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1.
陆地棉品种抗黄萎病性状的分子标记及其辅助选择效果 总被引：15，自引：6，他引：15
利用综合性状优良、适应性广、抗黄萎病的鲁棉研22号与渐渗了海岛棉优异纤维基因的鲁原343组配杂交组合,对F2∶3家系在不同发病时期进行黄萎病鉴定,并以SSR标记对抗黄萎病性状进行定位分析.在棉花发病相对较轻的7月份检测到1个位点(qVWR-16-1a)与抗黄萎病有关;在发病较重的8月份,检测到3个QTLs位点与抗黄萎病有关,其中1个QTL(qVWR-16-1b)与7月份检测到的位点qVWR-16-1a为同一位点,能解释的表型变异为10.27%,与NAU751连锁较紧密,另外2个与BNL1395和BNL3590连锁较紧密的位点qVWR-16-2b、qVWR-2-1b,能解释的表型变异分别为10.8%和13.78%.利用检测到的与3个QTL位点连锁较紧密的SSR标记对杂交后代辅助鉴定,发现标记NAU751和BNL1395的抗性基因型均能显著增加后代的黄萎病抗性,两个标记的抗性基因型聚合后,后代抗性水平提高极显著.分子标记辅助抗病选择应用于优异纤维渐渗系杂交后代的鉴定中,可以培育出既优质又抗病的棉花新品种. 相似文献
2.
SSR标记与陆地棉田间黄萎病抗性的关联分析 总被引：1，自引：0，他引：1
《华北农学报》2018,(6)
通过关联分析挖掘与陆地棉黄萎病抗性关联的分子标记,为陆地棉抗黄萎病性状的分子检测及标记辅助选择育种提供有益参考。选用在棉花基因组上均匀分布多态性较好的237个SSR标记对214份陆地棉材料的基因组变异进行了扫描,并使用Power Marker v3. 25分析群体的遗传多样性,Structure 2. 2分析群体结构,在此基础上结合3年黄萎病抗性鉴定数据,采用Tassel 2. 1中的GLM(Q)方法挖掘与黄萎病抗性相关的QTLs。结果表明,不同陆地棉材料黄萎病发病情况差异显著; 237个标记共检测到280个多态性位点,共计695个等位变异,变异范围2～6个,平均等位变异数2. 479 0;按照基因型数据可将该群体划分为2个亚群;通过关联分析,在不同年份中发掘与黄萎病抗性显著关联(P 0. 01)的SSR位点27个,其中有2个位点(BNL3442和BNL1064)在3年均被重复检测到,表型变异解释率最高分别为12. 10%和8. 02%。这些在不同年份中稳定存在的SSR标记位点有可能与抗病基因紧密连锁,有望用于棉花黄萎病抗性材料筛选和抗病基因挖掘。 相似文献
3.
基于单片段代换系的水稻粒型QTL加性及上位性效应分析 总被引：4，自引：3，他引：1
以分子标记辅助选择的手段有目的地进行基因聚合育种,对于加快育种进程具有重要的意义。而基因的加性和上位性效应是决定基因聚合能否成功的关键。本文以16个单片段代换系(SSSL)及15个双片段代换系分析了水稻粒型性状QTL的加性及上位性效应。共检测到9个水稻粒型性状QTL,包括4个粒长QTL、1个粒宽QTL和4个籽粒长宽比QTL,分别位于第2、第3、第4、第7和第10染色体上。此外,还检测出7对双基因互作,其中3对为有显著效应的两座位间互作,1对为两座位均没有显著效应的座位间互作,3对为1个有显著效应的座位与1个没有显著效应的座位间互作。本文结果进一步揭示了同一粒长QTL与不同单片段代换系聚合时会产生不同的互作效应,只有当上位性效应与目标基因的加性效应同向时,才可以达到明显改良粒长的效果。而且,2个长粒或2个短粒QTL聚合很难再产生更长或更短的籽粒。以上结果对于通过分子标记辅助育种手段改良水稻粒型具有重要意义。 相似文献
4.
海岛棉抗黄萎病基因SSR标记研究 总被引：12，自引：5，他引：12
以高抗黄萎病的海岛棉品种Pima 90-53和高感黄萎病的陆地棉品种中棉所8号的182个F2单株为标记群体,在田间病圃中鉴定F2单株,并通过培养室人工接菌法鉴定F2:3家系,以进一步确定相应F2单株的抗病性,经χ2c适合性测验,抗病、感病植株比例符合3∶1。采用混合分组分析法(BSA)对768对SSR引物进行筛选,发现引物BNL2440和BNL3255在抗、感DNA池呈现多态性,其中BNL3255在抗、感DNA池之间扩增出一条大小为208bp的多态性片段,定名为BNL3255-208。以Mapmaker/Exp(Version3.0b)软件分析F2单株检测结果,BNL3255-208标记与棉花黄萎病抗性位点之间的遗传距离为13.7 cM。 相似文献
5.
