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1.
采用随机扩增多态DNA(RAPD)方法对6个群体30丛撑篙竹个体进行了遗传变异的研究。28个随机引物共检测到173个位点,其中85个是多态位点,平均每个引物提供6．18个RAPD信息量,扩增出的DNA片段大小一般在200～2000bp范围之间;用POPGENE1．31版软件进行遗传多样性分析：平均Nei’s基因多样性为0．2114,Shannon’s信息指数为0．3277,基因分化系数0．1853,表明群体间有一定的分化;各群体平均遗传距离0．0350,表明群体亲缘关系较近;试用UPGMA方法对不同产地的撑篙竹群体作聚类分析,初步可将6个群体聚为3类。 相似文献
2.
《中南林业科技大学学报(自然科学版)》2010,(12)
利用ISSR分子标记技术,对湖南城步马尾松种子园的4个种源区的117个无性系的马尾松遗传多样性进行了研究。采用了10个ISSR引物扩增共获得了218个标记位点,其中有210个为多态位点,多态位点比率为96.33%。不同种源区多态位点百分率在88.99%~90.37%之间。其中两广种源区的多态位点百分率最高,达90.37%,说明其种源内遗传变异水平在4个种源区中是最高的。总的Shannon多样性指数为0.503 0。Nei’s遗传多样性指数为0.334 7。各个种源区的遗传一致度的变化范围在0.968 9~0.981 2之间,各群体间的基因分化系数为0.039 3,基因流为12.221 9。4个种源区间Nei’s遗传距离UPGMA聚类分析结果表明,遗传距离(0.019 0)最小的为雪峰山地种源区与贵州种源区首先聚类,雪峰山地种源区、贵州种源区与南岭山脉种源区依次聚类,遗传距离最大(0.031 6)的是两广种源区与贵州种源区,两广种源区在遗传距离上与其他3个种源区的聚类相距较远,这与其地理分布格局大致吻合。本研究的初步结果为无性系种子园的经营和择伐提供了一定的理论依据。 相似文献
3.
本文应用6条ISSR引物对石蒜和忽地笑11个种群共279个样本进行试验,欲从分子水平上研究其遗传差异,并对其遗传多样性和遗传结构等方面进行研究。6条引物共扩增出62个条带,其中多样性条带为60条,多态性可达96.8%。其中有5条引物可以扩增出鉴别石蒜和忽地笑的特异性扩增条带,共计11条,其中4条为石蒜种群特有,7条为忽地笑种群特有,从而将二者鉴别出来。另外石蒜和忽地笑种群多态位点百分率(PPB)分别为95.2%和58.1%,Nei’s基因多样性(H)分别为0.297和0.157,Shannon多样性指数(I)分别为0.454和0.248。石蒜和忽地笑种群的基因分化系数Gst分别为0.374和0.457,说明其天然种群的大部分变异(62.6%和54.3%)存在于种群内。石蒜和忽地笑种群的基因流Nm分别为0.836和0.593,比较小。UPGMA聚类结果显示,8个石蒜种群聚为一类,然后与3个忽地笑种群最后聚在一起。 相似文献
4.
运用RAPD技术,对现存于武夷山国家级自然保护区内4个不同海拔光皮桦天然种群共91个基因株的遗传多样性进行分析.18个10碱基随机引物共扩增出199条清晰的条带,种群平均多态位点百分比(PPL)为60.05%,Nei's基因多样性指数(h)为0.224 2,Shannon信息指数(I)为0.318 1;不同种群遗传变异水平随海拔差异呈规律性变化,表现为沿海拔升高而呈由高到低的分布;在物种水平上光皮桦具有较高的遗传多样性(PPL=87.44%,h=0.344 2,I=0.489 9),种群间的遗传分化系数Gst=0.348 6.利用AMOVA软件对遗传变异的等级剖分结果表明,种群问有显著的遗传分化,约1/3的遗传变异存在种群间,种群内占2/3.Pearson相关分析表明,光皮桦种群内遗传多样性与海拔、气候因子(年均温和年降水)、土壤养分(全氮、碳氮比、有机质含量)之间存在极显著或显著的相关关系.Mantel检验结果显示,光皮桦种群间遗传距离与海拔差距、土壤养分因子的分异相关显著.以上结果表明不同海拔区域的生态因子、低基因流等对光皮桦种群间的遗传分化影响较大. 相似文献
5.
