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1.
《分子植物育种》2016,(8)
为研究‘大久保’资源的多样性,以不同来源的9份‘大久保’种质和26份其它桃种质为试材,利用SSR标记,进行了亲缘关系分析。PCR扩增结果表明,从44对引物中筛选出的13对SSR引物共扩增出93个等位基因,其中多态性为91条,达97.85%,平均引物多态性条带数目为7条。聚类结果表明:在SM相似系数为0.74时可将35个试验品种划分成7个亚组,9份‘大久保’种质聚为一类,聚类结果与各品种间系谱关系基本吻合。在遗传相似系数为0.77的阈值时,9个‘大久保’被分成两类:来源于北京和易县的‘早久保’聚为一类,其它7个‘大久保’桃聚为一类,这与按照果实发育期以及成熟期对9个‘大久保’的分类结果一致。 相似文献
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应用AFLP技术检测水稻遗传多样性的研究 总被引：5，自引：0，他引：5
利用扩增片断长度多态性（Amplified fragment lenth polymorphism简作AFLP)分子标记技术研究了23个水稻品种的遗传多样性从49对AFLP引物中筛选出4对多态性高，分辨能力强的引物。4个AFLP引物组合分别扩增出43、37、49、33条多态性带，平均每个引物组合扩出40．5条多态性带，4个引物组合共扩增出246条带。利用AFLP数据进行聚类分析，将23个品种聚为10个类群，结果表明，AFLP在水稻类群划分的应用是可行的。 相似文献
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风信子作为春季园林景观中的流量花卉,应用方式灵活多样。由原种风信子(Hyacinthus orientalis)培育而来的现代风信子品种资源极为丰富,部分园林常用品种存在同物异名或同名异物现象,本研究利用AFLP分子标记对风信子园艺品种进行有效分类,为新品种选育提供新思路。利用64对引物对30个常见园艺风信子品种进行AFLP分子标记测定,使用NTSYSpc2.1软件计算其遗传相似系数。并通过NTSYSpc2.1软件中的UPGMA法构建聚类树状图。筛选出的8对AFLP引物通过PCR扩增获得条带11 703条,其中多态性条带9 033条,多态性比率为77.18%;所有品种的遗传相似系数范围在0.796 9～0.916 7之间,平均值为0.864 9。以相似系数0.830 0为阈值,30个风信子品种可分为两大类群、两个亚类、五个组群,其中,‘White Pearl’和‘Carnegie’相似系数最大,为0.916 7;‘Jan Bos’和‘Atlantic (2008)’相似系数最小,为0.796 9,小组群多个品种间的遗传系数均达到0.900 0以上,如‘Sky Jacket’与‘Aiol... 相似文献
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甘蓝型油菜人工合成种遗传多样性分析 总被引：11，自引：0，他引：11
用RAPD及SSR技术对98份甘蓝型油菜人工合成种与46份甘蓝型油菜品种(系)进行遗传多样性分析。30条随机引物共扩增出332条带,其中多态性带309条,多态性比率为93.07%。33对SSR引物共扩增出134条带,其中多态性带129条,多态性比率为96.27%。经聚类分析与主成分分析,表明甘蓝型油菜人工合成种遗传多样性十分丰富。因此通过人工 相似文献
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为研究罗田迟熟板栗品种种质资源遗传信息,采用ISSR分子标记技术,对‘桂花香’、‘九月寒’等8个板栗品种分类鉴定及亲缘关系进行分析。(1)ISSR-PCR反应体系及引物筛选。选择了条带的数量多和清晰度高的反应体系,应用‘九月寒3号’筛选前期设计的21条ISSR引物,淘汰扩增效果差、带型不易辨认的引物,最终选定7条引物用于迟熟板栗品系的分析;选取的7条ISSR引物总共扩增出140条清晰、重复性较好条带,其中,多态性条带有106条,多态性条带比率达75.7%。(2)应用NTSYS 2.10e软件进行UPGMA法聚类分析,在相似系数0.45处将8个板栗品种大致分为2类。结果显示,‘羊毛栗’、‘桂花香2号’与其他板栗品种在遗传上有较大差异。 相似文献
8.
