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采用限制性内切酶RsaⅠ对云南地方品种撒坝猪及其长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2的273bp扩增产物进行多态性分析,结果在2种猪中均发现B、C、G3种等位基因,在撒坝猪中发现6种基因型:132bp/84bp/30bp/27bp(BB)、246bp/27bp(CC)、132bp/114bp/27bp(GG)、246bp/132bp/84bp/30bp/27bp(BC)、132bp/114bp/84bp/30bp/27bp(BG)、246bp/132bp/114bp/27bp(CG);长撒二元杂猪中发现5种基因型:BB、CC、BC、BG、CG。经χ2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2在RsaⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传不平衡状态。 相似文献
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为明确猪SPDEF基因的遗传特性,试验对不同猪种SPDEF基因的CDS区进行序列扩增、测序、拼接,并对撒坝猪SPDEF基因CDS序列进行生物信息学分析。采用PCR直接测序法测定猪SPDEF基因外显子序列,运用SeqMan进行序列拼接。采用生物信息学软件分析撒坝猪SPDEF基因开放阅读框及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构、三级结构、功能结构域,并构建系统进化树。结果表明,各猪种SPDEF基因编码区仅在外显子1、2分别检测到1个同义突变(C13971T、C16541T),表明该基因编码区在所检测的猪群中高度保守。生物信息学分析发现,该基因有1个长1 092 bp的完整开放阅读框;SPDEF蛋白中丝氨酸(Ser)含量最高(10.7%),体外理论半衰期为30 h,属于不稳定的亲水性蛋白;该蛋白不存在信号肽及跨膜结构,存在39个潜在的磷酸化位点和1个糖基化位点,亚细胞定位于细胞质;二级结构预测中,参与无规则卷曲的氨基酸最多(55.10%),其次是α-螺旋(28.37%);功能结构域预测发现,该蛋白存在1个ETS功能结构域和1个SAM-PNT功能结构域。系统进化树结果显示,撒坝猪与牛、绵羊和山羊的亲缘关系较近。本研究为进一步分析撒坝猪SPDEF基因的功能奠定了一定的理论基础。 相似文献
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对不同猪的AIDA基因编码区进行扩增、测序、拼接,采用生物信息学方法对撒坝猪AIDA编码蛋白进行功能和性质分析,并通过实时荧光定量PCR检测其在撒坝猪不同组织中的表达水平。PCR扩增测序表明:该基因在撒坝猪的编码区序列没有发生错义突变,序列长921 bp,编码306个氨基酸。AIDA蛋白属于亲水蛋白,没有跨膜结构和信号肽,含有两个卷曲螺旋结构,有1个糖基化位点和29个磷酸化位点,无CpG island;二级结构是以无规卷曲为主的混合型蛋白;AIDA基因在大白猪的背最长肌和背脂中表达量要高于撒坝猪,而撒坝猪AIDA基因在胰脏中的表达量最高,其他组织中的表达量依次为脾脏、背脂、肾脏、肺、大脑、肝脏、心脏和背最长肌。 相似文献
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撒坝猪SLA-DQA基因多态性与生长性状的相关性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
应用PCR-RFLPs方法检测撒坝猪SLA-DQA基因突变位点多态性,通过最小二乘分析进行基因型与生长性状表型值的相关分析,结果表明SLA-DQA基因3种基因型在所分析的几个阶段体重和6月龄体尺性状上差异均未达到显著水平,且而在045日龄日增重和70日龄45日龄日增重和70日龄4月龄日增重上AA基因型与AB基因型间的差异达到显著水平,大多数生长性状都以BB型的较高。 相似文献
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滇南小耳猪与巴马小型猪SLA-DQA基因多态分析 总被引：8，自引：2，他引：8
对滇南小耳猪和巴马小型猪的SLA-DQA基因的部分内含子1、完整的外显子2和部分内含子2共341bp片段进行了PCR-RFLP酶切分型,结果表明：2品种经EcoR Ⅰ酶切后BB基因型频率（0.468 8）高于AB型（0.375 0）,AA型最低（0.156 3）,B为优势基因（0.656 3）,A为劣势基因（0.343 7）.经AluⅠ酶切后,滇南小耳猪MM基因型频率（0.500 0）高于MN型（0.321 4）和NN型（0.178 6）;而巴马猪则以MN基因型频率（0.485 3）高于MM型（0.338 2）和NN型（0.176 5）;2个品种中M等位基因（0.604 2）频率高于N等位基因（0.395 8）.经分析表明,2猪种在两酶切位点上各分型已达Hardy-Weinberg平衡.巴马小型猪和滇南小耳猪中分别存在9种和7种PCR-RFLP组合基因型,其中BBMN为优势组合基因型,AAMN为劣势组合基因型;AAMM组合基因型在2品种间差异显著（P＜0.05）.遗传多态参数分析表明：SLA-DQA基因外显子2的两酶切位点在2猪种间均表现为中度多态,AluⅠ的基因多样性略高于EcoRⅠ,巴马小型猪杂合性略高于滇南小耳猪,2品种间遗传距离为0.000 4. 相似文献
