陕西马铃薯卷叶病病原的分子生物学鉴定   总被引：1，自引：0，他引：1  

颜永杰  吴宽  谢海峰 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》2010,38(5):87-92

【目的】对陕西榆林疑似感染马铃薯卷叶病毒(Potato leafroll virus,PLRV)的病株毒源进行分子生物学鉴定,为陕西省马铃薯卷叶病的防治提供参考。【方法】根据GenBank数据库已报道的马铃薯卷叶病毒外壳蛋白(Coat protein,CP)基因序列设计了1对引物,利用RT-PCR技术成功扩增了陕西PLRV.CP基因,然后进行克隆、测序,并与GenBank中已报道的27个PLRV分离物的CP基因进行同源性分析。【结果】获得的陕西PLRV.CP基因大小为627 bp,含有1个ORF,编码208个氨基酸的多肽,其与已报道的27个国内外PLRV.CP高度同源。【结论】陕西榆林的疑似病株确定为感染PLRV的马铃薯病株。  相似文献   

马铃薯卷叶病毒福建分离物的基因克隆与序列分析     

吴兴泉  谭晓荣  陈士华  谢联辉 《河南农业大学学报》2006,40(4):391-393

依据马铃薯卷叶病毒外壳蛋白基因序列,设计合成了一对特异性引物,采用反转录-聚合酶链式反应扩增得到了PLRV福建分离物外壳蛋白基因,克隆并测定了其核苷酸序列,进行了同源性分析.依据PLRV外壳蛋白氨基酸序列建立了PLRV不同分离物的系统进化树.  相似文献   

辣椒CMV广州分离物的CP基因序列分析及亚组鉴定   总被引：1，自引：0，他引：1  

孙秀东  周淑梅  雷建军  曹必好  陈国菊 《山东农业科学》2008,(9)

从广州市呈现花叶病症的辣椒上分离纯化得到1个黄瓜花叶病毒的分离物(CMV-GZ)。利用RT-PCR技术克隆了该病毒分离物的外壳蛋白(CP)基因,其序列长度为657 bp,编码218个氨基酸。对CP基因序列进行同源性比较分析,结果表明该病毒分离物的CP基因与CMV亚组Ⅰ5个株系的同源性均在90%以上,而与亚组Ⅱ4个株系的同源性均低于80%。据此将该分离物归属于CMV亚组Ⅰ。  相似文献   

鲁粤两省黄瓜花叶病毒辣椒分离物CP基因序列分析及亚组鉴定     

孙秀东  周淑梅  雷建军  曹必好  陈国菊 《华南农业大学学报》2009,30(1)

从广东和山东呈现花叶病症的辣椒上分离纯化得到2个黄瓜花叶病毒Cucumber mosaic virus(CMV)的分离物.利用RT-PCR技术克隆了病毒分离物的外壳蛋白(CP)基因.核苷酸序列测定表明,CMV-GDLJ和CMV-SDLJ 2个病毒分离物CP基因序列长度为657bp,编码218个氨基酸.2个病毒分离物的CP基因序列与CMV亚组Ⅰ的6个株系CP基因序列同源性均在90%以上,而与亚组Ⅱ的3个株系同源性均低于80%,据此将分离物CMV-GD和CMV-TA归属于CMV亚组Ⅰ.  相似文献   

贵州辣椒烟草花叶病毒的分子鉴定     

《贵州农业科学》2015,(10)

为有效控制贵州辣椒的病毒,采用生物学单斑分离法对酶联免疫吸附(ELISA)检测烟草花叶病毒为阳性的贵州辣椒病毒分离物(TMV-GZ)进行纯化。RT-PCR技术克隆其外壳蛋白(CP)基因并测序,使用DNAMAN7.0和MEGA5.0软件对TMV-GZ的CP基因进行序列同源性分析。结果表明:成功克隆该病毒分离物的CP基因,其序列长度为480bp,编码159个氨基酸残基;该分离物的CP基因与11种已报道的TMV各地分离物同源性均在98%以上,而与其他3种同属不同种的病毒同源性均低于65%。贵州辣椒感染的病毒为TMV。  相似文献   

