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应用AFLP技术检测水稻遗传多样性的研究 总被引：5，自引：0，他引：5
利用扩增片断长度多态性（Amplified fragment lenth polymorphism简作AFLP)分子标记技术研究了23个水稻品种的遗传多样性从49对AFLP引物中筛选出4对多态性高，分辨能力强的引物。4个AFLP引物组合分别扩增出43、37、49、33条多态性带，平均每个引物组合扩出40．5条多态性带，4个引物组合共扩增出246条带。利用AFLP数据进行聚类分析，将23个品种聚为10个类群，结果表明，AFLP在水稻类群划分的应用是可行的。 相似文献
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大白菜的适宜AFLP-Pst I/Mse I引物组合 总被引：1，自引：1，他引：0
基于PCR的DNA指纹鉴定技术AFLP广泛应用于生物多样性、遗传图谱构建、基因定位、分子系统发育和品种鉴定等方面.为了筛选出大白菜适宜的AFLP引物组合,研究以抗根肿病大白菜双单倍体CR Shinki、感病自交系94SK及其后代F2构成的纯合抗病和纯合感病DNA混合池为材料,利用256对Pst I/Mse I引物组合进行了AFLP分析.结果表明:平均每个组合检测到55条带,共扩增13 079条带,平均每1 000条带检测到1.30个根肿病抗性基因连锁标记;多态性带数为3 167条,双亲间多态性频率约为0.24;扩增带数与多态性带数呈线性正相关,引物组合中的不同GC含量与扩增带数和多态性带数存在显著性差异,并表现出线性负相关.筛选出的适宜53对引物组合共扩增出4 381条带,占总扩增片断的33.50%,平均每对扩增出83条,其中9个组合扩增出与抗根肿病基因连锁标记. 相似文献
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马铃薯品种遗传多样性的AFLP分析 总被引：5，自引：0，他引：5
利用AFLP分子标记技术对19份克新系列马铃薯品种进行了遗传多样性分析,用30对引物组合进行了初筛,选出7对有多态性的引物组合进行了详细研究。每对AFLP引物组合扩增出54~90条带,共获得495条带,其中多态性条带为302条。AFLP分析表明19个材料的遗传距离介于0.2091~0.7679之间,平均值为0.4811。聚类分析将19份材料划分为4类,其中第2类包括14个品种,占总数73.86%,表明多数品种亲缘关系较近,但有少数品种亲缘关系较远,说明克新系列马铃薯的遗传基础有所拓宽。研究表明：AFLP指纹分析技术具有很高的分辨率,适于进行马铃薯遗传多样性研究 相似文献
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羊耳蒜遗传多样性研究中AFLP反应体系的建立与初步应用 总被引：2，自引：1，他引：1
为研究羊耳蒜种质资源遗传多样性,建立并初步应用羊耳蒜AFLP反应体系。以羊耳蒜幼嫩叶片为材料,采用常规SDS法提取基因组DNA,通过优化AFLP反应体系中的几个关键因素,建立适合羊耳蒜的AFLP银染反应体系,并利用筛选出的引物组合对羊耳蒜的遗传多样性进行初步研究。经EcoRⅠ和MseⅠ酶组合37℃酶切3 h后可将500 ng基因组DNA完全切开;酶切产物和接头经16℃连接过夜后,用带有1个选择性碱基的预扩引物和带有3个选择性碱基的选扩引物分别进行扩增,扩增产物经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染,能够得到清晰的扩增图谱。3对引物组合对8个羊耳蒜种群共185个体的扩增共得到221条条带,其中多态性条带195条,多态性条带百分率为88.24%。本研究结果表明建立的AFLP反应体系可用于羊耳蒜种质资源遗传多样性研究。 相似文献
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利用SSR和SRAP标记分析花椰菜自交系的遗传多样性 总被引：1，自引：0，他引：1
为选育优质花椰菜新品种,指导种质资源引进和利用,本研究采用简单重复序(simple sequence repeat,SSR)标记和相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记对38份花椰菜自交系进行了遗传多样性分析,分别从48对SSR引物、48对SRAP引物中各筛选出4对有效引物。4对SSR引物扩增的总条带数为47个,多态性条带为39个,平均多态性比率达83.0%;4对SRAP引物扩增的总条带数为86个,多态性条带为51个,平均多态性比率为59.3%,该结果显示花椰菜自交系间具有较丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析揭示了花椰菜自交系的熟期与其遗传差异相关。 相似文献
