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山核桃花芽总RNA提取方法研究 总被引：4，自引：0，他引：4
以山核桃的花芽为材料,利用改良CTAB法、异硫氰酸胍法和改良热酚法提取其总RNA,并对RNA产率、纯度、电泳图谱和RT-PCR进行分析,结果表明:改良CTAB法明显优于其它两种提取方法,用它提取的28S rRNA、18S rRNA条带清晰、稳定,无降解,OD260/OD280值保持在1.9～2.0,产率相对较高;经RT-PCR检测发现,改良CTAB提取的RNA能被成花基因特异引物扩增出清晰的条带,说明该法完全适合于山核桃花芽总RNA的提取,并可用于Northern杂交、cDNA文库构建等分子生物学操作. 相似文献
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几种提取杜仲RNA方法的比较 总被引：3，自引：0，他引：3
杜仲富含酚类、多糖、蛋白、杜仲胶等代谢物质,用普通方法提取杜仲RNA时很难将其去除,比较研究了Trizol、CTAB和热硼酸盐3种方法,发现改进的CTAB法和热硼酸盐法均能从杜仲中提取纯度较高的RNA,热硼盐法分离效果最好,凝胶电泳显示条带清晰完整,分光光度计检测OD260/OD280=1.92.用该方法提取的杜仲RNA可以进行RT-PCR、Northern-blot、RACE等分子生物研究. 相似文献
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芒果属植物叶绿体DNA提取方法的研究 总被引：1，自引：0，他引：1
为了探究不同提取方法对芒果属植物叶绿体DNA提取质量的影响,以芒果和扁桃的成熟叶片为材料,比较植物叶绿体DNAout试剂盒法和高盐-低p H法分离叶绿体及提取叶绿体DNA效果。结果表明:叶绿体DNAout试剂盒法能够较好地去除蛋白质、酚类、多糖等代谢物质,OD260/OD230大于2.000,OD260/OD280在1.800~1.900之间。高盐-低p H法提取叶绿体DNA产率高达75.8 ng/μL,远大于叶绿体DNAout试剂盒法提取叶绿体DNA最高产率42.8 ng/μL,2种方法所得模板电泳图和SSR标记图谱谱带完整性皆好。显微镜下观察叶绿体,2种方法都可以得到杂质少、背景清晰的叶绿体显微成像效果,但高盐-低p H法提取的叶绿体细胞器密度更高。2种方法获得的叶绿体DNA均可满足后续研究工作的需要。 相似文献
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采用Invitrogen Total RNA Purification Kit直接提取法,Trizol试剂盒法和本实验室改良的CTAB法,分别提取樟树不同组织(根、茎、叶和花)的总RNA,并对提取效果进行了检测和比较分析。结果表明:(1)采用本实验室改良的CTAB法提取的RNA完整性好,无杂质污染且得率高,稳定性好,可满足半定量RT-PCR等试验需要;而Invitrogen Total RNA Purification Kit直接提取法和Trizol试剂盒法提取的樟树不同组织总RNA,结果均不理想,存在RNA 28S rRNA谱带模糊不清、有DNA污染、降解严重和得率低等问题,这两种方法均不适用于樟树不同组织RNA的提取。(2)樟树不同组织总RNA提取的得率不同,其中叶片的总RNA得率最高,达到782.34 mg/kg;茎的得率最低,为514.33 mg/kg。(3)以Actin作为内参基因,对樟树根、茎、叶和花中的Fad2基因片段进行半定量RT-PCR检测,结果表明,Fad2基因片段在樟树叶片中的表达量相对较高,而在花中的表达量较低。 相似文献
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高质量丝栗栲基因组DNA的提取方法 总被引：1，自引：0，他引：1
为了促进丝栗栲分子生物学的研究,采用尿素法、柠檬酸钠法、改良CTAB法和SDS法4种方法提取丝栗栲叶片基因组DNA,并对提取效果进行了比较和分析。结果表明,改良CTAB法较适合丝栗栲基因组DNA提取,其提取的DNA产率高,凝胶检测条带整齐清晰,杂质少、无明显降解,OD260/OD280比值在1.8左右;而尿素法难以提取基因组DNA,SDS法提取的DNA得率较低,柠檬酸钠法有蛋白质、多糖等杂质污染均不太适用丝栗栲基因组DNA提取。采用改良CTAB法提取得到丝栗栲幼叶、老叶、嫩芽和幼茎基因组DNA,产率分别为177.3、167.1、242.0和156.7μg/g。酶切分析也证明,改良CTAB法提取的不同组织DNA适用于进行后续分子生物学研究。 相似文献
