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1.
PLIN基因多态性与秦川牛胴体、肉质性状的相关性研究 总被引：3，自引：0，他引：3
旨在研究PLIN基因第3、4外显子多态性与秦川牛部分产肉性状的关系。以相同饲养条件下18~24月龄的405头秦川牛为研究对象,利用PCR-SSCP方法和测序技术,对PLIN基因第3、4外显子进行SNPs位点检测,并将发现的SNPs位点与部分产肉性状进行关联性分析。结果,在第3外显子的156 bp处发生T→C突变,第4外显子的14 bp处发生C→T突变。方差分析表明:AB基因型个体的宰前活体质量、胴体质量、背膘厚和眼肌面积显著高于AA和BB基因型个体(P0.05),而且相对于AA基因型个体达到差异极显著水平(P0.01);DE基因型个体的胴体长、胴体胸深和背膘厚显著高于DD和EE基因型个体(P0.05),DD基因型个体的肌肉嫩度极显著高于EE和DE基因型个体(P0.01)。研究显示,PLIN基因单核苷酸多态性对秦川牛脂肪沉积有一定的影响,可作为影响胴体和肉质的候选基因,指导肉牛的育种工作。 相似文献
2.
《中国畜牧兽医文摘》2012,(4)
肌肉生长抑制素(Myostatin)或生长和分化因子-8(GDF8),已经被证实是能引起双肌表型的因子,一系列的变异使其基因失活导致其不能调节肌纤维的沉积。这种现象高频率的发生在一些品种的牛身上,比如比利时兰和皮爱蒙特牛。迄今为止,报道了在myostatin基因编码区9个变异能够引起非同源变异。其中,3个是错义突变包括外显子1的2个突变和外显子2的1个突变。其余的6个变异存在于外显子2和3,结果导致过早的出现终止密码子。这些都能引起双肌表型,虽然双肌表型牛存在饲养管理问题,比如分娩困难。但这种问题是可以通过遗传控制的育种程序所克服的。 相似文献
3.
用PCR-RFLPs方法对南阳牛、秦川牛、郏县红牛3个品种共411个个体的myostatin 5'调控区的单核苷酸多态性(SNPs)进行分析.结果表明,3个品种在myostatin 5'调控区T→A突变以等位基因T为主,仅在郏县红牛中发现1个AA型纯合体,郏县红牛品种显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05),其它品种处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).对黄牛myostatin 5'调控区T→A突变与南阳牛、秦川牛和郏县红牛生长性状进行相关分析,结果显示,TT型南阳牛6月龄的胸围和胸围指数显著低于TA型个体,TT型南阳牛18月龄的体高显著高于TA型个体(P＜0.05),但基因型对秦川牛和郏县红牛生长性状的效应不显著(P＞0.05).提示在南阳牛的育种实践中应该综合考虑南阳牛生长阶段和所要选择的性状. 相似文献
4.
以LYST基因作为候选基因,基于GeneBank提供的序列,以鲁西牛、南阳牛、秦川牛、郏县红牛4个品种共计602个个体为试验材料,利用DNA池测序结合聚丙烯酰胺凝胶电泳对LYST基因的插入缺失(InDel)进行探索验证,并对不同个体进行基因分型,再结合体尺数据分析不同基因型与生长性状的关系。结果表明:(1)黄牛LYST基因的第44内含子上检测到一段InDel,片段长度为22bp;(2)LYST基因内含子区P2InDel突变位点在郏县红牛、秦川牛、鲁西牛群体中均存在II、ID、DD共3种基因型,而在南阳牛群体中仅存在野生纯合基因型DD和杂合子ID两种基因型,无II基因型存在;(3)LYST基因第28号内含子区InDel位点多态性与郏县红牛的体高、胸围、体重、重高比及体躯指数之间存在显著相关性,可以作为候选分子标记用于郏县红牛分子标记辅助选择。结论:本研究在LYST基因第28内含子发现一个能显著影响郏县红牛生长性状的22bp插入突变,该突变可作为郏县红牛生长性状的潜在分子标记。 相似文献
5.
抑肌素(GDF8)是骨骼肌细胞生长的重要负调控因子.抑肌素基因突变是牛"双肌"性状形成的分子遗传基础,在不同牛品种中存在着不同的抑肌素基因突变类型,在利木赞品种中,"双肌"性状主要是抑肌素基因第2外显子的Q204X型突变及第3外显子nt821突变.本研究报道一种新的检测该突变的简便方法.应用突变型与正常型引物在一次PCR反应中同时检测出不同的等位基因.对Q204X突变型PCR产物克隆测序分析表明,该片段确实含有一个能导致抑肌素功能缺陷的Q204X突变. 相似文献
6.
