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四川主栽小麦品种遗传多样性的SSR标记研究 总被引：26，自引：7，他引：26
采用微卫星分子标记 (SSR)对四川省近 5 0年以来年推广面积达 6 6 70 0 hm2 (10 0万亩 )以上的 4 0个主栽小麦品种的遗传多样性进行了研究。结果发现 ,在小麦全基因组 4 2条染色体臂上的 4 6个 SSR位点上 30个 SSR位点 (6 5 .2 2 % )具有多态性。这 4 6个位点共检测到 110个等位变异 ,每个 SSR位点能检测到 1～ 8个 ,平均为 2 .4个。聚类分析表明 ,SSR标记能将 4 0个品种相互区分开。品种间遗传相似系数 (GS)变幅为 0 .4 5 1～ 0 .76 7,平均 GS值为0 .6 0 1。据此认为 ,SSR标记揭示出四川主栽小麦品种具有较高的遗传多样性。各年代间 GS值变化趋势分析表明 ,2 0世纪 70年代后 ,四川小麦的遗传多样性呈明显的下降趋势 相似文献
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为鉴定糙柱花草种质的遗传背景和亲缘关系,提高其利用效率,利用来自不同柱花草种中的16个SSR标记对14份糙柱花草种质进行遗传多样性和聚类分析。结果表明：在16个SSR标记中,10个SSR标记在14份糙柱花草种质间具有多态性。10个多态性SSR标记共检测到32个等位基因,每个标记可检测到2～8个等位基因,平均为3.20个;每个SSR标记的Shannon信息指数(I)和多态性信息含量(PIC)分别为0.191～0.796和0.173～0.769,平均为0.474和0.411。14份糙柱花草种质间的遗传相似系数为0.438～0.938,平均为0.733。聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.74处,14份供试糙柱花草种质可明显被分为3类,其中III类中的CPI 93116柱花草与其他种质遗传关系较远。 相似文献
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分子标记技术在小麦遗传育种中的应用现状 总被引：14，自引：3，他引：11
小麦庞大的基因组使得分子标记技术在小麦中的应用落后于大麦、玉米、水稻等作物。近年来,随着他子标记技术检测系统的发展和完善,分子标记技术在小麦中的应用已有了很大的进展。分子标记技术依靠提供准确、稳定可靠的ＤＮＡ水平的遗传标记,在小麦遗传育种研究中已用于构建遗传图谱、标定和定位目的基因、鉴定与标记外源染色体片段、鉴定品种真实性和纯度、绘制品种指纹图谱、遗传分析、物种演变、标记辅助选育等方面。 相似文献
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江苏淮北地区小麦品种资源遗传多样性的SSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为明确江苏淮北地区小麦品种资源的遗传基础,选用31对SSR标记对107份近年来淮北地区所育小麦材料进行了遗传多样性分析,共检测出170个等位变异,单个引物的等位变异数为3~8个,平均为5.48个;位点多态性信息含量变幅为0.176~0.791,平均为0.543;3个基因组的平均等位变异丰富度及遗传多样性指数均为DBA;江苏淮北5个地区中以徐州小麦材料的平均遗传多样性指数最高(0.613),以淮安小麦材料与江苏淮北另外4个地区的平均遗传距离最小(0.282)。聚类结果表明,品种间遗传距离变幅为0~0.935,平均为0.586,除淮麦20与华瑞0049外,SSR标记能将其他供试材料相互区分开;所有供试材料被聚为3大类,聚类结果与品种(系)的系谱来源比较吻合。 相似文献
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为了明确美国红粒硬质春小麦品种Grandin在小麦育种中的利用价值,对其进行了白粉病抗性基因的鉴定,并利用分子标记进行了定位.遗传分析结果表明,Grandin携带1个显性抗白粉病基因,该白粉病抗性基因与小麦SSR标记位点Xcfd81和Xcfd78连锁,遗传距离分别为0.9 cM和3.3 cM.根据小麦微卫星标记遗传连锁图以及利用中国春第5同源群双端体系对这两个SSR标记位点的定位结果,该抗白粉病基因被定位于小麦染色体5D短臂,与小麦已知抗白粉病基因Pm2的定位结果基本一致.进一步通过标记多态性比较和小麦白粉菌分小种鉴定证实Grandin所含的抗白粉病基因就是Pm2.同时还对Pm2基因的STS标记在不同群体中的实用性进行了讨论. 相似文献
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小麦抗麦红吸浆虫品种遗传多样性的表型和SSR标记分析 总被引：2，自引：0，他引：2
为更深入地揭示小麦抗麦红吸浆虫品种（系）的遗传多样性,从而为进一步选育抗虫品种提供依据,在对田间虫圃1 562份小麦品种（系）损失率鉴定的基础上,取47份年度间鉴定抗性结果较为一致的材料,利用表型和SSR标记,进行遗传多样性分析。这些抗麦红吸浆虫品种农艺性状表现出较大的差异,表型聚类在遗传距离为0.68处将供试材料分为6个类群。19对SSR标记在47份不同抗性品种中检测到104个等位基因,能够将所有品种区分开来,每对引物可以检测到3～8个等位基因,平均5.47个。47个小麦品种间遗传距离为0.40～0.95,平均为0.71。SSR标记聚类分析在遗传距离为0.74处将供试材料分为6大类群。Mental测验结果表明,表型同基因型距离矩阵间存在显著正相关（r=0.76,P〈0.05）。抗虫品种晋麦65号单独聚为一类,同其余品种具有较远的亲缘关系,可作为新的抗源用于抗虫育种,并在吸浆虫发生地块推广种植。 相似文献
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大麦有益基因向普通小麦导入的研究进展 总被引：2，自引：1，他引：2
小麦和大麦是世界上两大麦类栽培作物，小大麦杂交始于1896年，由于其亲缘关系较远，杂交极不易成功。本文较为详细地介绍了小大麦杂交的研究历程，1973年Kruse首次成功地获得小大麦真实杂种，此后Islam及其他学者经过多年努力，先后获得了小大麦附加系、代换系、易位系及其他小大麦重组材料。同时介绍了利用遗传标记进行小麦中大麦染色体的追踪及鉴定过程，具体鉴定方法包括形态标记、细胞学标记、生化标记和分子标记，其中两种以上遗传标记结合起来可使鉴定结果更加准确可靠。本文对小大麦杂交历史的全面回顾，可为进一步利用大麦中的有益基因打下坚实基础。 相似文献