烤烟几种化学成分的QTL初步分析 总被引：9，自引：3，他引：6
以含137个株系的烤烟DH群体(G-28×NC2326)及其亲本为材料, 在以前作图数据的基础上, 新增23个标记。将这些标记数据合并起来构建了包括11个ISSR标记和158个RAPD标记、由27个连锁群组成的烤烟分子标记遗传连锁图, 覆盖长度2 094.6 cM, 相邻标记间的平均图距为15.95 cM。利用4个环境下的试验数据进行了总糖、烟碱、氧化钾3种烟叶化学成分的QTL初步分析, 共检测到7个加性效应QTL和9对加加上位性效应QTL, 其中3个加性QTL和3对上位性QTL存在QTL与环境互作效应(QE)。表明在烤烟总糖、烟碱、氧化钾的遗传控制中除加性效应外, 上位性效应也具有重要作用。对于烟碱、氧化钾检测到加性QTL与环境互作效应, 对于总糖、氧化钾检测到上位性QTL与环境互作效应, 利用这些与环境具有互作效应的QTL进行标记辅助选择时宜考虑特定的环境条件。 相似文献
6.
棉花纤维强度主效QTLs分子标记辅助选择及聚合效应研究 总被引：1，自引：1，他引：0
利用2个纤维品质优异材料0-153和新陆早24与2个大面积推广品种鲁棉研28和冀棉516为亲本,配制了(冀棉516×0-153)×(冀棉516×新陆早24)(Pop1)、(鲁棉研28×0-153)×(鲁棉研28×新陆早24)(Pop2)组合的双交F1群体,对3个纤维强度主效QTLs连锁的4个SSR标记进行辅助选择,并对不同QTLs的聚合效应进行了研究。结果表明,4个标记的选择都表现出显著的遗传效应,在2个群体中纯合显性基因/显性基因单株平均纤维比强度在31.21~32.62 cN·tex-1,杂合基因型单株平均纤维比强度在30.77~32.50 cN·tex-1,单个标记的选择效应在0.80~1.51 cN·tex-1;QTL-1×QTL-3和QTL-2×QTL-3组合在2个群体中同时聚合该2个QTLs时单株平均纤维比强度达到33.40~34.08 cN·tex-1,与2个QTLs均无单株相比选择效应在2.73~3.56cN·tex-1,与只含有其中1个QTL单株相比选择效应在1.12~3.02 cN·tex-1。此外,聚合效应分析表明,QTL-1与QTL-2可能是同一个QTL,QTL-2与QTL-3之间存在明显的上位效应。本研究进一步明确了开展纤维强度的分子标记辅助聚合育种是可行的。 相似文献
7.
三个栽培种中天然彩色棉的遗传多样性及关联分析 总被引：2，自引：1，他引：1
本研究利用主要农艺性状和SSR标记分析了137份陆地棉、13份海岛棉以及27份亚洲棉等不同纤维色泽的种质资源。170对SSR引物共检测到1036个等位基因变异。其中有多态性的等位基因923个,平均每个SSR位点有5.43个等位变异,变化范围为1~10。位点多态性信息量(PIC)的变化范围为0.56~0.93,PIC在0.85以上的多态性SSR位点为122个。结果表明,实验材料存在着丰富的遗传多样性。在群体结构分析基础上,使用TASSEL软件中的混合线性模型(MLM),在陆地棉中得到与11个性状相关联的SSR标记23个;在海岛棉群体得到与5个性状关联的17个标记;在亚洲棉中检测到与8个性状关联的15个标记位点。在三个栽培种中与纤维色泽度相关的标记位点一共有6个,分别是CIR51-4、BNL1421-2、BNL2656-2、DPL570-2、GH268-6和TMB131-1,表型变异解释率从3.12%到18.97%。三个栽培种中天然彩色棉种质具有丰富的遗传多样性,为棉花的种间、种内杂交育种以及拓宽棉花新品种的遗传背景提供了物质基础和理论依据。 相似文献
8.
