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采用AFLP分子标记技术对山东省30个枣栽培品种进行了遗传多样性分析。从64对引物组合中,筛选出重复性好、多态性高的引物组合8对,共扩增出1178条条带,其中多态性条带1148条,多态性比率97.45%,表明供试枣品种间具有丰富的遗传多样性。应用NTSYS软件计算样本间的遗传距离,NJ法进行聚类分析结果表明,不同品种间的遗传距离在0.2935～0.7794,平均为0.5663;鉴定了近年来选育的傲雪、乐金4号、沾冬2号与原有品种不同,是枣新品种;并将枣早熟品种、晚熟品种和抗裂果品种分别进行了聚类。AFLP研究较好地揭示了枣种质资源间亲缘关系,为枣品种鉴定、进一步开展枣早熟、晚熟和抗裂果基因研究奠定了基础。 相似文献
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利用SRAP分子标记研究了6个切花菊品种及其2×4不完全双列杂交(NCⅡ)的38个F1代单株的遗传关系。结果表明,17对SRAP引物组合共获得229条带,其中多态性条带127条,平均每个引物获得7.5个多态性条带,多态性比率为56.0%,说明切花菊亲本品种及其杂交后代的分子多样性适中。6个亲本品种之间的Nei’s遗传距离介于0.11~0.25之间,平均为0.19,说明亲本品种之间的亲缘关系较近。亲本和杂交后代的遗传相似系数分别介于0.42~0.72和0.40~0.85之间,杂交后代遗传相似系数的中位数(0.61)高于亲本品种(0.55),说明杂交产生了一些变异株系,但是总的遗传基础有变窄或同质化趋势。基于遗传相似系数,UPGMA聚类将亲本和杂交后代划分为两大类,聚类结果与母本和杂交组合类型相符,说明SRAP分子标记可有效用于鉴定菊花不同杂交组合后代。 相似文献
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利用ISSR标记对32份安徽省地方枣种质资源及山东、河南等邻近省份的42份枣资源进行了遗传多样性分析。26条引物在74份种质中共扩增出241个位点,其中多态性位点214个,多态性比率为88.8%。利用NTSYS软件计算得到DICE相似系数为0.5936 ~ 0.9353;32份安徽地方种质共扩增出219条电泳谱带,其中186条为多态性条带,多态性比率为84.93%,32份样品遗传相似系数在0.6267 ~ 0.9353之间,表明安徽地方枣种质资源遗传多样性较为丰富。采用UPGMA法对74份种质的ISSR数据进行聚类分析,分析结果显示可分为8个类群,种质间亲缘关系与地理来源关系较为密切,来自安徽的地方种质基本上都独立聚成不同的类群,表明安徽地方枣种质与周边其它省份枣种质资源亲缘关系较远;研究结果表明体细胞突变可能是推动安徽地方枣种质进化的重要因素。 相似文献
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15份葡萄种质亲缘关系的ISSR分析 总被引：10，自引：2，他引：10
利用ISSR标记对15份葡萄材料进行了基因组多态性分析,从60条引物中筛选出15条用于葡萄的ISSR扩增。共扩增出105条带,其中多态性条带91条,多态性百分率为86.7%。根据ISSR扩增结果,利用NTSYSpc2.10e软件进行Jaccard相似性系数分析,15份葡萄材料的遗传相似系数为0.27～0.75,平均遗传相似系数为0.471。通过UPGMA进行聚类分析,探索亲缘关系。在遗传相似系数0.39处,15份葡萄材料可分为2大类群。第1类包含7份山葡萄资源、2个山欧杂交品种,第2类包含3个欧亚种品种、2个欧美杂种品种和1个美洲杂种品种。由此可见,山葡萄与欧亚种、美洲杂种葡萄的亲缘关系较远,欧亚种与美洲杂种之间亲缘关系较近。 相似文献
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苹果属部分观赏品种与中国野生种的亲缘关系 总被引：3，自引：1，他引：3
采用AFLP分子标记技术对47种苹果属植物进行遗传多样性和亲缘关系分析，其中24个为国外引进的观赏海棠品种。结果表明，筛选出的10对分辨率强的引物共扩增出589条带，其中多态性带534条，多态位点百分率达90.66%。观赏海棠品种在DNA分子水平上表现出极为丰富的遗传多样性。基于Jaccard系数对AFLP扩增结果进行UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean)聚类，以相似系数0.60为标准，将供试材料分为8组，以相似系数0.59为标准，将观赏海棠品种分为4组。分析认为，供试的24个观赏海棠品种中有22个品种与我国原产的苹果属植物亲缘关系较近。 相似文献
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陈徵尼仲玲玲邹天福戚建莉 《中国果树》2015,(1):18-21
利用ISSR分子标记技术对甘肃省42份枣种质资源的遗传多样性进行分析。结果表明:筛选出8条引物共扩增出76条DNA谱带,其中多态性谱带70条,多态性位点比率92.0%;按照42份枣种质间的遗传距离构建UPGMA聚类图,42份枣种质被划分为4个大类、10个亚类,遗传多样性处于较高水平;从聚类结果看,原产自甘肃省的枣品种遗传背景相似,主要根据原产地进行聚类,目的性品种交换现象较少。另外,对6个未知身份的枣品种进行了初步鉴定。 相似文献
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RAPD技术在石榴品种分类上的应用 总被引：5，自引：1，他引：5
以55个石榴栽培品种为试验材料,利用15条多态性好的随机引物进行RAPD分析,共扩增出125条带,其中多态性条带92条,多态性百分率73.6%,说明品种间有变异。应用TFPGA软件计算55个石榴品种间的Nei’s遗传距离,并用UPGMA法构建聚类图,将55个石榴品种分为4个类群,从DNA水平上揭示了石榴品种之间的亲缘关系。结果表明,采用UPGMA法聚类的结果与形态上的分类存在着一定的差异,即与根据花色和果味进行的分类没有相关性而与瓣型进行的分类有一定的相关性。 相似文献
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黄瓜种质资源遗传多样性及其亲缘关系的AFLP分析 总被引：39，自引：4，他引：39
采用AFLP分子标记技术，对中国黄瓜种质资源遗传多样性及其与外来种质的关系进行了分析， 结果表明8对AFLP引物在70份黄瓜种质中共扩增出425条带，多态性带的比例为66％。供试黄瓜种质的平 均期望杂合度为0．376，中国种质的平均期望杂合度为0．387，明显高于国外种质的n 291。西双版纳黄瓜和印度野生黄瓜具有一些栽培种质没有的特异位点，中国栽培种质的特异位点多于外来栽培种质，后者也有一些中国栽培种质没有的特异位点。聚类分析将70份种质分为三大组群，即西双版纳黄瓜(Cucumis sativus L.vaF．xishuangbannanesis Qi et Yuan)组群，e sativus var．hardwickii野生黄瓜组群和栽培黄瓜组群。西双版纳黄瓜与栽培黄瓜的距离最远，与野生黄瓜次之。按一定的遗传距离可以将中国和外来栽培种质分开。大多数 华南型和华北型种质归属于不同的亚组。这些结果有助于有目的地利用这些变异拓宽育种材料的遗传背景。 相似文献