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中国部分优质小麦品种(系)遗传多样性的SSR分析 总被引：2，自引：0，他引：2
为明确中国优质小麦品种(系)间的遗传关系,利用21对SSR引物对75份优质小麦品种(系)进行了遗传多样性分析.结果表明,21对引物共检测到135个等位位点,每对引物等位位点数在2～13之间,平均为6.4个.位点多态性信息含量(PIC)变幅为0.49～0.90,平均为0.76.品种间遗传相似系数(GS)变幅为0.46～0.96,平均为0.66.SSR标记能将75份优质小麦品种(系)分成五大类.聚类分析结果与品种系谱来源及地域比较吻合. 相似文献
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Fusarium head blight (FHB) of wheat is responsible for extensive damage of wheat in humid and semi-humid regions of the world. Presently, FHB of wheat is a minor disease in India but due to global climate change, there is a chance that moist conditions and high humidity resulting from more rainfall during mid-anthesis could increase the susceptibility of wheat to Fusarium infection. For the present study, 27 isolates of three Fusarium spp. viz., Fusarium graminearum, Fusarium verticillioides and Fusarium oxysporum were isolated from naturally infected wheat sampled from Punjab, Himachal Pradesh and Wellington (Tamil Nadu) during 2000–2003. Genomic DNA was isolated from fresh mycelia using the CTAB method. Fusarium spp./isolates were analyzed with four newly developed microsatellite markers (MS-Fg1353, MS-Fg6808, MS-Fg307 and MS-Fg3654) and six previously published microsatellite markers (MS-Fg97, MS-Fc1, MS-Fg103, MS-Fg30, MS-Fg75 and MS-Fg90). All markers amplified a DNA fragment of variable length for different Fusarium spp./isolates. Microsatellite markers, MS-Fg103, MS-Fg103 did not amplify F. oxysporum and F. verticillioides isolates, respectively. MS-Fg307 amplified a fragment of 200 bp with F. graminearum isolates of Wellington. This study has shown that there is considerable genotypic variability among Fusarium spp./isolates causing FHB of wheat in India. 相似文献
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《作物学报(英文版)》2015,(4)
The rich genetic variation preserved in collections of Aegilops tauschii can be readily exploited to improve common wheat using synthetic hexaploid wheat lines. However,hybrid necrosis, which is characterized by progressive death of leaves or plants, has been observed in certain interspecific crosses between tetraploid wheat and Ae. tauschii. The aim of this study was to construct a fine genetic map of a gene(temporarily named Net Jing Y176)conferring hybrid necrosis in Ae. tauschii accession Jing Y176. A triploid F1 population derived from distant hybridization between Ae. tauschii and tetraploid wheat was used to map the gene with microsatellite markers. The newly developed markers Xsdau K539 and Xsdau K561 co-segregated with Net Jing Y176 on chromosome arm 2DS. The tightly linked markers developed in this study were used to genotype 91 Ae. tauschii accessions. The marker genotype analysis suggested that 49.45% of the Ae. tauschii accessions carry Net Jing Y176. Interestingly, hybrid necrosis genotypes tended to appear more commonly in Ae. tauschii ssp. tauschii than in Ae. tauschii ssp. strangulata. 相似文献
