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1.
三倍体毛白杨无性系的AFLP分子标记鉴定 总被引：9，自引：0，他引：9
利用AFLP标记技术采用MseⅠ+3/EcoRⅠ+2引物组合,对12个三倍体毛白杨和二倍体毛白杨无性系进行了分析鉴定. 从38对引物组合中选出12对扩增条带较多的引物组合,多态性比例最高的是M-CAT/E-TC,多态性水平达到32.4%,最低的M-CTT/E-TT只有15.7%,证明供试材料之间的亲缘关系较近;UPGMA聚类分析结果与供试材料的系谱关系以及形态鉴别结果一致,表明凡亲本相同或形态差异小的无性系具有较高的相似系数;利用3个引物组合的8条多态性条带构建了12个供试材料的指纹图谱,可以作为三倍体毛白杨无性系鉴别以及品种保护的依据. 相似文献
2.
红肉桃种质资源的AFLP分析 总被引：4，自引：0，他引：4
利用AFLP技术对24份红肉桃和5份白内桃对照品种进行了DNA多态性分析,从64对E 2/M 3引物组合中筛选出6对引物用于扩增基因组DNA.共获得清晰可辨的174个标记.其中多态性标记为108个,多态性检出率为62.1%.UPGMA聚类分析结果显示.在遗传相似系数0.916处,红肉品种与白肉品种分别聚成了两大类(第6类和第7类),说明两类群间存在较明显的差异;红肉桃14、粘核红肉桃、黑桃1、黑桃2、红肉桃2与红肉桃4几个红肉桃品种独自成类.与其他绝大部分品种遗传距离较远.具有独特的基因型,故应作为重点种质保存. 相似文献
3.
采用醋酸洋红染色法,在研究胡杨和毛白杨不同无性系间花粉粒形态差异的基础上,研究不同形态判别标准条件下2n花粉发生频率调查的准确性。研究结果表明,胡杨花粉粒的平均直径为29.7μm,比毛白杨花粉粒的平均直径32.4μm略小。胡杨或毛白杨无性系对花粉粒直径影响显著。通过调查四分体时期四分体、三分体以及二分体的比例,可估算2n花粉的理论频率。胡杨和毛白杨各无性系2n花粉的理论频率与以2n花粉粒直径大于花粉粒平均直径的1.28倍为标准时统计的2n花粉实际频率差异不显著,而与以2n花粉粒直径大于37.0μm为标准时统计的2n花粉实际频率差异极显著。这说明以37.0μm作为判别胡杨或毛白杨2n花粉形态判别标准会导致较大的误差。而以各无性系花粉粒平均直径的1.28倍作为2n花粉形态判别标准更加科学合理。 相似文献
4.
利用AFLP(amplified fragment length polymorphism)技术筛选中华绒螯蟹性别相关标记,共使用192对引物组合检测中华绒螯蟹雌、雄和雌雄混合3个基因组池的多态性,共扩增出5 376条多态性条带,平均每对引物组合扩增出28条多态性条带,获得88条雌雄差异条带。利用雌雄各10个个体再次进行AFLP验证,共62条差异条带具有性别差异,包括两种情况:(1)有49条条带在雌性的4～6个个体中存在,在雄性全部个体中缺失;(2)有13条条带在雄性4～6个个体中存在,在所有的雌性个体中缺失;其余的26条没有性别差异性。差异条带经回收、克隆、测序,结果发现有些条带包含多个序列,共得到77条DNA序列,其中31条序列与鸟类、两栖类和哺乳类等脊椎动物性染色体DNA部分片段具有同源性,相似区间在22～212 bp不等,其中6条DNA序列与命中序列之间具有生物学相关性。设计特异性的引物在基因组中检测,没有获得性别特异SCAR标记。 相似文献
5.
CAO Shao-xian YANG Li-guo JIANG Xun-ping LIU Hong-lin LU Wei-zhong XIANG Yang-Hai 《中国农业科学(英文版)》2003,2(3)
Blood and tissue samples were collected from 105 goats including 60 Boer goats (30 for eachsex), 30 Xuhuai goats (15 for each sex) and 15 Haimen goats (7 stud and 8 does). DNA was extracted andDNA pools were constructed on the basis of goat breeds. In 36 selective primer combinations, 29 combinationsamplified totally 3 253 markers including 92 polymorphic markers by amplified fragment length polymor-phism (AFLP). On average, 3.17 polymorphic markers were amplified per combination, with a polymorphicfrequency of 2.8%. The primer combinations amplifying more polymorphic markers (showed in brackets)were involved in E00+ACG/M00+CAA (13), E00+ACG/M00+CAG (10), E00+AAC/M00+CAC (8)and E00+AAC/M00+ACT (7). A total of 183 markers including 60 polymorphic markers were amplified byRAPD from the pooled DNA of three breeds using 22 primers with strong polymorphism and high reproduc-ibility selected from 93 RAPD primers. On average, 2.73 polymorphic markers were amplified per primer,with a polymorphic frequency of 32.8%. The results of AFLP and RAPD coincidently suggested that the ge-netic distance is the closest between Xuhuai and Haimen goat, next between Xuhuai and Boer goat, and the far-thest between Haimen and Boer goat. According to the UPGMA method, Haimen and Xuhuai goats can begathered together as a cluster, then Boer goat. Both methods can be used to implicate the genetic difference ofthese three breeds, in particular AFLP has more polymorphic markers. 相似文献
6.