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本文利用AFLP方法对在农业生产上大面积推广使用的4个玉米杂交组合及其8个亲本共12个材料进行了分析研究，得到了清晰的DNA扩增指纹图谱。在AFLP分析当中，共采用了10个EcoRI 3／MseI 3引物组合，每个引物组合扩增出的条带数在62～95条之间，平均为85．3条。并从这10个引物组合中筛选出一个引物组合，能够用来对供试4个玉米杂交种进行真实性及品种纯度鉴定。从而证明了AFLP技术在玉米种子真实性及品种纯度鉴定中的可行性。该项技术应用于玉米种子真实性及品种纯度鉴定在国内尚属首次。其具有稳定性重复性好，检测分辨率高等优点．很适合于玉米种子真实性及品种纯度鉴定。是今后种子真实性及品种纯度鉴定的发展方向，应加大其研究力度。 相似文献
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AFLP分子标记技术在名贵春兰鉴别中的应用 总被引：3，自引：0，他引：3
从基因水平建立名贵春兰品种的鉴定方法,突破以往只能用传统方法鉴定名贵春兰品种的局限性;利用AFLP分子标记技术对18种主要名贵春兰品种进行了DNA指纹图谱分析,结果筛选出16对引物,这16对引物在18个名贵春兰品种中共扩增出345条带(平均每对引物扩增21.56条带),其中有多态性带169条(平均每对引物扩增多态性带10.56条),多态性比例为48.99%;通过这些多态性条带的不同组合,可明确将供试的18个名贵春兰品种加以区分,并作为18个名贵春兰品种鉴定的依据。 相似文献
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哺鸡竹亲缘关系的AFLP和SRAP分析 总被引：6，自引：0，他引：6
本研究采用AFLP和SRAP分子标记技术对9个哺鸡竹类竹种(含2个变型)的亲缘关系进行分析。研究结果表明:12对AFLP引物共扩增出359条带,多态性条带比率为49.7%,相似系数变化范围在0.779～0.978之间;24对SRAP引物共扩增出258条带,多态性条带比率为64.0%,相似系数变化范围在0.721～0.958之间。UPGMA聚类分析表明,AFLP和SRAP标记均将哺鸡竹分成2大类:第Ⅰ类为富阳乌哺鸡竹、花哺鸡竹、黄纹竹、黄秆乌哺鸡竹、毛壳花哺鸡竹、乌哺鸡竹、白哺鸡竹;第Ⅱ类为云和乌哺鸡竹、红哺鸡竹。对这两种标记相似性系数进行相关性分析,AFLP与SRAP的结果呈极显著相关(r=0.934),但SRAP标记比AFLP标记可在竹类及其种下等级检测到更大的遗传变异。 相似文献
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甘蔗常用亲本及优良组合双亲间遗传相似性分析 总被引：3，自引：1，他引：2
采用18对SSR引物和15对AFLP引物对我国196份甘蔗常用亲本的遗传相似性进行分析,分别获得438和1192个标记,多态性位点比例分别是87.60%,80.80%,平均为84.2%;亲本遗传相似系数变幅介于0.476～0.9099之间,总平均值为0.6673,遗传差异处于中等水平的亲本占了大多数,而差异较小和较大的都只是少数;45个甘蔗品种亲系的遗传相似系数分布在0.5687～0.6723,平均值为0.6723,91.11%甘蔗品种亲系的遗传相似系数集中在0.6100～0.7300之间,较理想的甘蔗杂交组合亲本间的遗传相似系数应为0.6723±0.0600;聚类分析表明,以遗传相似系数阈值约为0.700划分,育出45个品种所使用的30个亲本可分为9大类,在不同类型间选择亲本搭配的组合更容易选育出优良品种. 相似文献
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花生DNA分子标记的研究Ⅲ不同限制酶组合AFLP分析效果比较 总被引：1，自引：0，他引：1
采用了28对EcoR I/Mse I AFLP选择性扩增引物、64对Pst I/Taq I AFLP选择性扩增引物,对 作图亲本24-3、B4及其杂种F1进行了分析,统计了两种限制酶组合的扩增总带数、多态性带数及多 态性率。秩和检验结果说明,两种限制酶组合AFLP每对引物扩增出的总带数无显著差异,而多态性条 带数目以及多态性率均有极显著的差异。证明尝试不同的限制酶组合可望揭示出花生品系材料间更 为丰富的遗传变异性。 相似文献
