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云南地方猪种线粒体DNA多态性研究 总被引：3，自引：0，他引：3
本文用ＡｐａⅠ、ＡｖａⅠ，ＢａｍＨⅠ，ＢｅｌⅠ，ＢｃｌⅠ，ＣｌａⅠ，ＤｒａⅠ，ＥⅠ，ＥｃｏＲⅤ，ＫｐｎⅠ，ＰｓｔⅠ，ＰｕｖⅡ，ＳａｌⅠ，ＳｍａⅠ，ＳｔｕⅠ，ＸｈｏⅠ等１８种限制性内切酶分析云南猪种的ｍｔＤＮＡ多态性。在全部１８头个体中只检出一种限制性类型，结果表明，云南猪种的ｍｔＤＮＡ变异度很低，遗传多样性贫乏，提示云南猪种起源于一个共同的祖先，在品种形成的早期可能受到创立者效应的制约。 相似文献
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云南几个地方鸡种的mtDNA限制性片段多态性研究 总被引：6，自引：0，他引：6
云南几个地方鸡种的ｍｔＤＮＡ限制性片段多态性研究邹平张廷饮（云南省畜牧兽医科学研究所昆明６５０２２４）王文陈永久张亚平（中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放实验室线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）具有进化速度快、严格单性母系遗传和易于提取分析而成为研... 相似文献
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蜜蜂线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）研究进展王瑞武董捷乔广辉（中国农科院蜜蜂研究所，北京１０００９３）线粒体是细胞中进行能量代谢的重要细胞器。线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ，ｍｔＤＮＡ）是线粒体中的遗传物质。长期以来，人们对ｍｔＤＮＡ的结... 相似文献
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蜜蜂线粒体DNA碱变性提取法 总被引：2，自引：0，他引：2
一、前言线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）已被广泛应用于动植物群体遗传学和进化生物学的研究中，并为分子系统学提供了有价值的比较生物学的数据，取得了许多非常有意义的结果。有效的ｍｔＤＮＡ提取方法，无疑是开展这方面研究的前提。而ｍｔＤＮＡ提取实验成功的标志是把染色体ＤＮＡ（即核ＤＮＡ）、蛋白质与ＲＮＡ尽量去除干净，从而获得一定得率和纯度的ｍｔＤＮＡ，以满足ｍｔＤＮＡ用于限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）分析中的酶切及聚合酶链式反应（ＰＣＲ）中酶切、拷贝和连接的需要。本试验用碱变性提取法，ＣｓＣｌ超速离心法和蛋… 相似文献
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几种鸟类mtDNA限制性酶切图谱的比较研究 总被引：2，自引：0，他引：2
本文用５种限制内切酶（ＨｉｎｄⅢ，ＢｇＬＩ，ＰｓｔＩ和ＢａｍＨＩ）初步建立了头鹅、白鹅、火鸡和鹌鹑的肝脏线粒体ＤＮＡ的内切酶图谱。结果表明白鹅和狮头鹅的ｍｔＤＮＡ的酶切图谱极为相似。山鸡、火鸡和鹌鹑的ｍｔＤＮＡ限制性性内切酶图谱之间的差异是很大的，以上事实说明驯化中的鹅类的不同品种间ｍｔＤＮＡ差异不在。而鸡形目中的不同物种间的ｍｔＤＮＡ是有很大的差异的。 相似文献
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四川白鹅朗德鹅及杂交后代线粒体DNA多态研究 总被引：7，自引：1，他引：6
采用ＲＦＬＰ技术，对四川白鹅和朗德鹅及其杂交后代进行了线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）多态分析，在所使用的１９种限制性内切酶中，有４个酶（ＥｃｏＲＶ，ＨａｅⅡ，ＨｉｎｃⅡ和ＫｐｎＩ）检测出多态，共获得两种ｍｔＤＮＡ单倍型，四川白鹅和以四川白鹅为母本杂交后代ｍｔＤＮＡ为Ｉ型，朗德鹅的ｍｔＤＮＡ为Ⅱ型，以上结果为中国鹅和欧洲鹅存在两种不同起源学说提供了分子遗传学的证据，ＥｃｏＲＶ，ＨａｅⅡ，ＨｉｎｃⅡ和Ｋｐ 相似文献
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动物mtDNA遗传研究进展及在育种上的应用 总被引：12，自引：0，他引：12
动物ｍｔＤＮＡ遗传研究进展及在育种上的应用魏彩虹（甘肃省畜牧兽医研究所平凉７４４０００）自从Ｎａｓｓ（１９６２）发现线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）以来，有关ｍｔＤＮＡ的遗传结构、复制、转录、基因表达与调控等方面已积累了丰富的资料。动物的ｍｔＤＮＡ是共价闭... 相似文献
