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青藏扁蓿豆(Medicago archiducis-nicolai)广泛分布于青藏高原及其毗邻地区,对高海拔极端环境具有极强的适应性。本研究利用高通量转录组测序数据,对青藏扁蓿豆的EST-SSR标记进行了开发。结果发现,随机选取的477对引物中,350对可在青藏扁蓿豆中有效扩增,其中346对引物在扁蓿豆(M.ruthenica)中可实现跨物种扩增。利用其中64对独立遗传且符合哈迪–温伯格平衡的标记引物对青藏扁蓿豆和扁蓿豆野生群体的遗传多样性和群体遗传结构分析发现,两个物种存在明显的种间和种内的遗传分化,且提示种内群体间的遗传分化与地理隔离或环境选择有关。本研究所开发的EST-SSR标记为今后进一步评价青藏扁蓿豆和扁蓿豆的遗传多样性以及解释其适应极端环境的遗传机制提供了重要的研究工具。 相似文献
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遗传多样性的量化与分类是收集和利用种质资源的重要前提。运用SSR和ISSR技术分析扁蓿豆种质资源的遗传多样性。从供试材料中筛选到具有多态性的SSR引物18对,ISSR引物18条。SSR引物共扩增到109条清晰的多态性条带,多态性比率为80.09%,相似系数变化范围为0.669～0.885。ISSR引物共扩增到125条清晰的多态性条带,多态性比率为87.08%,相似系数变化范围为0.448～0.811。对2种标记结果进行UPGMA聚类分析,结果表明,扁蓿豆材料部分聚为1类,黄花扁蓿豆材料大部分聚为1类。Mantel检测显示,2种标记的遗传相似性呈显著相关(r=0.019 6,t=0.121 2),扁蓿豆比黄花扁蓿豆的遗传多样性水平稍高,细叶扁蓿豆之间的遗传差异较大。 相似文献
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应用SSR分子标记对内蒙古野生扁蓿豆4个地理种群进行了遗传多样性研究。结果表明,扁蓿豆具有较高的遗传多样性,12对引物共扩增出66个位点;物种水平上Nei＇s基因多样性指数为0．2222,Shannon多样性指数为0．3639,种内总基因多样性为0．2223;种群内基因多样性为0．2153,96．88％的遗传变异存在于种群内,3．12％的遗传变异存在于种群间;种群间的遗传分化系数为0．0312,基因流为15．5256;4个种群间有一定遗传分化,但遗传漂变不会引起遗传分化。UPGMA遗传距离聚类结果表明,生态地理条件相似的种群优先聚集。 相似文献
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扁蓿豆遗传多样性的SSR分析 总被引：5，自引：1，他引：4
应用SSR分子标记对内蒙古野生扁蓿豆4个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明,扁蓿豆具有较高的遗传多样性,12对引物共扩增出66个位点;物种水平上Nei's基因多样性指数为0.2222,Shannon多样性指数为0.3639,种内总基因多样性为0.2223;种群内基因多样性为0.2153,96.88%的遗传变异存在于种群内,3.12%的遗传变异存在于种群间;种群间的遗传分化系数为0.0312,基因流为15.5256;4个种群间有一定遗传分化,但遗传漂变不会引起遗传分化.UPGMA遗传距离聚类结果表明,生态地理条件相似的种群优先聚集. 相似文献
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利用青藏高原及其毗邻地区的7个青藏扁蓿豆(Medicago archiducis-nicolai),以及来自上述地区和内蒙古的3个扁蓿豆(M.ruthenica)野生群体,根据叶绿体trnL-trnF基因间隔区序列,对其遗传多样性和群体遗传结构进行了分析。对161个个体的trnL-trnF序列的分析,共检测到11个核苷酸变异位点,定义了14种单倍型。对单倍型在不同群体中的分布分析显示,青藏扁蓿豆在青藏高原东南边缘地区可能存在避难所,同时在青藏高原边缘地区可能发生了青藏扁蓿豆向扁蓿豆群体的基因入侵。空间分子变异分析和基于K-2P遗传距离的群体聚类均支持将上述群体分为扁蓿豆和青藏扁蓿豆两组,组间的遗传分化程度很大。分子变异分析表明,群体内的遗传变异明显大于群体间的变异,但部分群体间存在较高水平的遗传分化;错配分布和中性检验表明,在采样范围内两种扁蓿豆都没有经历明显的近期种群扩张。研究认为,青藏高原复杂的地形结构、冰期时的气候波动以及扁蓿豆本身的进化历史可能是造成其现今遗传结构形成的主要原因。 相似文献
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《中国草地学报》2016,(4)
