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运用RAPD技术分析60份亚麻种质资源的遗传多样性。结果表明:从供试材料中筛选到具有多态性的RAPD引物11条。RAPD引物共扩增到71条清晰的多态性条带,多态性比率(PPB)为88.8%。对标记结果进行类平均法(UPGMA)聚类分析,在GD为0.41时60份亚麻品种聚为7类。 相似文献
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新疆梨种质资源亲缘关系的ISSR和RAPD分析 总被引:3,自引:0,他引:3
[目的]探讨新疆梨种质资源亲缘关系以及遗传多样性,旨在为供试梨资源的分类提供科学依据.[方法]采用ISSR和RAPD分子标记对48份梨种质资源进行聚类分析和遗传关系研究.[结果]14条ISSR引物共扩增出113条清晰的谱带,其中101条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.19条RAPD引物共扩增出163条清晰的谱带,其中多态性谱带138条,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.基于ISSR和RAPD两种标记,利用UPGMA分别构建了48份梨资源的聚类树状图.ISSR和RAPD分别聚类以及两种标记混合聚类均将48份梨种质分为3类:第Ⅰ类群中包括1份种质;第Ⅱ类群中包括23份种质;第Ⅲ类群中包括24份种质.[结论]两种标记适合于梨种质资源亲缘关系和遗传多样性分析,可为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据. 相似文献
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[目的]利用RAPD标记分析葱属7个栽培品种的遗传多样性。[方法]采取改良CTAB法提取植物的总DNA,从68个RAPD引物中筛选出25条具有多态性且扩增稳定的引物用于品种的DNA多态性分析,采用优化后的RAPD的PCR反应体系进行PCR扩增。利用MEGA4软件进行各品种间UPGMA聚类分析。[结果]从25个引物中共扩增出245条DNA带,其中99条为多态性带。根据聚类分析,葱属7个栽培品种可分为2类:汉中冬韭、阜丰1号和豫韭2号为1类;其他4个为1类,其中怀化大蒜和南宁大蒜、连葱6号和杭州分葱各为1小类;7个品种的相似系数范围为80.2%~99.8%。该聚类结果与依据表型特征的传统分类的结果一致。[结论]该研究为准确地进行葱属植物种质资源的鉴定、筛选和利用提供了科学依据。 相似文献
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[目的]研究甘肃枸杞属植物种间亲缘关系。[方法]提取甘肃省内分布的枸杞属植物的基因组DNA,用RAPD方法检测其DNA多态性,并用UPGMA聚类法对其种间关系进行分析。[结果]从80条10碱基的随机引物中筛选出了28条适用于枸杞属植物RAPD分析的引物。在6份种质材料中共扩增出了171条带,其中118条为多态性条带,多态性条带的比例为69.0%;遗传相似性系数在0.39~0.70之间,平均值为0.59。[结论]聚类分析显示6份甘肃枸杞属种质材料中宁夏枸杞、北方枸杞和截萼枸杞亲缘较近,中国枸杞和新疆枸杞亲缘较近,黑果枸杞与其他种质间遗传距离较远。 相似文献
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[目的]对椰子遗传多样性进行深入研究,为进一步开发利用椰子种质资源奠定基础。[方法]利用80个10碱基随机引物,对从中国海南、云南、广东、广西等椰子种植区所采集的67个椰子种质进行随机扩增,以筛选适合于对所有椰子品种进行RAPD分析的引物。[结果]共筛选出30条能扩增出条带清晰、明亮、具多态性且重复性好带型的有效引物。12个随机引物在所有样品中共扩增出340条带,即检测到340个椰子RAPD位点,其中307个位点为多态性位点,占总位点的90.3%。[结论]利用RAPD标记技术对椰子大量样品的系统分析,为椰子的品种鉴定、遗传育种及种质资源的保护与利用提供了依据和背景资料。 相似文献
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应用RAPD标记对大蒜18个品种的遗传多样性和亲缘关系进行分析。从38个随机引物中筛选出6个多态性明显、反应稳定的引物,共扩增出36条谱带,其中多态性谱带27条。根据36个标记位点的信息,利用POPGENE32软件计算相关参数。结果表明,在物种水平上,多态性位点百分率P=75%,平均每个位点有效等位基因数Ne=1.4964,Nei s基因多样性指数H=0.2819,Shannon s多样性信息指数I=0.4158。根据Nei s遗传距离进行各类型间的UPGMA聚类分析,聚类结果将18个品种分为2大类群,成都二水早与其它地区大蒜种质资源有较大差别。 相似文献
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广西桑树种质资源亲缘关系的SRAP分析 总被引:2,自引:0,他引:2
【目的】从DNA分子水平了解广西地方桑树种质资源的系统发育和亲缘关系。【方法】利用SRAP分子标记技术对28份广西地方桑树种质资源进行SRAP多态性和聚类分析。【结果】筛选的22对SRAP引物组合从28份材料中共扩增出144条谱带,其中45条为多态性带,多态性带比率为31.81%。每对引物组合的谱带数和多态性带数分别为6.55条和2.05条。供试材料间的遗传相似系数为0.8264~1.0000,平均为0.8944。UPGMA聚类结果表明,28份桑树材料可分成3类,Ⅰ类包括20份广西地方种质资源,Ⅱ类包括7份广西选育的种质资源,Ⅲ类包括1份广西种质资源。【结论】广西桑树种质资源品系间存在较高的遗传变异,桑树地方种质资源的遗传多样性和亲缘关系与地域性有密切关系,可为桑树种质资源的分类、保护和育种利用提供参考。 相似文献
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[目的]探讨中国湖桑地方品种的遗传多样性。[方法]采用ISSR分子标记技术,对141个湖桑品种的遗传多样性进行分析,并根据ISSR标记遗传相似系数,按UPGMA法对141份湖桑地方品种进行聚类分析。[结果]共扩增出90个条带,其中多态性条带57条,多态性比率63.33%。141份湖桑的遗传相似系数变异范围为0.633 3~1.000 0,平均遗传相似系数为0.483 4,表明不同湖桑品种间的遗传多样性存在差异。但聚类分析结果与传统的形态学和农艺学性状的分类结果不完全一致。[结论]4个亚类清楚地代表了141份湖桑的遗传关系,并为桑树品种的优化和种质资源的保护提供了理论依据。 相似文献
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Genetic Diversity in Wild Populations of Poacynum hendersonii from Inland Arid Regions of Northwest China 总被引:3,自引:0,他引:3
