苹果茎痘病毒双重RT-PCR检测体系的建立及应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

胡国君  董雅凤  张尊平  范旭东  任芳  张梦妍 《植物病理学报》2019,49(3):428-432

<正>病毒病是危害苹果(Malus domestica)的一类重要病害。已报道的苹果病毒种类很多,在我国发生普遍的主要有苹果褪绿叶斑病毒(Apple chlorotic leaf spot virus,ACLSV)、苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)、苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)、苹果花叶病毒(Apple mosaic virus,ApM V)以及苹果锈果类病毒(Apple scar skid viroid,ASSVd)~([1～3])。病毒或类病毒混合  相似文献   

北京月季病原病毒的高通量测序鉴定和RT-PCR检测   总被引：1，自引：1，他引：0  

张秀琪  刘松誉  杨一舟  李梦林  胡安安  刘唱  张宗英  韩成贵  王颖 《植物病理学报》2021,51(4):525-535

本研究利用高通量测序技术对北京地区的月季染病样品进行了病毒鉴定,通过序列比对和拼接获得了李属坏死环斑病毒(prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)、苹果茎沟病毒(apple stem grooving virus,ASGV)、柑橘碎叶病毒(citrus tatter leaf viru...  相似文献   

苹果茎沟病毒微滴数字RT-PCR检测方法的建立和应用     

王岩滨  安玮  李殷  吴云锋  郝兴安 《植物病理学报》2024,(2):436-442

我国是第一大苹果生产国。苹果茎沟病毒(apple stem grooving virus, ASGV)在我国各苹果产区分布广泛,侵染果树导致树势变弱,生长量减少,果实品质下降,严重威胁我国苹果产业的可持续发展。病毒检测是果树病毒病防控的重要前提。本研究根据苹果茎沟病毒外壳蛋白基因保守序列,设计了引物和探针,建立了微滴数字PCR (droplet digital PCR, ddPCR)检测方法。所建立的检测方法能特异性检出苹果茎沟病毒,检测重复性好,灵敏度比qRT-PCR法高10倍,可适用于田间样品及组培苗检测。该方法的建立为苹果茎沟病毒的检测提供了重要的技术手段。  相似文献   

竹花叶病毒浙江麻竹分离物全基因组序列及siRNA分析     

费莉玢  侯盼盼  曹友志  姚佳越  苏秀  马良进 《植物病理学报》2020,50(4):499-504

正已知有3种病毒可在自然条件下侵染竹类植物,即竹花叶病毒(bamboo mosaic virus,BaMV)~[1]、樱桃坏死锈斑驳病毒(cherry necrotic rusty mottle virus,CNRMV)和苹果茎沟病毒(apple stem grooving virus,ASGV)~[2,3]。其中,BaMV是最早在巴西的金竹(Bambusa vulgaris Cv.)和孝顺竹  相似文献   

苹果潜隐病毒对一年生苹果苗木生长的影响          下载免费PDF全文

李明立  魏凤彩  王炳辛 《植物保护学报》1993,20(1):54-54,60

我国苹果普遍潜带3种苹果潜隐病毒,即苹果褪绿叶斑病毒(Apple chloroticleafspot virus)、苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus)和苹果茎沟槽病毒(Apple stem grooving virus),金冠、红星等品种病株率高达100%。  相似文献   

苹果潜隐病毒对一年生苹果苗木生长的影响          下载免费PDF全文

李明立  魏凤彩  王炳辛 《植物保护学报》1993,(1)

我国苹果普遍潜带3种苹果潜隐病毒,即苹果褪绿叶斑病毒(Apple chloroticleafspot virus)、苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus)和苹果茎沟槽病毒(Apple stem grooving virus),金冠、红星等品种病株率高达100%。国外报道,  相似文献   

