利用小RNA深度测序和组装技术鉴定紫藤花叶病病原     

苏秀  徐毅  陈莎  傅帅  钱亚娟  张立钦  周雪平 《植物病理学报》2015,45(1):88-92

<正>RNA沉默(RNA silencing)是一种在真核生物体内普遍保守的基于核酸序列特异性抑制基因表达的调控机制[1]。2009年Kreuze等[2]发现病毒特异的小RNA(small RNA,sRNA)在序列上是重叠的,因此推测通过深度测序技术获得的大量sRNA序列能用来组装病毒的基因组并用来鉴定和发现新病毒。利用sRNA深度测序技术已在作物和昆虫上鉴定发现多种病毒[3、4],但在木本植物上还未见报道。  相似文献   

葡萄灰皮诺病毒微滴数字RT-PCR检测方法的建立     

赵晓丽  齐玮  骆卫峰  张永江  郑祖亮  邓丛良 《植物保护学报》2020,47(2):457-458

正葡萄灰皮诺病毒(Grapevine Pinot gris virus,GPGV)最早于2012年由意大利研究人员利用高通量测序技术发现(Giampetruzzi et al.,2012),该病毒可引起葡萄叶片褪绿、斑驳、皱缩、变形等症状,导致葡萄植株发育不良、成熟期延迟、产量降低、果实腐烂,还可与其它病毒共同作用产生复合负面效应。目前,葡萄灰皮诺病毒病尚缺乏有效防治药剂,为防控该病毒病的发生和传播,本研究拟设计特异性引物  相似文献   

甘薯杆状DNA病毒B的分子检测及外壳蛋白CP基因的原核表达     

李学成  张振臣  乔奇  秦艳红  王爽  郑文明 《植物保护学报》2016,43(2):345-346

<正>甘薯杆状DNA病毒B(Sweetpotato badnavirus B,SPBV-B)是花椰菜花叶病毒科杆状DNA病毒属Badnavirus的一个暂定种。Badnavirus病毒粒体为杆状,主要分布在热带和亚热带地区,由带毒寄主植物的无性繁殖材料传播,传毒昆虫介体主要是粉蚧(洪健等,2001)。Kreuze et al.(2009)利用小RNA深度测序法获得了SPBV-B的基因组全序列,全长为7 991 bp,含5个ORFs。目前,我国尚未见有关  相似文献   

畸形桑叶中病毒的鉴定及其小RNA特征分析     

孔卫青  凌君  杨金宏 《植物保护》2022,48(5):251-255

从安康市桑园采集了68份畸形桑树叶片样品, 利用PCR扩增检测鉴定其中存在4种病毒, 分别是桑花叶型萎缩病相关病毒(mulberry mosaic dwarf-associated virus, MMDaV)?桑花叶卷叶病相关病毒(mulberry mosaic leaf roll associated virus, MMLRaV)?桑花叶萎缩类病毒(mulberry mosaic dwarf viroid, MMDVd)和桑潜隐病毒(mulberry cryptic virus, MuCV), 存在复合侵染?对4种病毒复合侵染桑叶进行小RNA深度测序和分析, 结果显示其中的sRNA来自MMDaV?MMLRaV?MMDVd?MuCV 4种病毒, 与RT-PCR检测结果一致?进一步分析sRNA长度和5′-末端序列, MMDaV sRNA长度以24 nt最多, 其他病毒sRNA主要为21 nt?MMDaV基因组链sRNA 5′-末端以A和T为主, MuCV以C最多, MMLRaV和MMDVd一致, 均以T最多?  相似文献   

两种柑橘新病毒双重RT-PCR检测体系的建立及应用     

周彦  陈洪明  王雪峰  唐杰  金鑫  周常勇 《植物保护学报》2017,44(4):699-700

正柑橘黄化脉明病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)和柑橘褪绿矮化病毒(Citrus chlorotic dwarf-associated virus,CCDaV)是2种最近在我国发生的柑橘病毒(Chen et al.,2014;Guo et al.,2015),主要通过带病苗木和昆虫传播(陈洪明等,2015),对我国柑橘产业造成了严重损失。目前尚无防治CYVCV和CCDaV的药剂,种植无病毒苗木和加强病害检测是重要的防治途径。当前虽已建立了CYVCV和CCDaV的RT-PCR检测方法(Loconsole et al.,2012;陈洪明等,2015),但鉴于田间可能存在  相似文献   