ZHAO Jin-feng ZHANG Wei-ming PENG Xue-mei TANG Ze-zi GU Gong-ping LU Chang-mei College of Life Sciences Nanjing Normal University Nanjing Nanjing Institute for Comprehensive Utilization of Wild Plants 《(《农业科学与技术》)编辑部》2008,(4)
[Objective] Study on the genetic diversity in wild populations of Poacynum hendersonii.[Method] Random amplified polymorphic DNA(RAPD)technique was employed to analyze the genetic diversity in five wild populations of P.hendersonii sampled from Xinjiang,Gansu and Qinghai provinces.[Result] Totally 165 clear and repeatable bands were generated in RAPD reaction by using 20 primers screened from 80 primers,of which 110 were polymorphic,accounting for 66.67%.At species level,Nei's gene diversity index(H),Shannon's information index(I)and genetic differentiation coefficient(Gst)were 0.220 5,0.304 7 and 0.908 2,respectively.P.hendersonii germplasm resources share a high level of genetic diversity,and genetic differentiation mainly exists among the populations.Results from genetic distances and cluster analysis showed that relationships among P.hendersonii populations were to some extent related with their geographical and climatic characters.[Conclusion] This study suggests that the conservation of P.hendersonii should focus on the protection of many populations,particularly the Qinghai population. 相似文献
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《(《农业科学与技术》)编辑部》2008,(4)
[Objective] Study on the genetic diversity in wild populations of Poacynum hendersonii.[Method] Random amplified polymorphic DNA(RAPD)technique was employed to analyze the genetic diversity in five wild populations of P.hendersonii sampled from Xinjiang,Gansu and Qinghai provinces.[Result] Totally 165 clear and repeatable bands were generated in RAPD reaction by using 20 primers screened from 80 primers,of which 110 were polymorphic,accounting for 66.67%.At species level,Nei's gene diversity index(H),Shannon's information index(I)and genetic differentiation coefficient(Gst)were 0.220 5,0.304 7 and 0.908 2,respectively.P.hendersonii germplasm resources share a high level of genetic diversity,and genetic differentiation mainly exists among the populations.Results from genetic distances and cluster analysis showed that relationships among P.hendersonii populations were to some extent related with their geographical and climatic characters.[Conclusion] This study suggests that the conservation of P.hendersonii should focus on the protection of many populations,particularly the Qinghai population. 相似文献
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[目的]为更好地将随机扩增多态(RAPD)技术应用于李品种资源鉴定及遗传基础的研究提供理论依据。[方法]以16个李品种为材料,分别使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)对RAPD的PCR扩增产物进行电泳检测,并对检测效果进行比较。[结果]PAGE电泳检测出的谱带总数量以及多态性谱带的数量均高于琼脂糖凝胶。根据2种电泳系统获得的标记信息构建了2张树状聚类图,2张聚类图的聚类情况基本一致。通过对随机挑选的23个片段进行克隆与测序,结果发现23个片段都是对应引物的RAPD扩增产物。其中有4条是编码蛋白的基因片段,说明RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可以扩增编码蛋白的基因片段。[结论]RAPD不仅能扩增基因组上的非蛋白编码序列,而且还可以扩增编码蛋白的基因片段,是能够较全面反映基因组序列信息理想的DNA标记技术。 相似文献