牛抗病基因BoLA-DRB3的新等位基因的发现 总被引：4，自引：1，他引：4
BoLA-DRB3基因是主要组织相容性复合物（Major Histocompatibility Complex，MHC）基因家族中的Ⅱ类基因，它是该基因家族中最主要的功能基因，所编码的MHC抗原与免疫应答、抗病性密切相关。其第2外显子是编码抗原的主要功能区。本试验以地方良种鲁西牛、秦川牛、晋南牛和南阳牛为研究对象，采用PCR—RFLP方法对DRB3基因307bp的扩增产物进行多态性分析，结果表明DRB3基因第2外显子的第154位C→A，从而产生新的等位基因。经x^2适合性检验，鲁西牛在MHC-DRB3基因第2外显子的Msp I酶切位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态（P〈0．05）。 相似文献
7.
用PCR—RFLPs方法对南阳牛、秦川牛、郏县红牛3个品种共411个个体的myostatin 5′调控区的单核苷酸多态性（SNPs）进行分析。结果表明，3个品种在myostatin 5′调控区T→A突变以等位基因T为主，仅在郏县红牛中发现1个AA型纯合体，郏县红牛品种显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态（P〈0．05），其它品种处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0．05）。对黄牛myostatin 5′调控区T→A突变与南阳牛、秦川牛和郏县红牛生长性状进行相关分析，结果显示，TT型南阳牛6月龄的胸围和胸围指数显著低于TA型个体，TT型南阳牛18月龄的体高显著高于TA型个体（P〈0．05），但基因型对秦川牛和郏县红牛生长性状的效应不显著（P〉0．05）。提示在南阳牛的育种实践中应该综合考虑南阳牛生长阶段和所要选择的性状。 相似文献
8.
采用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术分析了类胰岛素生长因子1(IGF-Ⅰ)基因5′侧翼区、第5外显子、第2外显子在南阳牛、鲁西牛、中国西门塔尔牛3个牛品种中的遗传多态.结果表明在IGF-Ⅰ基因的5′侧翼区、第5外显子上未发现PCR-SSCP或PCR-RFLP遗传多态;在第2外显子中发现PCR-SSCP多态,有3种基因型AA型、AB型、BB型.对第2外显子的多态片段测序分析表明在35 bp处有碱基A→G的突变,248 bp处有碱基C→T的突变,256 bp处有碱基A→G的突变;35 bp、248 bp的碱基突变都是无义突变,而256 bp处碱基A→G的突变为有义突变,使谷氨酸变为甘氨酸. 相似文献
9.
研究过氧化物酶体增殖激活受体α (PPARα) 基因第7外显子SNP位点与牛的部分胴体、肉质性状的相关性。以6个牛品种(秦川牛、南阳牛、郏县红牛、鲁西牛、安格斯、夏南牛) 共计717个个体为研究对象,采用PCR SSCP结合DNA测序方法对PPARα基因第7外显子进行SNP检测,并该SNP位点与108头秦川牛的部分胴体、肉质性状的相关性进行分析。结果发现在PPARα基因第7外显子的184位检测到C→T突变,在南阳牛、秦川牛、郏县红牛、安格斯、鲁西牛、夏南牛这6个群体中等位基因E/F的频率分别是0.225/0.775,0.151/0.849,0.125/0.875,0.123/0.877,0.070/0.930, 0.157/0.783;遗传学指标结果显示：秦川牛、郏县红牛、安格斯、鲁西牛和夏南牛这5个群体属于低度多态(PIC<0.25),南阳牛为中度多态（PIC=0.288）;相关分析结果显示：该位点与秦川牛的背膘厚和胴体长两个性状显著相关,表现为FF基因型个体在背膘厚性状方面显著高于EE和EF基因型个体(P<0.05),FF基因型个体的胴体长显著高于EE基因型个体(P<0.05)。这一位点可能是影响牛背膘厚和胴体长的主效QTN或与之紧密连锁,可做为肉牛选育的候选分子标记。 相似文献
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抑肌素(GDF8)是骨骼肌细胞生长的重要负调控因子。抑肌素基因突变是牛"双肌"性状形成的分子遗传基础,在不同牛品种中存在着不同的抑肌素基因突变类型,在利木赞品种中,"双肌"性状主要是抑肌素基因第2外显子的Q204X型突变及第3外显子nt821突变。本研究报道一种新的检测该突变的简便方法。应用突变型与正常型引物在一次PCR反应中同时检测出不同的等位基因。对Q204X突变型PCR产物克隆测序分析表明,该片段确实含有一个能导致抑肌素功能缺陷的Q204X突变。 相似文献
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Copy number variations at LEPR gene locus associated with gene expression and phenotypic traits in Chinese cattle 
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下载免费PDF全文 Tao Shi Yao Xu Mingjuan Yang Yongzhen Huang Xianyong Lan Chuzhao Lei Xinglei Qi Xiaoming Yang Hong Chen 《Animal Science Journal》2016,87(3):336-343
