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1.
为给进一步保护、收集和利用沙生冰草种质资源提供依据,采用26个多态性小麦SSR引物对采集自中国不同生态环境的18个沙生冰草居群进行遗传多样性的SSR分析。结果表明,26个SSR引物多态性带纹数目变化为2～27条,平均每个引物在沙生冰草居群中扩增出了9．384条多态性带纹;不同引物间总遗传多样性指数最高为0．944（引物Xgwm544）,最低为0．375（引物Xgwm257）,平均遗传多样性指数为0．745;SSR检测到地区内遗传多样性占总体的82．2％,地区间为17.8％;在Nei遗传距离0．67处,18个沙生冰草居群被分为3个类群;UPGMA聚类和PCA分析表明,采集地生态环境相似的沙生冰草居群遗传距离较近。沙生冰草遗传多样性与居群的遗传和生态环境相关,在沙生冰草的有效保护和持续利用中,对其主要生态环境居群保护和利用基础上还需进一步加强不同生态环境中特异类型居群的保护和研究。 相似文献
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应用ISSR标记技术对温郁金传统产区6个居群的样品进行遗传多样性分析。利用NTSYS—pc（version2．10e）软件分析遗传相似系数，UPGMA法进行聚类，构建系统树。11条引物共扩增得到82条带，其中多态性带26条，占总扩增带的31．7％。遗传相似系数均在0．88以上。聚类结果显示各居群样品间的遗传变异小。由此可见传统产区栽培的温郁金遗传多样性水平较低，种质间的亲缘关系较近。 相似文献
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大豆疫霉菌遗传多样性的RAPD分析 总被引：2，自引：1，他引：2
利用随机扩增DNA (RAPD)技术分析了15个大豆疫霉菌( Phytophthora sojae)的遗传多样性,并同其它7 个疫霉种的8个菌株进行了比较。运用筛选出的12个引物共获得152个RAPD标记,其中84. 2%具有多态性。通 过聚类分析结果表明,疫霉属种间的遗传相似系数的变化幅度为0. 533～0. 783,大豆疫霉菌与其它几种疫霉的遗 传距离相对较远,用引物OPB06扩增到P. sojae种特有的一个RAPD标记; P. sojae种内菌株间遗传相似系数的变化 幅度为0. 855～0. 967,亦存在较丰富的遗传多样性,该遗传多样性与菌株毒力之间有一定相关性,而与菌株地理来 源没有相关性。 相似文献
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银耳芽孢遗传多样性分析 总被引：2，自引：1，他引：1
利用ISSR和RAPD分子标记分析了不同来源的14株银耳芽孢多样性.4个ISSR引物和2个RAPD引物总扩增条带数为40条带,其中多态性位点数为39,多态性位点百分比97.50%.平均等位基因位点数为1.9750,平均有效等位基因位点数为1.393 1,物种水平上Nei's基因多样度指数为0.2270,Shannon遗传多样性指数为0.3559.UPGMA聚类方法对14个银耳菌株进行聚类分析,聚类结果表明,福建省内栽培的不同银耳菌种芽孢没有差异,福建省内银耳菌种比较单一,遗传背景相当狭隘;但这些菌株的芽孢与野生采集分离的银耳菌株的芽孢存在一定的差异. 相似文献
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基于主要农艺性状及AFLP分子标记技术，对40份入选菜用大豆品种进行遗传多样性评价，为拓宽菜用大豆种质资源基础及新品种选育提供理论依据。研究结果表明，基于农艺性状及品质性状的聚类将40份材料划分为3个类群；AFLP标记数据聚类将40个材料划分为3个AGs（AFLP-based groups）分子类群，且聚类结果与材料的地理来源无关。另外，8对AFLP引物共扩增出30条多态性条带，平均每对引物3.75个等位变异；品种间的遗传相似系数变化范围为0.3704－0.9998，平均值变化范围为0.5980－0.7924，总体平均值为0.7094，说明供试材料间的遗传相似系数较高，遗传差异较小，因此必须进一步加强菜用大豆种质资源的筛选和创新工作。 相似文献
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为了给中国西南地区小麦新品种选育以及杂种优势研究提供依据,采用微卫星分子标记（SSR）对2005～2006年西南地区参加国家小麦区试及预试的33个小麦品种（系）进行了遗传多样性分析,筛选出24对扩增谱带稳定的引物,共检测到126个等位基因变异,每对引物检测等位基因3～11个,平均5．25个。33个品种（系）之间的遗传相似系数为0．373～0．794,平均为0．597。品种间遗传相似系数变幅较大,表明西南麦区小麦品种（系）间存在着不同程度的遗传多样性差异。用UPGMA法可将33个品种（系）分为6个类群,聚类结果在一定程度上反映了它们之间的亲缘关系。 相似文献
8.