甘蓝型黄籽油菜分子标记辅助选择的效果分析 总被引：8，自引：1，他引：7
应用分子标记辅助选择的方法,将黄籽性状导入到波里马恢复系中,利用杂种优势,将是提高油菜产量的理想途径。分析了分子标记辅助选择甘蓝型黄籽油菜的前景和背景选择的效果,结果表明,在背景选择中,7种不同 RAPD引物数目组合方式的选择结果基本一致;应用少数连锁群上的标记可以获得与全基因组相似的选择结果。在前景选择中,随着世代的增加,每一个标记的选择准确率在降低;双侧标记的选择准确率比单侧的标记高,此外,多个单侧标记未能提高选择准确率。据此,提出了作物前景和背景选择过程中的一些改进策略。 相似文献
9.
棉花纤维长度主效QTLs的分子标记辅助选择及聚合效果研究 总被引：6，自引：4，他引：2
以2个品种（系）TG41和sGK156以及3个纤维品质优异的种质系7235、HS427-10和0-153为亲本,配制了(sGK156×HS427-10)×(0-153×7235)、(TG41×HS427-10)×(0-153×7235)[JP]和(sGK156×0-153)×(sGK156×HS427-10) 3套组合的双交F1及F2群体,利用3个纤维长度不同QTLs相关的SSR标记进行辅助选择。结果,用3个标记分别进行单标记辅助选择时,有/无标记单株平均纤维长度之间的差异在3个群体的F1世代中都可以达到显著或极显著水平,并且在F2世代株行中也表现出一定差异,可以稳定表达。当用2个或3个标记同时进行聚合选择时,随着聚合到QTL个数的增多,单株平均纤维长度值增大,选择效果越来越好,但在不同群体中表现有差异。可见,用分子标记辅助选择的方法对棉花纤维长度进行改良是有效的,聚合多个QTLs时,可以达到更好的效果。有必要培育多个基因聚合并纯合的高代重组自交系材料,进一步研究多基因聚合的遗传效应。 相似文献
10.
分子标记辅助选择及其在水稻育种中的应用 总被引：8，自引：1，他引：8
植物育种中分子标记最直接的用途是对性状进行辅助选择(MAS),也就是利用目标性状基因与分子标记之间的紧密连锁关系进行间接选择.MAS不受其它基因效应和环境因素的影响,是对目标性状在分子水平上的一种选择,因此选择结果十分可靠,同时又可避免等位基因间显隐性关系的干扰.MAS一般可在育种早代时期完成,从而大大缩短育种周期,已引起育种学家的广泛关注.该文主要就MAS在不同育种程序中和不同类型目标性状(质量性状和数量性状)进行选择时应用的基本原理进行了阐述,并简要综述了水稻MAS育种所得的一些具体成果. 相似文献
11.
基于人工病圃筛选和分子标记辅助的棉花抗黄萎病育种方法研究与应用 总被引：3，自引：0，他引：3
以抗病性较强的中植372为研究对象,和陆地棉感病品种军棉1号配制组合构建F2作图群体,筛选到和黄萎病抗性紧密连锁的SSR标记NAU1269。选育过程中,以中植372为父本或者母本,通过人工黄萎病病圃对种间杂交、回交、加代选育以及再杂交的材料进行了抗病性筛选,同时每代育种材料均对黄萎病抗性紧密连锁的SSR标记NAU1269进行跟踪检测,筛选出与黄萎病抗病性状紧密连锁的亲本及其后代材料,进而培育出抗黄萎病、产量高、品质优良的中植棉2号、新植5号、中植棉6号、中植棉8号等10余个国审及省审抗(耐)黄萎病棉花新品种。对育成的品种进行检测发现,中植2棉号、中植6棉号、中植8棉号和新植5号均能够检测到与黄萎病抗性紧密连锁的SSR标记NAU1269和已报道的抗黄萎病的分子标记NAU828和NAU1225,而且这3个标记在各个品种材料之间呈共显性分离。结果表明,基于人工病圃筛选和分子标记辅助育种相结合是选育棉花抗黄萎病材料可行、高效的育种方法。 相似文献
12.