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大花蕙兰遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析 总被引：16，自引：0，他引：16
对来源于日本、韩国和美国的42个大花蕙兰品种和两个国产兰属原生种进行了遗传多样性和亲缘关系的AFLP分析, 9对多态性引物在50～500 bp内共扩增出1 597条带, 其中多态性带1 565条, 多态性比率9810%。单引物对扩增的带数156～193条, 平均每对引物扩增带数177条。42个品种具特征带或缺失带。大花蕙兰品种间的遗传多样性丰富, 品种间的相似系数0.3399 ～0.8223, 平均相似系数0.5783。UPGMA聚类结果将供试品种分为4大类, 与根据花枝类型或花径大小、花色等形态指标分类的结果相吻合, 同一产地来源甚至同一育种公司选育出的品种能基本上聚类在一起, 反映出了品种间的亲缘关系。 相似文献
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红肉猕猴桃种质资源果实性状及AFLP 遗传多样性分析 总被引：2，自引：0，他引：2
对中国红肉猕猴桃种质资源进行收集和调查,并对其进行果实性状变异分析和AFLP 遗传多
样性及遗传关系分析。结果表明,红肉猕猴桃野生资源主要分布于湖南省、湖北省、河南省、江西省、
四川省和陕西省等地,共采集到52 份野生资源和2 份品种资源（包括软枣猕猴桃红肉类型、中华猕猴桃
红肉类型和美味猕猴桃红肉类型）。红肉猕猴桃种质资源在果实性状和DNA 分子水平上都存在丰富的变
异和较高的遗传多样性水平,4 对AFLP 引物共扩增出259 个多态性位点,多态性位点百分率为90.56%,
Nei’s 基因多样性和Shannon’s 信息指数分别为0.318 和0.477;资源间遗传相似性系数介于0.568 ~ 0.883
之间,平均为0.714。聚类分析和主坐标分析将54 份资源划分为4 个组,软枣猕猴桃红肉类型单独聚为
一类;中华猕猴桃和美味猕猴桃红肉类型亲缘关系较近且有按地理来源优先聚类的趋势。果实性状数据
和AFLP 数据之间具有极显著的相关性,二者可结合用于红肉猕猴桃资源评价和保护利用工作中。 相似文献
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Yoshimi Yonemoto Abul Kashem Chowdhury Hidenori Kato Mustad Malid Macha Hitoshi Okuda 《Scientia Horticulturae》2007
Floral morphology, random amplified polymorphic DNA (RAPD), and amplified fragment length polymorphism (AFLP) were used to characterize and verify genetic diversity within a white sapote cultivar collection and to develop molecular markers for germplasm identification. On the basis of floral morphology, the cultivars were classified into three types: type I included 23 cultivars with large ovaries and small anthers; type II included 13 cultivars with small ovaries and large anthers; and type III included one cultivar, named ‘Maltby’, with a large ovary and large anthers. DNA was isolated from 39 cultivars of white sapote and subjected to RAPD and AFLP analysis using 24 and 7 primers, respectively. One hundred and sixty-eight RAPD and 286 AFLP bands were used to assess genetic characterization among white sapote. Sixty percent of the RAPD and 77% of the AFLP amplification products were polymorphic among accessions. RAPD or AFLP markers differentiated all white sapote cultivars effectively. Moreover, each flower type was characterized as specially associated with two RAPD bands. UPGMA dendrograms based on RAPD and AFLP data, showed the majority of the cultivars from flower type I and flower type II clustering together. Finally 101 RAPD markers and 220 AFLP markers were used to construct a neighbor-joining dendrogram. This showed that the 37 cultivars could be classified into six distinct clusters, between which the similarity coefficient was as low as 0.00–0.55, even though the cultivars were morphologically very similar. The remaining two cultivars namely ‘Smathers’ and ‘Maltby’ were found genetically very distant from the other cultivars in RAPD, AFLP or combined RAPD and AFLP based dendrograms. The results suggested that the level of genetic variation among white sapote cultivars is diverse and the morphological and molecular data may lead to representation of the cultivar relationships as well as flower type discrimination. 相似文献
