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方差组分估计方法的比较 总被引:2,自引:0,他引:2
本文通过蒙特卡罗模拟产生的八个模拟资料比较了我国常用的方差分析法(不考虑场年季效应)、Henderson方法1、Henderson方法3、最大似然法、改进最大似然法与约束最大似然法。结果表明:方差分析法估计值偏差最大,而约束最大似然法的估计值最准确。 相似文献
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基于SPOT-5卫星影像的灌区作物识别 总被引:1,自引:0,他引:1
高分辨率卫星影像是作物精确分类和评估的重要数据源,在农作物种植规划、估产等领域具有重要的应用价值。本研究利用分辨率为2.5 m的SPOT 5影像分析张掖市盈科灌区的作物分布状况,同时分别生成分辨率为10和30 m的影像,用于尺度验证。最终得到研究区作物分类图,所用方法主要有最小距离法、马氏距离、最大似然法、光谱角制图仪(SAM)和支持向量机(SVM)。Kappa系数分析表明,最大似然法和SVM的分类效果好于其它分类器,分别为0.871 9和0.862 5,但这两种方法的统计量无明显区别;分类图精度评价表明,基于最大似然法的分类图总体精度最高,为90.6%;随像元空间尺度的增加,分类精度未产生明显变化。研究结果表明,最大似然法和SVM技术可以与SPOT 5影像结合,用于作物类型识别和作物面积估算。 相似文献
3.
旨在利用高速双倍自助法研究蒙古马系统发育树的问题。本研究选用30匹蒙古马的mtDNA D-loop区碱基序列,其中包括5个蒙古马类群(巴尔虎马、三河马、乌审马、乌珠穆沁马、锡尼河马)各6匹,对其所有105个可能系统树(普氏野马作为外群,6匹)进行分析,利用生物信息学软件Mega6和PAMAL4.9,以最大似然法估计蒙古马的最大似然系统树。最后利用生物信息软件CONSEL、R3.0中的SDBP包等计算105个候补系统树的基于高速双倍自助法的可靠度(speedy double bootstrap P-value,SDBP)。结果表明,SDBP值最大的蒙古马系统树共有3个分支,巴尔虎马与乌审马合并为一个分支,具有较近的遗传关系;乌珠穆沁马与锡尼河马具有较近的遗传关系;三河马独立于其他4种蒙古马,构成一个系统发育分支。SDBP值最大的蒙古马系统树与三河马和其他4类蒙古马具有较远的预测血缘关系是一致的,同时此结果的系统树也具有最大似然值。本研究结果还表明,采用最大似然法结合SDBP值分析蒙古马的系统拓扑关系是较最大似然法结合渐近无偏(approximately unbiased,AU)值以及结合自助(bootstrap P-value,BP)值分析蒙古马系统拓扑关系更有效。同时也比非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)有效,而与邻接法(neighbor joining,NJ)得到了相近的结论。上述结果提示,我们的研究结果使蒙古马的进化理论奠定在更坚实的遗传学基础上,可推动蒙古马的进化理论进一步发展与完善。 相似文献
4.
基于数码照片的草地植被覆盖度快速提取方法 总被引:2,自引:0,他引:2
草地植被覆盖度是草地健康与否的重要参数,提高草地植被覆盖度的计算效率和精度具有重要的意义。本研究提出了一种利用过绿特征植被指数和半自动阈值设定算法(半自动阈值法)的从数码照片中快速计算草地植被覆盖度的方法,并将该方法与最大似然法监督分类方法(最大似然法)和色度饱和度法进行了比较。对32张草地数码照片的植被覆盖度估算结果和准确结果进行回归分析,分别得到斜率、截距和回归系数这3个参数。结果表明,3种方法都未能考虑植物的非绿色组分而存在低估的问题。半自动阈值法的准确度堪比最大似然法,且没有后者存在的低覆盖率高估问题;而且该方法人工干预少,计算结果准确客观,适用性强;但是对绿色特征不明显的植物(如灰绿色植物)效果不佳。 相似文献
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以鲁西黄牛和渤海黑牛(各30头)12个微卫星座位数据为基础,利用系统树分析法、最大似然法及Bayes方法,比较不同方法对个体识别效率的影响。结果表明:当利用12个微卫星座位和6个低杂合度位点数据时,3种个体识别方法鉴定的准确性均为100%。但利用6个高杂合度座位时,Bayes方法的准确性最高(83.33%),最大似然法次之(76.67%),系统树分析法最低(71.67%)。结果表明,基于Bayes理论的个体识别方法最准确,是进行同类研究的首选工具,而系统树分析法和最大似然法可以作为其补充加以应用。 相似文献
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本文研究讨论了在单性状模型下几种方差组分估计方法,它们是:极大似然法(ML)、约束极大似然法(REML)、最小二乘无偏估计(MINQUE)、最小方差二乘无偏估计以及 Henderson 的第3法等。其中MINQUE和REML法的估计误差最小,但MINQUE的收敛速度高于REML。Henderson 第3法和ML对误差方差均为有偏估计,因此它们的估计误最大;MINQUE法实质上就是REML估计,因此在实际应用中多采用MINQUE和REML法。 相似文献
