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为了探明山东古银杏种质及其群体的亲缘关系和遗传多样性水平,从20对ISSR中筛选出7对扩增产物重复性好、谱带清晰的引物,对29个山东古银杏种质的亲缘关系及遗传多样性进行了研究。结果表明:7对引物共产生34条谱带,其中多态带28条,多态带的比例为82.4%;29个古银杏种质之间的相似系数为0.53～0.95;当相似系数为0.78时,供试种质可分为5类,种质的聚类与种质是否在同一地理区域并非完全相关;泰安与临沂群体之间的遗传一致度比较高,非半岛地区古银杏种质的遗传多样性高于半岛地区的。 相似文献
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柳树种质资源遗传多样性和亲缘关系的CE-AFLP分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用毛细管电泳-AFLP技术,采用EcoR Ⅰ+3/Mse Ⅰ+3和Pst Ⅰ+2/Mse Ⅰ+3引物组合,对从国内外搜集的37份柳树种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析.11对引物共扩增出1 580条条带,多态性条带数为1 399条,多态率在80.65％ ～ 94.67％之间,表明柳树种质间的遗传多样性较高.采用NTSYS-pc 2.10e软件对37份种质进行聚类分析和主成分分析,在相似系数0.63时,37份种质分为2大类,一类是乔木柳,一类除小乔木康定柳外,其余都为灌木柳.聚类分析和主成分分析结果与传统形态分类基本一致,但筐柳组中簸箕柳P295和沙柳基因组水平上差异较大,P295与银芽柳亲缘关系较近.研究结果为柳树分子生物学分类、种质资源保存与利用及品种改良等研究提供理论依据. 相似文献
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为探究黑松家系的遗传多样性,采用限制性片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism)分子标记技术对51份黑松家系进行遗传多样性的分析。9对引物共检测出1 125条谱带,其中有1 122条多态带,平均多态带比例为99.73%,表明所试黑松材料具有较高的遗传多样性。分析统计黑松家系的特异性条带有220条,包括一条缺失带,通过特异性条带可将90%的黑松家系鉴别出来。聚类分析将黑松种质分成5组,来源相同的家系并未严格聚在一起,表明黑松家系的变异与地理来源没有严格的相关性。 相似文献
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银杏雌株种质遗传关系的AFLP分析 总被引：8，自引：2，他引：6
从64对Eco RI/MseI引物(其中MseI引物为荧光标记物)中筛选出7对扩增产物多态性高、谱带清晰的引物.对来自日本、法国和中国的49个银杏雌株种质的遗传关系进行研究.结果表明:7对引物共产生1 219条谱带,132个特异位点(其中缺失带11条、单态带121条),多态带1 200条,多态带的比例为98.44%;每对引物鉴别效率为100%.49个雌株种质之间相似系数为0.39～0.83,来自不同国家的雌株遗传变异程度不同.当相似系数为0.51时,供试种质可分为2类,来源地相同的种质并不单独聚成一类,山东大部分雌株种质聚为一类,它们与其他的雌株种质有显著的遗传差异,亲缘关系较远.叶籽银杏不是很原始的种质,而'海阳'则比较原始.对雌株种质的特异位点、相似系数、聚类结果等的综合分析表明,法国的'垂枝银杏'、日本的'黄金丸'、中国的'盘县1'、'灵川'、'安陆'、'东安1'、'西山大佛手'、'荣城'、'煜?、'郯城2'、'泰安1'、'泰安2'、'泰安3'、'崂山'、'海阳'、'灵岩'16个种质是银杏雌株中的重要特异种质. 相似文献
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为研究44份楸树种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用AFLP分子标记技术,对采自鲁豫地区的44份楸树优良种质进行了分析。结果表明:筛选出的8对PstI/MseI引物组合从44份楸树种质中共扩增出1087条清晰条带,其中多态性条带(NPB)1043条,多态性比率(PPB)达到95.60%。平均每对引物可扩增出135.88条带和130.38条多态性带。每个位点的平均有效等位基因数(Ne)、Nei’s平均基因多样性(H)、Shannon平均信息指数(Ⅰ)分别为1.3210、0.2003和0.3204,且8对引物组合共产生261条特异性条带,表明楸树资源间具有丰富的遗传多样性。通过计算种质间遗传相似系数和进行UPGMA聚类分析得出,各种质材料间的遗传相似性系数在0.5022~0.7919间,平均为0.6527。以遗传相似性系数0.65为界44份楸树种质可划分为5组,其中第1组包括15个山东种质和2个河南种质;第2组包括18个山东种质和3个河南种质;第3组包括3河南种质;第4组包括1个河南种质;第5组包括2个河南种质。这表明不同地理生态条件造就了各种质材料间丰富的遗传多样性,其遗传多样性以及亲缘关系与其地理分布并不完全一致。综上,AFLP标记技术能较好的揭示楸树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,可为楸树优良种质资源的收集、鉴别及利用提供参考依据。 相似文献
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《山东林业科技》2021,(4)