进行了臂形草内生菌特异DNA片段的克隆及分子鉴定方法的研究。从5个臂形草品种分离的5个内生菌纯培养特中，提取基因组DNA，通过140条随机引物的RAPD分析，引物OPAK10扩增出1条约500bp的共有PCR谱带。此DNA片段命名为BE1。对BE1进行分离、纯化，经点杂交证实BE1为臂形草内生菌特异DNA片段。进一步将BE1片段进行回收、克隆和DNA序列分析。BE1在基因库中进行序列分析，未发现相关同源片段。臂形草内生菌特异DNA片段的获得，为建立一种准确、快速检测臂形草内生菌及特异内生菌方法奠定了分子生物学基础。 相似文献
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为给燕麦种质资源的收集保护和育种研究提供依据,利用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对74份燕麦种质资源的遗传多样性进行了分析。结果表明,10对AFLP引物共产生784个扩增位点,多态性位点比率达96.91%;供试燕麦种质的平均Nei′s指数为0.382,平均Shannon′s信息指数为0.573,各供试材料的AFLP多态性丰富,表现出较高的遗传多样性,利用AFLP标记评价燕麦种质的遗传多样性具有较高的检测效率。对AFLP数据进行聚类分析,构建了供试燕麦种质的UPGMA系统进化树,74份燕麦种质可以聚为五大种质群,聚类结果与地理来源及皮裸性有一定的相关性。 相似文献
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3种分子标记分析油菜品种间的多态性效率比较 总被引：11，自引：0，他引：11
应用RAPD、SSR和AFLP三种分子标记,对甘蓝型油菜恢复系垦C1和保持系1141B、32B的多态性进行了分析.在648条RAPD引物、196对SSR引物、414对AFLP引物中,两组合材料具有多态性的引物分别为172条和167条,131对和133对,147对和141对,而重复性好、多态性比率高的引物分别有78条,50对,120对组合;结果表明,平均每个(对)引物可以扩增出多态性片段数目为RAPD 2.1个,SSR 2.6个,AFLP引物12.7个.AFLP多态性检测效率高.AFLP、SSR是研究油菜遗传多样性比较有效的分子标记. 相似文献
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利用醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD分子标记研究了16个玉米自交系的遗传多样性,并对这16个自交系进行聚类分析。结果显示,在供试材料中筛选到多态性、重复性均比较好的随机引物13个,检测到醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD标记的多态性条带分别为30条、34条和112条,分别占总带数的83.3%、85.0%和86.8%。3种标记所得遗传相似系数的相关性均达到了极显著水平,所得平均遗传相似系数(0.597、0.541、0.554)基本一致,RAPD标记的遗传相似系数标准差最小(0.080),相对较可靠。依据醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD分子标记分别将16个供试自交系划分为3类、3类和4类,聚类分析结果都与系谱分析大体相似,同时也存在与所知系谱不符的现象。 相似文献
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杧果炭疽菌随机扩增多态性DNA分析 总被引：1，自引：0，他引：1
对海南、广东、四川、广西等14个尤果主要栽培地采集的70个忙果炭疽菌分离菌株进行了遗传多态性的初步研究。利用19个10碱基随机引物对70个忙果炭疽菌分离菌株基因组DNA进行RAPD分析。根据它们的遗传相似性,这70个尤果炭疽菌分离菌株被聚类为2大群（I和I）和相似系数为0.306-0.928的6小群（1-a,1-b,L-c,1-d,Ⅱ-a,I-b）。不同栽培地的相似系数低;同一栽培地的相似系数高,所以忙果炭疽菌的遗传基础与地理来源虽没有严格的对应关系,但存在相关性。抗药性试验结合RAPD分析结果表明,抗药性菌株一般与非抗药性菌株的亲缘关系较远,推测遗传基础的改变是抗药性产生的原因之一。 相似文献
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东北地区玉米弯孢菌的致病性分化与RAPD分析 总被引：1，自引：0，他引：1
在东北三省15个地区采集分离26个玉米弯孢菌菌株,通过鉴别寄主技术与RAPD分子标记技术进行致病性与遗传分化的研究。结果表明,东北地区玉米弯孢菌在致病性与遗传上都存在明显的变异,二者有一定的相关性,未发现变异程度与菌株地理来源有明显的直接关系。26个菌株的致病性分为5种类型,其中中等致病类型分布遍及东北三省,为优势致病类群;强致病类型分布在吉林省的白城市;弱致病类型主要分布在吉林省的白山和梨树。用8个引物对供试菌株进行RAPD扩增,共获得77个RAPD标记,其中多态性标记71个,多态性比例92.2%。供试菌株在相似系数约0.71处共聚为4组,大多数致病性较强的菌株聚在一起,而弱致病株在相似系数相对较低时和其他菌株聚在一起。 相似文献
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Meybodi DE Torkamaneh D Danaee M Hashemi M 《Pakistan journal of biological sciences: PJBS》2011,14(17):831-837