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牛属遗传多样性及种间的遗传分化研究进展（下） 总被引：1，自引：0，他引：1
牛属遗传多样性及种间的遗传分化研究进展（下）涂正超邱怀（西北农业大学动物科学系陕西杨陵７１２１００）４牛种间的ｍｔＤＮＡ遗传分化线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）为核外遗传物质,以母系遗传方式遗传,序列简单,核苷酸岐异度大,在种间、近缘种间具有丰富的遗传多... 相似文献
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藏绵羊线粒体DNA遗传多样性研究 总被引：21，自引：4，他引：21
本文用ＡｐａＩ,ＡｖａⅡ,ＢａｍＨＩ,ＢｃｌⅡ,ＣｌａＩ,ＥｃｏＲⅤ,ＨｉｎｄⅢ,ＨｐａＩ,ＫｐｎＩ,ＰｓｔＩ,ＰｖｕⅡ,ＸｂａＩ,ＸｈｏＩ等１４种内切酶,分析了１２头藏绵羊ｍｔＤＮＡ的限制性片断长度多态性,共检测了３５个酶切位点,发现ＡｖａⅡ,ＣｌａＩ,ＰｖｕⅡ三种酶切类型具有多态性,根据不同个体的ｍｔＤＮＡ的酶切类型,发现藏绵羊存在三种ｍｔＤＮＡ单倍型,计算ｍｔＤＮＡ多态度π值为０．００１２, 相似文献
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试验旨在探讨近红外（near-infrared,NIR）光谱技术应用于云南地方猪种肉质特性分析的可行性。在云南省8个县采集7个云南地方猪种腰背最长肌共计102份样品,利用近红外光谱分析技术,对各猪种近红外指纹图谱进行主成分分析和聚类分析。结果表明,7个猪种肉质的近红外光谱具有共性和差异性,其主成分空间分布位于不同的区域,大河乌猪与大河猪光谱欧氏距离最近,迪庆藏猪肉质特异性明显。利用近红外光谱技术可以准确、快速地对地方猪种进行肉质特性分析,揭示出地方猪种肉质方面的特色资源。 相似文献
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为阐明保山猪、迪庆藏猪、高贡黎山猪、丽江猪、明光小耳猪、滇南小耳猪、撒坝猪、大河猪、昭通猪、大河乌猪10个云南省优良地方猪种的群体遗传多样性和遗传结构,本试验参考ArkDB数据库中家猪14条染色体上的15对微卫星引物,对549个云南地方猪个体的耳组织样品进行了检测分析,计算各微卫星座位等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Shannon's信息指数（I）、表观杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、F-统计量（Fis、Fit、Fst）、基因流（Nm）、群体遗传距离等相关参数及多态信息含量（PIC）,采用NTsys 2.10软件构建聚类树,并采用STRUCTRUE 2.3.3软件评估群体遗传结构。结果显示：15个微卫星座位共检测到293个等位基因,各座位等位基因数在5~38个之间,平均等位基因数为19个,平均有效等位基因数8.3682个;10个云南地方猪群体的Shannon多样性、表观杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别在1.4374~2.0317、0.6389~0.7756、0.7021~0.8281和0.6647~0.7993之间。各座位单个群体内近交系数（Fis）、总群体近交系数（Fit）、群体间遗传分化系数（Fst）的变化范围分别为-0.0678~0.4594、0.0618~0.5567和0.0713~0.1801;群体间Fst平均值为0.1101,处于中度遗传分化状态,有11.01%的遗传变异来自于群体间,大部分遗传变异来自于群体内;每个座位基因流程度较高,变化范围在1.6392~3.2551之间,平均值为2.0214。基于Nei氏遗传距离构建UPGMA系统发生树显示,高黎贡山猪与迪庆藏猪聚为一支,并与丽江猪、保山猪和明光小耳猪聚为一大支,其结果得到了STRUCTURE分析的验证。综上所述,10个云南地方猪种遗传多样性丰富,群体内有近交现象,群体间处于中度遗传分化,存在着一定的基因交流。 相似文献
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11个猪种SLC6A14基因3个SNPs的群体遗传变异研究 总被引：2，自引：0，他引：2
本研究旨在了解猪种的遗传变异、种群间的亲缘关系和遗传分化。以白色杜洛克×二花脸资源家系F0代的17头二花脸母猪和2头白色杜洛克公猪的DNA池为模板,通过直接测序在猪SLC6A14基因内识别4个SNPs,以3个突变位点(g.7944AT、c.1438GA、g.21063GT)为基础,通过PCR-RFLP技术,对11个中外猪种进行多态性检测。结果表明:在SLC6A14g.7944AT和g.21063GT2个突变位点上,所有检测猪种都出现变异,其中槐猪、二花脸猪在g.7944AT位点上变异显著(0.01P0.05);而里岔黑猪、槐猪、玉山黑猪、合作藏猪、八眉猪在g.21063GT内变异极显著(P0.01),以GT基因型为主,且二花脸猪中出现TT基因型;在SLC6A14c.1438GA突变位点上,3个欧洲猪种(长白、大白、杜洛克)没有出现变异,均为GG纯合型,而其他猪种在此位点上均存在变异;再根据11个猪种3个位点的多态性信息计算Nei氏遗传距离,由UPGMA法构建聚类图,说明中国地方猪种与外引猪种存在明显的遗传分化;由此得出中国地方猪种比外引猪种有高的遗传多样性和变异,且存在明显的遗传分化,品种间多数猪种符合品种地域分布和品种特性。 相似文献