侵染大豆的花生斑驳病毒公主岭分离物基因组测序及分析     

张春雨  李小宇  王晨  战笑蕾  刘建青  王永志 《植物保护》2022,48(1):61-65

本研究利用小RNA深度测序法在大豆叶片上检测到1株花生斑驳病毒Peanut mottle virus (PeMoV),根据小RNA深度测序结果和GenBank公布的PeMoV基因组序列设计引物克隆了PeMoV公主岭分离物(PeMoV-Gongzhuling)的基因组序列.测序结果经拼接后获得了PeMoV-Gongzhu...  相似文献   

基于DPO引物的SYBR Green Ⅰ实时荧光RT-PCR检测葡萄卷叶伴随病毒3号     

《植物保护学报》2017,(2)

正葡萄卷叶病是葡萄上一种重要的病毒病,在国内分布较为普遍,引起该病的葡萄卷叶伴随病毒(Grapevine leafroll-associated virus,GLRaV)是由多种病毒单独或复合侵染造成。已报道的GLRaVs至少有5种,其中GLRaV-3是葡萄卷叶病毒属Ampleovirus典型成员(Ling et al.,2004)。目前,检测GLRaV-3的方法主要有指示植物法、酶联免疫吸附法、  相似文献   

‘阳光玫瑰’葡萄中主要葡萄病毒病原的检测   总被引：2，自引：0，他引：2  

娄兵海  白先进  宋雅琴  白扬  王博  陈爱军 《植物保护学报》2017,44(2):345-346

正葡萄病毒病可以造成葡萄植株长势衰退、产量降低,甚至死亡。对葡萄上发生的病毒种类和侵染情况进行研究,可为我国葡萄病毒病防控策略的制定提供科学依据。‘阳光玫瑰’(Shine Muscat)葡萄是日本国家果树科学研究所选育的新品种(Yamada et al.,2008),引入我国后在各地栽培过程中普遍表现出叶片反卷、畸形、褪绿斑驳、透明斑等类似病毒病的症状,严重影响果实产量和品质,目前尚无关于  相似文献   

基于DPO引物的SYBR Green I实时荧光RT-PCR检测葡萄卷叶伴随病毒3号     

乾义柯  张娜  魏霜  陆平  张祥林 《植物保护学报》2017,44(2):343-344

葡萄卷叶病是葡萄上一种重要的病毒病,在国内分布较为普遍,引起该病的葡萄卷叶伴随病毒(Grapevine leafroll-associated virus,GLRaV)是由多种病毒单独或复合侵染造成.已报道的GLRaVs至少有5种,其中GLRaV-3是葡萄卷叶病毒属Ampleovirus典型成员(Ling et a1.,2004).目前,检测GL-RaV-3的方法主要有指示植物法、酶联免疫吸附法、分子生物学检测法等,而这几种技术均存在不足.SYBR Green Ⅰ实时荧光RT-PCR技术关键要避免引物之间、引物与其它模板之间的非特异性互作干扰.由于DPO引物自身以及引物之间很少形成二级结构且对退火温度不敏感等特点(Chun et al.,2007),因此,本研究结合SYBR Green和DPO引物的各自优点,建立一种特异性强、灵敏度高的GL-RaV-3检测方法,以期为葡萄卷叶病毒的快速检测及预防提供技术支持.  相似文献   

河南省芝麻花叶病病原的分子鉴定     

施艳  史亚娟  王英志  孙虎  王振跃 《植物保护学报》2015,42(5):861-862

<正>芝麻是我国主要的油料作物,引起芝麻黄化花叶等症状的芝麻花叶病病原是马铃薯Y病毒属花生条纹病毒芝麻分离物(peanut stripe virus sesame isolate,PSt V-se)(杨书军等,1993;晏立英等,2009),且国外也研究发现芝麻花叶病病原是马铃薯Y病毒属的成员之一(Sreenivasulu et al.,1994;Pappu et al.,1997)。河南省作为芝麻主产区之一,引起当地芝麻花叶病的病原尚不清楚,本试验通过采集河南  相似文献