Current evidences show that copy number variations (CNVs) are linked to complex phenotypic traits. Leptin receptor (LEPR) gene plays a critical role in energy homeostasis and fat development and re‐sequencing of the cattle genome revealed the CNV region (herein referred to as “I3 DNA”) within the LEPR intron 3. In the present study, we qualified copy numbers of I3 DNA within LEPR gene in four cattle breeds (Qinchuan, Nanyang, Jinnan and Xianan) by quantitative PCR, and explored their impacts on LEPR gene expression and phenotypic traits in Qinchuan and Nanyang cattle. The results showed that more individuals in Nanyang are with loss of the I3 DNA copy number than that in the others. Additionally, I3 DNA CNVs exhibited a significant negative correlation with LEPR gene expression (P < 0.05). Association analysis showed that gain/normal copy number types performed better traits of body weight, body height and body length than the loss type in Nanyang. To the best of our knowledge, this is the first evidence of the association between LEPR CNVs and cattle traits, and this may help deep understanding of the function of CNVs which may be promising markers for beef cattle breeding and genetics. © 2015 Japanese Society of Animal Science 相似文献
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试验旨在对宁夏六盘山区肉牛杂交改良群体肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的多态性进行研究,为宁夏肉牛杂交改良选育提供理论基础。采用PCR-RFLP对该群体110头个体MSTN基因多态性进行检测。结果扩增出1346 bp的目的片段,其PCR产物被限制性内切酶DraⅠ消化后表现出多态性,共检测到2种基因型:AT和TT,其中AT基因型频率为0.0545,TT基因型频率为0.9455;T为优势等位基因,TT基因型为优势等位基因。因此,宁夏六盘山区的肉牛杂交改良群体MSTN基因具有多态性。 相似文献
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采用PCR-SSCP技术检测边鸡及2个对照鸡群体(京海黄鸡和尤溪麻鸡)肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因外显子3的单核苷酸多态性,并与边鸡的生长性状进行相关性分析。结果表明,在MSTN基因外显子3的8527—8528 bp处检测到一个TC的插入。在边鸡和京海黄鸡中只检测到2种基因型(AA和AB基因型),在尤溪麻鸡中检测到3种基因型(AA、AB和BB基因型)。在3个鸡品种中都以A等位基因为优势等位基因。最小二乘分析结果表明,边鸡2种基因型个体的6~16周龄体重均无显著差异(P>0.05)。 相似文献
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试验旨在获得秦川牛肉用新品系（以下简称"秦川肉牛"）具有高干扰效率的脂肪细胞分化相关蛋白2（PLIN2）基因干扰siRNA及高过表达效率的基因超表达载体,为后续研究PLIN2基因在秦川肉牛脂肪细胞分化过程中的功能提供试验依据。通过采用siRNA介导的靶基因沉默技术合成靶向牛PLIN2 mRNA序列的si-PLIN2及构建真核pcDNA3.1（+）-PLIN2过表达载体,利用FuGENE6低毒性转染试剂配制转染复合物,转染秦川肉牛脂肪细胞并进行诱导分化。采用实时荧光定量PCR检测技术检测各试验组与对照组中PLIN2基因的相对表达量,并计算目的基因干扰及过表达效率;采用Western blotting方法检测蛋白水平的表达情况;采用BODIPY脂滴染色的方法观察表型。结果表明,转染秦川肉牛前体脂肪细胞后干扰组3对si-PLIN2（si-PLIN2_01、si-PLIN2_02和si-PLIN2_03）与对照组（si-PLIN2-NC）相比,PLIN2基因表达量下降（P<0.01）,干扰效率分别为71%、54%和50%;蛋白水平检测发现,si-PLIN2_01、si-PLIN2_03组蛋白水平表达与对照组（si-PLIN2-NC）相比出现下降趋势;脂滴染色后发现,干扰组与对照组相比,脂滴数目明显减少。过表达组pcDNA3.1（+）-PLIN2与对照组相比,PLIN2基因表达量显著上调,达35倍,脂滴数目明显增多。综上所述,siRNA介导的PLIN2基因沉默或pcDNA3.1（+）介导的体外表达载体均可以成功实现对PLIN2基因在秦川肉牛脂肪细胞分化过程中的干扰或超表达,并影响脂肪细胞分化过程中脂滴的形成数量。本研究为进一步探究PLIN2在秦川肉牛脂肪细胞分化过程中的功能奠定基础。 相似文献
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Associations of polymorphisms in the Pit-1 gene with growth and carcass traits in Angus beef cattle 总被引：16，自引：0，他引：16