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贵州地方猪种UCP3基因多态性与肉质性状的相关性分析 总被引：4，自引：0，他引：4
解耦联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)是调节能量和脂肪代谢的重要因子。以商品猪(杂交猪)为对照,采用SSCP方法对贵州地方猪品种糯谷猪和萝卜猪的UCP3基因进行了多态性分析。结果表明:3个猪群体中,都检测到了3种基因型(AA、BB、AB),χ2独立性检验结果显示,3种基因型在3个群体间的分布不一致,糯谷猪和萝卜猪以AB基因型为主,杂交猪以BB基因型占优势,杂交猪与地方猪种之间的差异显著(P<0.01);对纯合基因型的UCP3基因片段进行克隆测序,证实AA基因型中UCP3基因外显子6编码区第842位碱基发生了单碱基突变(T→C),导致编码的氨基酸从苏氨酸突变为甲硫氨酸。进一步分析3种基因型与胴体和肉质性状之间的相关性,证明AB基因型个体的肉质最优,贵州地方猪种的大理石纹、肌内脂肪含量和嫩度3项指标显著优于商品猪(P<0.01),因此推测UCP3基因与贵州地方猪种的肉质性状具有相关性,可能是贵州地方猪种肉质性状的候选基因。 相似文献
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西北地区几个猪种银染核仁组织区（Ag—NORs）多态性的研究 总被引：6，自引：0，他引：6
本文用核仁组织区银染法对西北地区4个品种42头猪Ag-NORs的数目和分布作了较详细的研究。结果表明,猪的NOR位于8号和10号染色体的次缢痕区,每个细胞Ag-NORs的分布范围在1～4个之间。杜洛克、巴克夏、关中黑和八眉猪每个细胞Ag-NORs数平均为2.05、2.00、3.33和2.95个。Ag-NORs在品种、个体和细胞间具多态性,这种多态性与猪的起源和杂交育种时所用亲本品种的血缘有关。同时,对八眉猪以及中国猪种的起源问题作了初步探讨。 相似文献
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The paper was aimed to investigate the polymorphism of copy number variation (CNV) in different pig breeds.Three CNV regions of CNVR91,CNVR92 and CNVR143 were chosen from the porcine SNP60 chip genotyping results.The polymorphisms of three CNVs were determined by Real-time quantitative PCR method,taking five pig breeds as samples,including Yorkshire pig,Xiang pig,Kele pig,Nuogu pig and Rongchang pig breeds.The results showed that the dominant status of CNVR91 was loss in Xiang pig,while it was normal in other four pig breeds.The major type of CNVR92 was deletion in Xiang pig,Yorkshire pig,Kele pig and Rongchang pig breeds,with a high normal percent in Nuogu pig.For CNVR143,the dominant event was gain in Xiang pig and Nuogu pig breeds,but it was not diverse in other three pig breeds.These results indicated that three CNV regions emerged with polymorphism in five pig breeds,which might have effects on gene expression in CNV regions and physiological function by dosage effect especially in Xiang pig,Nuogu pig and Kele pig breeds. 相似文献