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本文对撒坝猪三种来源的性能进行了对比分析，初步揭示了不同饲养管理水平下撒坝猪的性能表现以及经过选育所获得的改进，并对其作为杂交母本在杂交全系中的应用作了较为全面的测定，基本摸清了撒坝猪的种质特性，为保种、选育以及开发利用提供参数。 相似文献
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撒坝猪及其杂交组合的肉质研究 总被引：21，自引：4，他引：17
本研究测定了撒坝猪及以它为母本的两个杂交组合（长×撒二元杂、杜×长撒三元杂）肥育猪22头（♂10头、♀12头）的PH值、肉色、大理石纹、熟肉率、失水率、贮存损失、嫩度、化学成分、组织学特性等9项13个指标。测定结果表明，撒坝猪肉质优良，是食用和肉品加工的上乘原料。与撒坝猪相比，两个杂交组合的肉质在PH值、保水性、嫩度、化学成分等项指标上有不同程度下降。但未见PSE肉和DFD劣质猪肉。 相似文献
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撒坝猪及其配套系氟烷基因检测与遗传效应分析 总被引：4，自引：1，他引：3
利用PCR -RFLP技术对云南省楚雄州种猪场 1 0 4头种猪 (包括撒坝纯种 71头 ,加系大约克 1 0头 ,丹系长白 8头 ,美系杜洛克 9头及三元杂大长撒 6头 )进行了氟烷基因检测。发现杂合子猪(Nn) 4头 ,包括 2头大约克 ,2头大长撒 ,未发现阳性猪 (nn) ,其余皆为阴性 (NN)。对大长撒氟烷基因杂合子与同群阴性猪作生长和肉质性状比较 ,显示其杂合子在瘦肉率、日增重和料重比等有优势 ,而肉质性状无明显差异。本文还就氟烷基因对地方母系及其配套系建设的影响作了初步分析 相似文献
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本研究通过对云南地方猪品种高黎贡山猪和撒坝猪及其杂交组合的生产性能进行研究，以期生产出适应云南气候环境且生产性能好的杂优商品猪。实验选取胎次、出生日期、体重相近的高黎贡山猪、撒坝猪、高×撒杂交猪（高黎贡山猪×撒坝猪）各12头（6♂，6♀）进行饲养，饲养结束后每组随机屠宰6头（3♂，3♀），对其各项生产性能指标进行测定及比较分析。结果表明：高×撒杂交猪的平均日增重显著高于高黎贡山猪，但低于撒坝猪，且耗料增重比最低；与高黎贡山猪相比，高×撒杂交猪屠宰性能中的宰前活重、胴体重极显著增高，皮厚降低，腰大肌肌纤维直径降低，背最长肌氨基酸中的苏氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、鲜味氨基酸、必需氨基酸极显著增高，脂肪酸中的油酸、花生四烯酸、二十二碳一烯酸、不饱和脂肪酸含量极显著增高，胆固醇含量显著降低；与撒坝猪相比，高×撒杂交猪屠宰性能中的瘦肉率增高，皮率、脂率降低（P<0.05），肉质性能中的瘦肉率增高、滴水损失降低（P<0.05），背最长肌氨基酸中的苯丙氨酸极显著增高，脂肪酸中的棕榈酸、十七烷酸、花生四烯酸、二十二烷酸、二十二碳一烯酸含量极显著增高。由此可见，高×撒杂交猪结合了高黎贡山猪和撒... 相似文献
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为明确猪SPDEF基因的遗传特性,试验对不同猪种SPDEF基因的CDS区进行序列扩增、测序、拼接,并对撒坝猪SPDEF基因CDS序列进行生物信息学分析。采用PCR直接测序法测定猪SPDEF基因外显子序列,运用SeqMan进行序列拼接。采用生物信息学软件分析撒坝猪SPDEF基因开放阅读框及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构、三级结构、功能结构域,并构建系统进化树。结果表明,各猪种SPDEF基因编码区仅在外显子1、2分别检测到1个同义突变(C13971T、C16541T),表明该基因编码区在所检测的猪群中高度保守。生物信息学分析发现,该基因有1个长1 092 bp的完整开放阅读框;SPDEF蛋白中丝氨酸(Ser)含量最高(10.7%),体外理论半衰期为30 h,属于不稳定的亲水性蛋白;该蛋白不存在信号肽及跨膜结构,存在39个潜在的磷酸化位点和1个糖基化位点,亚细胞定位于细胞质;二级结构预测中,参与无规则卷曲的氨基酸最多(55.10%),其次是α-螺旋(28.37%);功能结构域预测发现,该蛋白存在1个ETS功能结构域和1个SAM-PNT功能结构域。系统进化树结果显示,撒坝猪与牛、绵羊和山羊的亲缘关系较近。本研究为进一步分析撒坝猪SPDEF基因的功能奠定了一定的理论基础。 相似文献
