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运用PCR-DGGE分析比较瘤胃中不同饲料固相粘附微生物区系 总被引:4,自引:0,他引:4
通过研究奶牛瘤胃中苜蓿、青贮玉米和羊草3种饲料固相粘附微生物菌群结构,分析比较附着于不同粗饲料微生物区系的差异。选择3头健康且体质量相近的装有永久性瘤胃瘘管的中国荷斯坦奶牛,将苜蓿、青贮玉米和羊草分别装入尼龙袋,在瘤胃中孵育24h后取出,PBS洗脱获得固相粘附微生物,提取总DNA,采用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)分析群落结构,选取清晰条带测序后构建系统发育树。不同样品的DGGE图谱条带的数目和条带颜色深浅有一定差异;苜蓿与青贮玉米和羊草间相比相似性较低,青贮玉米与羊草间的相似性较高;3种饲料及瘤胃内容物固相粘附微生物的Simpson多样性指数差异显著(P0.05),Shannon-Wiener多样性指数差异不显著(P0.05);3种饲料固相粘附微生物条带近源种分别归属Butyrivibrio sp.、Fibrobacter sp.、Prevotella sp.、Succiniclasticum sp.、Pseudobutyrivibrio sp.5个属。3种饲料固相粘附微生物的种群构成存在差异。 相似文献
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反刍动物的瘤胃是一个复杂的厌氧微生态发酵系统,研究其瘤胃微生物区系组成与功能已成为反刍动物营养学的重要内容,分子生物学技术是开展瘤胃微生物研究的重要技术手段。本文就变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术、16S r DNA序列分析、宏基因组技术、DNA芯片技术等在瘤胃细菌多样性研究中的应用情况进行了总结与归纳,为今后开展此方面研究工作提供技术参考。 相似文献
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《黑龙江畜牧兽医》2015,(19)
为了研究补饲糖蜜尿素舔砖对放牧羊瘤胃中细菌种群结构随时间变化的规律,试验采用基于16S DNA的PCR变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,在放牧羊舔食舔砖的不同时间点取样,进行瘤胃液的DGGE分析。结果表明:舔食糖蜜尿素舔砖后放牧羊瘤胃细菌主要以拟杆菌门、硬壁菌门为主。在舔食15 d后瘤胃细菌多样性显著增加,舔食30 d后瘤胃细菌多样性达到最高。糖蜜-尿素对瘤胃微生物种群具有明显的筛选作用,舔食前以Capnocytophaga canimorsus为优势菌群,舔食一段时间后各菌群或出现或消失,呈动态变化和定植过程;30 d后瘤胃种群结构基本保持稳定,Prevotella ruminicola Bryant处于优势地位。说明舔食舔砖前后细菌种群结构存在明显差异,舔砖可明显增加瘤胃微生物多样性。 相似文献
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