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不同猪种肉质相关基因Hal、RN和FTO的多态性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
为了明确肉质相关基因氟烷基因(Hal)、酸肉基因(RN)和脂肪肥胖相关基因(FTO)在国内外不同猪种群体间的遗传变异特性,本研究以大约克、长白、杜洛克和金华猪等猪种群体为研究对象,应用PCR-RFLP技术分别检测了Hal、RN和FTO基因的多态性,并分析了FTO基因上2个多态位点g.276G＞T和c.594C＞G的遗传变异情况.结果表明:(1)在杜洛克猪中发现了Hal的基因型HalN Haln,其频率为0.166,但未发现基因型Haln Haln,其它猪种群体中仅检测到了基因型HalN HalN;(2)在已检测的所有猪种群体中只检测到RN基因的rn/rn基因型,未发现rn/RN和RN/RN基因型;(3)在FTO的g.276G＞T位点上,金华猪呈现单态,其它猪种群体均呈现多态.在FTO的c.594C＞G位点上,4个猪种群体均呈现多态,3个外来猪种群体均以CC基因型频率较高,而金华猪则以GG基因型频率较高.研究结果提示,由于Hal基因在养猪生产中的利弊双重性,因此在某些猪种群体中仍然存在较高频率的HalN Haln基因型.此外,结合FTO基因的生理功能和已有的研究结果,可在特定的猪群中将其作为影响猪肉质性状的候选基因.本研究发现FTO的基因型分布在我国优良地方猪种金华猪与国外3个种猪群间存在较大差异,为深入研究不同品种猪的肉质形成机理提供了基础数据. 相似文献
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为了探究拷贝数变异(copy number variation,CNV)在不同猪品种间的多态性,本试验根据猪SNP60芯片检测结果,以大白猪、香猪、柯乐猪、糯谷猪、荣昌猪为主要研究对象,采用实时荧光定量PCR方法,对5个猪品种基因组中3个CNV区域(CNVR91、CNVR92和CNVR143)的拷贝数进行测定。结果显示,香猪的CNVR91以拷贝数缺失为主,其他4个猪品种的拷贝数以正常为主;香猪、大白猪、柯乐猪、荣昌猪的CNVR92以拷贝数缺失为主,糯谷猪以拷贝数正常为主;香猪和糯谷猪的CNVR143以拷贝数增加为主,其他3个猪品种以拷贝数正常为主。表明3个拷贝数变异区在5个猪品种之间具有多态性,可能通过剂量效应影响香猪、糯谷猪和柯乐猪等相关基因的表达和生理功能。 相似文献
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本试验以欧洲猪种为参照,研究贵州地方猪对氧磷脂酶1(paraoxonase,PON1)基因的多态性,探讨基因多态性与地方猪的脂肪沉积之间是否存在相关性。研究采用锚定聚合酶链反应技术对香猪、糯谷猪、萝卜猪和可乐猪共138个贵州地方猪品种PON1基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)进行研究。结果表明,猪群PON1基因的163/165位点出现A/T、G/A变异,515位点检测到C/T突变,均以3种基因型存在。经卡方(χ2)检验,贵州地方猪群PON1基因515位点的基因型频率和基因频率与欧洲猪品种间的差异不显著(P>0.05);163/165位点中,贵州地方猪种A等位基因的频率为83.7%,明显高于欧洲猪品种(25.2%)。贵州地方猪品种PON1基因的163/165位点A等位基因占优势,编码的第55位氨基酸为甲硫氨酸(Met55),与脂代谢异常人群的基因型相同;欧洲猪种以B等位基因为主(P<0.01),编码的第55位是亮氨酸(Leu55),与正常人群的基因型一致。以人PON1蛋白的晶体结构为模板,推导出香猪PON1蛋白的三维结构。地方猪PON1基因变异导致的Met55突变可能影响PON1水解酶活性中心的疏水环境,可能使蛋白的水解酶活性下降,使得地方猪品种的脂肪沉积量和肉质不同于欧洲猪种。由此推测,贵州地方猪品种PON1基因163/165位点存在多态性,可能与地方猪种的脂肪沉积和肉质有一定的相关性。 相似文献
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本研究利用微卫星标记技术从分子水平对云南5个地方绵羊品种（腾冲绵羊（TC）、昭通绵羊（ZS）、迪庆绵羊（DQ）、宁蒗黑绵羊（NL）、乌骨绵羊（WG））进行了分析,通过计算平均杂合度、多态信息含量等对它们之间的亲缘关系及群体间、群体内的遗传变异进行了探讨。结果发现,各品种内杂合度较低,在0.2894~0.3349之间,说明各群体内遗传变异较小;PIC值均大于0.5,呈现高度多态,说明5个绵羊品种具有较丰富的遗传多样性。5个绵羊品种之间的基因流分析结果发现,除与乌骨绵羊之间的基因交流较小外,其他4个绵羊品种之间的基因交流都较大。应用UPGMA法进行系统发生关系分析,乌骨绵羊同其余品种亲缘关系较远,最近的是迪庆绵羊和宁蒗黑绵羊。 相似文献