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核用银杏品种遗传关系的AFLP分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用AFLP技术对34份核用银杏品种进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明：8对AFLP引物组合共扩增出1 337条谱带,多态带百分率为99.63%;品种间的遗传相似系数在0.2915 ~ 0.6812之间,平均值为0.4911;在相似系数为0.50时供试品种可分为4大类;依据AFLP结果建立了核用银杏品种指纹图谱。核用银杏4个类型的Nei’s遗传多样性指数范围为0.1392 ~ 0.2014,总体为0.2112,Shannon’s信息指数范围为0.2138 ~ 0.3165,总体为0.3417;4个类型品种间的遗传分化系数为0.0871,基因流为5.4230。结合特异位点、相似系数、聚类结果等筛选出8份核用银杏优质品种。 相似文献
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部分芍药种质资源的RAPD分析 总被引：6，自引：0，他引：6
对5种野生芍药和26个栽培芍药品种的亲缘关系进行了RAPD分析。17条引物在所有供试样本中共扩增出153条反应带，其中多态带149条。对RAPD扩增结果采用UPGMA法进行聚类分析，在遗传相似度0.32处，块根芍药(Paeonia anomala)被单独分为一类，其它30份材料归为另一类；在遗传相似度0.54处，川赤芍(P.veitchii)、草芍药(P.obovata)和美丽芍药(P.mairei)3个野生种先后从30份材料中分别单独分离出来，而野生种芍药(P. lactiflora)则与所有的栽培品种聚为一类。该结果表明26个品种间的遗传背景相对一致，并与野生种芍药的遗传基础最为近密，与其它4种野生芍药的遗传差异则较大。按照与栽培品种亲缘关系由近到远的次序，4个野生近缘种依次排布为：美丽芍药、草芍药、川赤芍和块根芍药。研究结果从分子水平揭示出中国芍药品种群遗传背景狭窄，利用野生近缘种改良现有品种尚具有广阔空间。 相似文献
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Gladiolus is one of the important commercial flowers with a large number of cultivars. However, genetic relationships among its genotypes have not been reported. This study analyzed genetic relatedness of 54 gladiolus cultivars using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. A total of 24 AFLP primer pairs with three samples were initially screened, from which 9 primer sets that showed clear scorable and highly polymorphic bands were selected for AFLP reactions. Fluorescence-labeled amplification products were subjected to electrophoresis and then analyzed using an automated sequencer. A dendrogram was constructed by the unweighted pair group method using the arithmetic average (UPGMA). The number of AFLP fragments generated per primer set ranged from 10 to 151 with fragment sizes varying from 50 to 450 bp. A total of 660 AFLP fragments were detected, of which 658 (99.70%) were polymorphic. All the primers except E-AGG/M-CTA displayed 100% polymorphism. All cultivars were clearly differentiated by their AFLP profiles. The AFLP data were compared with previously obtained RAPD data and combined to generate a common dendrogram. The first cluster was dominated with indigenously bred cultivars while the second was dominated with exotic cultivars. This shows that most of the exotic cultivars as well as indigenous cultivars are closely related with each other. However, two indigenous cultivars viz., Pusa Suhagin and Pusa Archana share genetic similarity with exotic cultivars. Among the genotypes selected for the investigation, Pusa Gunjan was identified as the most distinct genotype. The AFLP markers developed will help future Gladiolus cultivar identification, germplasm conservation and new cultivar development. The assessed genetic relationships among gladiolus cultivars may enhance the efficiency of breeding program by selecting desirable parents with reduced breeding cycle. 相似文献