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相似文献
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1.
杨虎  徐兴莉 《猪业科学》2011,(11):102-103
1微卫星DNA的结构 微卫星DNA又称短串联重复或简单重复序列,由侧翼序列和重复串联的核心序列2部分组成,核心序列长度一般为1~6个碱基,首尾相连组成重复串联序列[1],其中最常见的是2个碱基的双核苷酸重复,即(TG)n和(CA)n,每个微卫星DNA的核心序列结构相同  相似文献   

2.
微卫星DNA(Microsatellite DNA)是指以少数几个核苷酸(多数2~4个)为单位多次串连重复的DNA序列, 也称简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)、短串联重复(short tandem repeat, STR)或简单序列长度多态性(simple sequence length polymorphism).早在上世纪70年代初, Skinner在寄居蟹的DNA中发现了一类简单串联重复序列, 1980年Singh等人又在蛇W染色体的性别特意性卫星DNA中发现了一类GATA和GACA的简单重复序列, 1982年Singh等人在人心肌肌动蛋白(Ha-25)的内含子中发现了一个重复25次的(dT-dG)序列,同时指出这一序列在人及其它真核生物的基因组中广泛存在,并与Z-DNA的形成有关.  相似文献   

3.
微卫星标记DNA是简单串联重复序列(simple sequence repeas,SSR),它的组成基元为1~6个核苷酸,例如(CA)n、(CGA)n、(GACG)n等.由于这些序列广泛存在于真核细胞的基因组中,且由于串联重复的数目是可变的而呈现高度的多态性,以及在单个微卫星点上可作共显性分析.近年来,微卫星序列作为比较理想的分子标记广泛应用于遗体图谱的构建、居群遗传学以及系统发育的研究.  相似文献   

4.
微卫星标记BMS2508在4个山羊品种中的遗传多样性研究   总被引:5,自引:3,他引:5  
微卫星DNA又称简单序列重复、短串联重复序列和简单序列长度多态性,广泛存在于真核生物基因组中.微卫星多态性是由于减数分裂过程中不等交换造成变异而产生的,具有保守性,其核心序列为2~6 bp,重复约10~20次,属于等显性遗传.自1989年在人类基因组研究发现微卫星多态性后,目前在马、牛、猪、绵羊和鸡等动物基因组中也筛选出了大量的微卫星标记,但山羊等动物中则相对较少.  相似文献   

5.
微卫星分子标记的研究进展   总被引:2,自引:0,他引:2  
微卫星是指以少数几个核苷酸(一般1~6个)为单位多次串联重复的DNA序列,是1974年Skinner在研究寄居蟹的卫星DNA时发现的。微卫星广泛均匀地分布在基因组上,其重复数和重复单位序列都是可变的,故多态信息含量大。但由于微卫星无位点特异性,无法确切定位。因此以微卫星核心序列为中心,两侧各加上1个侧翼序列,形成所谓的序列示踪微卫星位点(STMS)。由于侧翼序列在基因组中是单拷贝的,具有位点特异性,而微卫星本身又使STMS具有多态性,只需根据微卫星侧翼序列设计一对PCR引物,通过PCR反应从模板DNA中将该位点扩增出来,然后用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,溴乙锭或银染法显色进行研究。  相似文献   

6.
有关微卫星的报道始见于Skinner等(1974)在研究寄生蟹的卫星DNA时发现一种简单的串联重复序列。Ali等(1986)首次将合成的寡聚核苷酸用于人的指纹研究,才受到重视。Jeffreys等和Gao等(1988)进一步将其发展成为一种新的遗传标记系统。Tautz等(1989)报道微卫星具有丰富的多态性。早期将微卫星称为“简单序列”、“简单序列重复(SSR)”、“简单串联重复(STR)”等。  相似文献   