利用高通量测序检测新疆野苹果上的病毒     

米美璇  张志想  李世访  战斌慧  麦合木提江·米吉提 《植物保护》2023,49(6):247-252

新疆野苹果Malus sieversii (Ledeb.) Roem.是苹果的祖先, 也是重要的育种遗传资源, 常用作砧木。近年来, 新疆野苹果的分布面积骤减, 对其的保护越来越重要。本研究采用高通量测序技术, 对采自新疆伊犁天山野果林的26份样本进行病毒检测, 检测到苹果褪绿叶斑病毒(apple chlorotic leaf spot virus, ACLSV)和苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus, ASPV)。通过RT-PCR检测所有样品(127份), 检测到ACLSV、ASPV和苹果茎沟病毒(apple stem grooving virus, ASGV), 检出率分别为22%、19.7%和11%。结合RACE PCR技术扩增得到ASGV新疆野苹果分离物基因组全长序列, 暂时命名为ASGV-XJ。去除3′末端poly(A)后的长度为6 506 bp, 有两个彼此重叠的开放阅读框(open reading frame, ORF), ORF1(47-6 364 nt)编码一个241 kD的多聚蛋白, 包含甲基转移酶(methyltransferase)、木瓜蛋白酶(papain-like-protease)、解旋酶(nucleotide triphosphate-binding helicase)、RNA 依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase)和C端的外壳蛋白(coat protein, CP)等; ORF2(4 798-5 760 nt)编码一个36 kD的运动蛋白(movement protein, MP)。系统发育分析表明, 分离物间没有表现出寄主专一性和地理分布规律。上述结果对新疆野苹果的保护工作有重要的参考意义。  相似文献   

苹果茎痘病毒新疆阿克苏分离物基因组全序列测定及分析     

龚卓群  郝璐  谢吉鹏  国立耘  周涛 《植物保护学报》2018,45(4):923-924

正苹果病毒病在世界各苹果种植地广泛发生,严重影响苹果生产。苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)是一种危害苹果的重要潜隐病毒,是凹陷病毒属Foveavirus的代表种(Adams et al.,2004),基因组为正单链RNA,长约9 306 nt,编码5个开放阅读框(open reading frame,ORF)。自然寄主有苹果、梨、樱桃和海棠等,被ASPV侵染后一般症状不明显,但生长不良,树势衰退,果实产量和品  相似文献   

苹果茎痘病毒在山楂中的首次鉴定与序列分析     

高德航  何成勇  邢飞  侯婉莹  李世访  战斌慧  王红清 《植物病理学报》2021,51(4):515-524

山楂是我国重要的果树,但山楂病毒的相关研究较少.本研究通过高通量测序及生物信息学分析首次在山楂样品中发现苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus,ASPV).利用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术对ASPV山楂分离物全长序列进行扩增,结果表明,ASPV山楂分离物基因组全长由9 290个核苷酸组...  相似文献   

一种高效的苹果褪绿叶斑病毒TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法     

秦子禹  孙建设  王娜  邵建柱 《植物保护学报》2015,42(4):551-556

为建立一种检测苹果褪绿叶斑病毒(Apple chlorotic leaf spot virus,ACLSV)的Taq Man探针实时荧光定量RT-PCR方法,根据ACLSV外壳蛋白基因(coat protein,cp)保守序列设计了特异性引物和Taq Man探针,以构建的ACLSV-cp重组质粒为阳性标准品绘制标准曲线,并对该方法的特异性、灵敏性、重复性进行检验。结果显示,以ACLSV-cp重组质粒为标准品建立的标准曲线相关系数达0.999,扩增效率为103.7%;建立的Taq Man探针实时荧光定量RT-PCR方法特异性好,与苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)、苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)、苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd)均无交叉反应;灵敏度为100拷贝/μL,比常规RT-PCR高100倍;批内和批间变异系数均小于0.84%。表明Taq Man探针实时荧光定量RT-PCR方法具有特异性强、灵敏性高、重复性好的优点,适用于实际样品中ACLSV的快速准确检测。  相似文献