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1.
DNA甲基化对基因表达具有重要的调控作用。本研究采用甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)技术对11个不同湿地松×洪都拉斯加勒比松子代及亲本进行甲基化和表观遗传分析。结果表明内侧胞嘧啶的甲基化为湿加松及亲本DNA甲基化主要模式,其中8个杂交组合内侧胞嘧啶的甲基化相对高于亲本中值,不同组合后代之间在CCGG位点胞嘧啶的甲基化水平上存在差异,但差异不显著。进一步分析表明内侧胞嘧啶甲基化与湿加松生长性状表型值及杂种优势值呈负相关关系,但相关关系不显著;与生长性状特殊配合力呈正相关关系,其中与胸径特殊配合力相关关系显著。本研究为湿加松杂种优势与表观遗传分析提供参考。 相似文献
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中棉所12配制的2个杂交棉DNA甲基化遗传与传递 总被引：1，自引：0，他引：1
DNA甲基化在真核生物的生长发育过程中起着重要的调控作用。本研究用MSAP方法分析了中棉所12配制的2个杂交棉和亲本不同发育时期的基因组DNA 5′-CCGG位点胞嘧啶的甲基化水平及其遗传传递模式。研究表明: (1)杂交棉及其亲本不同发育时期的胞嘧啶甲基化水平不同,随着生育期的逐步推进,出现两头低而中间高现象;(2)两个杂交棉组合的DNA 甲基化总体水平为12.41%~20.05%,其中以内侧胞嘧啶全甲基化为主(约占6.90%~11.47%);(3)棉花中绝大多数CCGG胞嘧啶甲基化位点是由亲本稳定遗传给杂交种的,但杂交棉仍有1.14%~3.39%的位点显示了变异,其变异频率在不同亲本组合之间和不同发育时期都存在差异;(4)对甲基化差异条带测序分析发现,其功能涉及到富含亮氨酸重复、类PDR的ABC转运蛋白、GTP结合蛋白、病程相关蛋白、磷酸激酶、功能未知的蛋白质和反转录酶等,部分差异序列没有产生有意义的匹配。 相似文献
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利用MSAP(甲基化敏感扩增多态性)技术对11株叶籽银杏的胞嘧啶甲基化水平和模式进行评估。结果表明,叶籽银杏基因组的CCGG序列中检测到36.86%～46.43%的DNA发生甲基化。本研究从36对选扩增引物中筛选出14对引物组合,共得到2879条清晰可辨的带,叶籽银杏总体平均DNA基甲基化水平为42.14%,甲基化模式以内侧胞嘧啶为主,其中,外侧胞嘧啶甲基化水平为11.90%～23.90%,内侧胞嘧啶甲基化水平为17.03%～28.37%。UPGMA聚类分析和主成分分析结果一致,不同单株的叶籽银杏可分为3大类。推断叶籽银杏的变异机制可能与DNA甲基化有关。 相似文献
4.
自交不亲和系植株的种子往往出现退化现象,为了研究种子的退化现象是否与甲基化相关,因此本文采用甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism, MSAP)技术,以羽衣甘蓝自交不亲和系9#种子、自交亲和系14#种子为研究对象,对其生长发育过程种子基因组DNA甲基化水平变化情况进行研究。采用改良的CTAB法提取种子萌发不同时期DNA,然后通过MSAP分析、统计扩增条带,比较二者之间的差异。对9#种子DNA甲基化状态分析表明,萌发前期(0~2 d)发生甲基化位点数目持续增多,但萌发后期(2~8 d)发生去甲基化的数目大量增加,整个萌发期去甲基化位点数目是甲基化位点数目的11倍,说明9#种子萌发过程中DNA甲基化修饰是基因表达的重要调控方式之一;在相同发育时期,9#在总甲基化、全甲基化、半甲基化水平上均不同程度高于14#。随着种子的萌发,9#全甲基化水平明显上升,半甲基化水平几乎不变,而14#变化趋势与9#相反,半甲基化水平明显上升,全甲基化水平几乎不变. 相似文献
5.
