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ISSR和RAPD分子标记技术在不同君子兰品种遗传多样性上的应用 总被引：1，自引：1，他引：0
采用ISSR标记和RAPD标记技术研究了15个君子兰品种的遗传多样性。结果表明:从55条寡聚核苷酸引物中筛选出10条简单重复序列引物,共扩增出65条带,平均每条引物扩增出6.5条带,其中5.4条多态性带,多态性比率为81.95%;从55条寡聚核苷酸引物中筛选出11条多态性引物,共扩增出47条带,平均每条引物扩增出4.27条带,其中32条多态性带,多态性比率为67.88%。POPGEN软件计算出君子兰品种间遗传距离为0.1123~0.6330,平均值为0.3263。基于遗传相似系数的UPGMA聚类分析将15个品种明显聚为二组,国兰系列品种为一组,日本兰系列品种组成另一组。 相似文献
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陈徵尼仲玲玲邹天福戚建莉 《中国果树》2015,(1):18-21
利用ISSR分子标记技术对甘肃省42份枣种质资源的遗传多样性进行分析。结果表明:筛选出8条引物共扩增出76条DNA谱带,其中多态性谱带70条,多态性位点比率92.0%;按照42份枣种质间的遗传距离构建UPGMA聚类图,42份枣种质被划分为4个大类、10个亚类,遗传多样性处于较高水平;从聚类结果看,原产自甘肃省的枣品种遗传背景相似,主要根据原产地进行聚类,目的性品种交换现象较少。另外,对6个未知身份的枣品种进行了初步鉴定。 相似文献
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山楂（Crataegus pinnatifida Bge.)遗传多样性的RAPD和ISSR标记分析 总被引：7，自引：0，他引：7
利用RAPD和ISSR标记对35份山楂（Crataegus pinnatifida Bge.）资源进行了DNA多态性分析。12个RAPD引物共扩增出110条清晰的谱带,其中89条显示多态性,平均每个引物扩增出7.4条多态性谱带。13个ISSR引物共扩增出110条清晰的谱带,其中94条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带。基于RAPD和ISSR标记,利用UPGMA分别构建了35份山楂资源的聚类树状图。距离系数分别为0～0.62（RAPD）和0～0.64（ISSR）,表明山楂具有较高的遗传多样性。 相似文献
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以不同地区的20份冬荪种质资源为试材，利用ISSR(inter-simple sequence repeat简单重复序列间扩增)分子标记技术，从78条引物中筛选出条带清晰、重复性高和特异性强的引物，在供试冬荪菌株中进行扩增。利用NTSYS 2.10e聚类分析软件UPGMA法进行聚类分析，同时利用PopGen 32软件对20份冬荪种质ISSR统计结果进行遗传多样性分析，以期通过分子标记技术评价冬荪种质资源遗传多样性，为冬荪遗传育种提供优质材料。结果表明：筛选出具备多态性ISSR引物24条，对供试冬荪菌株进行PCR扩增共获得谱带有788条，其中多态性谱带768条，多态位点比例达到97.5%;遗传多样性分析显示平均等位基因(Na)为1.991 3,平均有效等位基因数(Ne)为1.585 6,平均Nei′s基因多样性指数(He)为0.343 8,平均Shannon信息指数(I)为0.516 1;在遗传相似系数为0.67时，20份冬荪菌株可分为三大类群。综上，20株冬荪种质资源间具有丰富的遗传多样性，亲缘关系较复杂；不同来源的种质由于菌种流通频繁而导致亲缘关系复杂，育种亲本的选择纯化周期较长。 相似文献
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野生和栽培桔梗种质遗传多样性的SRAP研究 总被引：1，自引：0，他引：1
采用SRAP分子标记技术,对8份野生和8份栽培桔梗种质资源进行遗传多样性研究,旨在为桔梗的遗传育种提供理论依据。结果表明:12对随机引物组合共扩增出109条谱带,平均每对引物组合扩增出9.1条谱带,其中扩增出80条多态性谱带,平均每对引物组合扩增出6.7条多态性谱带,多态率为73.4%,显示出了较高的多态性。试验中SRAP数据的遗传相似系数范围为0.56~0.88,并以遗传相似系数0.56为标准,将16份桔梗种质资源分为野生桔梗和栽培桔梗二大类群。 相似文献
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芥菜种质资源的RAPD和ISSR分析 总被引：4，自引：0，他引：4
利用RAPD和ISSR标记对28份芥菜种质资源进行遗传多样性分析,20个RAPD引物共扩增出162条清晰的谱带,其中140条显示多态性,平均每个引物扩增出7.0条多态性谱带.18个ISSR引物共扩增出143条清晰的谱带,其中多态性谱带124条,平均每个引物扩增出6.9条多态性谱带.基于RAPD和ISSR两种标记,利用UPGMA分别构建了28份芥菜资源的聚类树状图.结果表明,RAPD和ISSR分别聚类以及两种标记混合聚类均将28份芥菜种质分为3类:第Ⅰ类群中包括了15份种质;第Ⅱ类群中包括了9份种质;第Ⅲ类群中包括了4份种质. 相似文献
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以12份杧果种质为试材,利用SRAP分子标记技术对其进行遗传多样性研究。结果表明:从36对引物中筛选出22对多态性好的引物,共扩增出251条DNA条带,其中多态性谱带181条,平均每对引物扩增得到15.08条多态性谱带,多态性比率为72.11%。UPGMA聚类表明,所有供试品种(系)之间的亲缘关系都比较近,相似系数在0.77~0.89;如果以相似系数0.78为标准,可将供试的12个品种(系)分为3类。表明利用SRAP技术能较好的区分杧果的亲缘关系;SRAP分子标记适合杧果的DNA遗传多样性分析,可作为杧果种质鉴定依据之一。 相似文献
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24个山东石榴品种遗传多样性的ISSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用ISSR分子标记技术,利用8条ISSR引物对24个山东石榴品种进行遗传多样性分析。结果表明:共检测到178个DNA位点,平均每条引物扩增出22.25个DNA位点,其中有122个多态性DNA位点,多态性位点比率为68.54%。平均观察等位基因数、平均有效等位基因数、平均Nei’s基因多样性指数、平均Shannon信息指数分别为1.685 4、1.379 0、0.228 2、0.345 3;品种的遗传相似系数为0.674 2~0.910 1,其中‘峄城多刺’与‘峄城竹叶青’这2个品种的亲缘关系最远,而‘峄城大红皮酸’与‘峄城大青皮酸’的亲缘关系最近。通过UPGMA法构建分子树状图,以遗传相似系数约0.806为阈值,将供试的24个山东石榴品种分为6类,表明ISSR分子标记技术可有效用于石榴品种的遗传多样性分析。 相似文献