7.
微卫星DNA标记在川渝山羊品种遗传多样性研究中的应用   总被引:1,自引:0,他引:1  
微卫星,又称短串联重复序列(Short Tandem Repeat,STR)或简单重复序列(Simple Sequences Repeat,SSR),是20世纪80年代末期发展起来的一种新型DNA标记。常用于检测个体基因型,统计群体中微卫星位点等位基因的数目和频率,并结合分子遗传学和数量分类学原理,计算各个品种的遗传变异程度、生存稳定性,初步评估品种的遗传多样性及品种间的亲缘关系与分化关系。论述了遗传多样性的研究进展及微卫星在遗传多样性研究中的应用,并以川渝山羊品种(类群)为重点进行了系统讨论,以期为今后的相关研究提供理论基础。  相似文献   

8.
微卫星技术是20世纪80年代末期发展起来的能有效区别不同物种、不同群体及不同基因型个体的分子标记,可作为第二代分子标记。微卫星标记广泛分布于各真核生物基因组中,且随机分布。微卫星DNA(Microsatellite)是一类以1~6 bp的核苷酸为基本单位,呈串联重复状散在分布于整个基因组的重复序列,具有数量多,分布广且均匀,多态性丰富和  相似文献   

9.
旨在研究牛亚科物种间串联重复序列(tandem repeats sequence,TRs)的分布特点及着丝粒区卫星DNA的进化关系。本研究基于普通牛、瘤牛、牦牛、水牛、野牛、独龙牛6个牛亚科物种的基因组序列,研究了不同物种间TRs的组成、分布及结构特点,并分析了6个牛亚科物种染色体着丝粒区卫星DNA的进化关系。结果表明:1)TRs在牛亚科物种中平均占比为2.03%,平均长度54.93 Mb,其中普通牛的占比最高3.42%(93.00 Mb),瘤牛最低1.42%(37.88 Mb)。2)微卫星DNA在3类TRs中位点数最多,为483 405,占TRs总位点数85.64%,高于小卫星DNA(43 026,7.62%)和卫星DNA(38 180,6.75%)。3)通过对微卫星DNA丰度和平均长度分析发现,二碱基微卫星DNA在牛亚科物种中丰度最高,为70.93 loci/Mb,且以AC拷贝类别为主。4)通过构建着丝粒区1.715和1.723卫星DNA的系统发育树发现,1.715卫星DNA普遍存在于牛亚科物种的基因组中,而1.723卫星DNA在牦牛中不存在,两类卫星DNA在不同物种间或不同染色体上存在不同程度分化,具有较明显的种间特异性。TRs在牛亚科6个物种中平均占比为2.03%,微卫星DNA为TRs主要序列,且二碱基微卫星丰度最高,并以AC拷贝类别为主;1.715卫星DNA普遍存在于6个牛亚科物种的基因组中,但在物种间或染色体间存在不同程度分化。本研究结果为牛亚科物种间TRs分布特征及进化关系研究提供了重要理论依据。  相似文献   

10.
微卫星电泳及银染检测中的常见问题分析及对策   总被引:1,自引:0,他引:1  
微卫星DNA,又称短串联重复序列(short tandemrepeat STR),是一类广泛存在于原核/真核生物基因组的DNA串联重复序列。它是继RFLP之后兴起的一种新的分子遗标记技术。因其多态信息含量高,检测快速,重组率低,已被越来越多的应用于基因定位及构建基因组图谱和群体遗传结构分析及杂交优势预测等诸多方面[1]。尽管微卫星标记方法操作简便、快捷,但因其灵敏度高、操作时间短,在实际操作中出现的一些问题常常会影响最终的检测结果。笔者总结了一年来STR工作中所遇到的一些有关于微卫星电泳及银染的常见问题,做出了相应的分析和对策,对于保证…  相似文献   

11.
微卫星DNA是广泛存在于原核生物和真核生物基因组中的短串联重复序列,具有快速突变性、多态性信息丰富、易于检测等特点.在动植物遗传育种、遗传图谱的构建、群体遗传学研究、肿瘤学、亲子鉴定、濒危野生动物保护及法医鉴定等方面的研究中被广泛应用.论文综述了微卫星DNA技术的研究进展及其在寄生虫学中的应用.  相似文献   