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为了筛选最适的菠萝蜜总RNA提取方法,采用Trizol提取法、Tris-硼酸提取法和试剂盒提取法提取菠萝蜜叶片和种子总RNA,通过紫外分光光度计检测、琼脂糖凝胶电泳、RT-PCR检测以及Agilent2100检测,对提取结果进行比较分析。结果表明:采用这3种方法均能从菠萝蜜叶片和种子中提取到总RNA,Tris-硼酸提取法较其他2种方法所提取的总RNA产率高,但杂质较多;采用Tris-硼酸提取法能提取完整性较好的总RNA,28S、18S和5S清晰可见,但提取质量较试剂盒提取法差;试剂盒提取法省时省力,有明显的28S和18S条带,A260/A280分布在1.92~1.98,A260/A230分布在2.04~2.09,叶片总RNA产率42.3ng/μL,种子总RNA产率15.6ng/μL。RT-PCR检测结果表明在约200bp处存在清晰整洁的电泳条带,Agilent2100检测结果显示杂峰极少,28S峰积分面积约是18S峰积分面积的2倍。经综合评定认为,试剂盒提取法是适合菠萝蜜叶片和种子总RNA提取的方法。 相似文献
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为了探寻能够满足芒果各组织转录组测序要求的高质量RNA提取方法,以‘桂热芒82号’的叶片、花和果实为材料,从RNA提取质量和产率、琼脂糖电泳和RT-PCR结果分析、RNA测序质量评价这3个方面,对常用的3种试剂盒的提取效果进行了实验研究和评价分析。结果表明:以来自于天根生化科技有限公司的DP 419试剂盒提取的芒果各组织的RNA质量均较好,提取的RNA产率远高于其余两种试剂盒的提取产率;除以美伯生物医药技术有限公司的RM 103试剂盒提取芒果各组织所得RNA,经琼脂糖电泳未见有5S条带出现外,以其余两种试剂盒提取的芒果各组织的RNA都存在28S、18S、5S条带且RT-PCR分析结果理想;对以3种试剂盒提取所得的RNA进行完全测序,结果表明,3种试剂盒提取的RNA完全测序都大于98.99%,能满足RNA-Seq分析的要求。文中综合上述评判因素分析认为,天根生化科技有限公司的DP 419试剂盒是适用于芒果叶片、花和果实RNA提取的最优试剂盒。 相似文献
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Asghar Omidvar Marc H. Schneider A. R. P. Van Heiningen 《Wood Science and Technology》1997,31(4):235-240
Summary A modified solute exclusion technique was used to pressure impregnate a polystyrene molecular weight (MW) series dissolved in styrene into red maple samples at approximately the fiber saturation point (FSP) and oven dry (OD). Radial penetration was less than tangential and FSP less than OD. There was a marked change in radial OD penetration at 900,000 MW. There was no marked penetration change with MW in the tangential direction, although there appeared to be a slight decrease in FSP penetration at the higher MW tested. 相似文献
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以华山松（Pinus armandi）种子胚乳为实验材料,分别采取经典CTAB法、简易CTAB法和SDS法微量法提取华山松基因组DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计分析、标准差和标准误、卡方检验和SPSS软件显著性分析,将它们在DNA产量、质量和方法稳定性等方面的优缺点进行总结。得出结论：通过对数据进行卡方检验,所有数据都是差异是由方法所引起的,不是偶然误差所引起的;相比于经典CTAB法,SDS微量法和简易CTAB法的（OD260-OD320）/（OD280-OD320）标准差和标准误相差不大,数据相对精确,结果相对精确;通过SPSS软件分析分析,简易CTAB法和其他2种方法相比存在显著差异性,SDS微量法与经典CTAB法的P〉0.05,差异不显著,提取效果相差不大。综上所述：相比于简易CTAB法,SDS微量法与经典CTAB法的（OD260-OD320）/（OD280-OD320）都接近2.0,可能存在RNA污染污染,DNA的浓度也相对较低,SDS微量法与经典CTAB法不适合华山松胚乳DNA提取。简易CTAB法的（OD260-OD320）/（OD280-OD320）比率很接近1.80,不存在蛋白质和RNA污染,DNA纯度也最好,DNA浓度最高,比较适合华山松胚乳DNA提取。 相似文献