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ISSR．PCR技术在桂花品种分类研究中的应用 总被引：24，自引：5，他引：24
利用ISSR．PCR方法对桂花的19个品种进行了基因组多态性分析，从74个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增，共扩增出9o条DNA片段，其中多态性DNA条带79条，占总扩增片段的87．8％ ，平均每个引物扩增的DNA带的数目为6．92条。根据ISSR扩增结果，应用RAPDistance软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算，利用UPGMA法构建聚类树状图。聚类分析的结果把供试桂花的l9个品种分为8个大类，并对4个品种群的遗传关系和种下分类系统进行了探讨。 相似文献
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采用营养液水培, 研究了根际低氧胁迫下Ca2+对两个耐低氧能力不同的黄瓜品种根系呼吸代谢的影响。结果表明: 与耐低氧能力较弱的‘中农8号’相比, 耐低氧能力较强的‘绿霸春4号’根系LDH活性增加幅度较低, 乳酸含量较少, ADH活性增加幅度较大, SDH和IDH活性降低幅度较小。低氧胁迫下, 营养液加钙处理能够提高根系SDH、IDH和ADH活性, 降低LDH活性和乳酸含量; 而低氧缺钙处理表现出相反的结果。这表明, 低氧胁迫下, Ca2+能提高根系乙醇发酵能力, 降低乳酸发酵, 使植物保持有氧呼吸代谢, 从而缓解低氧胁迫对植株的伤害。 相似文献
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我国南方长茄种质资源的ISSR标记分析 总被引：26，自引：1，他引：26
从分子水平用ISSR标记法对南方长茄资源的遗传多样性进行分析,从100个ISSR引物中共筛选出12个多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,对57个样品DNA共扩增出116条谱带,平均每个引物扩增出9·67条带,其中多态性位点84个(71%)。品种间遗传相似系数在0·51~0·98之间,表明茄子栽培种内品种间的遗传基础相对较狭窄。利用UPGMA聚类分析,能将57个南方长茄品种划分为6个类群,类群的划分与地方来源没有很大的关系。 相似文献
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黑穗醋栗品种亲缘关系的ISSR分析 总被引：4，自引：1，他引：3
采用ISSR标记技术对39个黑穗醋栗品种的亲缘关系进行分析。结果表明：13条ISSR引物扩增的总带数（A）从3到11条不等,平均扩增出6.77条带,平均多态性带百分比（P）为64.37%。聚类分析显示,在相似性系数为0.8496处将39个黑穗醋栗品种分为5组。第Ⅰ组包含8个起源国家的品种,说明世界各国之间基因交流较为频繁。‘Ben Lomond’和‘Kantata’同其他品种的遗传距离较远,两者又有诸多优良农艺性状,可作为黑穗醋栗的优良育种材料。 相似文献
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Hong-Li Tian Jian-Hua Xue Jun Wen Grant Mitchell Shi-Liang Zhou 《Scientia Horticulturae》2008,116(4):421-429
Genetic diversity and genetic relationships of lotus (Nelumbo Adanson) cultivars were evaluated using allozyme and ISSR markers. The samples used covered 11 accessions of possible hybrids between Nelumbo nucifera and Nelumbo lutea and 92 accessions of N. nucifera including 69 flower lotus, 13 rhizome lotus, 5 seed lotus and 5 wild lotus. For allozyme studies, a total of 31 alleles at 23 loci of 18 enzyme systems were detected of which 5 (21.7%) loci Aat, Idh, Mdh-2, Pgd, Sod were polymorphic. The loci of Aat and Idh included two alleles, Mdh-2, Pgd and Sod included three alleles. Eighteen genotypes were detected with the 13 alleles of the 5 polymorphic loci. The parameters of average allele number, observed heterozygosity, expected heterozygosity and Shannon information index of 92 N. nucifera samples were 1.35 ± 0.71, 0.06 ± 0.21, 0.05 ± 0.14, 0.10 ± 023, respectively. Thirteen ISSR primers generated 93 loci, of which 37.63% were polymorphic across all samples. The percentage of polymorphic loci, average allele number, expected heterozygosity and Shannon information index of 92 N. nucifera samples were 26.67%, 1.30 ± 0.46, 0.10 ± 0.18 and 0.15 ± 0.25, respectively for the ISSR data. The ‘Bottleneck effect’ and