《中南林业科技大学学报(自然科学版)》2016,(5)
采用ISSR分子标记技术,对我国濒危植物福建柏的7个种群进行遗传多样性分析。结果显示:17个引物共扩增出202个位点,多态性位点167个,占总位点的82.67%;引物UBC849可以将24份福建柏样本完全鉴别出来;7个福建柏种群的多态位点百分率在17.82%~54.95%之间;群体总观测等位基因数Na为1.821 8,有效等位基因数Ne为1.431 3,Nei指数为0.258 2,Shannon指数为0.394 0;种群内平均Na指数为1.372 0,平均Ne指数为1.289 2,平均Nei指数为0.160 0,平均Shannon指数为0.203 5;基因分化系数Gst为32.41%,种群间基因流Nm为0.878 0;7个种群遗传相似度在0.668 3~0.806 9之间,遗传距离在0.214 5~0.404 3之间;利用UPGMA法进行聚类,将泉州市、福州市和龙岩市种群分为第一类,将南平市、三明市和漳州市种群分为第二类,将宁德市种群分为第三类。 相似文献
6.
以中国蒙古栎全分布区的8个天然群体和辽东栎1个天然群体为研究对象,进行了水平淀粉凝胶电泳技术的同工酶分析,共分析了13种酶系统产生22个位点。结果表明：(1)蒙古栎在种和群体水平的遗传变异水平较低,多态位点百分率P分别为52．38％、28．976％,期望杂合度He分别为0．099、0．085,观测杂合度H0分别为0．092、0．088;(2)蒙古栎群体间遗传分化程度较高,分化度Gst为0．107,遗传多样性中的遗传变异量89．27％存在于群体内;蒙古栎群体水平的基因流Nm比值为2．080。(3)蒙古栎群体间的平均遗传距离D较低,为0．0121,各群体之间的遗传一致度I为0．097-1．00;(4)东灵山辽东栎群体的遗传多样性较低,多态位点百分率P为36.36%,期望杂合度He为0．083,观测杂合度H0为0．070;(5)利用群体间遗传距离进行的UPGMA聚类结果表明,蒙古栎自然分布区的东北部的4个群体和西南部的2个群体分别聚为一亚类,这与其地理分布格局大致吻合,但群体间遗传距离与地理距离无明显的相关性。(6)长期的砍伐和破坏,造成有效群体较小,而且经受繁殖瓶颈效应,是蒙古栎遗传多样性下降的主要原因。 相似文献
7.
巨桉群体遗传结构分析 总被引：3，自引：0，他引：3
用20个l0bp随机引物对巨桉11个种源80个个体进行了群体遗传变异的比较分析。共检测到149个位点,其中89个为多态性标记位点,总的多态位点百分率为59．73％。其种源内多态位点百分率(P)、香农信息指数(SI)及遗传分化指数(DC)值均较高,巨桉各种源内遗传变异性丰富;种源间遗传分化指数百分比(PDC)显示,PDC值介于1．52％～10．42％之间,说明巨桉种源间遗传变异较小,即种源群体的变异主要存在于群体内部。8号、10号种源内具有较高的遗传变异,3号和6号种源内的变异水平较低。这些为巨桉种源的选择提供了有利的遗传基础。 相似文献
8.
