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1.
荷包红鲤与德国镜鲤正反杂交组遗传结构的微卫星分析 总被引：1，自引：0，他引：1
用11对微卫星引物对两个杂交组合（荷包红鲤♀×德国镜鲤♂,德国镜鲤♀×荷包红鲤♂）的遗传结构进行了分析。结果表明：11对引物均能表现很好的多态性,可用作两个杂交组合遗传结构的分析,且得到的MFW 30可以用来鉴别正反杂交组的双亲;正反杂交组多态信息含量（PIC）均值分别为0.5072和0.5359,属高度多态性;子代的有效等位基因数分别为2.6594和2.9211,均大于母本而小于父本;在反交组子代中杂合度为0.9212,要高出双亲,正交组中为0.7515,介于双亲之间,均显示出子代的高遗传变异水平;Hardy-Weinberg平衡的卡方检测发现,正反杂交子代分别有8个和10个位点发生大幅度偏离平衡;双亲间遗传距离正交组为0.2699,反交组为0.3578,显示出能产生杂交优势的潜力且正交组要低于反交组;UPGMA聚类图显示,子代在正交组中与母本近,在反交组中与父本近,两者都提示杂交子代与荷包红鲤的亲缘关系较近。 相似文献
2.
长江、珠江和黑龙江草鱼双列杂交组合遗传变异的微卫星分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为研究本课题组筛选获得的长江、珠江和黑龙江草鱼优秀种质间完全双列杂交组合遗传多样性及遗传结构的变化情况,采用多重PCR技术对构建的6组杂交组合[珠江♀×黑龙江♂(ZH)、黑龙江♀×珠江♂(HZ)、长江♀×珠江♂(CZ)、长江♀×黑龙江♂(CH)、珠江♀×长江♂(ZC)、黑龙江♀×长江♂(HC)]和3组自交组合[黑龙江♀×黑龙江♂(HH)、长江♀×长江♂(CC)及珠江♀×珠江♂(ZZ)]共9个草鱼组合群体进行微卫星遗传变异分析。结果显示,9个群体平均等位基因数(N_a)为(5.75～12.33),平均有效等位基因数(Ne)为(3.8077～6.3065),平均观测杂合度(H_o)为(0.7682～0.9036),9个草鱼群体均显示出较高的遗传多样性水平,平均期望杂合度(H_e)为(0.8385～0.6210),12个草鱼微卫星位点的多态信息含量(PIC)分别为0.892、0.823、0.857、0.894、0.927、0.859、0.850、0.859、0.907、0.929、0.879和0.749,均表现为高度多态位点(PIC=0.749～0.929)。基于不同群体的Nei’s遗传相似性和遗传距离构建的UPGMA系统发育树显示,9个群体中黑龙江♀×珠江♂(HZ)与长江♀×珠江♂(CZ)首先聚类,表明两个组合亲缘关系更近,珠江♀×黑龙江♂(ZH)与黑龙江♀×长江♂(HC)组合遗传距离最远。本研究结果将为草鱼目前种质退化现象提供解决思路,为草鱼优良品系的选育提供理论依据。 相似文献
3.
利用12对微卫星引物对花鱼骨和唇鱼骨及其正反杂交子代(花鱼骨♀×唇鱼骨♂F1和唇鱼骨♀×花鱼骨♂F1)共4个群体进行微卫星分析,计算等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、多态性信息含量(PIC)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、遗传分化系数(Fst)、Nei氏遗传距离(DS)。结果表明:在4个群体中,反交F1的平均Ne最大(3.453 7),花鱼骨的平均Ne最小(3.049 7);花鱼骨和唇鱼骨及其正反杂交子代4个群体的平均PIC分别为0.599 4、0.602 6、0.628 0、0.637 4;反交F1的平均Ho最高(0.411 1),花鱼骨的平均Ho最低(0.208 3)。聚类分析结果表明,正交F1和母本花鱼骨先聚为一支,再和父本唇鱼骨聚为一支,最后同反交F1聚在一起。遗传距离和遗传相似系数结果显示:正交F1与母本花鱼骨的遗传相似系数最大,与反交F1的遗传相似系数最小;反交F1同父本花鱼骨的遗传相似系数最大,同母本唇鱼骨的遗传相似系数最小。杂交子代群体的等位基因基本来自父母本双方,可以推断杂交子代的遗传物质来自父母双方,属两性融合生殖,且杂交子代的遗传变异水平明显高于父母本,是真正意义上的杂交种。 相似文献
4.
