RAPD和SRAP分子标记在金针菇菌种鉴定中的应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

郭钟尧  姜辉  贾培培  郭立忠 《食用菌》2011,33(2):15-17

试验从分子生物学和形态学角度，利用SRAP和RAPD分子标记技术对7个金针菇菌株进行遗传多样性分析。SRAP共扩增出469条DNA条带。大部分条带分子量在200～3000bp，多态性条带为377条，占总条带数的80．4％，每对引物平均获得41．9条多态性条带。RAPD扩增出476个条带。其中多态性条带为274条，占总条带数的57．6％，每个引物平均获得343条多态性条带。结果证明，RAPD与SRAP分子标记技术在试验中分别在以相似系数0．91和0．72为阈值时，7个供试菌株的分组大致是相同的。金913和金19同源性最大，在2种分子标记技术中相似系数分别达到了0．9903和0．8966，表明金913和金19可能是同物异名，而金405与其他菌株的亲缘关系最远，其远缘优势应在杂交育种中引起重视。  相似文献   

石斛属植物遗传多样性RAPD分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

张建勇  袁佐清  刘涛 《北方园艺》2007,(7):134-136

应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对石斛属植物16个种进行了基因组DNA多态性分析.从82个随机引物中筛选出20个多态性好的引物进行RAPD扩增,扩增DNA片段数据用UPGMA聚类法构建系统发育树.20条引物共扩增出142条带,多态性带118条,约占总数的83.1%.聚类结果显示RAPD分子标记构建的系统发育树与经典分类系统一致.RAPD标记可为石斛属植物的系统分类研究提供分子生物学依据.  相似文献   

具有拮抗关系的18个香灰菌株遗传差异性分析     

《食用菌学报》2014,(2)

香灰菌(xiang-hui-jun)是银耳(Tremella fuciformis)的伴生菌,对银耳的生长、发育具有至关重要的作用。采用RAPD、SRAP和ISSR三种分子标记对具有拮抗关系的18个香灰菌菌株进行遗传差异性分析。结果表明:8对RAPD引物共扩增出59个位点片段,多态性条带总共为49条,占总片段条数的比率为83%;7对SRAP引物共扩增出49个位点片段,多态性条带总共为47条,占总片段条数的比率为96%;6对ISSR引物共扩增出60个位点片段,多态性条带总共为50条,占总片段条数的比率为83%。聚类分析表明,当以相异系数0.48为阈值时,可将这些香灰菌株分成7个类群:Hp.sp0006、TR柏溪、瓦坑野生、TR枫树和TR8801枫树分别自成一个类群,Hp.sp0052和69为一个类群,其余11个(Hp.sp0004、Hp.sp0010、T0050、T0048、T0036、TR23、TR5、TR95、71、TR03和TR86)菌株归为一个类群。  相似文献   

洋葱种质资源遗传多样性的SRAP和ISSR分析     

《中国蔬菜》2021,(3)

利用SRAP和ISSR分子标记技术对58份洋葱种质资源进行遗传多样性分析,筛选出9个扩增效果较好的ISSR引物,共扩增出105条清晰的条带,其中有多态位点的条带数为104条,多态性条带比率为99%;筛选出11个扩增效果较好的SRAP引物,共扩增出132条清晰的条带,其中有多态位点的条带数为115条,多态性条带比率为87%,表明58份洋葱种质资源具有丰富的遗传多样性。基于2种分子标记的聚类分析结果均可将58份洋葱种质资源明显分为4大类,二者的聚类分析结果基本一致,但SRAP分子标记技术检测的基因位点更多,是遗传多样性分析的最佳分子标记技术。  相似文献   

基于ISSR和SRAP分子标记的22株鸡腿菇遗传多样性和亲缘关系分析     

高傲  刘宇  宋庆港  谷彤彤  廖燕玲  荣成博 《中国食用菌》2021,(4):92-98

为进行鸡腿菇(Coprinus comatus)的种质资源鉴定和及其分子育种提供理论依据,以22株鸡腿菇菌株为试材,采用ISSR和SRAP分子标记技术,对样本进行遗传多样性分析.采用筛选出的24条ISSR引物和24对SRAP引物以22株鸡腿菇的基因组DNA为模板进行PCR扩增,共获得清晰的条带368条,其中多态性条带3...  相似文献   