一个与西瓜核不育育性基因连锁的AFLP分子标记的获得 总被引：2，自引：0，他引：2
以西瓜G17AB核雄性不育两用系为材料,采用BAS法构建了不育池和可育池。利用AFLP分子标记技术,通过筛选256对AFLP引物组合,获得了一个与育性位点紧密连锁的AFLP标记,片段长度在310~350 bp之间,该标记与育性基因的遗传距离为5.0 cM。 相似文献
7.
Zhikun Li Xingfen Wang Yan Zhang Guiyin Zhang Liqiang Wu Jina Chi Zhiying Ma 《Frontiers of Agriculture in China》2008,2(3):245-252
Seventy-one glandless cotton germplasm resources were firstly evaluated genetically by using nine agronomic traits, 33 simple
sequence repeat (SSR) primers and ten amplified fragment length polymorphism (AFLP) primer combinations. Principal component
analysis (PCA) of the agronomic traits showed that the first six principal components (PCs) explained a total of 86.352% of
the phenotypic variation. A total of 329 alleles were amplified for 33 SSR primers, and 232 polymorphic bands in a total of
389 bands were obtained by using ten AFLP primer combinations. The average polymorphic information content (PIC) value was 0.80 and 0.18 for SSR primers and AFLP primer combinations, respectively. The DIST (average taxonomic distance)
and DICE (Nei and Li’s pairwise distance) coefficients ranged from 0.373 to 3.164 and 0.786 to 0.948, respectively, for agronomic
traits and SSR&AFLP data based on UPGMA analysis. This suggested that there was a higher diversity in the evaluated population
for both agronomic traits and molecular markers. The Mantel’s test showed that the correlation between the dendrograms based
on agronomic traits and SSR&AFLP data was non-significant. 相似文献
8.
毛白杨遗传作图最适分离群体的选择 总被引：1，自引：1，他引：1
该研究以毛白杨及其杂种毛新杨和银白杨与腺杨的杂种银腺杨为材料 ,利用控制授粉杂交和种子组织培养技术相结合制备了 3个规模较大的遗传作图群体 .在此基础上 ,采用扩增性片段长度多态性 (AmplifiedFragmentLengthPolymorphisms,AFLPs)标记技术对这些作图群体的亲本进行了多态性检测 ,结果表明 :8对EcoRⅠ MseⅠ引物组合在毛新杨无性系TB0 1×毛白杨无性系LM5 0作图群体亲本间的多态性水平最高 ,平均可检测到 2 0个多态性位点 .结合对子代在田间表型性状分离情况 ,选取了该分离群体作为构建毛白杨遗传连锁图的作图群体 .并利用AFLP技术对随机抽取的 12 0株子代个体进行了基因型检测 ,10对AFLP引物组合在作图亲本间共检测到 197个多态性位点 ,其中有 15 8个位点在P <0 0 1水平上符合 1∶1孟德尔期望分离比 ,占多态性位点总数的 80 2 % ,选取该群体作为构建毛白杨遗传连锁图的作图群体是合适的 相似文献
9.
ZHANG Na YANG Wen-xiang YAN Hong-fei LIU Da-qun CHU Dong MENG Qing-fang ZHANG Ting 《中国农业科学(英文版)》2006,5(12):938-943
Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis was carried out in Thatcher, near isogenic lines (NILs) carrying different genes conferring resistance against wheat leaf rust, and TcLr45 x Thatcher F2 progenies were used to develop markers for Lr45 gene. Sixty AFLP primer combinations were screened and most of them provided clear amplification products, 31 primer combinations displayed polymorphism of TcLr45 in 23 NILs. Two AFLP markers closely linked to the gene Lr45 were acquired: P-AGG/M-GAG261 bp, which was found closely linked to the Lr45 locus at a distance of 0.6 cM on one side, and P-ACA/M-GGT105 bp, which was found at a distance of 1.3 cM on the other side. The specific bands were cloned and subsequently sequenced. The 261-bp fragment produced by P-AGG/M-GAG showed 86% similarity with the sequence of Vulgare Hart I gene; the 105-bp fragment produced by P-ACA/M-GGT showed 96% similarity with the phosphatidylserine decarboxylase gene of the Triticum monococcum. Both included an open reading frame (ORF). 相似文献
10.