The Pit-1 gene was studied as a candidate for genetic markers of growth and carcass traits. Angus beef cattle that were divergently selected for high- or low-blood serum IGF-I concentration were used in this study. The single-strand conformation polymorphism method was used to identify polymorphism in the Pit-1 gene including regions from intron 2 to exon 6. Two polymorphisms, Pit1I3H (HinfI) and Pit1I3NL (NlaIII), were detected in intron 3 of the Pit-1 gene. One polymorphism, Pit1I4N (BstNI), was found in intron 4, and a single nucleotide polymorphism, Pit1I5, was found in intron 5. The previously reported polymorphism in exon 6, Pit1E6H (HinfI), was also studied in 416 Angus beef cattle. Associations of the polymorphisms with growth traits, carcass traits, and IGF-I concentration were analyzed using a general linear model procedure. No significant associations were observed between these polymorphisms and growth and carcass traits. 相似文献
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试验旨在利用生物信息学方法对秦川牛肉用新品系(以下简称“秦川肉牛”)AdipoR1、AdipoR2基因的CDS区进行克隆及分析,并探究其在秦川肉牛不同组织及肌细胞诱导分化不同时间的表达情况。以秦川肉牛为研究对象,经PCR扩增得到AdipoR1、AdipoR2基因CDS区序列,运用生物信息学软件对其功能结构进行预测,同时采用实时荧光定量PCR术获得AdipoR1、AdipoR2基因在秦川肉牛15个组织和诱导分化后不同时间的表达量,再进行差异分析。结果显示,秦川肉牛AdipoR1基因编码序列全长为1128 bp,编码375个氨基酸,蛋白分子质量为42446.41 u,理论等电点为6.70,AdipoR1蛋白二级结构主要由α-螺旋构成,二、三级结构预测结果一致,属于亲水性蛋白,没有信号肽位点;AdipoR2基因编码序列全长1161 bp,编码386个氨基酸,蛋白分子质量为43707.70 u,理论等电点为6.27。亚细胞定位结果表明,AdipoR1蛋白有60.9%的可能定位在细胞膜,AdipoR2蛋白有73.9%的可能定位在细胞膜。不同物种氨基酸系统进化树结果显示,秦川肉牛AdipoR1、AdipoR2基因编码的氨基酸序列分别与瘤牛和野牦牛的亲缘性最近。实时荧光定量PCR结果显示,AdipoR1、AdipoR2基因在秦川肉牛心脏、肝脏、肌肉等15个组织中均有表达,且在肌肉组织中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),在肌细胞诱导分化时序上也有明显差异。本试验揭示了AdipoR1和AdipoR2基因在秦川肉牛不同组织和肌细胞诱导分化后不同时间上的表达差异,以期为进一步探究AdipoR1、AdipoR2基因的生物学功能与调控机理奠定基础。 相似文献
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试验旨在利用生物信息学方法对秦川牛肉用新品系（以下简称"秦川肉牛"）AdipoR1、AdipoR2基因的CDS区进行克隆及分析，并探究其在秦川肉牛不同组织及肌细胞诱导分化不同时间的表达情况。以秦川肉牛为研究对象，经PCR扩增得到AdipoR1、AdipoR2基因CDS区序列，运用生物信息学软件对其功能结构进行预测，同时采用实时荧光定量PCR术获得AdipoR1、AdipoR2基因在秦川肉牛15个组织和诱导分化后不同时间的表达量，再进行差异分析。结果显示，秦川肉牛AdipoR1基因编码序列全长为1 128 bp，编码375个氨基酸，蛋白分子质量为42 446.41 u，理论等电点为6.70，AdipoR1蛋白二级结构主要由α-螺旋构成，二、三级结构预测结果一致，属于亲水性蛋白，没有信号肽位点；AdipoR2基因编码序列全长1 161 bp，编码386个氨基酸，蛋白分子质量为43 707.70 u，理论等电点为6.27。亚细胞定位结果表明，AdipoR1蛋白有60.9%的可能定位在细胞膜，AdipoR2蛋白有73.9%的可能定位在细胞膜。不同物种氨基酸系统进化树结果显示，秦川肉牛AdipoR1、AdipoR2基因编码的氨基酸序列分别与瘤牛和野牦牛的亲缘性最近。实时荧光定量PCR结果显示，AdipoR1、AdipoR2基因在秦川肉牛心脏、肝脏、肌肉等15个组织中均有表达，且在肌肉组织中的表达量最高，极显著高于其他组织（P<0.01），在肌细胞诱导分化时序上也有明显差异。本试验揭示了AdipoR1和AdipoR2基因在秦川肉牛不同组织和肌细胞诱导分化后不同时间上的表达差异，以期为进一步探究AdipoR1、AdipoR2基因的生物学功能与调控机理奠定基础。 相似文献