[目的]从亲权排除率、鉴别准确率、鉴别成功率等方面评价微卫星标记鉴别草鱼亲权关系的可行性,为草鱼系谱信息的确定奠定基础.[方法]利用8个微卫星标记检测5个草鱼家系亲本(F.)及其子代(F1)的基因型,以Cervus 3.0软件进行亲权鉴定,并统计微卫星位点的等位基因数(Na)、多态信息含量(PIC)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)等;最后通过模拟分析和试验验证,评估8个微卫星位点最多可鉴定的亲本数及其与鉴定率、置信度之间的关系.[结果]8个微卫星位点中,当两个亲本基因型未知时,单个亲本排除率(E-1P)介于0.342~0.668,平均值为0.520;当一个亲本基因型已知时,另一个亲本的排除率(E-2P)介于0.521~0.802,平均值为0.681;一对亲本组合的亲权排除率(E-PP)介于0.711~0.937,平均值为0.847.以95%置信水平和100%鉴定率为标准,模拟分析及试验验证结果表明,所选择的8个微卫星位点最多可以鉴定598个已知性别的亲本或431个未知性别的亲本.[结论]所选的Hl18、H137、H165、H148、4703、C2489、H57、H81等8对微卫星标记可在生产及科研试验中用于获取草鱼系谱信息. 相似文献
5.
采用形态学测定与统计分析相结合的方法,观察和测定泥鳅♀×大鳞副泥鳅♂(D×P)和大鳞副泥鳅♀×泥鳅♂(P×D)及其亲本的形态差异、可数性状及可量性状,研究泥鳅和大鳞副泥鳅杂交子代及其亲本的形态差异。结果显示,正反交子代(D×P和P×D)外观相似,同时具有双亲的一些特征,如尾柄处皮褶发达,与大鳞副泥鳅相似,而身体上的花纹与泥鳅更相似,大多为圆形斑点,兼有少部分条纹。在体型方面,2种杂交子代体型介于泥鳅和大鳞副泥鳅之间,较大鳞副泥鳅更圆。聚类分析和主成分分析显示,2种杂交泥鳅形态相近,均与大鳞副泥鳅更相似。判别分析综合准确率达到94.1%,可以有效鉴别这2种泥鳅和它们的杂交种。泥鳅和大鳞副泥鳅正反交均可获得存活子代,且孵化率、畸形率和早期存活率与自交组没有显著性差异(P0.05)。 相似文献
6.
缢蛏微卫星多态性分析及其在亲子鉴定中的应用 总被引：1，自引：1，他引：0
利用磁珠富集法,构建了缢蛏(Sinonovacula constricta)微卫星富集文库。开发并筛选出18对微卫星引物,其中8对微卫星引物亲缘排除率较高,选取这8对引物对家系进行了亲子鉴定。结果表明,18对微卫星引物在12个个体中等位基因为2~6,平均等位基因为3.00;观测杂合度在0~1.000之间,平均值为0.581 3;期望杂合度0.290~0.779,平均值为0.528 4;多态信息含量为0.239~0.703,平均值为0.432 2。当两个亲本基因型未知时,8对微卫星引物在整个家系中单个亲本排除率(E-1P)为0.583~0.916,平均值为0.790 0;当一个亲本基因型已知时,另一个亲本的排除率(E-2P)为0.406~0.830,平均值为0.653 9。同时可知在子代个体数量不断增加的情况下,排除率仍在较高范围,因此可以作为亲子鉴定的分子标记。这对于缢蛏规范化养殖、家系选育的开展具有重要意义。 相似文献
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为了对8个尼罗罗非鱼家系进行亲子鉴定,利用GM024、GM435、GM459、UNH719、UNH846、GM558六个微卫星标记设计引物并进行PCR扩增,在12%聚丙烯酰胺凝胶上电泳分型,应用cervus3.0软件统计分析。结果表明,各微卫星位点的等位基因数在4~12之间;观测杂合度在0.313~0.988之间,平均观测杂合度为0.696;期望杂合度在0.318~0.794之间,平均期望杂合度为0.638。平均多态信息含量为0.608。已知一亲本时,各个位点的非父排除率在0.301~0.818之间;双亲未知时,各位点的累计排除率在0.113~0.69之间。当已知一亲本时,6个位点的累积排除率达到了0.9962。当双亲都未知时,6个位点的累积排除率也达到了0.9674。所以利用这6个位卫星位点能够有效地确认尼罗罗非鱼各家系父本。 相似文献
8.