为研究木槿种质资源的遗传多样性及遗传关系,采用AFLP分子标记技术,对41份木槿种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:9对AFLP引物对41份供试种质进行选择性扩增后,共产生谱带733条,其中多态性条带699条,多态性位比率平均为95%;Nei基因多样性指数为1.1801～1.2515,平均值1.2076;Shannon信息指数为0.1863～0.2445,平均值0.2035。通过聚类分析,41份木槿种质的Dice相似性系数为0.702～0.932,并在0.87处将供试材料分为5大类。研究认为,来源相同的木槿种质并未严格聚在一起,表明供试木槿种质表现出较大的遗传差异和丰富的遗传多样性,亲缘关系与材料来源没有绝对的相关性。 相似文献
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以云南省境内金沙江、元江、红河和怒江流域自然分布的构树为试材,采用AFLP分子标记技术对90份构树种质资源进行了遗传多样性分析研究.结果表明:筛选出的7对引物组合共扩增获得786条清晰可辩的条带,其中,多态性带632条,多态性条带百分率达80.4％,平均每对引物组合检测出90.3个多态位点.分布于4条水系流域的构树居群间,金沙江流域构树居群的遗传多样性水平最高,Nei's基因多样性指数为0.145 5,而元江流域构树居群的遗传多样性水平最低,Nei's基因多样性指数为0.1129.4个构树居群间的遗传分化系数为0.038 6,表明构树的遗传变异主要存在于居群内不同个体之间.在遗传距离为0.003时,4个构树居群可分为2组,第1组由金沙江流域的构树居群构成,第2组包含分布于红河、怒江和元江流域的3个构树居群. 相似文献
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木瓜属优良品种亲缘关系的AFLP分析 总被引：3，自引：1，他引：2
用AFLP技术对29个木瓜属品种的亲缘关系进行分析.用8对引物(EcoRⅠ+3/Mse Ⅰ+3)对基因组DNA进行选择性扩增,共获得1095条扩增带,其中1035条具有多态性,多态带百分率达94.52%,揭示木瓜品种具有丰富的遗传多样性.采用NTSYS-PC软件的DICE法计算样本间的相似系数,UPGMA法进行聚类分析.结果表明:品种间的相似系数在0.4650～0.8339之间,具有相似形态特征的品种优先相聚,29个品种可以划分为4类,且基本对应着贴梗海棠、日本木瓜、木瓜海棠和傲大贴梗海棠,但品种'猩红与金黄'宜归人贴梗海棠内,而'碧雪'的分类地位值得进一步探讨.说明AFLP标记技术能较好地揭示木瓜属种质资源的亲缘关系及演化规律. 相似文献
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[目的]探究山东省野生豆梨种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其种质资源收集、保存以及育种材料的选择提供理论依据.[方法]采用AFLP分子标记技术对山东省分布的6个群体61个野生豆梨单株的遗传多样性进行了分析.[结果]8对引物组合共扩增出清晰条带1344条,平均每对引物组合扩增出168条带,其中多态性条带有1340条,多... 相似文献
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为了探讨银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代间的遗传多样性参数及个体聚类关系,利用8对引物对银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代4个样本进行了AFLP分析。结果表明,8对引物共扩增出780条扩增谱带,其中多态性条带数为715条,多态性比例为91.65%,平均有效等位基因数为1.5017,Nei’s平均遗传多样性指数为0.3065,Shannon平均信息指数为0.4679。不同杂交子代在E-AAC/M-CAG引物对上均有特异性位点,这些特异位点可用于品种鉴定。聚类研究发现,在相似系数为0.76时,试验样品分成2个AFLP群,其中马氏杨为1个AFLP群,银白杨及2个杂交子代为1个AFLP群;当相似系数为0.78时,银白杨和2个杂交子代的AFLP群又划分为2个亚群,其中杂交子代1和杂交子代2聚合为亚群1,银白杨为亚群2。本研究的结果多态性比例很高,对样品的区分率达到100%,为杨树AFLP分析检测提供了指导借鉴价值。 相似文献
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本研究在对选择性扩增引物进行筛选的基础上,对银白杨、N001杨及银白杨×N001杨杂交子代共10个样本进行了AFLP试验,并利用Popgene和NTsys软件分别对遗传多样性参数及个体聚类进行分析。结果表明:筛选出的8对选择性扩增引物,共扩增出969条谱带,多态性条带数929条,多态性比例为95.76%,平均有效等位基因数为1.4329,Nei's平均遗传多样性指数为0.2662,Shannon平均信息指数为0.4161。不同杂交子代在E-ACC/M-CAC引物对上均有特异位点,这些特异位点用于申报优良品种保护。在通过NTsys软件聚类后,在遗传相似系数为0.76时,将10个试样分为2个大支,其中N001杨为1个AFLP群,银白杨及8个杂交子代为1个AFLP群;当遗传相似系数为0.79时,银白杨与8个杂交子代的AFLP群又细化为2个亚群,其中杂交子代2和杂交子代6聚合为亚群1,银白杨和其余6个杂交子代为亚群2。本研究的结果多态性比例很高,对样品的区分率达到100%,为杨树AFLP分析检测提供了较好的应用和指导借鉴价值。 相似文献
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采用AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)技术对小菊花色芽变品种与原始品种的DNA进行差异性分析,旨在建立芽变品系形态学以外的分子水平鉴定技术。在引用13对引物中,每对引物平均扩增出13.5条多态性带,分子量在110～800bp之间。3对引物组合(第8对E-ACG/M-CAT、第10对E-AGG/M-CTC、第11对E-AGG/M-CTG)产生5条清晰特异性条带可以将二者区分,这些特异性片段可能包含引起花色芽变的基因序列,经计算,二者遗传相似系数为0.986,遗传物质多态性为2.81%。 相似文献