利用SSR和SRAP标记分析花椰菜自交系的遗传多样性 总被引：1，自引：0，他引：1
为选育优质花椰菜新品种,指导种质资源引进和利用,本研究采用简单重复序(simple sequence repeat,SSR)标记和相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记对38份花椰菜自交系进行了遗传多样性分析,分别从48对SSR引物、48对SRAP引物中各筛选出4对有效引物。4对SSR引物扩增的总条带数为47个,多态性条带为39个,平均多态性比率达83.0%;4对SRAP引物扩增的总条带数为86个,多态性条带为51个,平均多态性比率为59.3%,该结果显示花椰菜自交系间具有较丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析揭示了花椰菜自交系的熟期与其遗传差异相关。 相似文献
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国内外陆地棉品种资源的亲缘关系和遗传多态性研究 总被引：5，自引：0，他引：5
应用SSR分子标记对国内外74份棉花种质资源的遗传多样性进行分析,从2278条SSR引物中筛选出82条引物,这82条引物共扩增出个435条带,其中多态性带313个,多态率达83.70%,平均每条引物扩增出3.81个条带。UPGMA聚类分析结果表明,74份材料的相似性系数(GS)变化范围在0.371～0.958。其中国内品种遗传相似系数变化范围在0.684～0.916,平均遗传相似系数大小顺序为：长江流域棉区品种>特早熟棉区品种>短季棉品种>黄河流域棉区品种>新疆品种。国外品种遗传相似系数变化范围为0.661～0.958,平均遗传相似系数大小顺序为：乌兹别克斯坦品种>法国品种>墨西哥和前苏联品种>美国和巴基斯坦品种>乌干达品种>印度品种>澳大利亚品种。聚类图0.760阈值处可以把国内外品种聚为两类,26个国内品种和1个国外品种被聚为国内品种类,包括3个亚类。绝大多数国外品种为一类,包括4个亚类。本研究结果表明,SSR具有丰富遗传多样性和稳定性,是一种较好的遗传分子标记,适宜于棉花品种遗传多样性分析。 相似文献
10.
为了鉴定马铃薯品种间的亲缘关系,采用5对SSR分子标记引物,对18个贵州马铃薯生产品种进行SSR分子标记及遗传多样性分析.结果表明:5对SSR引物共扩增出77个多态性条带,每个组合的多态性条带数为10～24不等,平均每个引物组合产生15.4个多态性条带.18个马铃薯材料之间的遗传距离范围在0.376 6～0.909 0之间,平均为0.701 1.经聚类分析,18个马铃薯材料在遗传距离0.57水平上全部聚为一类,以遗传距离0.60为基准,可明显聚为4个类群.第Ⅰ类包括5个材料;第Ⅱ类仅1个材料;第Ⅲ类包括4个材料;第Ⅳ类包括8个材料. 相似文献
11.
为了筛选出优异的扁蓿豆育种新材料,本研究采用AFLP和SSR分子标记技术对来自于中国7个省市自治区的15份扁蓿豆种质资源进行遗传多样性的比较分析,结果表明:18对SSR引物扩增出109个多态位点,8个AFLP引物组合扩增出640条带,其中472条多态带.AFLP标记的平均Nei′s遗传多样性指数、Shannon多样性指数和遗传分化系数均高于SSR标记.15份扁蓿豆种质的遗传距离和遗传相似系数与地理类群很接近.AFLP和SSR数据的聚类分析显示:15份扁蓿豆种质分为4大类,但是聚类结果与地理类群不完全相符,主成分结果与聚类结果相似,Mantel 检测表明:AFLP和SSR数据有较高的显著相关性,AFLP和SSR标记能够有效地对扁蓿豆进行遗传多样性分析,其结果为扁蓿豆育种和资源保护具有指导意义. 相似文献
12.