真姬菇三个选育菌株的RAPD分析   总被引：7，自引：0，他引：7  

上官舟建  谢宝贵  罗联忠  林汝楷 《中国食用菌》2004,23(3):12-14

用 11个随机引物对三株新选育的真姬菇菌株进行基因组DNA的PCR扩增 ,应用RAPD技术分析不同菌株的DNA序列多态性 ,从分子水平上验证真姬菇新菌株遗传基因间的差异  相似文献   

基于SRAP分子标记的24个黑木耳栽培菌株遗传分析     

《食用菌》2019,(6)

以24个北方地区主栽的黑木耳菌株为材料,采用相关序列扩增多态性SRAP分子标记,对24个黑木耳菌株进行遗传分析。结果表明,从48对引物中筛选出了稳定性好、可重复性高、多态性稳定并能扩增出清晰明亮条带的25对引物,扩增出133条多态性条带,片段大小在0.1～1.5 kb,平均每个引物扩增出6条多态性条带。基于非加权组平均法(UPGMA)的聚类分析结果表明:遗传相似系数变化范围为0.56～1.0,在遗传相似系数为0.56时,将24个黑木耳菌株划分为2大类群,第一类包括黑山等18个菌株;第二类包括黑29等6个菌株。  相似文献   

东北地区香茶菜属植物遗传多样性的RAPD分析     

张博  刘翠晶  刘霞 《北方园艺》2013,(12)

以东北地区不同产地的24份蓝萼香茶菜和尾叶香茶菜样品为试材,采用RAPD分子标记技术对其进行遗传多样性分析.结果表明:从60条随机引物中筛选出5条引物用于2种香茶菜的扩增,2种香茶菜共扩增得到63条清晰条带,其中55条为多态性条带,多态性比率为87.30％.系统聚类分析结果表明,2种香茶菜亲缘关系明显,遗传多样性较丰富,且种间大于种内.因此,RAPD分子标记技术可以作为研究香茶菜属植物遗传多样性的有效标记方法.  相似文献   

不同产地人参种质资源RAPD和SSR分析     

侯志芳  孟露露  许世泉  王英平  雷秀娟  郑培和 《北方园艺》2016,(23):96-101

以15个产地人参种质资源为试材,采用RAPD和SSR分子标记技术对其遗传多样性进行分析。结果表明:2种分子标记均能揭示不同地区人参种质间的遗传多样性。共筛选出11条RAPD随机引物,平均每条引物可扩增出3~17条DNA片段,共扩增出104条清晰条带,多态性条带100条,多态性百分率为96.15%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.505 3~0.989 5,平均值为0.760 4。筛选出5对SSR引物,平均每对引物可扩增出1~8条DNA片段,共扩增出38条清晰条带,多态性条带35条,多态性百分率为92.11%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.400 0~0.960 0,平均值为0.742 1。RAPD和SSR标记的聚类分析在分类上稍有差异,但总体趋势一致,RAPD、SSR及RAPD+SSR均将样品聚为三大类,均能揭示它们之间的亲缘关系,为人参种质资源的收集与利用奠定了基础。  相似文献   

30份莲种质资源的RAPD遗传多样性分析     

吴景栋  刘生财  杨盛春 《长江蔬菜》2011,(16):42-45

采用RAPD分子标记技术对30份莲(Nelumbo nueifera Gaertn.)种质资源的遗传多样性进行鉴定.筛选出14对有效引物进行PCR扩增,共产生2 146条带,其中有1 516条为多态性条带,各对引物的平均多态性条带为108.29条,扩增条带的多态率达70.64％.对所得到的30份莲种质资源的RAPD图谱...  相似文献