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Lin J Gunter LE Harding SA Kopp RF McCord RP Tsai CJ Tuskan GA Smart LB 《Tree physiology》2007,27(11):1575-1583
Salix matsudana Koidz. cultivar 'Tortuosa' (corkscrew willow) is characterized by extensive stem bending and curling of leaves. To investigate the genetic basis of this trait, controlled crosses were made between a corkscrew female (S. matsudana 'Tortuosa') and a straight-stemmed, wild-type male (Salix alba L. Clone 99010). Seventy-seven seedlings from this family (ID 99270) were grown in the field for phenotypic observation. Among the progeny, 39 had straight stems and leaves and 38 had bent stems and curled leaves, suggesting that a dominant allele at a single locus controls this phenotype. As a first step in characterizing the locus, we searched for amplified fragment length polymorphism (AFLP) and randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers linked to the tortuosa allele using bulked segregant analysis. Samples of DNA from 10 corkscrew individuals were combined to produce a corkscrew pool, and DNA from 10 straight progeny was combined to make a wild-type pool. Sixty-four AFLP primer combinations and 640 RAPD primers were screened to identify marker bands amplified from the corkscrew parent and progeny pool, but not from the wild-type parent or progeny pool. An AFLP marker and a RAPD marker linked to and flanking the tortuosa locus were placed on a preliminary linkage map constructed based on segregation among the 77 progeny. Sectioning and analysis of shoot tips revealed that the corkscrew phenotype is associated with vascular cell collapse, smaller cell size in regions near the cambium and less developed phloem fibers than in wild-type progeny. Identification of a gene associated with this trait could lead to greater understanding of the control of normal stem development in woody plants. 相似文献
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AFLP fingerprinting analysis of Fusarium circinatum, Nirenberg and O’Donnell and relative species was carried out. Ten primer-pairs that could generate abundant polymorphism fragments were screened. A total of 298 nucleotide acid fragments were amplified with the primers from the template of the 17 strains of Fusarium spp., among which 283 fragments were polymorphic. Percentage of polymorphic loci produced by each pair of AFLP primer-pair was 94.97% in average and varied from 89.29% to 100%. All these data indicated that considerable genetic variation existed among F. circinatum and relative species at DNA