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中国冬、春性小麦品种遗传多样性的微卫星标记分析 总被引：3，自引：0，他引：3
为了明确中国目前各麦区育成品种的遗传基础,为育种工作者提供育种材料的遗传变异信息,利用141对SSR标记对中国冬、春麦区的73份小麦材料进行了遗传多样性分析,共检测出513个等位位点,每对引物等位变异数为2～10,平均为3.61;多态性信息指数(PIC)为0.08～0.88,平均为0.60.遗传距离(GD)为0.12～0.48,平均为0.35.聚类分析结果显示,73个品种聚为四大类11个组,在一定程度上反映了供试材料的冬春性差异及品种之间的亲缘关系.对7个部分同源群多样性的比较结果表明,4和6两个部分同源群多样性较低.并对小麦品种遗传基础狭窄的原因以及拓宽中国小麦品种遗传基础的可能途径进行了讨论. 相似文献
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三粒小麦每朵小花通常可以结三粒种子。三粒小麦被认为是普通小麦"甘麦8号"的自然突变体,但一直缺乏分子证据。为了探讨三粒小麦与甘麦8号的亲缘关系,本研究利用SSR标记对三粒小麦、甘麦8号及其姊妹系等16份小麦材料进行了遗传多样性分析,63对引物共扩增出275条多态性带;遗传相似性分析表明,三粒小麦与甘麦8号之间未表现出更近的遗传距离;聚类分析将三粒小麦单独聚在一个亚组,而甘麦8号、甘麦8号的姊妹系及其亲本聚在另一个亚组,说明三粒小麦不一定来源于甘麦8号的自然突变。 相似文献
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小麦EST-SSRs分子标记的特性及其遗传作图 总被引：1，自引：0，他引：1
为了解普通小麦EST来源的微卫星的多样性,从大约1 000个包含微卫星的ESTs中设计了300对引物,研究和评估了它们的多态性水平,并且将多态性标记加入到现有的遗传图谱中.在五种不同类型的重复单元中,三个碱基的重复单元出现最多,占到77%.几乎所有的EST SSRs标记(99.3%)的重复单元都含有G-C碱基对.37.4%的微卫星都是四次重复.对于扩增和多态性,300对引物中有60对没有扩增,21.3%的扩增引物没能产生预期的扩增片断.58%的标记至少在所用8个材料的一个中显示出多态性.W7984和Opata组合表现出最高的多态性水平.大多数普通小麦EST-SSRs标记的重复次数小于10,并且4次重复是最为普遍的.81个新的EST-SSR位点被添加到两个已有的参照遗传图谱中(62个加到ITMI,19个加到CTCS).研究结果表明小麦EST-SSRs标记展示了一些不同于基因组微卫星的特异特征,在标记发展和其他遗传应用中,这就使得它们能够成为一种非常有价值的资源. 相似文献
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为了从分子水平上明确江苏省小麦品种资源的遗传多样性水平,选用138对微卫星分子标记(SSR)对江苏省近40年来的90份主栽小麦品种的遗传多样性进行研究。结果表明,在90份主栽品种中,138个SSR位点共检测到542个等位变异,平均每个位点有3.93个等位变异,变化范围2~11;多态性信息含量(PIC值)变化范围为0.032 6~0.824 5,平均为0.415 1;基因组的平均等位变异及PIC值均为BAD;对90个品种按照所应用的麦区可分为淮北麦区品种(45个)和淮南麦区品种(45个),淮北麦区品种平均PIC值为0.428 7,淮南麦区品种平均PIC值为0.356 6,淮南麦区品种基因多样性和PIC值显著低于淮北麦区,并且不同时期淮北和淮南麦区品种的遗传多样性也存在不同的变化趋势。 相似文献
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利用微卫星标记定位一个新的小麦抗白粉病基因 总被引：2，自引：0，他引：2
小麦农家品种ZB90是一个广谱抗白粉病材料.苗期和成株期鉴定表明,其白粉病抗性由显性单基因控制.从位于不同染色体上的53对微卫星引物中筛选出3对引物(Wms382、Wms311和Wms312),对144株F2分离群体进行抗病连锁性分析.另外,与Pm4a共分离的STS标记STS-470也被用于基因定位.这4个标记和抗病基因在染色体上的顺序为:基因位点-Xgwm382-Xgwm311-STS-470-Xgwm312,它们之间的遗传距离分别为2.9、4.5、23.1和49.6 cM,与小麦染色体2AL上已构建的微卫星图谱顺序一致.根据材料来源和抗病基因的染色体定位结果,确定该基因为一个新的小麦抗白粉病基因,并命名为PmZB90.文中还讨论了PmZB90和其他位于染色体2AL上的基因之间的关系. 相似文献
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Tapinoma indicum (Forel) (Hymenoptera: Formicidae) is a nuisance pest in Asia countries. However, studies on T. indicum are limited, especially in the field of molecular biology, to investigate the species characteristic at the molecular level. This paper aims to provide valuable genetic markers as tools with which to study the T. indicum population. In this study, a total of 143,998 microsatellite markers were developed