小麦与叶锈菌互作前后基因组甲基化模式分析 总被引：2，自引：0，他引：2
首次使用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术分析两种小麦材料近等基凶系TcLrl9及其感病亲本Thatcher 的甲基化水平,同时比较了苗期接种叶锈菌生理品种THlTr前后基因组DNA胞嘧啶甲基化模式.60对选扩引物对接种前后的小麦DNA进行全基因组筛选,共得到3 554个片段.其中998个片段是两种甲基化模式中的一种,小麦近等基因系TcLr19及其感病亲本Thatcher的甲基化水平约为28.1%.在所有的引物中,并没有直接分离得到接菌前后的甲基化模式的差异.结果初步表明,叶锈菌可能并没有诱导植物基因组DNA胞嘧啶位点的甲基化模式变化. 相似文献
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巴西橡胶树DNA甲基化的MSAP分析 总被引：1，自引：0，他引：1
本文采用"甲基化敏感扩增多态性"(Methylation Sensitive Amplification Polymorphism,MSAP)的分析方法,在全基因组水平检测巴西橡胶树DNA甲基化位点,确定巴西橡胶树基因组DNA甲基化模式和水平。结果表明:16对MSAP引物选择性扩增,共扩增262条带,其中甲基化位点87个,甲基化比例为33.21%,其中,半甲基化位点为32个,比例为12.22%;全甲基化位点为55个,比例为20.99%。对部分巴西橡胶树基因组甲基化位点进行回收,最终分离了18条存在甲基化的基因组DNA序列。BLAST比对后,同源分析表明巴西橡胶树基因组中包括转录因子、蛋白激酶等在内的多种类型的DNA序列中均存在甲基化现象。本研究为深入研究巴西橡胶树的DNA甲基化奠定基础。 相似文献
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《华北农学报》2015,(Z1)
DNA甲基化在植物的生长发育中具有重要的调控作用,它是植物正常生长发育所必需的。采用甲基化敏感扩增多态性(Methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)技术,以羽衣甘蓝自交不亲和系9#种子为研究对象,从表观遗传学的角度,对其生长发育过程以及高压静电场处理条件下基因组DNA甲基化水平及模式变化情况进行研究,探讨自交不亲和系种子退化现象与表观遗传规律的相关性。结果表明,自交不亲和系9#种子经高压静电场处理后,同时发生甲基化与去甲基化事件,以去甲基化为主。其中全甲基化水平略有升高,半甲基化水平下降明显,总甲基化水平下降;通过记录和计算种子在萌发过程中的各项指标,结果表明,高压静电场可促进9#种子的萌发和幼苗的生长发育,改善种子品质,表明高压静电场处理是恢复或延迟羽衣甘蓝自交不亲和系退化种子生长势,保持自交后代品质的有效手段之一。 相似文献
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为了解新疆AL型三系杂交小麦亲本间配合力及其杂种优势关系,利用稳定不育系8份,恢复力强的恢复系9份,按照NCⅡ不完全双列杂交(8×9)设计配制72个F1杂交组合,对亲本及杂交组合的7个农艺性状进行配合力效应和杂种优势分析,再根据亲本性状和一般配合力划分杂种优势类群。结果表明,三系小麦杂交组合中普遍存在产量和产量性状杂种优势,针对强优势组合的亲本选择,双亲之一一般配合力(GCA)或双亲GCA之和为正值且相对较大;相关性分析表明,中亲优势与父本和母本GCA值之和呈极显著正相关,父本和母本的GCA相关性大于特殊配合力(SCA)相关性。针对6个性状的GCA效应值和性状表型值分别进行聚类分析表明,配合力距离远的亲本组配可能出现强优势杂交组合的几率较大,性状表型值距离较远的两个亲本同一性状之间的优势互补也可以在后代中表现出较强的杂种优势。将17个亲本划分为4个和5个类群,为后续AL型杂交小麦强优势杂交组合的配制提供了依据。 相似文献
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Alterations in inheritance pattern and level of cytosine DNA methylation,and their relationship with heterosis in rice 总被引：2，自引：0，他引：2
K. Sakthivel K. Girishkumar G. Ramkumar V. V. Shenoy S. T. Kajjidoni P. M. Salimath 《Euphytica》2010,175(3):303-314
Novel hybrid-specific/heterotic gene expression patterns observed from expression studies suggest the need to characterize
the underlying regulatory mechanism(s) to reveal the biological basis of heterosis in crop plants. To gain an insight into
the molecular basis of heterosis in rice, we investigated the inheritance pattern and level of cytosine methylation, a major
epigenetic regulatory mechanism, in the leaf tissue of an elite Indian rice hybrid KRH2 and its parents at three stages (15 day-old,
35 day-old seedling and flag leaf) and their correlation with heterosis using methylation-sensitive amplification polymorphism
(MSAP) technique. In contrast to parents, the level of methylation was high during initial growth stages and reduced as the
hybrid grew. Even though, a majority of cytosine methylation profiles were transmitted to hybrid at all stages, a considerable
level (25.4%) of cytosine methylation pattern was observed to be novel in hybrid and some of these altered loci were identified
to code for known/hypothetical proteins. It was also observed that demethylation events occurred more predominantly during
early stages than hypermethylation while the frequency of demethylation events decreased in flag leaf with a remarkable increase
in hypermethylation in the hybrid. These bi-directional events in methylation in KRH2 were validated in six hybrids with different
levels of grain yield heterosis and the level of cytosine methylation in the hybrid was observed to be significantly correlated
with heterosis. 相似文献
12.