利用简单重复序列间扩增(ISSR)分子标记对分布于我国浙江和山东的8个山茶种群共240个个体进行了遗传结构分析。结果表明:筛选出的20条引物扩增得到210条清晰条带,其中184条为多态性条带,多态位点百分率(PPB)为87.62%。经POPGENE1.32软件分析,山茶种群平均多态位点百分率(PPB)为68.99%,Nei’s基因多样性指数(HE)为0.256 9,Shannon信息指数(H)为0.377 9,种群遗传多样性较高。基因分化系数Gst=0.182 9,表明遗传变异主要存在于种群内个体间。地理距离与遗传距离具有显著相关性(r=0.856 7,P<0.05),岛屿地理隔离对山茶种群的遗传分化具有重要影响。UPGMA聚类表明:浙江5个山茶种群间的遗传相似度较高,山东青岛的植物园种群和五四广场种群可能移植自长门岩岛。我国野生山茶资源受人为破坏严重,建议在加强现有岛屿自然种群就地保护力度的同时,建立山茶种质资源库,促进基因交流。 相似文献
9.
利用RAPD分子标记技术对采自滇川两省的12个地涌金莲野生和栽培种群进行遗传多样性分析.选择10条随机引物在12个种群中共扩增出88条带,其中多态性带85条,整个种的多态性位点百分比PPB为96.59%,遗传多样性指数H为0.289 0以及Shannon信息指数I为0.441 6.种群间的遗传分化系数Gst为0.568 2,即43.18%的遗传变异来自于种群内,56.82%的遗传变异来自于种群间,种群间的遗传分化水平略高于种群内.种群间遗传一致度变化范围为在0.66～0.95之间.聚类结果显示:野生种群之间遗传距离较近,与地理分布基本相一致;栽培种群遗传距离较远,与地理分布不一致. 相似文献
10.
ISSR是一种特异性较强、稳定性较高的分子标记方法。本研究采用ISSR-PCR技术,检测了红松(PinuskoraiensisSieb.etZucc)在伊春市汤旺河高峰林场、长白山二道白河、黑河胜山林场和俄罗斯海参崴市郊的四个种群的遗传多样性和遗传分化。15个引物的扩增结果表明:红松群体的多态位点比率是60.70%,平均每个引物3.6个多态位点,多样性水平在松科植物中是较高的;红松分布中心区的遗传多样性要高于边界区;和大多数木本植物一致,红松群体的基因多样性主要来自种群内部,占总基因多样性的73%;红松四个种群的遗传距离和地理距离之间无正相关性。根据研究结果推测,天然红松分布区逐渐缩小的原因不是由于遗传多样性水平过低引起的,而是由于人类的破坏作用,再加上火灾和风倒等因素造成的。 相似文献
11.
运用随机扩增多态DNA（RAPD）技术,对黄心夜合[Michelia martinii（Levl.）Levl.]自然分布区的6个自然种群遗传多样性进行了研究。从100个随机引物中筛选出能产生清晰、稳定的多态性标记引物18个,共检测出110个位点,其中多态性位点为96个,占87.27%;在物种水平上,有效等位基因数目（Ne）,Nei’s基因多样性系数（He）和Shannon表型多样性指数（I）分别为1.735 2,0.416 3和0.597 1;总的遗传变异量（Ht）为0.339 8,其中居群内遗传变异量（Hs）为0.258 7,各居群间的遗传分化系数（Gst）达到0.323 1.应用UPGMA法对遗传距离进行聚类分析并构建树系图,结果表明：黄心夜合自然种群具有较高的遗传多样性,其种群间的遗传差异与其地理分布有关。 相似文献
12.
湘鄂西地区珙桐天然群体遗传结构的研究 总被引：3，自引：0，他引：3
以珙桐叶为材料,对湘西和鄂西两天然珙桐群体的60个样品进行RAPD分析.结果表明,9个随机多态引物,获得24个多态标记位点,平均每个引物产生2.67个多态位点;湘西和鄂西两群体之间的遗传多样性差异不明显,Shannon指数分别为0.427 4和0.448 1;种内平均遗传多样性为0.326 9,群体内平均遗传多样性为0.297 6,群体间的遗传多样性为0.029 3,基因分化系数为0.089 6,基因流为5.079 2.两个天然珙桐群体的遗传相似性非常高,达到0.923 3,遗传距离为0.079 8;湘西群体的多态百分位率略高于鄂西.这表明,湘西和鄂西两群体间存在着非常频繁的基因流. 相似文献
13.