《贵州农业科学》2021,49(5)
【目的】探明北京油鸡、吉林黄鸡及其正反交组合的屠宰性能,为改善吉林黄鸡生产性能及选种选育提供参考依据。【方法】以吉林黄鸡亲本(HH)、北京油鸡亲本(YY)、北京油鸡♂×吉林黄鸡♀正交组(YH)和吉林黄鸡♂×北京油鸡♀反交组(HY)为研究对象,测定分析各处理组间120日龄和150日龄的屠宰指标,对杂交组合F_1代屠宰性状进行评判。【结果】屠宰性能正反交组合绝对和相对产肉性能更接近其母本群体,其中,YH组的屠宰率达92.66%,显著高于亲本组和HY组,绝对和相对产肉杂种优势率高于HY组;HY全净膛率的杂交优势优于YH。正交YH的翅膀重杂种优势率最大,为5.591 8%。【结论】在1周龄时HY的料肉比杂种优势率最好,为-7.317 1%;在15周龄时YH的料肉比杂种优势率最好,为-5.505 9%。 相似文献
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10.
用8对微卫星对草鱼长江群体和珠江群体的2个自繁组合:长江♀×长江♂(YY)、珠江♀×珠江♂(ZZ),1个杂交组合:长江♀×珠江♂(YZ),进行遗传多样性和遗传结构分析。8个微卫星位点的等位基因数为2~6个,并具有较好的多态性,可以用于遗传变异分析。有效等位基因数、观测杂和度、期望杂合度、多态性息含量均以YZ组合最高,分别为2.8111、0.9843、0.6399、0.5598;ZZ组合最低,分别为2.6751、0.8650、0.6129、0.5283;YY组合介于两者之间。基于Nei’s遗传距离构建的UPGMA和NJ系统树揭示YZ组合与YY组合亲缘关系更近。组合间遗传分化分析(Fst)及AMOVA分析表明,YY组合与ZZ组合间达到中等遗传分化水平(Fst=0.0860,P<0.01)。结果表明:杂交后代遗传变异水平显著提高,具有较高的选育潜力;长江与珠江水系草鱼存在一定程度的遗传分化。 相似文献
11.
奥尼罗非鱼及其亲本的微卫星分析 总被引：2，自引：0，他引：2
运用SSR技术对奥利亚罗非鱼（Oreochromis aureus♂）、尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus♀）及其杂交子代（O．aureus♂×O．niloticus♀）的遗传多样性进行了研究。从12对微卫星引物中筛选出8个微卫星特异性位点,其中奥利亚罗非鱼（♂）特异位点7个;尼罗罗非鱼（♀）5个;杂交子代6个。利用这8个位点检测3个群体的遗传结构,共检测到63个等住基因,平均等位基因2．4394个,奥利亚罗非鱼（♂）、尼罗罗非鱼（♀）和杂交子代的平均观测杂合度分别为O．7083、0．9015和0．9787;平均期望杂合度分别为0．5341、0．5761和0．6435,平均多态信息含量（PIC）分别为0．4133、0．4693和0．5584。结果表明,3个群体的遗传多样性水平都较高,其中杂交子代群体的遗传多样性水平最高,奥利亚罗非鱼群体遗传多样性最低;基于Nei＇s遗传距离的聚类分析显示尼罗罗非鱼（♀）和杂交子代的遗传距离较近。 相似文献
12.
选择扩增效果好、有多态性的12个微卫星标记,对一个德国镜鲤选育群体(288尾)的遗传结构进行了分析。共检测到50个等位基因,等位基因数为3～5,平均有效等位基因数为3.076 9,平均观察杂合度为0.416 4,平均期望杂合度为0.658 2,平均多态信息含量为0.605 6。分析结果表明,该群体的多样性水平适中。经2检验,群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。12个位点均表现为杂合子缺失,表明选择压力较大,提示在后续的生产和选育过程中要注意保持群体的遗传多样性水平,避免近交衰退。 相似文献
13.