5-氮杂胞苷是一种DNA甲基化抑制剂,可以通过降低DNA的甲基化水平来调节基因的表达,从而对生物的生长发育进行表观遗传调控,其在动物与医学领域已有广泛的研究与应用,近年来在植物基因表达调节方面的研究与应用报道也逐渐增多。本研究对植物DNA甲基化的类型、引发、影响因素和抑制剂的作用进行了概述,重点对5-氮杂胞苷对植物基因表达水平的调节和作用效果进行了阐述。并对其在水稻、小麦、棉花等重要作物生长发育、逆境适应、育性调节及次生代谢的影响与作用进行归纳,可为植物基因表达表观调节研究与应用提出新的关注点。 相似文献
13.
DNA methylation,especially methylation of cytosine in eukaryotic organisms,has been implicated in gene regulation,genomic imprinting,the timing of DNA replication,and determination of chromatin structure.It was reported that 6.5% of the whole cytosine residues in the nuclear DNA in higher plants were methylated.The methylation of cytosine in plant nuclear DNA occurs usually in both CpG and CpNG sequences,and the methylation state can be maintained through the cycles of DNA replication and is likely to play an integral role in regulating gene expression. 相似文献
14.
用杂交油菜黔油12号的父母本及杂交种作材料，对亲本和杂交种的产量、经济性状考察和DNA多态性标记，进行杂种优势的研究和比较。结果表明：产量、经济性状中亲优势、超亲优势、杂种优势指数与DNA多态性预测杂种优势的中亲优势、超亲优势、杂种优势指数结果趋势基本一致。笔者认为大多育种者在一定时期内，一般以核心亲本或骨干（系）亲本作为育种的主要材料，利用DNA多态性表达亲本的遗传差异的显著特点，提出以核心亲本建立1个DNA多态性图谱库，不断补充新材料和新引物的DNA多态性结果，用分子标记预测杂种优势值得进一步研究和探讨。 相似文献
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全基因组倍增或多倍化, 伴随着基因丢失和二倍化进程, 被认为是植物进化的重要推动力量。DNA甲基化与miRNA的表观遗传调控机制在植物生长发育及进化过程中起着重要的作用。本文采用MSAP (甲基化敏感扩增多态性)技术分析同一双胚苗水稻来源的单倍体、二倍体及其杂交F1的基因组DNA 5'-CCGG位点胞嘧啶的甲基化及遗传特点。对部分甲基化位点进行切胶、回收、测序及功能注释, 并结合miRNA靶基因预测探讨特定甲基化位点的遗传特点及其与miRNA的相关性。16对选择性扩增引物在双亲及杂交F1中共检测了462个DNA甲基化位点, 杂交F1甲基化水平平均为43.20%, 与双亲相差不大(单倍体为46.75%, 二倍体为41.99%)。以TargetFinder软件分析发现其中的7个甲基化位点基因序列上存在1~4个miRNA的结合位点, 这些基因的功能注释包括逆转录转座子蛋白、ras相关蛋白、H2A/H2B/H3/H4核心组蛋白等。同时, 探讨了逆转录转座子在植物进化中的作用。研究结果为进一步阐明水稻基因组倍增过程中DNA甲基化与miRNA的关系提供了参考。 相似文献
16.
