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相似文献
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1.
鹿狂犬病病毒G基因主要功能区的序列分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
通过反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出了中国鹿狂犬病野毒株(8202株)糖蛋白(G)基因膜外主要功能区的2个片段,共约800个bp(370~1179),含有可以诱导中和抗体的2个抗原决定簇的基因片段和决定毒力及与神经细胞受体结合部位的基因片段。通过平端连接将2个片段克隆到pUC18的SmaⅠ位点,采用Sanger双脱氧终止法测定cDNA片段的核苷酸序列,并推导出其氨基酸序列。将这一序列与国内外已发表的11株狂犬病病毒的相应序列输入计算机进行比较分析,结果表明8202株主要功能区与上述11个毒株核苷酸序列的同源性在73.0%~96.4%之间,氨基酸序列的同源性在86.4%~94.4%之间,8202株与中国疫苗株无论是核苷酸序列还是氨基酸序列的同源性均最高,而与中国街毒(CDX-1)的核苷酸序列同源性最低,与CVS株的氨基酸序列的同源性最低。本研究对于进行狂犬病病毒的分子流行病学调查和研制鹿狂犬病基因工程苗具有重要意义  相似文献   

2.
狂犬病无毒疫苗株SRV9G基因主要功能区的序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
通过反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出了狂犬病无毒疫苗株(SRV9)糖蛋白(G)基因膜外主要功能区的两个片段,共约740个bp(450 ̄1144),含有可以诱导中和抗体的两个抗原决定簇和决定毒力及与神经细胞受体结合部位的基因片段。通过平瑞连续将两片段克隆到pUC18的SmaI位点。采用Sanger双脱氧终止法测定cDNA片段的核苷酸序列,并推导出其氨基酸序列。将这一序列与已发表的狂犬病病毒  相似文献   

3.
狂犬病病毒糖蛋白基因主要功能区的克隆和序列比较分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
对我国不同来源的狂犬病野毒株8202、BRV、MRV以及无毒疫苗株SRV9的G基因405~1144位核苷酸序列进行了RT-PCR扩增、克隆和序列测定,并应用计算机对其进行了分析比较。结果证明,鹿源8202株与中国人用疫苗株为同源株(同源性达97.0%),因此我国鹿狂犬病极可能是人用疫苗毒株污染所致;同地不同动物分离的MRV株和BRV株为亲缘关系较远毒株,表明BRV引起的牛狂犬病不是由于MRV感染所致;疫苗株SRV9与3个野毒株同源性在83%~84%之间。3个野毒株8202、BRV、MRV及疫苗株SRV9的糖基化位点和抗原决定簇内某些氨基酸亦不同。由计算机建立的系统树首次证明我国存在着狂犬病病毒基因亚型。8202、MRV、SRV9和其他对照株的同源性在85.3%以上,为Ⅰa亚型;BRV与它们的同源性仅为82.3%,被分为Ⅰb亚型。从而证明我国存在亲缘关系较远的狂犬病野毒株  相似文献   

4.
应用RT-PCR扩增了我国南京、成都、吉林3个兽医生物制品厂提供的猪瘟病毒兔化弱毒株(C株)的E2基因保护性抗原编码区,然后将其克隆到pGEM-T载体中,用Sanger′s双脱氧法对重组质粒中的插入片段进行了序列分析。将测得的这3个厂生产的C株的核苷酸序列及其推导的氨基酸序列与作者实验室测得的国内石门株和国外测得的C株相同区域进行同源性比较,发现不同来源的C株及石门株之间存在不同程度的差异,核苷酸同源性为93.6%~99.6%,氨基酸同源性为90.6%~98.9%。  相似文献   

5.
新城疫病毒(NDV)四平株、昌黎株、青岛株、F48E8株分别接种9日龄SPF鸡胚增殖,蚀斑纯化(3代),生物学特性鉴定及结合基因序列分析,表明NDV四平株、昌黎株、青岛株均为强毒株。经差数、蔗糖密度梯度离心提纯病毒,分别提取RNA,利用一对特异性引物及RT-PCR方法,一次性扩增出 NDV四平株、昌黎株、青岛株和 F48E8株的全长 HN基因,分别将该HN基因克隆入载体pKS(-)并进行测序。序列分析表明,这4个毒株HN基因核苷酸长度均为1713bp,编码571个氨基酸,其中四平株和 F48E8株含有5个糖基化位点,青岛株和昌黎株含有 6个糖基化位点,四平株含有 12个半胱氨酸残基,而昌黎株、青岛株和F48E8株含有13个半胱氨酸残基。3个野生毒株与F48E8相比较,核苷酸序列同源性为85.7%-99.3%,推导的氨基酸序列同源性为 89.5%-98.8%,其中 NDV四平株与标准强毒 F48E8同源关系最近,核苷酸同源性为 99.3%,推导的氨基酸同源性为 98. 8%。  相似文献   