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采集人工种植2年的铁皮石斛,将根、茎和叶研磨为粉末,采用NA培养基分离纯化其内生细菌,酶切去除冗余,利用16S rRNA基因序列同源性分析,对铁皮石斛根、茎和叶中分离得到的49株内生细菌进行分离鉴定。结果表明,获得的49株内生细菌在根、茎、叶中分别有24株、15株和10株,分别属于芽孢杆菌属的5个种、假单孢杆菌属的1个种和沙雷氏菌属的1个种。分离出的内生细菌表现出一定程度的细菌区系相似性,也表现出细菌区系的器官特异性。铁皮石斛内生细菌在石斛根部分布的属、种数量明显比茎、叶多,土壤可能是铁皮石斛内生细菌的主要来源;铁皮石斛不同部位内生细菌群落结构存在一定差异,群落种数根＞茎＞叶。研究获得荧光假单胞杆菌20株,占总内生细菌数量的40.82％,判断其可能为优势菌株。 相似文献
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Cermák J 《Tree physiology》1989,5(3):269-289
The solar equivalent leaf area (A(s)), a simply and easily determined biometrical parameter of leaves, trees and stands, was derived theoretically. The parameter is defined as projected leaf area weighted for the time integral of irradiance at a given location in the canopy relative to that of fully irradiated leaves at the top of the canopy. The efficiency of A(s) as a basis for estimating stand-area transpiration of a mature oak (Quercus robur L.) forest from measurements of transpiration by individual trees was compared with that of other stand and tree characteristics. Stand transpiration estimates based on A(s) were more precise and less prone to systematic error than estimates based on basal area, timber volume, projected tree crown area, projected leaf area, or leaf dry mass. Solar equivalent leaf area reflects both the amount and the physiological properties of leaves and can be used as a measure of tree size and functional capacity. It can be calculated from ordinary forest inventory data on trees and stands, adjusted according to simple phyllometric data. It appears to have wide application in ecological and forestry studies for relating the physiological characteristics of individual leaves to those of entire trees or stands. 相似文献
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通过对普洱本土植物总状山蚂蝗和入侵植物肿柄菊叶表真菌混合基因组DNA的提取、18SrRNA片段的扩增、克隆筛选及测序分析等方法,构建了2种植物叶表真菌的系统发育树。结果表明,肿柄菊和不同采集地的总状山蚂蝗叶表均生活着一些属于刺盾炱亚纲和异担子菌亚纲的真菌种类。但相对于独立生长的总状山蚂蝗,与肿柄菊共享小生境的总状山蚂蝗叶表共有真菌种类大多表现出下降的趋势。且肿柄菊和总状山蚂蝗叶表各自生活着一些在种类和功能上均存在差异性的真菌种类,其中生活于肿柄菊叶表的海枣粉座菌可能通过对本土植物的抑制作用来协助肿柄菊的入侵,因此未来研究应深入探索叶表微生物与植物入侵的关系以及相关作用的机制。 相似文献
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关于油桐属(Vernicia Lour.)与石栗属(Aleurites J.R.et G.Forst.)在分类学上分与合的问题,已经历了两个世纪的争论,长期以来油桐属不被承认,至今尚无定论。最近K.H.AiryShaw又将油桐属和石栗属重新分开。目前较多的植物分类学家接受了Airy Shaw的分类方法,即把油桐属和石栗属分为两个属,近期通过解剖构造和微观形态的研究,也支持了Airy Shaw的论断。本研究试图为此进一步提供一些生化论据。 相似文献