Fusarium Head Blight (FHB), caused mainly by Fusarium graminearum, is one of the most notorious diseases in North part of Iran. Due to lack of sufficient information regarding genetic diversity of FHB, the correlation between genetic diversity and geographic distribution of 52 isolates that collected from infected wheat kernels from four main grown region of North part of Iran were analyzed with 10 simple Sequence Repeat (SSR) primers and 15 Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) primers. The un-weighed pair group method using arithmetic means (UPGMA) was used and a dendrogram was constructed based on Jaccard's similarity coefficient. Principal Component Analysis (PCA) of SSR and RAPD markers revealed that the first two factors accounted for 51 and 41% of the total variance, respectively. SSR and RAPD data classified isolates into four and seven groups, respectively. SSR analysis showed that there was a correlation between genetic clusters of isolates and geographical origin in F. graminearum. However, results of cluster analysis using RAPD data didn't show any relation with geographical distribution but the results of this analysis confirmed a genetic variation among all isolates. 相似文献
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热辣2号辣椒纯度鉴定及优良自交系遗传多样性分析 总被引：2，自引：0，他引：2
为了提高种子质量和充分利用辣椒种质资源,应用SSR分子标记对热辣2号杂交种纯度进行鉴定并对部分辣椒优良自交系进行遗传多样性分析。以热辣2号母本材料CAYB02和父本材料CAYB01为模板筛选85对辣椒SSR引物,其中12对引物在亲本间能扩增出明显的多态性,多态性比率为14.12%,多态性标记分别位于辣椒1、3、4、6、7、9、11、12号染色体,利用3对位于不同染色体上的SSR标记对热辣2号黄灯笼椒杂交种的纯度进行鉴定,热辣2号种子纯度为98.79%,标记鉴定结果与田间鉴定结果一致。研究结果表明,利用SSR标记鉴定辣椒杂交种纯度是切实可行的。利用12对多态性明显、稳定可靠的SSR引物对部分辣椒自交系进行遗传多样性分析,共扩增出60条条带,多态性位点比率为100%,平均每对引物检测出5个等位基因。30份辣椒自交系间遗传相似系数变幅为0.33~1.00,平均为0.65,表明供试材料间具有丰富的遗传多样性。聚类分析结果表明,在遗传相似系数为0.47时,可以将中国辣椒和一年生辣椒区分开来。在遗传相似系数为0.85时,30份辣椒优良自交系分为11个类群,辣椒种质遗传关系与地理来源和农艺性状具有一定的相关性。 相似文献
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Relationships between pathotypes and other markers such as mating types, metalaxyl resistance, Gpi-allozyme and random amplified polymorphic DNA (RAPD) patterns, were investigated among 33 isolates ofPhytophthora infestans obtained from both potato and tomato across Canada in 1997. Pathogenicity testings, based on virulence against potato differentials carrying single-resistance genes and the size of lesions on leaves, revealed higher pathogenic diversity in 1997 than in the few past years, with more pathotypes and more race-complex isolates. A higher pathogenic diversity was observed within A2 (US-8) than within A1 (US-11) isolates. There was no correlation between the level of resistance to metalaxyl of an isolate and its pathogenicity. Nevertheless, when grouped into metalaxyl-sensitive (MS), -intermediate (MI), and -resistant (MR) classes, both average pathotype complexity and average lesion size were lowest for MS group. RAPD data revealed a good distinction between A1 (US-11) and A2 (US-8) mating type groups, and between isolates from British Columbia and those from other provinces. The detection in the last few years of both A1 and A2 mating types in Canada and the occurrence in 1997 of some isolates sharing different characteristics of both of these two groups suggest that sexual reproduction may have occurred locally. 相似文献