木兰科6个树种抗旱性及其抗氧化指标的测定 总被引：1，自引：0，他引：1
将木兰科6个树种进行28 d春旱处理,以观察田间生长状况,并测定土壤含水量及树种凋萎系数;干旱处理21 d时,测定植株叶片的抗氧化指标。结果表明:阔瓣含笑、乐昌含笑暂时凋萎系数均为7.6%,永久凋萎系数均为3.78%;金叶含笑、观光木、红花木莲、桂南木莲暂时凋萎系数均为14.2%,永久凋萎系数均为7.6%。根据以上结果及田间观察,6个供试树种抗旱能力由大到小排序为:阔瓣含笑、乐昌含笑、金叶含笑、观光木、桂南木莲、红花木莲。抗氧化指标测定结果显示:水分胁迫21d时,观光木和红花木莲总抗氧化能力有所降低,其余4个树种均升高;而抗坏血酸(Vc)和还原型谷胱甘肽(GSH)含量在6个树种中均升高。其中,阔瓣含笑和乐昌含笑升高幅度最大。 相似文献
14.
濒危小灌木长叶红砂种群的遗传多样性 总被引：3，自引：0，他引：3
采用RAPD和ISSR2种分子标记对濒危小灌木长叶红砂5个种群的遗传多样性进行检测。18个RAPD引物和14个ISSR引物分别扩增出118和114个位点,多态位点比率(P)分别为88.98%和89.47%。在物种水平上,RAPD标记的结果为:Shannon’s信息多样性指数(I)为0.4656,Nei’s指数(H)为0.3303;ISSR检测的结果:I=0.4688,H=0.3083。2种分子标记均表明濒危小灌木长叶红砂具有较高的遗传多样性水平。Nei基因多样性指数表明,大部分遗传变异存在于种群内。RAPD分析发现86.22%的遗传变异发生在种群内;ISSR分析发现89.29%的遗传变异发生在种群内。种群间遗传变异低的主要原因是种群间存在较强的基因流(Nm)分别为3.0097和4.1787)。长叶红砂较高的遗传多样性水平与物种特性和对高胁迫环境的长期适应有关,濒危植物并不一定表现为遗传变异水平的降低。 相似文献
15.
《Journal of Sustainable Forestry》2013,32(3):75-90
Abstract The Japanese cedar, Cryptomeria japonica D. Don., is one of the most important endemic species in Japan. A long history of heavy logging has resulted in natural populations being discontinuously distributed and scattered among small, restricted areas. An understanding of the patterns of genetic variability among and within populations of C. japonica is important for conserving the genetic resources of this economically important species. We studied genetic variation by random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers in C. japonica of Kyoto prefecture, western Japan. A total of 398 plants sampled from six natural populations were analyzed by ten arbitrarily chosen decamer primers, resulting in 50 highly reproducible RAPD bands. Analysis of molecular variance partitionated the RAPD variation into the among- and within population components. The within-population component accounted for 93.75% of the variation. The among-population component accounted for only 6.25%. Indirect estimates of gene flow indicated that the average number of migrants exchanged among six populations per generation was 3.72. A Mantel test for each population did not yield significant correlations between geographic and genetic distances. The extent and distribution of C. japonica diversity in the Kyoto prefecture is in agreement with the conclusion that long-lived, wind-pollinated, out-crossing species with wide ranges retain a considerable amount of genetic diversity within populations and exhibit little genetic differentiation among populations. 相似文献
16.
RAPD标记研究马褂木地理种群的遗传分化 总被引：18，自引：5，他引：18
利用RAPD标记对马褂木全分布区 15个种群的遗传多样性进行了分析。研究发现 ,马褂木具有丰富的遗传多样性 ,但东部种群因现有种群小 ,其遗传多样性明显地低于西部种群。种群遗传学研究揭示 ,由于小种群效应 ,以及缺乏有效的基因流和特有的致濒机制 ,马褂木种群间的遗传分化巨大 ,30 %以上的遗传变异存在于种群间。但在不同的地理区域 ,种群间的遗传分化程度不同。在西部分布区 ,地域上相距不远的种群其遗传距离较小 ,而在东部即使两个相邻的种群 ,其遗传距离也非常大。使用Nei’s遗传距离进行算术平均数的非加权成组配对法分析 (UPGMA) ,其聚类结果可以很好地将马褂木划分为西部和东部两个种源区 ,而西部种源又可再划分为西南亚区和华中亚区 相似文献
17.
