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《蚕学通讯》2013,(3):37-37
人工核酸酶介导的基因组编辑（genome editing with engineered nucleases ）技术是近几年发展起来的一种技术手段,被《Nature M ethods》杂志评为2011年的年度技术。家蚕的基因组编辑在研究家蚕功能基因、培育家蚕新型素材、家蚕生物反应器开发领域有着巨大的应用潜力。西南大学家蚕功能基因组研究团队紧跟国际上基因组编辑技术的最新发展趋势,迅速在家蚕基因组编辑研究领域开展相关研究工作。2012年9月,该团队在《PLoS ONE》杂志上公布了其利用近期发展起来的基因组编辑工具- TALE核酸酶技术（TALEN）实现对家蚕内源靶基因的可遗传敲除的研究成果,该论文发表以后受到国内外众多媒体的转载与评论,发表之后的短短一年时间内即被包括《Nat Rev Mol Cell Biol》、《Genome Res》等高水平杂志在内的论文引用28次。随后,研究团队又围绕着建立高效的家蚕基因组编辑技术平台开展研究工作,建立了适用于家蚕基因组编辑的 TALEN 高效组装技术体系和活性检测平台。通过组装平台,研究人员可以高效的对人工设计的 TALEN 打靶载体进行组装。通过活性检测平台,研究人员可以便利地对组装的 TALEN 打靶载体的打靶效率进行评估,筛选高活性的TALEN 打靶载体,这对提高对家蚕功能基因敲除,尤其是可遗传敲除的成功率有着重大意义。该体系的建立标志着家蚕基因组编辑技术平台的完善和成熟,为实现家蚕功能基因的大规模敲除打下了坚实基础。相关研究论文“High-efficiency system for construction and evaluation of customized TALENs for silkworm genome editing”于2013年9月28号在国家权威杂志《Molecular Genetics and Genomics》上在线发表（http ：／／link ．springer ．com／article／10．1007／s00438-013-0782-4）。 西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室博士研究生王峰、马三垣为论文的共同第一作者,西南大学长江学者特聘教授夏庆友是论文的通讯作者。该研究得到了国家973计划,863计划的支持。 相似文献
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美国犹他大学、深圳华大基因研究院以及丹麦哥本哈根大学等机构的科研人员分析家鸽与野鸽的基因组序列,从分子层面揭示家鸽的起源历史,相关论文发表于近期的《科学》杂志。为探讨家鸽(人类驯化后的原鸽)与野鸽(恢复野鸽习性的家鸽)间的遗传多样性、遗传结构和系统发生关系,研究人员将经Illumina HiSeq 2000测得的家鸽序列作为参考基因组,同时重测序40个原鸽群体(含36只家鸽和2只野鸽)基因组,发现经测序、拼接组装获得的序列可较好地覆盖鸽 相似文献
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全基因组重测序(whole genome resequencing, WGRS)是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的全基因组水平的测序,具有检测变异类型丰富、高性价比、应用广泛等优点。随着测序成本的降低和畜禽基因组测序工作的完成,全基因组重测序技术已成为畜禽遗传变异研究的重要工具。全基因组重测序技术可获得大量基因变异信息,包括单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)、插入缺失(insertion/deletion, InDel)、结构变异(structural variation, SV)和拷贝数变异(copy number variation, CNV)等,丰富了现有的基因组序列,形成的大量数据集为探索畜禽表型性状和遗传改良提供了一个基因组信息库,以促进对畜禽遗传资源的深入研究与利用。作者概述了全基因组重测序技术及其关键影响因素(测序深度、序列比对和变异检测),重点综述了该技术在重要畜禽(牛、羊、猪、鸡)研究领域的应用进展,并对将来侧重于整合分析重测序数据、精准表型记录和多组学信息的研究趋势进行了展望。 相似文献
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《中国畜牧杂志》2021,(10)
本研究旨在通过基因组重测序技术从分子层面深入了解地方猪种深县猪的种质遗传特性。实验以10头深县猪和10头梅山猪作为研究对象进行全基因组重测序,采用滑动窗口方法进行群体选择信号分析,结合群体遗传分化指数(Fst)和核酸多样性(θπ)2种参数筛选出受选择位点,调取相应的基因,并进行生物信息学分析。研究结果表明,深县猪独有的SNP变异位点有21 602 538个,对受选择区域筛选后得到受选择位点580个,定位于23个基因。GO和KEGG富集结果显示,与深县猪肉质、繁殖及免疫相关的候选基因有7个,这些候选基因通过参与激素合成、卵细胞成熟、脂质代谢以及免疫等信号通路发挥作用。基于全基因组重测序技术对候选基因的挖掘为揭示深县猪遗传特性以及保种选育工作的开展提供了参考。 相似文献
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猪具有独特的生物学特征,在畜牧业生产和医学研究中占有重要地位。全基因组测序即de novo测序和全基因组重测序为解释猪的生物学特性和促进猪的分子育种发挥了重要作用。本文重点阐述全基因组测序在猪基因组学研究中的应用,分析全基因组测序技术及其在猪的全基因组测序工作中的优势和不足,并对未来猪的分子遗传育种研究工作进行展望。 相似文献
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正近日,中国农业科学院蜜蜂研究所蜜蜂资源与遗传育种研究室石巍研究员带领的研究团队,在分子生物学和进化领域的权威期刊《分子生物与进化(Molecular Biology and Evolution)》(牛津大学出版社,5年累计影响因子:11.667)上发表在线文章,报道了该团队在我国首次发现的西方蜜蜂新亚种西域黑蜂(Ap/s mellifera sinisxinyuan)及运用重测序技术,从基因组水平上揭示的西域蜜蜂对温带气候的环境适应性机制研究。过去普遍认为西方蜜蜂的分布范围在中亚、非洲 相似文献
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最近,西南大学家蚕基因组研究团队再次取得重大突破和又一项标志性成果,研究论文《40个基因组完全重测序揭示蚕的驯化事件及其相关基因》（《Complete resequencing of 40 genomes reveals domestication events and genes in silkworm（Bombyx）》）于北京时间2009年8月28日3时在国际著名学术杂志《Science》在线发表。 相似文献
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产仔数是反映猪场生产水平和经济效应的一个重要的指标,作为多基因控制、遗传力低的复杂经济性状,鉴别影响产仔数的基因位点,利用分子选育标记来提高猪的产仔性能倍受重视。随着重测序成本的不断降低,基因组学研究不断深入,以全基因组重测序、简化基因组测序和基于高通量测序技术获得的芯片技术已得到广泛应用。本文综述了通过高通量测序技术以及基于高通量测序的芯片技术研究影响猪产仔数性能的数量性状座位(quantitative trait loci,QTL)及候选基因的研究进展,为后期鉴别影响产仔数变异主效基因提供参考,为生产采用分子育种进行产仔选育提升提供分子标记信息。 相似文献
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