonomic units,OTU）和特有 OTU 数量,这是嫁接植株抗性增强的主要原因。 相似文献