6.
新城疫病毒(长春株)F蛋白基因的克隆和序列分析   总被引:21,自引:6,他引:15  
新城疫病毒(NDV)长春株在鸡胚增殖后纯化,提取RNA,然后利用特异性引物,经RT-PCR一次性扩增出了NDV长春株的全长F基因。将该F基因插入pKS(-)后,进行了序列测定。序列分析表明,该F基因核苷酸长度为1758bp,编码553个氨基酸,序列中有6个糖基化位点,13个半胱氨酸残基,裂解位点区(112~117)氨基酸序列为Gly-Arg-Gln-Gly-Arg-Leu,与所有弱毒株在这一区域的序列(Gly-Arg/Lys-Gln-Gly/Ser-Arg-Leu)相符,证明长春株为弱毒株。同源性分析表明,长春株F基因与目前国外发表的其他NDVF基因相比,核苷酸序列同源性在88%~99%之间,推导的氨基酸序列同源性在90%~98%之间  相似文献   

7.
本研究用无特定病原体(SPF)鸡胚增殖禽流感病毒鹅体分离株A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)(GD1/96),提取病毒基因组总RNA,运用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术分别扩增该病毒分离株的8个基因片段的cDNA,分别克隆后进行序列测定。序列分析结果表明,所扩增到的8个片段均包含相应的病毒基因的完整开放阅读框架。GD1/96株与1997年香港禽流感事件中的4株香港流感病毒分离株(分别来自人、鸡、鸭和鹅)的HA基因的高度同源性说明它们可能起源于同一种系,但NS基因的差异说明它们分属于不同的基因群系。GD1/96株与香港流感病毒分离株的核苷酸和推导的氨基酸序列的同源性较低(63.9% ̄98.1%),而香港流感病毒分离株之间的核苷酸和氨基酸序列的同源性很高(96.5% ̄100%),且香  相似文献   

8.
新城疫病毒(青岛株)F蛋白基因的克隆和序列分析   总被引:7,自引:1,他引:6  
参考新城疫病毒(NDV)长春株的F基因序列设计了1以特异性引物,应用RT-PCR对NDV青岛株(野毒)的F基因进行了扩增,扩增产物克隆后测序,扩出的F基因核苷酸长度为792bp,编码261个氨基酸,包括完整的F2片段和部分F1片段,裂解位点区(112-117aa)氨基酸序列为Arg-Arg-Gln-Arg-Arg-Phe,与国外发表的强毒株序列相符,正明青岛株为强毒株,根据该基因推导的所基酸序列,与国内外发表的NDVF蛋白氨基酸序列相比,同源性为88.1%-94.3%。  相似文献   

9.
新城疫病毒四平株HN蛋白基因的克隆与序列分析   总被引:4,自引:1,他引:3  
新城疫病毒(HDV)四平株在鸡胚增殖后纯化,提取RNA,然后利用特异性引物,经RT-PCR一次性扩增出了NDV四平株的全长HN基因。将该HN基因插入pKS后测序。序列分析表明,该HN基因核苷酸长度为1742bp,编码571个氨基酸,序列中有5个糖基化位点,12个半胱氨酸残基。同源性分析表明,四平株HN基因与目前国外发表的其他NDVHN基因相比,核苷酸序鲁同源性在83.4 ̄89.2%之间,推导的氨基  相似文献   

10.
参考国外发表的新城疫病毒(NDV)的HN基因序列设计了1对特异性引物,应用RT-PCR对NDV昌黎株(野毒)的HN基因进行了扩增,扩增产物克隆后测序。扩增出的HN基因核苷酸长度为1 742bp,编码571个氨基酸,序列中有6个糖基化位点,13个半胱氨酸残基,与国外发表的强毒株序列相符。核苷酸同源怀在88.5%~92.9%,推导的氨基酸序列同源性在90.0%~94.2%之间。  相似文献   

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