level. Molecular genetic distances among Fusarium spp. were calculated, and the relationship among them was described quantitatively. Compared with biological species, the result of cluster analysis was basically similar to the phenotypic classification of species. Genetic diversity of E-AT/M-CAA AFLP fingerprinting of Fusarium spp. was analyzed, and specific and difference bands for each species and all Fusarium section Liseola tested were identified based on the E-AT/M-CAA AFLP fingerprinting. 相似文献
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十一种槭属植物遗传多样性AFLP分析 总被引：4，自引：0，他引：4
采用了AFLP技术分析了槭属十一种植物的遗传多样性,从12对AFLP引物中筛选出5对多态性高、分辨率清晰的引物,其中选择最优的3个引物组合分别扩增出101、163、178条多态性带。三对引物(E ACG/M CAG、E ACA/M CAT、E AAC/M CAC)共扩增出484条带。分析结果按UPGMA类平均法进行聚类,聚类结果显示将11种械属植物聚为I、Ⅱ、Ⅲ三大类,其中羊角槭和栓皮槭,长尾秀丽槭和毛脉槭,复叶槭与剑叶槭之间的亲缘关系最近。 相似文献
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We studied the genetic polymorphism among 29 clones of shisham (Dalbergia sissoo Roxb) belonging to different geographic regions using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Out of 30 primers used, only 20 primers generated polymorphism in amplified product. In total 232 bands were amplified with 20 primers, of which 192 (82%) were polymorphic with an average of 9.6 bands/primer. The resolving power (Rp) ranged from 2.14 (Primer 5) to 11.93 (Primer 4). Primer 4 and Primer 3 possessed high Rp value. Polymorphism information content (PIC) ranged from 0.15 (Primer 5) to 0.37 (Primer 4). Primer 4 amplified total 18 bands in 29 genotypes with PIC value of 0.37 hence; this set of primer was most informative. The similarity coefficient analysis revealed two clusters. The first cluster comprised of only 10 clones and the second major cluster comprised of 19 clones. The genetic similarity among 29 clones ranged from 25.86% (clone 10 and 235) to 100% (clone 19 and 59), suggesting a wide genetic base in shisham clones. 相似文献
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【目的】构建林木种质资源指纹数据库是林木种质材料遗传鉴定的前提,也可为林木杂交育种提供清晰的遗传学背景。【方法】选取亲缘关系较远的8份杨树无性系材料筛选SSR引物,基于TP-M13-SSR技术进行SSR-PCR扩增,采用ABI3730XL毛细管电泳系统检测PCR扩增产物,利用GeneMarkerV1.91进行基因分型,Cervus3.0.7估算多态信息含量(PIC)和各位SSR位点无效等位基因频率(pN),POPGENE3.2估算各SSR位点上的等位基因数目(Na)、Shannon信息指数(I)和观测杂合度(HO),NTSYS-pc2.1进行遗传聚类分析。【结果】共筛选出13对条带清晰、重复性好的SSR引物,共扩增出89条多态性条带,单个位点上的等位基因数目为2~12个,平均值为6.5个;Shannon’s信息指数(I)为0.13~1.91,平均值为0.97;多态信息指数(PIC)为0.19~0.81,平均值为0.56;观测杂合度为0.06~0.76,平均值为0.40。聚类分析结果表明,参试的无性系种质材料分为3类,第一类为南林系列无性系;第二类为中林108杨、中潜1号、中潜3-2、中驻2号、中驻4号、中驻6号、中驻7号、中驻8号、浙7、中皖1号、中皖2号、丹红杨、A65/27、南抗4、南抗3;第三类为湘林系列无性系。【结论】TP-M13-SSR分子标记技术能有效地鉴别杨树无性系种质,明晰无性系间亲缘关系,遗传聚类的结果与其谱系关系基本一致。研究结果为杨树无性系种质鉴定及进一步开展杨树杂交育种奠定了基础。 相似文献