rapid propagation of clones after the ice ages may explain the low genetic diversity of lotus. The dendrograms based on ISSR and allozymes were not congruent. Based on the ISSR data, the 103 samples were divided into the N. nucifera group (Group I), and the group containing inter-specific hybrids between N. nucifera and N. lutea (Group II). The flower lotus, rhizome lotus, and seed lotus each has multiple sources of origin. Plant size, a criterion commonly used in the classification of cultivars of lotus, is not correlated with genetic variation. Flower color is correlated with the cultivar classification to some degree, but its variation is complex in the hybrids. 相似文献
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Li-Wang Liu Li-Ping Zhao Yi-Qin Gong Ming-Xia Wang Li-Ming Chen Jin-Lan Yang Yan Wang Fan-Min Yu Long-Zhi Wang 《Scientia Horticulturae》2008
Three molecular marker systems, RAPD (random amplified polymorphic DNA), ISSR (inter-simple sequence repeat) and SRAP (sequence-related amplified polymorphism), were employed for identification and genetic diversity analysis of 35 elite late-bolting radish cultivars. Detected by 35 RAPD primers, 22 ISSR primers and 17 SRAP primer combinations, the proportions of polymorphic bands were 85.44%, 85.2% and 85.41%, respectively, and the mean genetic similarity coefficients between pairs of genotypes were 0.781, 0.787 and 0.764, respectively. Each of the three molecular marker systems can identify all the cultivars. Five sets of three-RAPD primers, 3 sets of three-ISSR primers and 16 sets of three-SRAP primer combinations were able to distinguish all the cultivars. A linear relationship was observed between Resolving power (Rp) of a primer and its ability to distinguish genotypes. The 35 cultivars were clustered into three major groups based on the RAPD, ISSR and marker combination data with UPGMA, which are in high accordance with their own origins and main characteristics. The results demonstrated that these three marker systems could be useful for identification and genetic diversity analysis of radish cultivars. 相似文献
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石榴种质资源遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析 总被引：2，自引：0，他引：2
利用ISSR标记技术对47个石榴品种遗传关系进行了分析。筛选出多态性高的6条ISSR引物,共扩增出120条DNA条带,其中多态性带109条,多态性百分率为90.83%,有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样(H)、Shan-non信息指数(I)分别为1.294 5±0.309 4、0.189 7±0.161 8、0.309 1±0.219 8,遗传距离(Dg)变异为0.075 0～0.400 0,表明石榴品种间存在比较丰富的遗传多样性。利用UPGMA法构建分子树状图,将47个石榴品种分为5个类群。同时检测到15条特异性条带,可用于供试石榴中的11个品种鉴定的参考性标记。 相似文献
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15份葡萄种质亲缘关系的ISSR分析 总被引：10，自引：2，他引：10
利用ISSR标记对15份葡萄材料进行了基因组多态性分析,从60条引物中筛选出15条用于葡萄的ISSR扩增。共扩增出105条带,其中多态性条带91条,多态性百分率为86.7%。根据ISSR扩增结果,利用NTSYSpc2.10e软件进行Jaccard相似性系数分析,15份葡萄材料的遗传相似系数为0.27～0.75,平均遗传相似系数为0.471。通过UPGMA进行聚类分析,探索亲缘关系。在遗传相似系数0.39处,15份葡萄材料可分为2大类群。第1类包含7份山葡萄资源、2个山欧杂交品种,第2类包含3个欧亚种品种、2个欧美杂种品种和1个美洲杂种品种。由此可见,山葡萄与欧亚种、美洲杂种葡萄的亲缘关系较远,欧亚种与美洲杂种之间亲缘关系较近。 相似文献