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全基因组重测序(whole genome resequencing, WGRS)是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的全基因组水平的测序,具有检测变异类型丰富、高性价比、应用广泛等优点。随着测序成本的降低和畜禽基因组测序工作的完成,全基因组重测序技术已成为畜禽遗传变异研究的重要工具。全基因组重测序技术可获得大量基因变异信息,包括单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)、插入缺失(insertion/deletion, InDel)、结构变异(structural variation, SV)和拷贝数变异(copy number variation, CNV)等,丰富了现有的基因组序列,形成的大量数据集为探索畜禽表型性状和遗传改良提供了一个基因组信息库,以促进对畜禽遗传资源的深入研究与利用。作者概述了全基因组重测序技术及其关键影响因素(测序深度、序列比对和变异检测),重点综述了该技术在重要畜禽(牛、羊、猪、鸡)研究领域的应用进展,并对将来侧重于整合分析重测序数据、精准表型记录和多组学信息的研究趋势进行了展望。 相似文献
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人类基因组序列的发现（1ander等，2001；Venter等，2001）和其他动物基因组序列的发现（http：／／www．ncbi．nih．gov／Genomes）是科学探索历程上的主要里程碑。基因组的揭示已帮助确定了很多未知基因的功能。另外，它还能在发病机制研究中帮助确定某些基因的特殊作用。过去10年中，功能性基因组学领域经历了快速的发展，这个领域结合了基因组学、蛋白质组学、基因型鉴定、转录组学和代谢组学。各个“组学”领域所得到的大量数据给生物信息学领域提供了丰富的资源，而生物信息学反过来又被开发出新的方法获取、储存、分享、分析、呈现和管理来自各个“组学”的信息，将复杂和通常是无类似点的数据处理和综合成连续一致的可检索数据库（Brazma，2001；Desiere等，2002；Van Ommen和Stierum，2002）。随着基因组学和生物信息学等的迅猛发展及在生命科学领域的应用，营养基因组学成为营养学研究的前沿。营养基因组学具有重要的理论研究意义和非常广阔的应用前景，它主要研究营养素和植物化学物质对人与动物基因的转录、翻译表达及代谢机制。文章重点介绍营养基因组学的研究内容与现状，并展望今后在水产研究方面的前景。 相似文献
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猪基因组信息资源的整合与利用 总被引：2，自引：0，他引：2
猪基因组图谱已得到极大发展，猪基因组计划已启动并在实施之中。利用QTL扫描，候选基因分析、基因阵列分析、生物信息学、比较基因组学等工具，已经发现了很多影响猪主要经济性状的基因或基因标记。利用标记辅助选择，结合基因标记和常规生产性能信息，可以极大地改进养猪业重要的经济性状。本文对猪的基因组学、生长速度、瘦肉率。饲料吸收，肌肉品质、窝产仔数及疾病抗性等主要经济性状的研究进展及标记辅助选择在猪生产中的应用进行综述。 相似文献
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目前,覆盖人类、植物、畜禽、微生物等100多种物种全基因组的细菌人工染色体文库在不同时间、不同群体中相继产生,为物种基因资源的保存、基因组学和后基因组学的研究提供了可靠的材料。细菌人工染色体与荧光原位杂交技术的结合能够将物种的大片段基因组DNA杂交在染色体上,确定基因或标记物在染色体上的物理位置,从而成为细胞和分子生物学领域中必不可少的工具。论文对细菌人工染色体荧光原位杂交技术在染色体结构与核型分析、疾病与肿瘤病原学研究、基因和标记物的定位与细胞遗传图谱绘制、基因组比较作图及物种进化中的应用和发展进行了综述。 相似文献
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改善猪肉质性状的分子育种方法 总被引：1，自引：0，他引：1
本文对利用分子育种方法鉴定猪肉质相关基因和标记的研究进行综述.家畜基因组序列的大量解读为鉴定复杂性状的候选基因和QTL效应提供了丰富的信息.猪基因组序列的解读,为研究猪的生物学系统提供了基础知识,并且还为其育种选择提供了理论依据.在基因组学这个领域中,功能基因组学和蛋白质组学能够同时关注许多基因和蛋白质的变化,从而更好地了解基因的功能和调控以及基因是怎样参与到复杂表型性状的控制网络中.特别是对mRNA和蛋白质水平的全基因组表达谱的研究可以更好地为肉质性状相关生物学功能和生理学过程的研究提供非常有用的工具.此外,利用生物信息学工具将基因组学和蛋白质组学整合起来也是充分挖掘分子育种信息的基础.这些知识的发展将有益于科学家和养殖户将分子数据应用到育种程序中,进而改进传统育种选择方案的效率和准确度. 相似文献
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功能基因组学研究进展 总被引：3，自引：0，他引：3
2 1世纪是生物时代和信息时代 ,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学 ,对于基因功能的研究也由单一基因转向大规模、批量分析。文章对功能基因组学及相关学科的概念作了概述 ,介绍了功能基因组学的研究内容与研究方法 ,主要包括应用差异显示反转录 PCR、基因表达序列分析 (SAGE)、微点阵、蛋白质组学和生物信息学等研究基因组表达概况、基因组多样性和模式生物学等。 相似文献
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营养基因组学研究最新进展 总被引：3，自引：0，他引：3
营养学的研究已经历了3个发展阶段：18世纪是机体生物学时代，人们开始探索各种营养素、维生素和矿物元素的代谢途径与作用，特别是营养素在代谢中的作用及其作为酶辅助因子的功能（Trayhum，2000）；20世纪后半叶，人类进入细胞学发展阶段，主要研究营养素在体内代谢、生理功能及对组织细胞的影响（乐果伟等，2004）；进入21世纪后，人类及模式生物的基因组草图和基因组序列图相继绘制完成。人类基因组测序完成后，研究的重点已由测序与辩识基因深入到探察基因的功能，营养科学也由营养素对单个基因表达及作用的分析，开始向基因组及表达产物在代谢调节中的作用研究，即营养基因组研究方向发展（Elliott和Ong，2002）。近年来，基因组学和生物信息学在生物技术领域的研究获得了巨大进展，为在营养学领域研究营养物与基因的交互作用打下了良好的基础。在此背景下，营养基因组学（Nutrigenomics）应运而生，并迅速成为营养学研究的新前沿（DeliaPenna，1999）。营养基因组学研究将以分子生物学技术为基础，应用DNA芯片和蛋白质组学技术等阐明营养素和基因的相互作用。第1届和第2届国际营养基因组会议于2002年2月和2003年11月先后在荷兰召开，凸现了营养基因组学研究的重要性。2006年4月，美国奥特奇生物技术公司第22届国际饲料工业年会上， 相似文献
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唾液乳杆菌（Lactobacillus salivarius）是一类具有益生菌潜能的乳酸菌，已应用于医药、食品和饲料添加剂等领域。本文在分析唾液乳杆菌相关文献和生物信息学数据的基础上，介绍了其对畜禽的效应、安全性和基因组学特征，并对唾液乳杆菌应用于畜禽生产的前景进行阐述，为唾液乳杆菌的推广应用提供参考。 相似文献