Identification of polymorphic DNA markers in cultivated peanut (Arachis hypogaea L.) 总被引：17，自引：0，他引：17
The detection of DNA polymorphism in cultivated peanut (Arachis hypogaea L.) is reported here for the first time. The DNA
amplification fingerprinting (DAF) and amplified fragment length polymorphism (AFLP) approaches were tested for their potential
to detect genetic variation in peanut. The AFLP approach was more efficient as 43% of the primer combinations detected polymorphic
DNA markers in contrast to 3% with the DAF approach. However, the number of polymorphic bands identified using primers selected
in both approaches was comparable. In the DAF study, when 559 primers of varying types were screened, 17 (mostly 10-mer types)
detected polymorphism producing an average of 3.7 polymorphic bands per primer with a total of 63 polymorphic markers. In
the AFLP study, when 64 primer combinations (three selective nucleotides) corresponding to restriction enzymes Eco RI and
Mse I were screened, 28 detected polymorphism. On an average, 6.7% of bands obtained from these 28 primer pairs were polymorphic
resulting in a total of 111 AFLP markers. Our results demonstrate that both AFLP and DAF approaches can be employed to generate
DNA markers in peanut and thus have potential in the marker-assisted genetic improvement and germplasm evaluation of this
economically important crop.
This revised version was published online in July 2006 with corrections to the Cover Date. 相似文献
13.
利用SRAP与SSR标记分析不同类型甜菜的遗传多样性 总被引：19，自引：1，他引：18
为选育优质甜菜新品种, 指导种质资源引进和利用, 为进行分子标记辅助选择育种提供科学依据, 采用SRAP和SSR两种分子标记方法相结合, 对甜菜单胚雄性不育系及保持系等49份材料进行遗传多样性分析。利用4个表型差异显著的甜菜品系对SRAP的64对引物组合及SSR的11对引物组合进行扩增, 分别筛选出有效引物组合11对和9对。SRAP的11对引物组合共产生199条扩增带, 其中有86条多态性带, 多态性带的比率平均为43.7%。SSR的9对引物共产生35条扩增带, 多态性比率为100%。全部材料的平均遗传距离为0.3860, 平均遗传相似系数为0.6795, 大约30%的材料遗传距离或遗传相似系数具显著或极显著差异。遗传相似系数平均值比较, 多胚四倍体品系0.7264＞单胚杂交组合0.7243＞国外品种0.7060＞多胚二倍体品系0.6908＞单胚品系0.6837。在遗传距离0.20处, 将49个甜菜材料划分为A、B、C、D 4个类群, D类群又分为4个亚类, 较好地显示了甜菜材料丰富的遗传多样性。表明不同甜菜品种具有相当高的异质性, 国外与国内材料的遗传基础存在一定差异, 但生产应用的甜菜品种间存在亲缘关系较近、遗传基础较窄的倾向。 相似文献
14.
斑茅割手密杂种后代真实性鉴定及遗传分析 总被引：3，自引：0，他引：3
以斑茅GXA87-36(♀)与割手密GXS79-9(♂)杂交获得的经形态鉴别为真杂种的后代材料GXAS07-6-1 (斑茅割手密杂合体)及其双亲为材料,利用体细胞染色体计数以及SSR、SRAP分子标记对杂种进行真实性鉴定,并利用SRAP分子标记对斑茅GXA87-36、割手密GXS79-9及其杂种后代遗传位点的传递进行分析。结果表明, GXA87-36体细胞染色体数为2n=60,GXS79-9体细胞染色体数为2n=64,其杂种GXAS07-6-1染色体2n=62,其杂交的染色体遗传方式为n+n;筛选出3对SSR引物和5对SRAP引物可分辨后代的真伪;利用71对SRAP引物扩增后代和双亲,检测到1 095个遗传位点,多态性位点数为800;母本有279个位点,其中有 79 %传递给其后代;父本有439个位点,其中有73%传递给后代;用NTSYS-pc2.10e软件计算Jaccard遗传相似系数,双亲间为0.474,后代与母本、父本间分别为0.696、0.752,表明后代GXAS07-6-1偏向父本遗传。 相似文献
15.