采用５个ＰｓｔⅠ／ＭｓｅⅠ引物组合对来自２个籼稻品种Ｈ３５９和Ａｃｃ８５５８的重组自交系（ＲＩ,Ｆ７代,１３１个系）群体进行了扩增片断长度多态性（ＡＦＬＰ）分析,并对ＡＦＬＰ的多态性程度、ＡＦＬＰ标记的染色体分布及分离比例进行了研究．在ＡＦＬＰ分析中,共检测到９８个多态性带,其中７８个定位到连锁图中,并分布在所有的１２条染色体上,表明ＡＦＬＰ是一种高效的分子标记,可与ＲＦＬＰ标记结合应用于遗传图谱的构建和基因定位． 相似文献
11.
紫杉醇合成途径中紫杉烯合成酶cDNA的克隆 总被引：2，自引：0，他引：2
从南方红豆杉（Taxus chinensis var. mairei）愈伤组织提取总RNA，根据已发表的中国红豆杉紫杉烯合成酶cDNA序列设计两对引物，通过RT-PCR技术扩增出该酶5’端长度为1201bp和3’端长度为1388bp的两个cDNA片段，将其克隆到pGEM-T Vector上并转化到E. coli DH5α中， 5’端片段经XbaⅠ和BglⅡ双酶切鉴定，3’端片段经BglⅡ和SacⅠ双酶切鉴定后，对阳性克隆进行序列测定，证实确为紫杉烯合成酶基因。将这两个cDNA片段拼接到一起，得到全长2589 bp的紫杉烯合成酶基因，编码862个aa，与中国红豆杉紫杉烯合成酶基因具有98%的同源性。两片段与双元载体pCAMBIA1300以T4 DNA连接酶连接并转化到E. coli DH5α中，经XbaⅠ和SacⅠ双酶切鉴定，证实紫杉烯合成酶cDNA全长连接成功并插入到pCAMBIA1300中，为下一步的转基因工作做好了准备。 相似文献
12.
13.
部分竹类植物遗传变异的AFLP,ISSR和SRAP分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用AFLP和ISSR分子标记技术对簕竹属4个竹种的12个变异类型的遗传变异进行分析,用12对AFLP引物和10个ISSR引物分别扩增出501、171个位点,多态位点百分率分别为73.6%(367)、78.8%(137)。2种标记均揭示簕竹属4个竹种间存在较大的遗传变异,但同一竹种不同变异类型间的遗传差异极小。利用AFLP,ISSR和SRAP分子标记分析了刚竹属和矢竹属4个竹种的12个变异变型的遗传变异,也得到了类似结果。 相似文献
14.
基于AFLP的家蚕性连锁平衡致死系Z染色体连锁分子标记筛选 总被引：1，自引：0，他引：1
平48(以下简称P48)是通过转育方法将性连锁平衡致死系的群体性比控制基因转移到白云品系培育而成的。研究以P48与白云(BY)这对近等位基因系为分析材料,利用AFLP筛选并分析差显标记,经PAGE电泳、片段回收、克隆、测序及与家蚕(P50)基因组数据库序列比对发现家蚕性连锁平衡致死系Z染色体特异性连锁标记C094,该标记与P50的对应序列间存在明显差异。进一步设计差异引物对P48与P50及其杂交F1代进行PCR验证,确定C094标记与家蚕性连锁平衡致死系P48致死基因l1连锁,这为进一步鉴定及克隆致死相关基因奠定了基础。 相似文献
15.
以豫杂一号泡桐为材料,通过对影响AFLP技术体系的各主要因素的研究,建立了适于泡桐AFLP分析的技术体系.结果表明最佳酶切体系(20μL)为500 ng模板DNA,3 U的Pst 1和Mse I,在37℃下双酶切3 h;20μL最佳连接体系中为酶切产物15 μL,0.25 μmol·L-1Pst I接头,2.5 μmol·L-1 Mse I接头,1 μL 10×T4 Buff-er,2 U T4连接酶,22℃连接18 h;20 μL最佳预扩反应体系中5 μL稀释10倍的连接产物,100 μmol·L-1dNTP,2 U Taq酶,250 μmol.L-1 Pst I和Mse I引物(P+AGT/M+AGT),2 μL 10×PCR Buffer.20 μL最佳选择性扩增反应体系中5 μL稀释20倍预扩增产物,100 μmol·L-1dNTP,2 U Taq酶,350 μmol·L-1 Pst I和Mse I引物(P+AGT/M+AGT),2 μL 10×PCR Buffer.最后,筛选出了97对适宜于泡桐AFLP分析的引物. 相似文献
16.