利用20对微卫星标记埘长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤3个鲤鱼群体的遗传多样性和遗传结构进行分析.结果表明:3个群体在20个位点上分别检测到108、164、154个等位基因,各群体等位基因数2～16个不等,平均有效等位基因数分别为4.496、5.695和5.606.3个群体平均期望杂合度分别为0.769、0.806、0.801,多态信息含量分别为0.703、0.761和0.757,遗传多样性指数分别为0.764、0.803和0.799,群体间遗传分化系数为0.071.结果说明3个群体遗传多样性较为丰富. 相似文献
14.
德国镜鲤养殖群体中抗病与死亡个体遗传结构比较研究 总被引：1，自引：1，他引：0
利用AFLP技术对2007年、2008年所采集的我国北方网箱养殖中出现爆发性死亡的德国镜鲤的死亡个体和存活个体分子样品进行遗传结构分析,以期对德国镜鲤群体内二者遗传变异进行快速而准确的评价。研究结果表明,(1)8对引物组合共扩增出289个条带,其中多态位点比例为47.40%,每对引物多态位点比例为18.8%~56.3%。(2)死亡和存活个体在两年采集样品中的遗传相似性系数分别为0.981 8和0.986 2,遗传分化系数分别为0.037 4和0.037 9,表明死亡个体和成活个体遗传分化程度较低。(3)在两年采集样品中死亡个体平均多态位点比例均低于存活个体,平均杂合度在2007年采集的样品中死亡个体比存活个体低,在2008年采集的样品中二者相等,表明成活个体遗传变异相对较大,遗传多样性较高,而死亡个体遗传变异相对较小,遗传多样性较低。(4)个体聚类分析表明死亡个体和成活个体分别在不同程度上进行了聚类。本实验结果表明出现大规模死亡现象德国镜鲤的死亡和存活个体在遗传物质上存在一定的差异,而这种差异可能导致了二者抗病性能的不同。研究结果将对德国镜鲤抗病品种的选育提供重要参考。 相似文献
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利用AFLP技术对2007年、2008年所采集的我国北方网箱养殖中出现爆发性死亡的德国镜鲤的死亡个体和存活个体分子样品进行遗传结构分析,以期对德国镜鲤群体内二者遗传变异进行快速而准确的评价。研究结果表明,(1)8对引物组合共扩增出289个条带,其中多态位点比例为47.40%,每对引物多态位点比例为18.8%~56.3%。(2)死亡和存活个体在两年采集样品中的遗传相似性系数分别为0.981 8和0.986 2,遗传分化系数分别为0.037 4和0.037 9,表明死亡个体和成活个体遗传分化程度较低。(3)在两年采集样品中死亡个体平均多态位点比例均低于存活个体,平均杂合度在2007年采集的样品中死亡个体比存活个体低,在2008年采集的样品中二者相等,表明成活个体遗传变异相对较大,遗传多样性较高,而死亡个体遗传变异相对较小,遗传多样性较低。(4)个体聚类分析表明死亡个体和成活个体分别在不同程度上进行了聚类。本实验结果表明出现大规模死亡现象德国镜鲤的死亡和存活个体在遗传物质上存在一定的差异,而这种差异可能导致了二者抗病性能的不同。研究结果将对德国镜鲤抗病品种的选育提供重要参考。 相似文献
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利用RAPD和微卫星标记技术,对芙蓉鲫及其原始亲本（红鲫、芙蓉鲤、散鳞镜鲤、兴国红鲤）5个群体的遗传关系进行研究。利用20条随机引物进行RAPD分析,其中12条在5个群体中均能扩增出特异条带。统计分析显示：芙蓉鲫与红鲫、芙蓉鲤、散鳞镜鲤、兴国红鲤的遗传相似性分别为0.8757、0.7478、0.7419、0.7449,遗传距离分别为0.1327、0.2906、0.2985、0.2944。在进行微卫星标记分析时,所扩增的29对微卫星引物中共有13对在5个群体中均能扩增出特异条带。统计分析显示,芙蓉鲫与红鲫、芙蓉鲤、散鳞镜鲤、兴国红鲤的遗传相似性分别为0.8717、0.7434、0.6680、0.7552,遗传距离分别为0.1374、0.2965、0.4034、0.2808。两种分析结果均表明,芙蓉鲫的遗传结构更接近于父本红鲫,与外祖父兴国红鲤的遗传相似性比与外祖母散鳞镜鲤的遗传相似性要大,其遗传结构更偏向于具红色体征的原始亲本。 相似文献
17.