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采用了28对EcoR I/Mse I AFLP选择性扩增引物、64对Pst I /Taq I AFLP选择性扩增引物，对作图亲本24-3、B4及其杂种F1进行了分析，统计了两种限制酶组合的扩增总带数、多态性带数及多态性率。秩和检验结果说明，两种限制酶组合AFLP每对引物扩增出的总带数无显著差异，而多态性条带数目以及多态性率均有极显著的差异。证明尝试不同的限制酶组合可望揭示出花生品系材料间更为丰富的遗传变异性。 相似文献
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Identification of polymorphic DNA markers in cultivated peanut (Arachis hypogaea L.) 总被引：17，自引：0，他引：17
The detection of DNA polymorphism in cultivated peanut (Arachis hypogaea L.) is reported here for the first time. The DNA
amplification fingerprinting (DAF) and amplified fragment length polymorphism (AFLP) approaches were tested for their potential
to detect genetic variation in peanut. The AFLP approach was more efficient as 43% of the primer combinations detected polymorphic
DNA markers in contrast to 3% with the DAF approach. However, the number of polymorphic bands identified using primers selected
in both approaches was comparable. In the DAF study, when 559 primers of varying types were screened, 17 (mostly 10-mer types)
detected polymorphism producing an average of 3.7 polymorphic bands per primer with a total of 63 polymorphic markers. In
the AFLP study, when 64 primer combinations (three selective nucleotides) corresponding to restriction enzymes Eco RI and
Mse I were screened, 28 detected polymorphism. On an average, 6.7% of bands obtained from these 28 primer pairs were polymorphic
resulting in a total of 111 AFLP markers. Our results demonstrate that both AFLP and DAF approaches can be employed to generate
DNA markers in peanut and thus have potential in the marker-assisted genetic improvement and germplasm evaluation of this
economically important crop.
This revised version was published online in July 2006 with corrections to the Cover Date. 相似文献
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双丰系列甜菜品种(系)AFLP亲缘关系及系谱分析 总被引：13，自引：0，他引：13
应用AFLP技术对甜菜双丰系列的8个品种(系)进行AFLP多态性分析,并结合系谱分析对其进行综合评价。从64对引物中筛选出10对多态性和分辨能力均较高的引物组合,10对引物共扩增出1238条带,其中特异性带18条,特异缺失带18条,特异百分率2．9％。获得总位点数282个,其中共有位点数177个,多态位点百分率为37．2％。用Philip3．6软件包进行聚类分析,将8个品种(系)聚类为3组。本研究获得的特征带和特征缺失带表明,AFLP的高特异分辨率在甜菜品种鉴定上的潜力。分子标记分析和系谱分析证明了供试甜菜品种(系)遗传基础狭窄。 相似文献