17.
《农业科学学报》2016,(6)
Hashemi, a popular aromatic rice among Iranians, is famous for its fragrance and taste. Such features are major reasons for its higher price compared to non-aromatic varieties available in Iran. Therefore, the knowledge of genetic diversity of this profitable crop is a fundamental ineterst for plant breeders in future breeding programs. In the present research, genetic diversity among 35 genotypes of Hashemi aromatic rice(Oryza sativa L.) from Guilan and Mazandaran provinces of Iran was estimated using simple sequence repeat(SSR) and amplified fragment length polymorphism(AFLP) markers. Out of 21 SSR and 12 Eco RI-Mse I AFLP marker combinations, only 16 SSRs and 10 AFLPs exhibited polymorphic patterns while others were monomorphic. The 10 AFLP primer combinations produced a total of 142 of bands and 20 were polymorphic(14.08%). Moreover, 40 out of 47 bands amplified with 16 SSR markers showed polymorphism(85.1%). The average number of alleles identified by SSR primers was 2.56 alleles per locus with a range of 2 to 4. The average value of polymorphic information content(PIC) was 0.393 and 0.468 for AFLP and SSR markers, respectively. However, the genetic similarity values ranged from 0.26 to 1 for SSRs and 0.21 to 1 for AFLPs. Later, a unweighted pair group method with arithmetic mean(UPGMA) dendrogram was generated and genotypes were clustered into four groups with SSRs at similarity coefficient of 0.55 while AFLPs clustered them into six groups at similarity coefficient of 0.41. Cluster analysis revealed a narrow genetic diversity and low correlation between geographical differentiation and genetic distance within cultivars. 相似文献
18.
油茶AFLP反应体系建立及其在遗传多样性研究上的应用 总被引：1，自引：0，他引：1
通过试验分析建立了适合油茶且简便易行的AFLP反应体系,筛选出了4对能够反映多态性的有效引物,并对油茶的遗传多样性进行了初步分析。平均每对引物扩增出23个具有清晰条带的位点,其中多态性位点数N为18,多态性位点百分率PPL为79.13%,有效等位基因数ne为1.320,Nei’s期望杂合度He为0.184,Shannon多态性信息指数I为0.267。研究结果表明了AFLP标记技术在油茶遗传多样性研究上的适用性,同时也显示了油茶具有较高的遗传多样性,为进一步研究油茶多居群的遗传多样性奠定了重要的理论和技术支持。 相似文献
19.
利用AFLP技术鉴定玉米自交系及杂交种 总被引：9，自引：0，他引：9
AFLP技术是一种非常有效的分子标记技术，但由于在品种鉴定方面的研究较少，限制了该技术在品种产权保护和真实性鉴定中的应用。本文对适合玉米自交系及杂交种鉴定的引物组合进行了筛选，通过对42种引物组合的试验，选出MGA EGAG和MGAA EGA两组引物组合多态性强、谱带多、质量高，能有效地区分不同材料。研究中还发现随引物选择碱基的增加，扩增的谱带数有降低的趋势，多态性有增加趋势。3 2引物组合比2 3引物组合扩增谱带数有明显降低。这些变化趋势可以作为其它作物引物组合选择的参考。 相似文献
20.
李达 《湖南农业大学学报(自然科学版)》2010,36(2):169-176
采用荧光AFLP技术,对所收集的22个红花檵木材料和变异类型进行分类与亲缘关系研究.从64对引物组合中筛选出8对引物组合进行扩增,共扩增出1226条带,多态条带1085条,多态性比率为88.5%.冬艳紫红、大圆叶双面红的多态性比率最高,达100%,其同源性最低.基于AFLP分析的UPGMA聚类分析得到,供试材料的遗传相似系数为0.7442~0.9207.以0.8171的相似系数为阈值,所有供试材料被分为6大组群,第一组群内以0.8484为阈值,又可分为4组.通过AFLP标记发现冬艳红5个类型中冬艳玫红、冬艳亮红、冬艳卷瓣玫聚类在一起,冬艳紫红、冬艳卷瓣红与其他类型存在的遗传差异通过分子标记可以鉴定出来.通过标记发现大圆叶双面红并没有与大叶玫红、大叶红、大叶卷瓣红、大红伏划分在双面红类型中,其外部形态相似,但遗传距离有较大差异.与形态标记相比,基于AFLP标记的红花檵木分类体系更能反映红花檵木品种间的亲缘关系. 相似文献