采用PHA体内二次注射法及快速银染法对德国镜鲤和不同倍性的泥鳅进行银染核型的比较研究。结果表明,德国镜鲤中期分裂相及间期核中呈现出Ag-NORs的数目为1～2个,含有2个Ag-NORs频率最高,分别为80%和56%。二倍体泥鳅中期分裂相及间期核中呈现出Ag-NORs的数目为1～2个,含有2个Ag-NORs频率最高,分别为72%和60%。四倍体泥鳅中期分裂相及间期核中呈现出Ag-NORs的数目为1～4个,中期分裂相中含有3个Ag-NORs,频率最高为36%,间期核中含有2个Ag-NORs,频率最高为40%。德国镜鲤2n=100,核型组成为30m+26sm+30st+14t,NF=156。NOR的染色体在核型中位置和NORs在染色体上的位置是:sm组第8号染色体的短臂末端。二倍体和四倍体泥鳅NOR的染色体在核型中位置和NORs在染色体上的位置均是:m组第1号染色体的短臂末端。研究结果证实德国镜鲤与中国鲤鱼一样,是多倍化后经历二倍化过程演变而来,是二倍化的四倍体,即染色体数目为2n=100。四倍体泥鳅进行加倍后未发生二倍化或在二倍过程中,是遗传四倍体,染色体数目为4n=100。 相似文献
18.
Ning Hou Xiaoshu Hou Yong Li Dayu Li Fujun Liu Ruixin Mao Xiaowen Sun 《Frontiers of Agriculture in China》2008,2(4):484-492
Using 30 microsatellite markers and combining quantifiable characteristics such as body weight, body length and body width,
we evaluated the genetic potential of 3 German mirror carp (Cyprinus carpio L.) populations. Number of effective alleles (Ae), observed (Ho) and expected (He) heterozygosity values and polymorphic information contents (PIC) were all calculated. Two hundred and eighty-seven alleles and 559 genotypes were detected. The DNA fragment length was 109–400
bp. The Hardy-Weinberg Equilibrium was checked and the phenomenon of some disequilibrium was studied according to the χ2 test. The results showed that the level of genetic variability was moderate, but genetic potential of Shuanglai population
was much lower than that of Huanxin and Songpu breeding populations. PIC of the three populations of German mirror carp were between 0.08787 and 0.5377, both highly and moderately polymorphic markers
were 13. The number of the Ae was between 1.1014 and 6.4665. The Ho and He heterozygosity values were 0.0968–0.9892 and 0.0926–0.8554, respectively. The linkage correlation was analyzed using the
data of body weight, body length and body width, and 30 loci. The result showed that there existed 2 loci, HLJ319 and HLJ693, associated with body length. The HLJ693 locus was significantly correlated with body weight trait. The HLJ677 locus was linked with body width. And then the result was verified in Recombinant Inbred Lines (RIL) of common carp. It
showed that the HLJ319 locus was significantly linked with body length, the same as the result of quantitative trait loci (QTL) location for
common carp.
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Translated from Hereditas (Beijing), 2007, 29(12): 1509–1518 [译自: 遗传 (北京)] 相似文献
19.
利用大样本镜鲤繁殖群体分析和验证8个生长相关微卫星标记与体质量和体长的相关性：结果显示：8个微卫星标记在镜鲤繁殖群体中均获得了稳定、清晰的DNA条带,片段大小在100-322bp之间,共检测到33个等位基因、75种基因型。对每个微卫星座位的基因型与体质量、体长性状进行相关性分析发现,HLJ343与体质量、体长显著相关;HLJ319、HLJ302及HLJE339与体长显著相关。本研究用大样本随机群体证实了此4个QTL位点与体质量或体长性状具有相关性,下一步可根据优势基因型指导家系配组,开展基于QTL结果的分子聚合育种研究。 相似文献