12.
微卫星又称短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),由侧翼序列和串联重复核心序列组成,一般其串联重复核心序列长度为1~6 bp[1]。由于微卫星遗传标记具有多态信息含量高、基因组内分布广泛及呈共显性遗传等优点,因而已被广泛应用于遗传图谱的构建[2-3]、QTL定位[4]、亲缘关系鉴定[5]及遗传多样性评估等[6]。微卫星标记的基因分型主要  相似文献   

13.
畜禽微卫星的应用   总被引:6,自引:0,他引:6  
微卫星(Microsatelite)是指由1-6bp的碱基序列为核心,呈串联重复状散在分布于整个基因组的DNA序列。由于微卫星标记在基因组中具有数量大、分布广、分布均匀、多态含量丰富及检测方便适合自动化和半自动化分析的优点,已成为各物种遗传图谱构建、...  相似文献   

14.
微卫星DNA标记及其应用   总被引:5,自引:0,他引:5  
微卫星DNA存在于大多数生物的基因组中,一般由1~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,所以微卫星DNA标记的应用范围非常广泛。笔者就微卫星DNA标记在基因组连锁图构建、基因定位、QTL分析、标记辅助选择、杂种优势预测、亲缘关系鉴定、近交动物以及医学等方面的应用作逐一概述。  相似文献   

15.
微卫星DNA(简单重复序列,SSRs)是由长度为2~6个碱基组成的串联重复的DNA束,SSRs是继RFLP之后发展起来的一种新的分子遗传标记技术.自从20世纪70年代被发现以来,SSRs得到了迅速发展.在各种动植物品种中,研究人员陆续发现了很多微卫星标记,这些微卫星标记在动植物的育种与遗传评估中得到了广泛的应用.  相似文献   

16.
微卫星标记(microsatellite)又称为短串联重复序列(si m-ple tandemrepeats,STRs),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,因此微卫星标记的应用非常广泛〔1〕。微卫星位点通常通过PCR扩增,扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。本试验研究的目的就是分析山西瘦肉型猪SD-Ⅲ系卫星标记SW489和SW2049的遗传多态性,从分子水平上了解山西瘦肉型猪SD-Ⅲ系,为猪的动物育种提供科学依据。1材料和方法1.1试验材料1.1.1试验猪…  相似文献   

17.
微卫星(mierosatelllte)一般由2~6bp组成核心序列,重复10~20次左右,首尾相接组成短串联重复(Short Tandem Repeat,STR),又称为简单序列重复(Simple Sequence Repeat,SSR)。它普遍存在于真核生物的基因组中,平均每10kb就出现一个STR。微卫星因数量多、分布广、多态性丰富、呈共显性遗传方式以及检测快速方便等优点而倍受推崇。乳房炎是奶  相似文献   

18.
帅小蓉 《蚕学通讯》2005,25(1):25-27
微卫星DNA(Microsatellete DNA),又称为简单重复序列(SSR,single sequence repeats),是一类由2~6个核苷酸为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列如(GA)n ,(AC)n,(GAA)n等,广泛存在于原核及真核基因组中.本文针对SSR标记的原理、操作程序及其在家蚕中的研究现状作了简要介绍.  相似文献   

19.
微卫星又称简单序列重复(SSR)或短串联重复(STR),其核心序列一般由1~6个核苷酸组成[1],例如(CA)n、(GAAA)n或(AG)n。由于微卫星序列广泛分布于真核生物的基因组中,且具有多态性高、呈共显性遗传等特点,因而自M.Litt等[2]首次报道微卫星基因分型以来,很快被广泛应用到遗传图谱构建、数量性状基因座(QTL)定位、遗传多样性分析、亲  相似文献   

20.
微卫星DNA遗传标记的研究进展及应用   总被引:2,自引:0,他引:2  
微卫星DNA又称为短串联序列重复(short tandem repeats,STRs)、简单序列重复(simple sequence repeat,SSR),其作为遗传标记在DNA指纹图、遗传连锁图、群体遗传结构及遗传关系、分析以及遗传育种分子标记辅助选择等领域拥有广阔的应用前景.对微卫星DNA进行了概述,并对其应用及展望进行介绍,以期为相关研究提供参考.  相似文献   

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