Targeted transfer of trait for Verticillium wilt resistance from Gossypium barbadense into G. hirsutum using SSR markers 
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下载免费PDF全文 Zhang Yan Wu Liqiang Li Zhikun Zhang Guiyin Wang Xingfen Ma Zhiying 《Plant Breeding》2016,135(4):476-482
Verticillium wilt (VW) is a soil‐borne disease of cotton that is destructive worldwide. Transferring desired traits from Gossypium barbadense is challenging through traditional interspecific introgression. We previously demonstrated that a molecular marker, BNL3255‐208, is associated with VW resistance in G. barbadense. This breakthrough opens the way for marker‐assisted selection (MAS) breeding. Here, the highly resistant G. barbadense cv. ‘Pima90‐53’ and the severe diseased Gossypium hirsutum cv. ‘CCRI8’ were used as donor parent and recipient parent, respectively. Our goal was to transfer the disease resistance from donor to recipient via MAS. Among 71 MAS obtained lines, as many as 19 lines had enhanced resistance. Among those lines, 11 lines showed high resistance and four lines displayed resistance to VW. Moreover, seven lines displayed improved fibre quality. After combining the markedly improved resistance and fibre properties, we identified two elite innovated introgression lines – ZY2 and ZY31 – that did not seem to differ in other agronomic traits from the recipient parent. This study first successfully transferred of G. barbadense resistance into G. hirsutum by MAS. 相似文献
13.
棉花对黄萎病的抗病机制研究进展 总被引：12，自引：0，他引：12
本文概述了棉花黄萎病抗性的遗传规律和特点，从寄主与病原菌识别的相互作用、组织抗性、生理生化抗性、生态抗性4个方面综述了棉花对黄萎病抗病机制的研究进展。指出真菌诱导子是寄主与病原菌识别和互作的关键因素，不同棉株的固有组织结构抗性和诱导组织结构抗性对黄萎病的抗病表现也不相同；在生理生化抗性上重点介绍了植物抗毒素、酶、糖类物质、激素与棉花抗病性的关系；阐述了棉花对黄萎病的生态抗性，即棉花根系分泌物和根系微生物与黄萎病抗性的相互作用。在这4种抗性中，生理生化抗性起主导作用，但离不开多种抗性机制的相互作用和协调。此外，作者对棉花抗黄萎病分子育种的进展作了概述，简要介绍了RFLP、RAPD、AFLP、SSR等分子标记技术和转基因技术在分子育种中的应用与所取得的进展。最后对棉花黄萎病抗性机制及棉花抗黄萎病分子育种研究的未来发展方向和重点作了展望。 相似文献
14.
利用染色体片段代换系定位棉花抗黄萎病QTL 总被引：3，自引：3，他引：0
通过陆地棉与海岛棉杂交并与陆地棉回交,获得1个染色体片段代换系苏VR043,抗江苏非落叶型黄萎病菌系BP2。分子检测表明,苏VR043兼有陆地棉苏棉8号的遗传背景和海7124的D4染色体片段。以苏VR043和苏棉8号为亲本构建包含176个单株的F2群体,通过标记分析和F2:3家系抗病鉴定,发现抗病性状与标记NAU3392连锁,p值为2.3×10-12。根据棉花D组染色体测序结果,参照置换区段的基因组序列,合成92对SSR引物;PCR扩增分析发现,有5对引物在苏棉8号和苏VR043之间表现多态性,并将抗病主效QTL定位在标记ZHX32和NAU3392之间,标记间遗传距离为3.2 c M,QTL解释表型变异64.8%。同时参照棉花D组测序结果,提取对应的置换区段序列,预测包含63个基因,基因聚类分析表明7个基因参与抗逆反应,其中1个基因与抗病相关。 相似文献
15.
Lu Ningning Zhao Yunlei Wang Hongmei Chen Wei Zhao Pei Gong Haiyan Cui Yanli Sang Xiaohui Zhang Kai 《棉花学报》2019,31(3):254-262
[Objective] The objective of this study was to identify the stable quantitative trait loci (QTLs) related to Verticillium wilt resistance in cotton. [Method] In this study, a population of 111 recombinant inbred lines (RILs) strains was developed by crossing a highly resistant parental line "Changkangmian" to Verticillium wilt and the susceptible parent TM-1. The complete composite interval mapping method was adopted to detect QTLs by Verticillium wilt disease index in multiple environmental conditions and periods in Anyang and Verticillium wilt affected areas of Xinjiang. Simple sequence repeat (SSR) markers of polymorphism were screened for genetic mapping. [Result] The genetic map was constructed by 40 simple sequence repeat (SSR) markers, consisted of 12 linkage groups with total length of 212.5 centimorgan (cM). A total of six QTLs related to the resistance to Verticillium wilt were obtained. The likelihood of odd (LOD) values ranged from 2.51 to 5.55. The maximum phenotypic variation explained (PVE) 20.34%, and the minimum PVE 6.93% were recorded. Among detected QTLs, qVR-D05-1 was detected in both Verticillium wilt affected fields in Anyang and Xinjiang in July 2015 and July 2016 with PVE of 12.96% and 20.34%, respectively. [Conclusion] This study can provide a potential reference for mapping stable QTLs related to resistance to Verticillium wilt. 相似文献