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试验旨在从分子水平分析撒坝猪保种群体的遗传结构变化以及遗传多样性,拓宽遗传背景,指导和促进撒坝猪的保种工作。利用“京芯一号”SNP芯片对云南省楚雄州种猪场100头保种撒坝猪群体的DNA进行遗传群体结构分析。结果表明：撒坝猪保种群体的有效群体含量（Ne）为21,群体的多态性标记比例（PN）为0.533,群体的期望杂合度（He）为0.263,观察杂合度（Ho）为0.275|G矩阵表明公畜与母畜之间基因组亲缘关系呈中等|100头撒坝猪保种群体可分为A ~ G 7个家系|在100头撒坝猪保种群体中,共检测到3552个长纯合片段（ROH）,长度在8.20 ~ 621.32 Mb,每头撒坝猪含有2 ~ 53个ROH,且平均个体ROH长度为（319.38±111.39）Mb。该撒坝猪保种群体基于ROH的近交系数（FROH）平均为0.130,中位数大于0.125。本研究表明,该保种撒坝猪群体内家系数量适中,个别家系公畜数量较少,各家系个体数差异明显,群体中可能存在非撒坝猪的外来血缘,个体亲缘关系呈中等程度,近交程度较高,需要进行合理选配或者从原种场引入新的血统方式来确保撒坝猪遗传资源的多样性。
[关键词] 撒坝猪|保种群体|遗传多样性|SNP芯片|亲缘关系|家系结构 相似文献
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撒坝猪胰岛素样生长因子-Ⅰ基因多态性及其与部分生长性状的关联分析 总被引：2，自引：2，他引：0
胰岛素样生长因子-Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)基因的表达产物对猪肌肉的生长有着重要的调控作用。以IGF-Ⅰ基因作为撒坝猪生长性状的候选基因,运用PCR-RFLP技术对其HhaⅠ位点的多态性进行了检测,并对IGF-Ⅰ基因的多态性与12个阶段体重、日增重和体尺性状的关系进行了分析。结果表明,撒坝猪IGF-Ⅰ基因的多态性较为丰富,产生AA、AB和BB 3种基因型,其基因型频率分别是0.3473、0.5149、0.1378,等位基因A和B的频率分别是0.6048、0.3952,且该基因座位处于Hardy-Weinberg平衡状态,撒坝猪IGF-Ⅰ基因的遗传变异对其生长性状有着显著的影响(P<0.05或P<0.01),其中,不同阶段体重和日增重的增效基因型为AB基因型,180日龄体尺性状的增效基因型多为BB基因型(部分性状表现为AB基因型最高)。结合前人的研究,初步推断IGF-Ⅰ基因可能是影响猪生长性状的一个主效基因或是一个与影响猪生长性状的数量性状座位(quantiative trait locus, QTL)连锁的基因。 相似文献
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根据人和小鼠TLR2基因序列设计了特异性PCR引物,优化PCR条件后扩增到中国梅山猪、欧洲约克夏猪、PIC-2系及PIC-3系商品猪的TLR2基因690 bp的基因片段,并对其进行序列分析。序列分析结果显示,猪TLR2基因多态性程度低,发现在猪TLR2基因编码区第1 255位点上存在1个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法(B i-PASA)建立了检测猪TLR2基因变异的遗传标记。利用猪TLR2基因的B i-PASA标记,分析了TLR2基因在大河乌猪、撒坝猪和黔邵花猪中的基因频率和多态性。研究建立的B i-PASA遗传标记和基因变异信息,将为进一步分析猪TLR2基因变异与疾病抵抗力及经济性状的相关分析提供基础资料。 相似文献
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猪肌生成抑制素基因的克隆和序列测定 总被引：18，自引：0，他引：18
根据文献报道的猪肌生成抑制素基因cDNA序列，分别从第1、第2和第3外显子中设计引物，以大约克猪染色体DNA为模板，分段扩增出含内含子和外显子的序列。将所得各序列回收、克隆到pGEM-easyT载体中，然后进行序列测定。合并所有测得的猪肌生成抑制素因序列，共获得6kb连续序列。分析结果表明，猪肌生成抑制素基因第1内含子长1809bp，第2外显子长374bp，第2内含子长1978bp。所测得的外显子序列与已发表的cDNA序列同源分析比较，没有出现引起氨基酸改变的突变。表明瘦肉型猪（大约克猪）肌生成抑制素基因仍很完整，可通过改变基因结构等降低肌生成抑制素活性的方法提高瘦肉率。 相似文献
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撒坝猪配合力测定试验的初步分析 总被引：2，自引：1，他引：1
对１１个撒坝猪杂交组合的达屠宰体重日龄、料重比、日增重、瘦肉率等４个重要经济性状的超中亲优势（Ｈ１）和超高亲优势（Ｈ２）进行了分析。结果表明：撒坝猪的杂种优势普遍存在;优势程度依组合、性状的不同存在差异,优势程度表现较好的组事是杜撒（１９９８）、杜长撒（１９９８）和约汉撒（１９９６）,表现较好的性状是达屠宰体重日龄和日增重。 相似文献