芜菁花叶病毒山东分离物外壳蛋白基因的克隆及序列分析   总被引：5，自引：0，他引：5  

宋云枝  李玲玲  朱常香  温孚江  温孚凯 《中国农业科学》2005,38(3):504-510

 从山东省3地市感病的白菜和萝卜上分离到芜菁花叶病毒6个分离物，将其分别命名为TuMV-SD1、TuMV-SD2、TuMV-SD3 、TuMV-SD4、 TuMV-SD5和TuMV-SD6。利用RT-PCR克隆了这6个分离物的外壳蛋白基因，测定了它们的核苷酸序列，并进行了序列分析。结果表明，6个分离物的CP基因均为867个碱基，核苷酸序列同源性较高, 达97.0%～99.4%；它们与World-B组分离物的同源性最高，达91.8%～100%；与Brassica- Raphanus (BR) 致病型分离物的同源性次之，在89.1%～91.0%之间；与basal-B组分离物的同源性最低，仅86.0%～90.3%。基于TuMV的CP基因核苷酸序列的分子进化树显示，TuMV分离物可分为4组，本研究所分离到的6个TuMV山东分离物属于第四组，即world-B组。用分离到的6个TuMV分离物对已获得的转TuMV CP基因的抗病毒大白菜进行攻毒试验。结果表明，尽管作为转基因的CP基因与这6个分离物的CP基因只有88.2%～88.9%的同源性，但转基因大白菜对这6个分离物均具有明显抗性。  相似文献   

地黄病毒病的检测与初步鉴定   总被引：2，自引：0，他引：2  

高雅红  李明福  刘冬梅  李桂芬  王敏  王进忠  赵世恒  张志勇 《北京农学院学报》2009,24(2):31-34

利用DAS-ELISA和RT-PCR等检测方法,对感染地黄病毒病的地黄进行检测和初步鉴定,并结合该病毒地黄分离物CP基因的克隆及序列分析进行验证。结果表明,烟草花叶病毒（TMV）为侵染地黄的主要病毒;扩增产物序列测定结果表明：TMV地黄分离物CP基因的核苷酸序列与GenBank上已登录的TMV其他株系CP基因核苷酸序列的同源性在85％～98％之间,氨基酸序列同源性在84％～98％之间,同源性较高。根据不同株系CP基因氨基酸序列进化树分析,推测该分离物可能为TMV的已有株系。  相似文献   

北京、宁夏甜椒上分离的黄瓜花叶病毒CP基因序列分析及亚组鉴定   总被引：6，自引：0，他引：6  

李志勇  夏惠娟  李兴红  董金皋 《河北农业大学学报》2005,28(4):89-92

从宁夏和北京地区甜椒上分离到3个黄瓜花叶病毒分离物(宁夏分离物为CMV-NX1,NX2;北京分离物为CMV-BJ)并保存在普通烟上。从叶片中提取该病毒RNA,经RT-PCR扩增到780bp的全长CP基因的cDNA,PCR产物纯化并测序。2个宁夏分离物(NX1,NX2)核甘酸序列同源性为100%,它们为同一株系。与已报道的部分CMV株系的CP基因序列相比较,表明3个分离物与CMV亚组I同源关系比亚组II更密切,因而3个分离物都属于黄瓜花叶病毒亚组I,通过DAS-ELISA进一步验证它们都属于亚组I。  相似文献   

马铃薯X病毒贵州分离物的分子鉴定     

姚东校  洪鲲  杨立昌  乙引  万晴姣 《广东农业科学》2013,40(13):139-141

从贵州威宁县染病马铃薯植株中分离得到马铃薯X病毒贵州分离物(PVX-GZ),采用RT-PCR扩增并克隆了该分离物的外壳蛋白基因(CP).经测序,该CP基因长714 bp,编码237个氨基酸残基,分子量25.2 ku;与19种已报道的PVX各地分离物的同源性相比,其核苷酸和氨基酸序列分别在78.6％～97.5％和84.8％～99.6％之间,其中,与两种典型的PVX X3株系(荷兰分离物X3和英国分离物UK3)的基因序列同源性达97.1％以上.结合寄主鉴别结果,判断该分离物属PVX的X3株系.  相似文献   

马铃薯卷叶病毒衣壳蛋白原核表达及多克隆抗体的制备     

王韬远  张春雨  王忠伟  李闯  张胜利  李建平  李小宇  王永志 《吉林农业科学》2021,46(4):20-23

本研究克隆马铃薯卷叶病毒(Potato leafroll virus,PLRV)衣壳蛋白(Coat Protein,CP)基因,改造其密码子,使其偏好原核表达,构建pCzn1-PLRV CP重组表达载体,通过大肠杆菌表达纯化,经Western Blot方法鉴定为PLRV CP蛋白,纯化后的蛋白免疫日本大耳兔,成功制备PLRV CP蛋白多克隆抗体,识别重组蛋白效价为128000倍,识别PLRV叶片的效价为32000倍,经Western Blot方法分析,其特异性良好.本研究为PLRV检测方法的建立及脱毒种薯的检测提供了必需的生物材料.  相似文献