Yuanqian Wang Kaixin Zhang Lifang Sun Xiao Han Sujie Fan Xueying Li Yiwei Qu Dan Yao Piwu Wang Jun Zhang 《Euphytica》2018,214(5):85
In order to well understand the molecular basis of heterosis in soybean, the methylation-sensitive amplification polymorphism (MSAP) method based on capillary electrophoresis was used to estimate levels and patterns of cytosine methylation in 15-day post-emergence leaves of four parental lines [Jilin 47 (no. 19), EXP (no. 12), Jilin 38 (no. 3) and Yi 3 (no. 6)] and 12 hybrids [Jilin 38 × Yi 3(3 × ?6), Jilin 38 × ?EXP(3 × ?12), Jilin 38 × ?Jilin 47(3 × ?19), Yi 3 × ?Jilin 38(6 × ?3), Yi 3 × ?EXP(6 × ?12), Yi 3 × ?Jilin 47(6 × ?19), EXP × Jilin 38(12 ×?3), EXP × Yi 3(12 × ?6), EXP × ?Jilin 47(12 × ?19), Jilin 47 × ?Jilin 38(19 × ?3), Jilin 47 × Yi 3(19 × 6), Jilin 47 × EXP(19 × 12)]. In addition, 12 traits of the hybrids and their parents were also analyzed to understand the relationship between DNA methylation variation and heterosis. MSAP results showed that the total relative methylation level of all hybrids was lower than the corresponding middle parent value, indicating that the methylation degree was decreasing. And may express a variety of genes related to the phenotypic variation of hybridization. Moreover, the hemi-methylation levels of Jilin 38 × Jilin 47 and Yi 3 × Jilin 47 hybrids and full-methylation levels of EXP × Yi 3 and EXP × Jilin 47 hybrids was significant higher than the corresponding mid-parent values. In addition, the heredity of methylation from parents in hybrids is more than the variations, in which there were four types appeared great higher: A1, B4, B8, and D2. Furthermore, the results of relationship between genetic variation in DNA methylation and heterosis showed that the hypo-methylation had a promoting effect to increase node number, and the hype-methylation of hybrids was helpful to add to stem thick. Our results may provide new insights into well understanding the molecular mechanisms of heterosis at the epigenetic level in soybean. 相似文献
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Heathcliffe Riday E. Charles Brummer T. Austin Campbell Diane Luth Patricia M. Cazcarro 《Euphytica》2003,131(1):37-45
Biomass yield heterosis has been shown to exist between Medicago sativasubsp. sativa and Medica gosativa subsp. falcata. The objective of this study was to gain a better understanding of what morphological and genetic factors were most highly
correlated with total biomass yield heterosis. We calculated genetic distances among nine sativa and five falcate genotypes
based on amplified fragment length polymorphism (AFLP) and simple sequence repeat (SSR) DNA markers. Genetic distance did
not correlate with specific combining ability (SCA) or mid-parent heterosis. In contrast, a morphological distance matrix
based on seventeen agronomic and forage quality traits was significantly correlated with heterosis; the agronomic traits of
maturity, midseason regrowth, and autumn regrowth showed strong association with heterosis. Heterosis was also correlated
with subspecies. We suggest that in many cases progeny heterosis can be accounted for by the interaction of genes controlling
morphologically divergent traits between the parents. In other cases, progeny heterosis could also be due to divergence between
the parents at particular genetic loci that do not control field-level phenotypic differences. Genetic distanceper se between parental genotypes, based on neutral molecular markers, however, does not reflect the potential of individual genotypes
to produce heterosis in their progeny.
This revised version was published online in August 2006 with corrections to the Cover Date. 相似文献
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黄鳝Dmrt3基因在性腺中的甲基化差异 总被引：1，自引：0，他引：1
DNA甲基化修饰是真核生物最常见的表观遗传现象之一,是一种可逆的过程,能够直接影响到基因的活性。黄鳝具有性逆转的特点,对于黄鳝的性别控制相关基因我们选择了Dmrt3基因,该基因已经证明在鱼类雌雄性腺中存在表达差异。黄鳝的Dmrt3基因编码的mRNA全长为1413bp,编码470个氨基酸。我们通过比较Dmrt3基因在雌雄性腺中甲基化状态就可以简单了解这些基因的开关状况。用甲基化敏感的限制性内切酶Hpa II酶切黄鳝的雌雄性腺,根据已知的mRNA序列设计相关引物扩增酶切产物,与未酶切的对照组进行比较,分析差异条带并验证结果,发现Dmrt3-FR2扩增序列中,精巢是去甲基化的,而卵巢是甲基化状态。所以此位点很可能与性别调控相关。本实验为黄鳝性别调控的相关研究提供一种分子学角度的方法。 相似文献