based on the 2.61 × 106 microsatellites isolated from T. indicum genomic DNA sequences. Fifty selected microsatellite markers were amplified with varying numbers of alleles ranging from 0 to 19. Seven out of fifty microsatellite markers were characterized for polymorphism with the Hardy–Weinberg equilibrium (HWE) and linkage disequilibrium (LD) analysis. All seven microsatellite markers demonstrated a high polymorphic information content (PIC) value ranging from 0.87 to 0.93, with a mean value of 0.90. There is no evidence of scoring errors caused by stutter peaks, no large allele dropout, and no linkage disequilibrium among the seven loci; although loci Ti-Tr04, Ti-Tr09, Ti-Te04, Ti-Te13, and Ti-Pe5 showed signs of null alleles and deviation from the HWE due to excessive homozygosity. In conclusion, a significant amount of microsatellite markers was developed from the data set of next-generation sequencing, and seven of microsatellite markers were validated as informative genetic markers that can be utilized to study the T. indicum population. 相似文献
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《Journal of Crop Improvement》2013,27(1):113-143
Summary Microsatellites are tandem repeats of short sequence motifs that occur ubiquitously in eukaryotic genomes. A key feature of this class of repetitive DNA is an extraordinarily high level of variation among taxa, mainly expressed as a variable copy number of tandem repeats. A multitude of techniques were described that exploit microsatellite variability as molecular markers. Basically, these approaches can be classified into four different experimental strategies. (1) Oligonucleotides complementary to microsatellites are used as hybridization probes for multilocus RFLP fingerprinting. (2) Microsatellite-complementary oligonucleotides serve as PCR primers, either alone or in combination with arbitrary primers, to amplify certain regions of genomic DNA. (3) (Non)radioactively labelled microsatellite motifs are hybridized to electrophoretically resolved RAPD fragments, resulting in new and unexpected banding patterns on the autoradiograms. (4) Length variation of individual microsatellite loci is analyzed by PCR with a pair of locus-specific flanking primers. In the present review, we will summarize the principles, advantages and limitations of the different microsatellite-based marker techniques developed so far. Appropriate application areas are discussed for each type of marker, and typical results are exemplified by our own research on chickpea (Cicer arietinum), an important grain legume of the Eastern Mediterranean region and the Indian subcontinent. Locus-specific microsatellite analysis is currently the method of choice for creating almost optimal molecular markers, and is discussed in more detail. 相似文献