以西洋梨‘丰产’二倍体及其10个同源四倍体株系为材料,通过微卫星(SSR)分子标记技术对西洋梨二倍体与同源四倍体之间的遗传差异性进行了研究。应用10对SSR引物对11份材料进行扩增,共扩增出23条谱带,其中有8条呈多态性,多态性比例为34.78%;10对引物中有3对引物为多态性引物。聚类分析显示,不同同源四倍体株系与二倍体的遗传差异大小亦不同;在10个同源四倍体株系中有3个株系扩增的条带与二倍体完全相同,7个同源四倍体株系与二倍体相比产生了差异性条带。研究结果表明,西洋梨二倍体与其同源四倍体之间以及10个同源四倍体株系之间在DNA水平上表现出了一定的多态性。本研究能够为进一步进行西洋梨多倍体的育种实践提供理论指导。 相似文献
16.
分析沙柳种质资源的遗传多样性和遗传分化,为资源的有效利用、新基因的挖掘和新品种选育提供参考。应用SSR分子标记分析8个产地330份沙柳样本的遗传多样性。从45对SSR引物中筛选出19对多态性引物,共扩增出74条带,其中63条具有多态性,每对引物检测到等位位点数为2~11,平均多态性位点为3.89,平均有效等位基因数(NE)为1.8171,平均期望杂合度(He)为0.4079,平均观测杂合度(Ho)为0.3798,平均Shannon信息指数(I)为0.6447。利用POPGENE软件对SSR扩增结果分析表明,8个产地间的遗传相似度在0.9437~0.9908。UPGMA聚类分析表明,8个产地划分成3类;遗传分化程度和产地间的距离呈正相关。 相似文献
17.
中国金针菇工厂化生产用种SSR和AFLP遗传多样性分析 总被引：3，自引：2，他引：1
探讨SSR、AFLP分子遗传标记技术在金针菇遗传变异分析和菌种鉴定上的应用。用SSR和AFLP分子标记技术比较分析了中国市场上20个主要的工厂化生产金针菇用种的遗传多样性。29对SSR引物和60对AFLP引物分别检测到37个及206个多态位点;遗传相似系数分别为0.56~1.00、0.54~0.97。AFLP标记的多态性比SSR高。2种标记的聚类分析结果均揭示出中国市场上工厂化金针菇用种遗传多样性相对较小,亲缘关系十分接近。 相似文献
18.
基于AFLP和SSR分子标记的苹果属植物亲缘关系研究 总被引：1，自引：1，他引：0
研究比较AFLP与SSR 2种分子标记技术在苹果亲缘关系上的准确性。应用AFLP、SSR、AFLP与SSR结合这3种方法,对41份苹果属内种质资源类型进行亲缘关系分析。从64对AFLP引物中筛选出7对多态性较好的引物,7对引物平均多态率为86.72%。从40对SSR引物中筛选出7对多态性较好的引物,多态率均为100.00%。UPGMA聚类结果显示,3种方法分别将41份供试材料分为6大类群,大部分种质的分类结果与传统的分类方法一致。通过聚类分析也明确了部分新发现类型的分类地位归属,合理解释了新类型的起源,也通过分析比较了3种方法的准确性,认为AFLP的聚类结果更符合传统分类及田间形态,为苹果属植物种质资源的分类方法提供了分子生物学依据。 相似文献
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应用SSR和ISSR标记分析栽培香稻品种的遗传多样性 总被引：27，自引：0，他引：27
本研究利用24对SSR引物和36个ISSR引物,分析33份来源于亚洲10个国家的香稻品种的遗传多样性。分别获得93条和181条多态性片段,每个SSR座位可检测3～8个等位基因,平均为4．23个;每个ISSR引物可检测3～8个多态性位点,平均为5．03个。根据SSR和ISSR标记计算的品种间遗传相似系数分别在0．294～0．884之间和0．595～0．867之间。聚类分析表明,利用两种标记所得的聚类结果基本上一致,与品种所处的3种气候类型变化基本相符。进一步证实SSR和ISSR标记是研究水稻种质资源分类有效的工具。 相似文献