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Marker-assisted selection of Verticillium wilt resistance in progeny populations of upland cotton derived from mass selection-mass crossing 总被引：1，自引：0，他引：1
Cheng-Qi Li Guan-Shen Liu Hai-Hong Zhao Li-Juan Wang Xiao-Fei Zhang Ying Liu Wan-Yang Zhou Liu-Liu Yang Peng-Bo Li Qing-Lian Wang 《Euphytica》2013,191(3):469-480
Two progeny populations of upland cotton derived from mass selection-mass crossing, M3S2F5 and its family lines M3S2F5:6, were generated from 17 hybrid cotton lines derived from regional trials conducted in the Yellow River basin and Yangtze River basin in China. These populations were used to verify 39 reported molecular markers that were related to quantitative trait loci (QTLs) for Verticillium wilt resistance of cotton. Only 12 of 39 markers were polymorphic; 19 had no polymorphisms, and amplification failed for eight markers. The differences in disease grades of aa/AA genotype individuals for five markers, BNL3241, NAU1225, NAU1230, JESPR153, and BNL3031, reached either significant or highly significant levels in at least one population. These markers can thus be effectively used for marker-assisted selection (MAS) of the target trait. Especially for JESPR153 and BNL3031, the differences in disease grades of aa/AA genotype individuals both reached either significant or highly significant levels in the two populations. These two markers should be given preferential consideration when undertaking MAS. The two flanking markers were more effective than the single flanking marker for MAS of single-loci QTL. The selection effect will be greatly enhanced through a reasonable allocation of marker combinations for multi-locus QTL polymerization. When using multi-locus markers for multi-locus QTL-assisted polymerization breeding, the selection effect can be improved progressively by increasing the number of polymerization markers. The possible interaction of different QTLs or genetic backgrounds does not influence the selection effect. A combination of resistant genotypes and disease grade performance enabled final selection of three individuals resistant to Verticillium wilt. 相似文献
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棉花黄萎病菌与抗黄萎病遗传育种研究进展 总被引：21，自引：1，他引：21
简要综述了棉花黄萎病菌及抗黄萎病遗传育种的研究进展。研究表明 ,各地的棉花黄萎病菌均存在致病力的分化 ,其致病机理是病菌侵入棉花后菌丝及孢子在导管内大量繁殖 ,同时刺激邻近的薄壁细胞产生胶状物质及侵填体而堵塞导管 ,使水分和养分运输发生困难 ,更重要的是病菌在棉株体内产生的糖蛋白毒素作用的结果。棉花抗黄萎病的遗传方式争论较大 ,但一般在温室由单一菌系接种鉴定时棉花黄萎病抗性表现为单基因遗传 ,而在田间病圃或用多菌系混合鉴定时 ,棉花黄萎病抗性表现为多基因遗传。由于陆地棉内缺乏高抗黄萎病资源 ,给棉花抗黄萎病育种带来一定困难 ,但 90年代以来 ,已育成 86 - 6、川 73 7、川 2 80 2、豫棉 1 9号、豫棉 2 1号等一些抗黄萎病的新品种。上述抗黄萎病品种在棉花黄萎病综合防治中起了重要作用 相似文献
19.
Soon Jae Kwon Petr Smýkal Jinguo Hu Meinan Wang Sung‐Jin Kim Rebecca J. McGee Kevin McPhee Clarice J. Coyne 《Plant Breeding》2013,132(6):642-648
Fusarium wilt is one of the most widespread diseases of pea. Resistance to Fusarium wilt race 1 was reported as a single gene, Fw, located on linkage group III. The previously reported AFLP and RAPD markers linked to Fw have limited usage in marker‐assisted selection due to their map distance and linkage phase. Using 80 F8 recombinant inbred lines (RILs) derived from the cross of Green Arrow × PI 179449, we amplified 72 polymorphic markers between resistant and susceptible lines with the target region amplified polymorphism (TRAP) technique. Marker–trait association analysis revealed a significant association. Five candidate markers were identified and three were converted into user‐friendly dominant SCAR markers. Forty‐eight pea cultivars with known resistant or susceptible phenotypes to Fusarium wilt race 1 verified the marker–trait association. These three markers, Fw_Trap_480, Fw_Trap_340 and Fw_Trap_220, are tightly linked to and only 1.2 cM away from the Fw locus and are therefore ideal for marker‐assisted selection. These newly identified markers are useful to assist in the isolation of the Fusarium wilt race 1 resistance gene in pea. 相似文献