应用AFLP标记对采自中国7个省市自治区的49份野生扁蓿豆种质材料进行遗传多样性及遗传结构的分析。研究结果显示:(1)利用4对条带清楚且稳定的AFLP引物组合共扩增出298个条带,其中多态性条带有219个,多态性条带比率为73.5%,每个引物扩增多态性条带数平均为54.8条。(2)49份野生扁蓿豆种质间多态性比率平均为32.70%,Nei’s基因多样性指数平均为0.115,Shannon多样性指数平均为0.172,表明供试种质材料间遗传多样性较丰富,遗传多样性水平较高。(3)河北省的扁蓿豆种质遗传变异最丰富,辽宁省的扁蓿豆种质变异幅度最小,不同地理类群间的扁蓿豆种质遗传多样性指数有显著差异。(4)种质材料间基因分化系数为0.6436,说明64.36%的遗传变异来源于不同种质材料间;地区间基因分化系数为0.2895,说明28.95%的遗传变异来源于不同地区间。表明地区间差异小于种质材料间的遗传变异。(5)UPGMA方法的聚类分析和主成分分析结果表明,49份种质材料间的遗传相似系数(GS)为0.5849~0.9904,遗传距离(GD)为0.0096~0.5363,49份扁蓿豆种质分为6大类,表现出明显的地域性。 相似文献
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扁蓿豆不同品系ISSR标记遗传差异和遗传多样性 总被引：4，自引：1，他引：3
采用ISSR分子标记技术对扁蓿豆4个品系的遗传多样性、遗传差异和遗传结构进行了研究。用7个有效引物对4个品系进行PCR扩增,共获得73个等位基因位点,每条引物平均检测出10.4个位点,其中多态性位点69个,多态位点百分率为94.5%。各品系的Nei’s遗传多样性为0.2569,Shannon’s信息指数为0.4046。Nei’s指数估算和分子方差分析均表明,扁蓿豆4个品系的遗传多样性主要存在于品系内,4个品系间亦出现了较大的遗传分化(Gst=0.1324)。品系00-61、90-36、00-81和93-21的多态位点百分率分别为73.97%、79.45%、82.19%和83.56%;Nei’s遗传多样性(H)分别为0.2050、0.2153、0.2264和0.2474;Shannon’s信息指数(I)分别为0.3222、0.3396、0.3538和0.3821。各品系的遗传参数大小排序均为品系93-21品系00-81品系90-36品系00-61。采用系统聚类和主坐标分析(PCA)两种方法所获得的聚类结果一致,即品系00-61和00-81遗传差异相对较小,其次是品系90-36,品系93-21与各品系的遗传差异较大。 相似文献
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不同扁蓿豆材料抗旱性比较研究 总被引：6，自引：3，他引：6
通过测定叶夹角、叶面积、保水力、光合强度、水分利用效率和电导率等指标，对不同来源的6份扁蓿豆材料进行了抗旱生理学方面的研究。其中，保水力、光合强度、水分利用效率为扁蓿豆抗旱性研究的适宜指标；综合评价表明3号和6号扁蓿豆材料的抗旱性较强。 相似文献
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PEG胁迫下不同品系扁蓿豆种子的萌发特性 总被引：4，自引：2，他引：2
采用-0.2、-0.4、-0.6、-0.8-、1.2 MPa共5个PEG渗透势梯度模拟干旱胁迫,以黄花苜蓿作对照,探讨了扁蓿豆4个品系种子萌发期的抗旱性。结果表明:供试种子的相对发芽率、相对发芽势、相对发芽指数、相对活力指数与渗透胁迫强度呈显著至极显著负相关;综合分析扁蓿豆4个品系的耐旱性均高于黄花苜蓿,干旱对其各品系种子萌发的影响顺序为品系90-36品系93-21品系00-61品系00-81。PEG干旱胁迫对不同品系扁蓿豆种子萌发速度、幼苗生长势的影响大于萌发能力。 相似文献
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本文着重讨论了家畜遗传多样性的四个表达水平形态学水平染色体水平、等位酶水平和ＤＮＡ水平，并详细论述了各个水平上的检测技术及其应用范围、应用局限和应用趋势。 相似文献
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我国扁蓿豆种子生产研究现状及提高产量的途径 总被引：6，自引：1，他引：5
分析了我国扁蓿豆种子生产中存在的有关问题和局限性,主要针对扁蓿豆种子生产中存在的成熟期不一、裂荚性和落粒性强、单位面积产量低等问题,提出了采用覆膜、人工辅助授粉、留株后熟等方法,提高扁蓿豆种子产量的途径。 相似文献
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Diversity and population density of methanogens in the large intestine of pigs fed diets of different energy levels 
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下载免费PDF全文 Hiroki Matsui Tomoyo Ishimoto‐Tsuchiya Sakiko Maekawa Tomomi Ban‐Tokuda 《Animal Science Journal》2018,89(10):1468-1474