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对敖汉细毛羊早期性状遗传参数估计的研究 《畜牧与饲料科学》2015,36(12):83-83
运用动物模型BLUP法(最佳线性无偏预测法)和MTDFREML法(多性状非求导约束最大似然法)对敖汉细毛羊的早期性状进行了分析,得出了初生重、断乳重和周岁重的遗传力,并就遗传参数估计结果进行了讨论。 相似文献
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家蚕标记基因位点与数量性状基因位点重组参数的最大似然估计法 总被引:8,自引:2,他引:6
利用分离世代群体(BC_1或F_2),估算家蚕标记基因位点与数量性状基因位点重组参数的最大似然估计法,求解似然方程组的EM迭代算法。通过120次计算机模拟和一个生产实例验证了方法的可行性。 相似文献
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利用最大似然法(ML)估计了内蒙古三河牛泌乳曲线基于不完全伽马函数(Wood)的不同统计模型,对各模型的差异用似然比(LR)进行检验。结果表明,模型Ⅲ显著优于模型Ⅱ和模型Ⅰ(P<0.01)。采用限制性最大似然法(REML)对模型Ⅲ估计得出,泌乳初期奶量在不同胎次(pari)、产犊年度(year)、产犊季节(seas)、场(herd)下具有显著差异(P<0.05);测定日产奶量的变化率随测定日(t)、测定日自然对数(t')的推移,以及胎次与测定日(t)及其自然对数(t')交互作用的不同差异极显著(P<0.01),泌乳初期奶量与t'和t的斜率系数之间存在显著的正或负相关(P<0.01)。 相似文献
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现有二个双纯系MQ/MQ与mq/mq,其中M与m为遗传标记位点一对等位标记,Q与q为数量性状位点一对等位基因,它们杂交后得到F1代,F1代再与双纯系mq/mq回交得到回交一代(B1),已知遗传标记与数量性状基因位点紧密连锁,那么对该群体进行最大似然分析的步骤如下:
1 似然函数的构建
当个体j具有表型值为(yj)及遗传标记基因型为(Mi)时,那么其似然函数表示如下: 相似文献
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利用BLUP模型和MTDFREML法对敖汉细毛羊产毛性状遗传参数估计 《畜牧与饲料科学》2015,36(12):85-85
对敖汉细毛羊的产毛性状进行分析,运用动物模型BLUP法(最佳线性无偏预测法)和MTDFREML法(多性状非求导约束最大似然法)计算产毛量、剪毛后体重、毛长度、纤维直径的遗传力。结果表明,产毛量、剪毛后体重、毛长度和纤维直径的遗传力分别为0.12、0.12、0.16和0.12。提示产毛量、剪毛后体重、毛长度、纤维直径4个性状都属于中等遗传力性状。 相似文献
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本研究旨在对比值性状QTL采用贝叶斯定位方法进行探讨。将两个具有正态分布的普通数量性状之比定义为比值性状。由于此类性状不服从正态分布,因此在遗传分析上不同于普通性状。利用构成比值性状的两个组分性状的线性结合,我们提出了定位比值性状数量性状位点(QTL)的最大似然法。在此基础上,进一步探索比值性状的贝叶斯定位策略。首先采用贝叶斯压缩方法估计两个组分性状的QTL参数,然后利用两个组分性状的群体均值和QTL遗传效应,产生一个关于比值性状QTL遗传效应的后验样本,通过对这个后验样本的统计分析,来推断比值性状的QTL。模拟研究表明:新方法表现出比似然法更高的QTL检测效力。 相似文献
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用MTDFREML估计中国美利奴羊(新疆型)产毛性状的遗传参数 总被引:1,自引:0,他引:1
利用新疆巩乃斯种羊场饲养的2001-2005年出生的5 425只中国美利奴羊(新疆型)周岁资料,采用动物模型多性状非求导约束最大似然法(MTDFREML),估计了中国美利奴羊(新疆型)在新疆自然条件下产毛性状的遗传参数.结果表明:毛长度、剪毛后体重、产毛量和纤维直径的遗传力估计值分别为0.13、0.29、0.22和0.36. 相似文献
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试验对6个白莱航杂交鸡群的微卫星变异及其与生长、产蛋和免疫活性等性状的关系进行了研究。采用9个微卫星标记,用最小二乘和最大似然法对6个遗传组的170个个体进行了关联分析。结果发现,7个微卫星标记具有多态性,有2~4个等位基因。5个微卫星标记的多态性息含量(PIC)大于52%。微卫星标记MCW0041、ADL0210、MCW0110同产蛋性状呈显著相关(P〈0.05)。 相似文献