Cyclobalanopsis glauca is a dominant species of evergreen broad-leaved forests in mainland China. This study compares the genetic variation of an artificially regenerated population with its donor population and two other wild populations, by using RAPD markers. A total of 74 clear, reproducible bands were scored for 12 RAPD primers; 72 were polymorphic (P = 97.3%). AMOVA revealed that most genetic variation was within populations and only 10.35% was among populations. Various measures indicated that there is no difference in genetic diversity between the planted and the original populations. ΦST between the planted offspring population and the donor population was larger than those between the planted and other two natural populations, indicating that artificial regeneration might lead to biased genetic composition, given that temporal differentiation is usually lower than spatial differentiation. This divergence may be due to unequal seed production among the maternal individuals and viability differences among seeds. 相似文献
18.
为研究云南特有濒危植物馨香木兰的遗传多样性水平,采用随机扩增多态DNA技术（ RAPD）,对云南省馨香木兰4个居群,即文山州广南县、西畴县新街、西畴县亚坪等3个天然居群及昆明树木园1个人工居群,进行遗传多样性分析。随机筛选出重复性好的8条随机引物,对70个样品的基因组DNA进行扩增,建立RAPD分析图谱。扩增结果为,共检测出84个多态位点。遗传多态位点百分率为61.90％（文山广南）、76.19％（西畴新街）、71.43％（昆明树木园）和66.67％（西畴亚坪）。遗传多样性Shannon指数为0.5686,其中30.55％来自种群间,69.45％来自种群内; Nei’s指数为0.3903,种群间的遗传分化系数（GST）为0.2216。文山广南和西畴亚坪之间的遗传距离最大,昆明树木园与西畴亚坪之间的遗传距离最小。结果显示,与木兰科等其他濒危植物相比较,馨香木兰遗传多样性相对较高。根据各种群遗传背景研究结果,提出了该物种迁地保护种群遗传资源管理建议。 相似文献
19.
利用RAPD标记从DNA水平对收集的4个天然黄藤种群进行遗传多样性分析。15条引物扩增得到154条片段,整个种的多态性位点比率为75.97%,Ne i’s指数为0.258 4,Shannon信息指数为0.388 8。黄藤种的遗传多样性为0.257 8,种群间的Ne i遗传分化系数为0.141 2,各种群间的遗传变异非常小。4个种群间的遗传相似性分析结果显示:毛感乡和尖峰岭种群间的遗传相似度最高,吊罗山和坝王岭种群间的遗传相似度最低。AMOVA分析结果表明:种群间基因分化系数为0.026 2,大部分遗传变异(97.38%)来源于群体内。研究结果揭示:收集的天然黄藤种群具有较高的遗传多样性,有良好的保存和利用价值,尖峰岭种群可以作为重点保护。 相似文献
20.
《Southern Forests》2013,75(2):73-80
The genetic diversity among 17 populations (including 10 newly discovered) of Talbotiella gentii (Fabaceae, Caesalpinioideae), a rare tree species endemic to Ghana, was assessed using random amplified polymorphic DNA (RAPD). A total of 80 polymorphic bands were generated from eight primers and analysed by cluster and correspondence analysis. This showed a clear distinction between populations, with two major groups associated with geographical origin. AMOVA analysis showed that 94.05% of the genetic variation was partitioned among populations, while only 5.95% was found within populations suggesting little gene flow between populations. Possible reasons for the high population genetic differentiation and the low levels of genetic variation within populations are inbreeding and genetic drift. Of a total of 26 known populations, 14 are now extinct, five during the course of this study. Action to prevent complete extinction of the species is therefore urgent. 相似文献