Marker gene analysis was performed to assess the effect of energy level on the diversity and population density of methanogens in pig fecal material. Crossbred pigs were fed high or low energy level diets, a high‐energy (HE) diet that satisfied daily gain at 1.2 kg, and a low‐energy (LE) diet with amount of 0.6 times of the HE diet. Growth performance and short‐chain fatty acid in feces were examined. Diversity of methanogen was analyzed by the α‐subunit of methyl coenzyme‐M reductase gene (mcrA) clone library from fecal DNA. The DNA copy numbers of mcrA were quantified by real‐time PCR. There was no difference in the concentration and composition of short‐chain fatty acid between treatments. Differences in the mcrA clone library were observed between HE and LE treatments (p < 0.05). Ninety‐five percent of cloned sequence affiliated genus Methanobrevibacter in the feces of the pig regardless of treatments. During the experimental period, no significant difference in the proportion of copy numbers of mcrA against that of 16S rRNA gene of total bacteria was observed between treatments. In conclusion, feeding energy level affected composition of methanogens in the large intestine of the pig, while population density of methanogen was not affected. 相似文献
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用不同方法处理后直立型扁蓿豆种子的发芽效果 总被引：8，自引：0，他引：8
分别采用砂纸打磨、１０％硫酸溶液浸泡３０ｍｉｎ、１０％氢氧化钠溶液浸泡３０ｍｉｎ、饱和氢氧化钠溶液浸泡１５ｍｉｎ和９８．０６％溶液浸泡１５ｍｉｎ处理直立型扁蓿豆种子，结果表明以砂纸打磨处理的效果最好，发芽率比对照高１８．６％，发芽势高２８３．９％。 相似文献
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利用SRAP标记对来自西藏境内的4个光核桃自然居群的遗传多样性和群体遗传结构进行了分析和评价。选用20对引物对4个居群的70份材料进行扩增,检测到338个多态位点。在居群水平上,多态位点百分率为63.96%,Nei’s基因多样性和Shannon’s信息指数分别为0.194 3和0.295 5。在物种水平上,多态位点百分率为89.89%,Nei’s基因多样性和Shannon’s信息指数分别为0.246 0和0.383 9。居群间的遗传分化系数为0.170 9,居群间的基因流为1.213 0。UPGMA聚类图中,70个个体未按4个居群各自聚在一起。结果表明,光核桃遗传多样性水平较高,居群间遗传分化较小,居群间的基因交流程度较高。 相似文献
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以1/2 MS培养基为种子发芽床,用摩擦、划破种皮、H2SO4溶液、NaOH溶液等物理和化学方法对扁蓿豆种子处理后进行萌发试验,结果表明:划破种皮发芽率86%,发芽指数15.97;摩擦处理发芽率71%,发芽指数12.94;摩擦后放置30 d发芽率65%,发芽指数11.54;98%用H2SO4溶液处理15 min降低扁蓿豆种子硬实率的效果较好,其发芽率可达84%,比对照提高59%,发芽指数13.45,比对照提高了78.7%,均达到了极显著差异水平;饱和NaOH溶液处理15 min的效果次之:发芽率达77%,发芽指数12.14;均比对照高,且差异显著。 相似文献